家蚕核糖体18S RNA基因的序列分析及分子系统学研究

为研究家蚕18S DNA基因的特点及分子进化,以家蚕丝腺为材料提取家蚕基因组DNA,通过PCR扩增、测序鳞翅目家蚕(Bombyx mori)核糖体小亚基18S RNA基因(18S rDNA)的全序列,将该序列与等翅目、直翅目、衤责翅目、鞘翅目、膜翅目、双翅目、捻翅目、弹尾目、蜉蝣目各一种昆虫的18S rDNA进行了比较。用DNAstav软件分析并进行序列比对,结果表明,昆虫18S rDNA有4段序列较为保守,以18S rDNA比对的第2保守区段构建的分子系统发育树表明鳞翅目和双翅目、膜翅目、鞘翅目进化关系最近,等翅目、直翅目、衤责翅目进化上较为接近,捻翅目昆虫与弹尾目昆虫的亲缘关系较为接近,捻翅目在分类上应是一种古老的昆虫。     

九种微孢子虫核糖体小亚单位RNA(SSUrRNA)基因拷贝数的研究

以已克隆测序的家蚕微孢子虫 (镇江株 ,Nosemabombycis)的核糖体小亚单位RNA(SSUrRNA)编码基因(12 0 5bp)为模板 ,用随机引物合成法标记的探针 ,在与 9种微孢子虫及家蚕基因组DNA的 6种限制性内切酶的酶切产物的Southern杂交图谱中 ,9种微孢子虫基因组DNA酶切产物的杂交图谱极为相似 ,而与家蚕基因组DNA的任何一种酶的酶切产物均无杂交信号 ,表明微孢子虫和家蚕的SSUrRNA基因同源性很低或没有同源性。同时还证实了已克隆的SSUrRNA基因来源于微孢子虫基因组DNA ,不是从家蚕基因组DNA扩增而来。在酶解较为完全的酶切产物的杂交图谱中 ,微孢子虫基因组DNA中SSUrRNA基因的拷贝数至少在 15以上     

猪链球菌核糖体基因分型研究

从青岛农业大学动物科技学院实验室分离培养的15株猪链球菌中提取基因组DNA,利用PstⅠ消化并进行电泳分析,将电泳分离的DNA片段转移至尼龙膜上并固定;以大肠杆菌C83907 16srDNA两侧保守区域设计引物,利用PCR扩增出16srRNA基因片段,用地高辛标记制成探针;该探针与基因组DNA酶切片段进行杂交,通过对杂交带型分析,进而对猪链球菌进行核糖体基因分型。     

家蚕环形RNA的预测与鉴定

环形RNA(circRNA)是具有闭合环状结构的单链RNA,其功能涉及对亲本基因转录的调控、miRNA的吸附和作为某些疾病的生物标志物。以家蚕幼虫、蛹和蛾3个发育时期蚕体的混合样本提取总RNA,利用高通量测序共获得112 271 320个测序read。采用软件Map Splice和Find_circ从获得的测序read中预测家蚕的circRNAs,其中用Map Splice预测到的circRNA共1 659条,用Find_circ预测到的circRNA共9 777条,2个软件共同预测到的circRNA有1 598条。利用circRNA预测程序CircRNApredictor.pl从家蚕转录组read(SRR315361)和家蚕基因组序列中预测到12 955条circRNA,进一步将高通量测序read匹配预测的circRNA序列,结果显示序列首尾重叠,为环状分子。通过软件miRanda预测了部分家蚕circRNA的靶miRNA。设计特异性的正、反向PCR引物对,选取其中11条SRPBM(spliced reads per billion mapping)值最高的circRNA进行PCR,产物测序鉴定为家蚕潜在的circRNA分子,其中BmcircR_3621、BmcircR_8955、BmcircR_8926、BmcircR_6123、BmcircR_8349、BmcircR_1198、BmcircR_9535、BmcircR_6215、BmcircR_7937在家蚕酪氨酸蛋白激酶Abl(tyrosine-protein kinase Abl)和异常细胞迁移蛋白10(abnormal cell migration protein 10)等的基因序列中以环的形式存在,并且主要成环位点与生物信息学预测结果一致,而BmcircR_2196和BmcircR_6226的成环位点与预测存在差异。研究结果可供家蚕乃至昆虫新型RNA分子的鉴定和研究参考。     

蓖麻蚕(Attacus ricini)核糖体RNA基因酶切图谱无性繁殖和物理图以及结构基因的定位

真核细胞基因的表达调控.尤其是调控基因的结构和功能是当前分子遗传学研究的重要方面.核糖体RNA(rRNA)基因(rDNA),由于它在生物学功能上的重要性.而受到广泛研究.近年来某些rDNA已被无性繁殖(克隆).对其结构的研究,发现有不同程度的非均一性.但家蚕的TBNA是均一的.蓖麻蚕rDNA的研究未见报导.我们以蓖麻蚕rDNA为对象研究rDNA表达调控基因的结构及其作用模式.     

