辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析

 利用SSR检索程序从两个辣椒转录组共221 037条unigenes（97.3 Mb）中筛选得到17 319个SSR位点（7.83%）,其发生频率为1/56 kb。其中以单核苷重复基序为主导类型,占总SSR的56.30%;其次是二、三核苷酸重复基序,其出现频率分别为19.16%和23.18%。对所有含SSR位点EST序列设计的10 468对引物进行E-PCR多态性检测,获得1 538对E-PCR多态性引物。随机选取20对引物进行验证,其中7对（36.84%）在10个不同类型辣椒材料中表现出多态性,PIC值范围为0.33 ~ 0.89,平均为0.67,将10个辣椒材料分为3类。这些潜在的多态性EST-SSR的开发为辣椒遗传多样性分析、图谱构建提供了更丰富的候选分子标记。     

辣椒转录组SNP挖掘及多态性分析

 利用SNP分析软件从辣椒（Capsicum annuum L.）251 068条Unigenes中筛选出18 159个SNP,其中有1 781个SNP位点被匹配在1 291个注释基因上,基因功能分类和代谢途径分析表明,其中有853个基因参与初生代谢（28.7%）、细胞代谢（17.3%）、生物合成过程（15.7%）,另有125个（9.7%）基因序列参与新陈代谢途径,53条（4.1%）序列参与次生代谢产物合成途径,31条（2.4%）序列参与植物激素合成途径。 EST-SNP序列中4 172条（22.9%）满足设计CAPS引物条件,为了验证EST-SNP正确性,并选取了15对CAPS引物对5份辣椒材料进行扩增,结果发现有8对（53.3%）引物表现出多态性。表明筛选出这些EST-SNP标记可作为辣椒基因分型、图谱构建等的候选分子标记。     

辣椒抗黄瓜花叶病毒（CMV）育种的进展

从ＣＭＶ株系的分化，抗ＣＭＶ种质资源的筛选，抗ＣＭＶ的遗传规律和抗ＣＭＶ育种的方法及成就四个方面综述了国内外近三十年来的辣椒抗ＣＭＶ遗传与育种研究进展，并提出了提高我国辣椒抗ＣＭＶ育种效率的若干建议。     

辣椒抗黄瓜花叶病毒病研究进展

近年来,辣椒生产中黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)病危害日趋严重,本综述对黄瓜花叶病毒的基因组结构、株系类型、传播媒介、防治方法、辣椒中CMV抗源筛选、抗性基因定位和连锁分子标记开发等方面进行了总结,以期为今后辣椒CMV抗病育种和解析CMV抗性分子机制提供借鉴和参考。     

线辣椒病毒病发生调查及综合防治

线辣椒发生病毒病后结实极少，一般结椒数比健株减少55％，而且椒短、颜色黄白、弯曲、肉薄、商品性差。该病由多种病毒侵染引起，主要是黄瓜花叶病毒（CMV）和烟草花叶病毒（TMV）。一般6月上中旬发病，7月下旬出现第1次发病高峰，8月下旬至9月中旬出现第2次发病高峰。6月下旬至7月上旬发病较轻，第1层果初红时发病开始加重，直至收获。     

江苏莲藕主产区黄瓜花叶病毒病发生分布调查

由黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)等引起的病毒病害是限制莲藕产量和品质的重要因素之一。采用酶联免疫吸附法(ELISA),调查了江苏省莲藕主产区CMV的发生分布状况。调查结果表明,43份莲藕样品中共检测到28份阳性样品,侵染率达65.12%,其中扬州宝应、邗江及苏州吴中地区的检出率依次为75%、58.6%和100%;表现黄化、花叶及皱缩花叶症状的莲藕叶片中CMV的检出率达100%,黄斑、皱缩、斑驳以及无症莲藕叶片中也均有检出,表明CMV在江苏莲藕上发生普遍,且可能产生多种症状类型。     

我国辣椒种质资源对黄瓜花叶病毒的抗性及相关分析

选择了363份来源于我国31个省、市的辣椒地方品种作为试验材料,对其进行黄瓜花叶病毒(CMV)的人工接种抗性鉴定,结果显示:供试材料中抗病(R)材料2份、中抗(MR)材料124份、感病(S)材料237份。同时对供试材料的CMV抗性与花期、株高2个性状进行相关性分析,结果表明:花期与CMV抗性之间为极显著的正相关,株高与CMV抗性之间为极显著的负相关。对CMV抗性较强的供试材料中,羊角椒、圆锥椒、指形椒和线椒占有较大比例;来源于华中地区和华东地区的抗病性材料所占的比例较其他地区高。     

