单核苷酸多态性及其在猪育种中的应用

单核苷酸多态性是一类在基因组中最普遍存在的分子标记。本文综述了单核苷酸多态性的概念、检测技术及猪生长性状、背膘厚和瘦肉率、肉质性状和抗病性状中单核苷酸多态性的应用,以及SNP的应用前景。     

单核苷酸多态性及其在猪育种中的应用

单核苷酸多态性是一类在基因组中最普遍存在的分子标记。本文综述了单核苷酸多态性的概念、特点、检测技术及猪生长性状、背膘厚和瘦肉率、肉质性状和抗病性状中单梭苷酸多态性的应用。     

猪6号染色体SW2098和SW1881之间区域的背膘厚和肌内脂肪的单核苷酸多态性关联研究

这是一项确定单核苷酸多态性与猪6号染色体的脂肪性状关系的研究。在125个完整的细菌人工染色体的SW2098和SW1881之间的区域里,检测了共11067个假定的基因变异,这里有很多影响着肌内脂肪(IMF)和背膘厚(BFT)的数量性状基因座(QTL)。541头韩国本土猪和长白猪的杂交后代的173个假定待验证的单核苷酸多态性和120个单核苷酸多态性被研究。通过使用单标记回归分析的方法,确定了每个单核苷酸多态性的显著性。另外,显著性阈值通过虚假发生率确定。120个     

猪繁殖性状相关基因的多态性研究进展

猪繁殖性状属于低遗传力性状,且受到多个基因的调控。调控猪繁殖性状的主效基因有雌激素受体基因、卵泡刺激素基因、催乳素受体基因和视黄醇结合蛋白-4基因等,本文对这些基因的多态性研究进展作一综述,以期为利用单核苷酸多态性实现母猪早期选留的研究和实践提供参考。     

PCR-SSCP研究进展及其在羊经济性状研究中的应用

PCR-SSCP是单核苷酸多态性分析的一项重要技术。本文简要介绍了PCR-SSCP的原理、方法、研究进展及其近年来在绵山羊经济性状研究中的应用。     

肉牛生长性状和肉质性状全基因组关联分析的研究进展

全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)是研究家畜复杂经济性状和疾病遗传变异的有效方法,GWAS的核心是挖掘遗传变异与目标表型性状间的关系.随着牛全基因组测序工作完成,海量单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点被标记...     

PCR-SSCP研究在羊经济性状中的应用

PCR-SSCP是单核苷酸多态性分析的一项重要技术。本文简要介绍了PCR-SSCP的原理、方法、研究进展及其近年来在绵、山羊经济性状研究中的应用。     

全基因组关联分析及其在猪育种中的研究进展

近年来,随着高通量单核苷酸芯片和基因分型技术的不断发展,利用全基因组关联分析猪的性状成为可能。全基因组关联分析是一种新兴的遗传分析方法,能有效进行复杂疾病和性状的研究。国内外相关研究人员针对猪性状进行全基因组关联分析,积累了大量的单核苷酸多态性(SNP)标记、候选基因以及数量性状位点,为猪分子育种提供基础。该文主要对全基因组关联分析的基本原理、分析方法以及对猪性状的研究进展进行综述。     

利用GWAS研究母猪繁殖性状的进展

母猪繁殖性状一直是猪的重要性状之一,母猪繁殖性能的高低关乎着养猪场的规模和养猪业的发展。目前利用GWAS(全基因组关联分析)发现影响母猪产仔数、初生重、断奶重和乳头数等繁殖性状的SNP(单核苷酸多态性)位点,进而发现关联的基因已经成为研究热点之一,并且利用GWAS研究母猪的繁殖性状取得了一定的进展。因此,文章主要对利用GWAS研究母猪繁殖性状的进展进行概述。     

猪肉质性状全基因组关联分析的研究进展

全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)是在全基因组范围内,以单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism sign, SNPs)作为分子遗传标记,筛选出与数量性状相关的SNP、数量性状基因座(quantitative trait locus, QTL)和候选基因的有效手段。猪肉品质是猪的重要经济性状,与人们的肉食营养、肉食品加工和养猪业经济效益密切相关。本文主要对GWAS在猪肉质性状的研究应用展开论述,以期为通过GWAS鉴别影响猪肉质性状的主效基因来改善猪肉品质提供理论依据。     