家蚕抗菌肽基因研究进展

抗菌肽是昆虫先天性免疫系统中十分重要的效应因子,近年来一直是昆虫免疫学研究的热点。家蚕作为鳞翅目昆虫的代表,其抗菌肽研究取得了长足进展。根据已经研究获得的抗菌肽基因序列在家蚕基因组中进行同源搜寻,共获得了40个家蚕抗菌肽基因。这些基因编码的多肽在大小、氨基酸组成和性质上差异很大,但基于结构性质可以分成3类:(1)具有α-螺旋结构并且缺乏半胱氨酸(cysteine,Cys)的线性抗菌肽;(2)富含脯氨酸或甘氨酸的组成性抗菌肽;(3)富含半胱氨酸的环形抗菌肽。以这3类结构作为主线,综述了家蚕抗菌肽近年来的研究进展。     

家蚕flightin基因的克隆

Flightin蛋白对于粗肌丝的组装和性能有着重要的作用。为调查家蚕的粗肌丝结构,通过PCR和RACE技术,我们在家蚕中获得了家蚕flightin基因的全长cDNA序列,并通过对家蚕wgs数据库的检索,获得了蚕flightin基因的结构,家蚕flightin执基因由4个外显子和3个内含子组成。家蚕flightin基因的cDNA全长为661bp,编码158个氨基酸残基。家蚕flightin蛋白与黑腹果蝇flightin蛋白的氨基酸同源性为29．67％,但存在保守区域。     

家蚕滞育关联基因的研究进展

昆虫滞育是受基因控制与外界环境多种因素影响的生物学过程,涉及基因众多,调控网络复杂,目前其分子机制仍未清晰.国内外滞育调控的相关研究多数基于家蚕、果蝇、麻蝇等模式昆虫.介绍了家蚕滞育关联基因的研究现状及进展,包括分类、生理功能、基因间互作、部分基因涉及的信号通路及研究热点等,为促进其在农林害虫的防治途径或天敌保护利用等...     

家蚕雌外观基因交换

在家蚕的雌,完全不发生基因交换,故在(PY×py)F_1♀×py♂,期待PY和py表现型为1∶1之比,但在F_1♀蛾照射X射线而如上和py♂交配、所产生之子生一头pY、此外观似为基因交换的结果,但实际不过是依X射线使PY变为pY而已。     

家蚕核糖体的提取及其Sarcin/Ricin结构域的初步鉴定

用超速离心结合密度梯度离心法从蚕蛹中提取家蚕80S核糖体,经尿素变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,结果表明家蚕核糖体的RNA同大鼠核糖体RNA在序列长度上有明显差异,家蚕5.8S rRNA高于大鼠5.8S rRNA,而家蚕5S rRNA的序列长度则略低于大鼠。用核糖体失活蛋白R ic in分析鉴定家蚕核糖体的Sarc in/R ic in结构域,结果是家蚕Sarc in/R ic in结构域比大鼠Sarc in/R ic in结构域离28S rRNA的3′末端更近。     

家蚕茧丝纤度基因的RAPD标记

家蚕茧丝纤度性状属于数量性状 ,受 2～ 3对主效基因控制[1] ,表现为部分伴性遗传[2 ] ,并容易受环境的影响。因此 ,家蚕新品种选育对这一性状的选择难度较大。应用分子标记法辅助育种 ,将提高目标性状选择的准确性和缩短育种进程。随机扩增多态性ＤＮＡ (ＲａｎｄｏｍＡｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃＤＮＡ ,ＲＡＰＤ)技术在种属特异性鉴定、确定进化关系、外源导入基因的追踪、鉴定染色体上特异的ＤＮＡ片段、寻找与靶基因连锁的分子标记进行基因定位和基因分离、遗传作图等方面都取得了良好的效果。家蚕方面利用ＲＡＰ…     

家蚕血液酸性磷酸酶的基因座位

把家蚕血液的酸性磷酸酶进行寒天凝胶电泳,可得到按移动慢的顺序分为A、B、C、D及O的5个类型.它们是由共显性复对基因Bph~A、Bph~B、Bph~C、Bph~D、Bph~O所支配(Yashitake和Akigama 1964).但是,Bph基因所属哪一连锁群仍不明了.因此作者等进行了Bph基因的连锁分析,阐明其所属连锁群及基因座位,报告于后.     

家蚕消化管酶基因控制的研究

Ⅰ.研究目的在蚕幼虫消化管,已发现为分解饲料蛋白的强蛋白酶活性,但此酶到熟蚕期以后,激减,一旦消失,在蛹后期再次激增,并成为茧容解酶的供给源。此等幼虫期与蛹期蛋白酶的性质,有许多点相异。但据我们免疫学的研究(未发表),则蛹中肠及幼虫期中肠组     

我国率先完成家蚕基因框架图

我国科学家15日宣布:经过400多名科研人员5个多月的艰苦努力,我国已率先完成家蚕基因组"框架图"绘制工作.