黄瓜花叶病毒病防治策略研究进展

针对黄瓜花叶病毒病防治现状,分析不同防治策略的优缺点,指出药剂防治、生物制剂、疫苗等由于污染环境、防效不明显等原因,在防治CMV上的应用受到越来越多的限制;常规育种由于缺少抗源及育种周期长,在抗CMV育种上成效较低.转基因技术由于基因资源丰富、育种周期短、抗性稳定、不污染环境等优点,在抗CMV研究上有较广泛的应用价值,获得了一批对CMV有较好抗性的转基因植株.运用植物细胞工程技术结合理化诱变因子诱变筛选抗CMV突变体,为创造抗CMV突变系提供了有益的尝试.     

青椒品种抗CMV和TMV苗期鉴定

病毒病是青椒主要病害之一,以黄瓜花叶病毒(CMV)和烟草花叶病毒(TMV)为主。青椒罹病后植株畸形、矮化,严重影响正常生长,产量下降。为了弄清国内品种对二种病毒的抗性强弱,本试验采用苗期人工接种方法,对国内部分主要栽培品种进行鉴定。     

辣椒抗黄瓜花叶病毒遗传育种研究的回顾与展望

黄瓜花叶病毒(CMV)是辣椒的主要病害之一。通过回顾辣椒抗黄瓜花叶病毒的种质资源研究、抗病育种以及相关分子标记和数量遗传的研究进展,进一步展望了我国辣椒抗黄瓜花叶病毒育种的发展方向。     

杭州地区辣椒病毒病病原分子鉴定

辣椒等茄科蔬菜病毒病发生普遍,一种作物往往遭受数十种植物病毒的侵染,是典型的病毒库。近年来随着蔬菜栽培密度的不断提高,反季节栽培和设施栽培的不断扩大,蔬菜病毒病呈逐年上升趋势,除了在番茄、黄瓜等茄果类蔬菜上发生外,辣椒也有     

黄瓜绿斑驳花叶病毒病生防菌株的分离与筛选

从黄瓜绿斑驳花叶病毒（Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV）病发病严重的田块采集黄瓜健株和病株,从不同生境（土壤、根围、叶围、茎围、根内、茎内和叶内）分离得到587株生防细菌。通过对各菌株胞外酶（葡聚糖酶、纤维素酶、蛋白酶和几丁质酶）活性及产嗜铁素活性进行测定,根据不同指标对菌株进行赋值,选择出157个菌株。进一步对其进行指纹图谱聚类分析,根据ARDRA图谱分析,筛选出47个菌株。通过47个菌株温室防效试验,发现9株菌株的防效达40%以上,其中菌株HW2的防效高达57.02%,其来源于嗜麦芽寡养单胞菌属（Stenotrophomonas maltophilia）,另外8个均来源于芽孢杆菌（Bacillus sp.）,其中3个为枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）。对47个菌株的活性赋值和温室防效进行相关性分析,相关系数为0.83。通过试验建立了针对CGMMV筛选生防菌株的系统,该系统可以为其他病毒病害生防菌株筛选提供参考。     

辣椒抗CMV种质资源筛选及SRAP分析

以收集的283份辣椒种质为试材,采用人工接种方法进行CMV抗性鉴定,在抗性筛选基础上进一步对鉴定出的抗性种质进行分子遗传多样性分析,以期为辣椒抗CMV相关育种的亲本选择选配、抗性遗传改良等提供指导。结果表明:从283份辣椒种质中筛选出抗CMV辣椒种质1份、中抗CMV辣椒种质28份,为辣椒抗CMV育种提供物质材料;SRAP分析将抗性辣椒种质分为两大类,明确了29份辣椒种质的遗传关系。     

辣椒病毒病发病原因及防治措施

春、夏、秋季节在我县经常发生辣椒病毒病,尤其在老菜区发病较重,果实畸形,商品性较差,严重影响辣椒产量和质量,经济损失惨重。辣椒病毒病症状较为复杂,病毒类型有黄瓜花叶病毒（CMV）和烟草花叶病毒（TMV）2种。现将其发病原因及防治措施介绍如下。     