Leptin基因第3469位点基因型对合作猪繁殖性能和体尺的影响

以Leptin基因作为控制猪产仔性状和生长性状的候选基因,采用PCR-SSCP技术在合作猪群体中进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,分析Leptin基因的遗传多样性及突变位点基因型频率与基因频率。同时,结合生长性状和母猪产仔性状记录,研究了不同基因型对产仔性状、生长性状的遗传效应。结果:通过对合作猪Leptin基因SNPs分析,检测到了2个等位基因,3种基因型。Leptin基因第3469位点的基因型效应对合作猪体重、体高、胸围、头长、头胎总产仔数、2胎总产仔数、2胎活产仔数、3胎总产仔数、3胎活产仔数和4胎活产仔数影响均显著(P0.05),而对体长、头胎活产仔数和4胎总产仔数影响不显著(P0.05)。这表明Leptin基因第3469位点的突变与合作猪的产仔数和生长性状有密切关系,Leptin基因可作为控制合作猪产仔性状和生长性状的候选基因。     

中国红牛苹果酸酶(ME1)基因3′UTR的克隆及多态性分析

试验鉴定了牛苹果酸酶(ME1)基因3′UTR的选择性转录及单核苷酸多态性(SNPs),并对其与中国红牛肉质性状和胴体性状的相关性进行了分析。试验克隆了ME1基因3′UTR的2个转录体(片段大小不同)。ME1-DraI酶切分析结果发现3′UTR存在1个SNP,且该位点与中国红牛蒸煮损失、pH24h、眼肌面积显著相关(P<0.05)。因此,该位点可作为中国红牛肉质性状和胴体性状的分子标记辅助常规育种位点。     

猪FRZB、ABCF1基因多态性与生长性状的关联分析

FRZB基因通过抑制Wnt信号途径调控细胞生长,ABCF1(也称为ABC50)结合e IF2,在翻译起始中发挥着重要的作用,可作为猪生长性状相关的候选基因。本研究采用直接测序法检测FRZB基因和ABCF1基因5'非翻译区中单核苷酸多态性(SNPs)基因型分布,并分析基因型与生长性状的相关性。结果表明:在美系大白猪中,FRZB基因位点ins(A-532G)多态性与背膘厚呈极显著相关(P0.01),与体长接近显著水平(P=0.05);ABCF1基因254A/G多态性与背膘厚、左乳头数和右乳头数均呈显著相关(P0.05);在法系大白中,ABCF1基因254A/G多态性与初生重呈显著相关(P0.05)。结果表明,FRZB和ABCF1基因是潜在的影响猪生长性状的候选基因。     

松辽黑猪胰岛素样生长因子Ⅱ基因PCR-SSCP多态性分析

采用PCR-SSCP技术检测胰岛素样生长因子Ⅱ(IGF-Ⅱ)基因外显子3和外显子4在松辽黑猪中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对松辽黑猪部分重要生长、胴体性状的影响。结果表明:3对引物中,只有p3的扩增片段存在多态性。p3的扩增片段在松辽黑猪中检测到AA、AB和BB 3种基因型;测序分析发现BB型与AA型相比在IGF-Ⅱ基因(AY044828)第21585 bp处有G→C突变,松辽黑猪AA、AB和BB基因型频率分别为0.6956、0.2609和0.0435。AA基因型对瘦肉率(P<0.05)、日增重(P<0.05),BB基因型对平均背膘厚(P<0.01)有正遗传效应,对其他性状差异不明显。     

