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皖西白鹅微卫星DNA遗传多样性分析 总被引:7,自引:2,他引:5
从9对微卫星引物中筛选出6对引物对49只皖西白鹅的DNA多态性进行检测,分析等位基因组成,计算各座位的基因杂合度和多态性信息含量。结果表明,6对微卫星引物共扩增出16个等位基因,基因频率分布在0.0392-0.9608之间。6个微卫星位点的平均杂合度为0.3809,平均多态性信息含量为0.3285。 相似文献
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微卫星分子标记分析四川绵羊群体遗传多样性 总被引:2,自引:0,他引:2
为探究四川省6个绵羊群体的遗传多样性,实验应用12个微卫星标记计算基因频率、有效等位基因数、杂合度及多态信息含量来评估群体内遗传多样度,通过遗传距离聚类图、群体结构推测图、主成分分析及群体间分子方差分析来评估群体间遗传关系。结果表明:6个绵羊群体在12个微卫星位点的平均有效等位基因数为3.006~3.176,平均多态信息含量变化为0.559~0.612,平均期望遗传杂合度为0.610~0.670;6个绵羊群体间的遗传关系与地理分布情况及育成史实不完全一致,但遗传距离聚类图、群体结构推测图和主成分分析结果均显示,6个绵羊群体中布拖黑绵羊类群与贾洛绵羊类群遗传关系更近;6个绵羊群体间方差组分F统计量结果为0.112 39,处于中度分化水平。 相似文献
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为了研究重庆地方鸡品种的遗传多样性,试验采用将微卫星标记与荧光标记引物测序相结合的技术进行基因分型,计算各群体在每个位点上的等位基因频率,以及各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)。结果表明:在12个微卫星位点中共检测到88个等位基因,Ne在3.158 5~8.480 6之间,位点平均杂合度在0.416 7~0.875 0之间,品种平均杂合度在0.587 3~0.722 5之间,平均杂合度最高的是南川鸡,最低的是城口山地鸡;3个鸡品种在12个微卫星位点上的基因频率存在明显差异,H为0.659 9,PIC为0.741 2;聚类分析显示,南川鸡和大宁河鸡聚为一类,城口山地鸡独自聚为一类。 相似文献
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《中国家禽》2019,(8)
试验利用Illimina MiSeq高通量测序对70日龄四川白鹅十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物进行微生物多样性分析。结果显示:①4个肠段微生物群落的α多样性(菌群丰度上)存在显著差异(P0.05);②4个肠段的菌群结构在6个菌门和13个菌属的相对丰度存在显著差异(P0.05);③盲肠微生物在7个菌属(脱硫弧菌属、拟杆菌属、拟杆菌属、相炭疽杆菌属、瘤胃球菌属、韦荣球菌属和Butycricimonas菌属)的相对丰度都显著高于其他3个肠段(P0.05),但是空肠的链球菌属和回肠的SMB53菌属的相对丰度均显著高于其他3个肠段(P0.05)。结果提示:鹅不同肠段的菌群组成存在显著差异,回肠和空肠微生物都参与粗纤维的消化,盲肠消化粗纤维的能力要强于其他3个肠段。 相似文献
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陇东绒山羊微卫星DNA遗传多样性的研究 总被引:1,自引:1,他引:1
利用9个微卫星座位,8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳PCR扩增产物,对120只陇东绒山羊基因组DNA的遗传多样性进行了检测,对其群体遗传学特性进行分析。结果表明:陇东绒山羊在9个微卫星座位中共检测到90个等位基因,其中微卫星座位LSCV24等位基因数最多,为14个;BMS1248多态信息含量最高,PIC为0.88;DB6座位多态信息含量最低,PIC为0.79。在所标记群体中平均有效等位基因数为7.69±1.65个,平均多态信息含量为0.84±0.03;遗传杂合度均值为0.86±0.03,均高于国内外部分研究结果。说明陇东绒山羊品种遗传多样性丰富,群体遗传变异程度高,育种潜力大。 相似文献
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边鸡微卫星DNA标记遗传多样性的研究 总被引:4,自引:0,他引:4
利用鸡基因组中5个微卫星标记,检测了边鸡群体的遗传多样性,并以大骨鸡做了比较分析。同时探讨了边鸡在国内5个地方鸡种中的系统地位。结果表明,5个微卫星位点共检测到38个等位基因,其中ADL0146位点的等位基因数最少(5个),而ADL0136和ADL0185两个位点的等位基因数最多(9个),平均等位基因数为7.6个.边鸡群体内比大骨鸡群体有更丰富的遗传多样性。聚类分析结果显示,边鸡与大骨鸡亲缘关系最近。而与鲁西斗鸡亲缘关系最远。 相似文献
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《中国畜牧杂志》2017,(2)
以岭南黄鸡为参照,利用微卫星位点检测贵妃鸡和麒麟鸡的遗传多样性,评估群体遗传资源现状。结果表明:26个微卫星位点在30个贵妃鸡、40个麒麟鸡和30个岭南黄鸡个体中共检测到197个等位基因,每个位点的等位基因范围为3个(MCW0037、MCW0165、MCW0098)~19个(LEI0234),平均7.58;总体平均期望杂合度为0.6816,平均观察杂合度0.5625,平均多态信息含量0.6327;岭南黄鸡的遗传多样性最高,麒麟鸡次之,贵妃鸡最低;3个群体均偏离了哈迪-温伯格平衡;贵妃鸡和麒麟鸡的群体内近交系数高于岭南黄鸡,表明前者的近亲交配事件较频繁;麒麟鸡群体内的遗传分化系数(均值0.2433)和岭南黄鸡(0.2281)大于贵妃鸡(0.0359),表明后者的有效群体较小。在后续的品种选育工作中应当加强亲本亲缘关系的评估,提高选育群体的有效数量,尽量减少近亲交配。 相似文献
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试验旨在分析岷县黑裘皮羊群体内遗传多样性,筛选出理想的遗传标记,为岷县黑裘皮羊的选育保种提供理论依据。选取144只岷县黑裘皮羊,颈静脉采血并提取DNA,对24对微卫星引物进行PCR扩增,用毛细管电泳技术进行基因分型,计算其等位基因数、等位基因大小及频率、有效等位基因数、杂合度和多态信息含量。结果显示,24个位点共检测到210个等位基因,平均等位基因数为8.75;群体等位基因频率为0.0104~0.7396,等位基因片段大小为97~285 bp;有效等位基因数为1.7581~8.2433个;群体平均观测杂合度为0.4839;平均期望杂合度为0.6959;平均多态信息含量为0.6527。其中MAF70位点等位基因数、有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量最高;OarFCB128位点观测杂合度最高;OarAE129位点等位基因数最少,SRCRSP9位点期望杂合度、多态信息含量最低;OarFCB304位点观测杂合度最低。Hardy-Weinberg平衡分析结果表明,所选位点中有19个处于非平衡状态。结果表明,岷县黑裘皮羊的遗传背景复杂,群体内遗传多样性丰富,可为其遗传资源的评估和选育保种工作提供理论依据。 相似文献