四种化学诱抗剂防治黄瓜绿斑驳花叶病毒病的试验初报

为了筛选出能够诱导瓠瓜产生黄瓜绿斑驳花叶病毒(Cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)病抗性的化学诱抗剂,在瓠瓜幼苗上分别喷施不同浓度的2,1,3-苯并噻二唑(2,1,3-Benzothiodiazole,BTH)、芸薹素内酯(Brassinolide,BL)、壳聚糖(Chitosan Oligosaccharide,CTS)、水杨酸(Salicylic Acid,SA)后,人工摩擦接种CGMMV,评价它们的相对防治效果。结果表明:接种前3 d用0.050 g·L-1 BTH、5.0×10-5 g·L-1 BL、1.0 g·L-1 CTS、0.138 g·L-1 SA处理均可使瓠瓜CGMMV的病情指数降低,其中5.0×10-5 g·L-1 BL防效最佳,达70.38%。进一步研究表明,BL、CTS、SA以喷药后3 d为最佳诱导时间,而BTH为喷药后1 d。4种化学物质均能诱导瓠瓜对CGMMV产生抗性,其抗性差异与诱抗剂种类、浓度及诱导时间相关。     

番木瓜转录组学研究进展北大核心

转录组学的发展为挖掘番木瓜的功能基因及探索相关分子机制提供了有效手段。通过检索番木瓜相关转录学研究的文献并进行了分析、总结,发现目前的研究主要集中在组培、性别分化、逆境胁迫、病害、成熟机制等方面。提出了今后在番木瓜转录组研究方面的展望:一是加强转录组、蛋白组、代谢组等多组学的联合研究;二是加强对番木瓜蛋白酶表达起关键调控作用的基因挖掘;三是探索针对番木瓜第三代测序技术的应用研究。     

基于转录组denovo拼接鉴定辣椒(Capsicum frutescens)中辣椒素生物合成相关基因

辣椒素是由辣椒果实产生的一组化合物,被广泛应用于许多领域,尤其是医药行业。辣椒素生物合成途径还没有被清楚地确定。为了解更多辣椒素生物合成的知识,我们对辣椒(Capsicum frutescens L.)胎座和果皮的混合材料进行了转录组测序。并使用不同的拼接软件对各拼接参数的影响进行了评估,最终获得了转录组数据de novo拼接的最佳策略之一。我们利用Trinity软件得到共54 045条高质量unigenes(转录物)。约92.65%的unigenes与马铃薯、番茄和辣椒(C.annuum)ESTs数据库公共蛋白序列和基因组有相似性。我们预测到了3个新的结构基因(DHAD,TD,PAT),填补了由Mazourek提出的辣椒素分子合成途径中的空缺,并且以KEGG(京东基因与基因组百科全书)分析为基础,鉴定到了参与辣椒素生物合成新的候选基因。大量的SSR(简单重复序列)和SNP(单核苷酸多态性)标记在C.frutescens和C.annuum序列中被预测到,这些标记可在识别辣椒群体多态性方面提供帮助。这些数据将为辣椒素生物合成途径及相关研究提供新的思路。此外,我们的转录组de novo拼接策略也可用于其他大量类似研究中。     

黄瓜花叶病毒病和绿斑花叶病毒病的发生与防治

1 黄瓜花叶病毒病 1．1症状 1）花叶型。新叶上出现黄绿相间的症状,叶片成熟后变小、皱缩、边缘卷曲。瓜条上出现深浅绿色相间的花斑,染病后瓜条生长缓慢、畸形。     

辣椒全基因组WRKY转录因子的分析

基于已公布的辣椒全基因组数据,利用生物信息学方法对辣椒WRKY转录因子家族进行全面鉴定和系统命名,并在此基础上对基因分类、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了研究。结果表明:辣椒CaWRKY家族包含71个基因,根据WRKY结构域的数量及锌指结构的特征可将其分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ等3大类,GroupⅡ又可分为Ⅱ(a)、Ⅱ(b)、Ⅱ(c)、Ⅱ(d)和Ⅱ(e)等5个亚类。辣椒12条染色体上均有WRKY转录因子分布,其中第1号染色体上分布最多,共有10个,第4号染色体上分布最少,仅有2个。辣椒每类/亚类WRKY几乎含有相同的保守基序。辣椒WRKY编码的蛋白在132~869个氨基酸范围内,平均氨基酸数量为373个。