奶牛乳质性状相关基因及其单核苷酸多态性的研究进展

乳质性状为奶牛重要的经济性状,主要包括乳蛋白量、乳蛋白率、乳脂量和乳脂率等。乳质性状改良是当今遗传育种界的研究热点之一,利用候选基因策略寻找影响乳质性状的功能基因或功能性单核苷酸多态,并将其应用于奶牛乳质性状的分子育种实践已经成为后基因组时代的发展趋势。目前针对乳质性状的功能基因或功能性单核苷酸多态已经开展了大量的研究工作,作者就参与泌乳调控的乳质相关基因、脂肪合成与次生物质代谢通路,以及其他一些与乳质性状相关基因及功能性单核苷酸的研究现状进行简要综述。     

用于鸡生长和肉质性状定位资源群体的构建

采用远交F-2设计,以杏花鸡(A系)为亲本,分别与隐性白洛克鸡(B系)、泰和丝羽乌骨鸡(C系)进行全同胞和半同胞的正反交,产生了包含A♂×B♀、B♂×A♀、A♂×C♀、C♂×A♀4个杂交组合的各两组F2群体,并进行详细的性状表型记录,建立了可用于定位生长和肉质的数量性状座位(quantitative trait loci,QTL)的4个资源群体。对F2群体的各种性状表型值进行分析,结果显示,F2群体各生长性状和肉质性状都分离得很好。资源群体有足够的群体规模,并有利于校正母体效应和环境影响,保证有效单核苷酸多态性(single nucleotide poly-morphism,SNP)检测数量和QTL定位的准确性,使资源群体的构建达到了预期的效果。     

猪IGFBP2基因多态性及其与胴体、肉质性状的关联分析

本研究旨在调查猪胰岛素样生长因子结合蛋白2基因(IGFBP2)潜在的变异与胴体性状和肉质性状之间的关系。IGFBP2是IGFBPs家族的一员,定位在猪15号染色体上。本研究利用PCR-MspⅠ-RFLP方法对该基因第二内含子g.171CT(Gen Bank Accession No.BV727778)进行了单核苷酸多态性(SNP)检测,在382头大白×梅山猪F2代猪群体中关联分析。结果发现该位点与背膘厚、眼肌高、眼肌宽、骨率等性状呈极显著相关(P0.01),与眼肌面积、肥肉率、瘦肥比、花油、色值(LD)和色值(BF)等性状呈显著相关(P0.05)。结果表明IGFBP2基因型与胴体和肉质性能存在一定程度的显著关联,是潜在的影响猪胴体和肉质性状的候选基因。     

鸡经济性状相关基因单核苷酸多态性的研究进展

随着分子生物学技术的发展,国内外采用分子标记的方法对鸡脂肪、生长屠体和繁殖等性状的相关基因进行了单核苷酸多态性的检测和关联分析,当关联被确定为富有成效的标记时,其潜在的可能性被直接用于育种方案。笔者对鸡经济性状重要功能基因单核苷酸多态性的研究加以综述,以期为今后的研究提供参考。     

奶山羊AGPAT6基因多态性与生长性状的关联分析

利用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术对549只西农萨能和关中奶山羊群的AGPAT6基因遗传多态性与生长性状(体高、体长和胸围)的相关性进行研究.结果表明AGPAT6基因存在4个单核苷酸多态性:P1、P2、P4与P10位点分别位于5′UTR (g.152G＞C)、内含子2(g.8124G＞A)、外显子4(g.9263C＞G)和3′UTR(g.16436G＞A).经关联分析,P2、P4和P10三位点在西农萨能奶山羊和关中奶山羊品种中都属于中度多态,4个SNPs的不同基因型对两个奶山羊品种的生长性状影响均不显著(P＞0.05).     

鸽生长激素受体基因多态性与生长性状及体组成的相关分析

根据鸽生长激素受体（GHR）基因CDS序列设计引物进行PCR扩增,克隆了鸽GHR基因内含子9序列,通过Gen-Bank中Blastn比对表明,与鸡内含子9（AF372659）同源性为70．01％。利用PCR-SSCP技术和DNA测序方法检测GHR基因内含子9、外显子10和3’-UTR的单核苷酸多态性。本试验共检测出3个多态位点,经最小二乘法分析,多态位点与两群体鸽生长性状及体组成均不相关。