快速高效miRNA分析流程在黄颡鱼中的应用

高通量测序技术速度快、成本低、通量高,广泛应用于miRNA领域研究。本研究基于高通量测序技术所产生的海量小RNA数据,结合已有的数据分析软件,开发了一套快速高效一键化的miRNA分析流程。该流程整合多个生物信息学数据分析软件,对多个miRNA高通量测序数据集进行标记、整合和去冗余分析,只需运行一次核心程序就可以实现对多个miRNA高通量测序数据的分析,避免每个样本单独数据分析的技术重复,精简后的数据集能大幅度减少软件计算量,显著提高软件运行效率。本研究利用快速高效miRNA分析流程分析黄颡鱼性腺XX卵巢、XY精巢、YY精巢的miRNA高通量测序数据,获得一批准确的黄颡鱼保守miRNA。在相同参数设置下,miRNA分析流程可以显著节约分析时间。该流程最终输出结果为多样本整合后的miRNA表达数据,便于研究者直接进行样本之间的比较和miRNA的表达差异,减少研究者手动整合分析结果的操作步骤。miRNA分析流程针对多样本miRNA测序数据具有明显的优势,样本越多测序量越大,软件运行效率越高。针对日益积累的海量小RNA测序数据,miRNA分析流程高效快速一键化数据处理优势将会越来越明显。     

波纹唇鱼肌肉中营养成分分析

通过对波纹唇鱼肌肉氨基酸、脂肪酸等营养成分的测定和分析,评估和讨论其肉质的风味特征。结果表明,波纹唇鱼Cheilinus undulates的含肉率为71.5%,肌肉中粗蛋白、粗脂肪、粗灰分、水分的含量分别为18.98%、1.56%、1.23%、76.33%;测定的18种氨基酸总量为878.1mg/g(干重),4种鲜味氨基酸含量为355.3mg/g(干重),是其美味的主要因素。DHA和EPA的含量分别为2.00和9.51mg/g,DHA和EPA含量占脂肪酸总量的12.76%。     

蓝圆鲹肌肉中营养成分分析与评价

为了测定蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)肌肉中的营养成分,并对其营养价值进行系统的分析及合理的评价,采用国家标准生化测定方法检测蓝圆鲹肌肉中的水分、粗蛋白质、粗脂肪、粗灰分、氨基酸、脂肪酸及矿物质。结果显示,蓝圆鲹肌肉中水分含量为75.00%,粗蛋白质、粗脂肪及粗灰分的干重含量分别为79.52%、9.88%和4.16%;共检出18种氨基酸,总含量为75.24%(干重),必需氨基酸占氨基酸总含量的30.08%,谷氨酸含量最高(11.40%),主要的限制氨基酸是色氨酸和缬氨酸,必需氨基酸指数EAAI为83.32;共检出17种脂肪酸,棕榈酸含量最高(2.60%),EPA+DHA含量为2.20%;富含磷(P)、钾(K)、钙(Ca)、钠(Na)、镁(Mg)等矿物质元素,常量元素中磷的含量最高(2 193.99 mg/kg),微量元素中铁的含量最高(22.25 mg/kg)。研究表明,蓝圆鲹是高蛋白低脂肪、营养价值及经济价值均较高的优质海洋经济鱼类,具有较好的综合开发利用价值。     

鳗鲡肌肉生化成分的分析

测定了江河成鳗肌肉生化成分正常值,脂肪含量高达18.3%,是一种多脂肪鱼类.     

黄鳝肌肉营养成分的分析

对黄鳝的稚鳝（体重9.2-15.5g)、幼鳝（体重62.3-76.0g)、小成鳝（体重108.3-121.4g)和大成鳝（体重222.8-242.8g)肌肉中的水分、蛋白质、脂肪含量及脂肪酸、氨基酸的组成进行了分析,结果表明：黄鳝肌肉中的蛋白质含量高达18.79%-19.93%,脂肪含量较低。高度不饱和脂肪酸含量占脂肪酸总量的19.15%,必需氨基酸的含量上中氨基酸总量的40.98%,谷氨酸的含量很高,为氨基酸总量的16.95%。     

日本七鳃鳗肌肉脂肪酸的组成分析

日本七鳃鳗Ｌａｍｐｅｔｒａｊａｐｏｎｉｃａ ,隶属于圆口纲 (Ｃｙｃｐｏｓ ｔｏｍａｔａ) ,七鳃鳗目 (Ｐｅｔｒｏｍｙｚｏｎｉｆｏｒｍｅｓ) ,七鳃鳗科 (Ｐｅｔｒｏｍｙ ｚｏｎｔｉｄａｅ )。主要分布在太平洋北部 ,南至日本、朝鲜沿岸 ,北至阿纳德尔和阿拉斯加。在中国主要分布于黑龙江、松花江、乌苏里江和图们江水系。目前 ,对日本七鳃鳗的研究仅局限于形态结构、生态分布以及生活习性[1～ 6] ,有关日本七鳃鳗脂肪酸组成的分析研究 ,尚未见报道。为了合理开发、利用这一特种水产资源 ,本文分析了日本七鳃鳗肌肉中脂肪酸的组成 ,为日本…     

丁鱥肌肉脂肪酸组成的分析

采用气相色谱仪对丁鱥肌肉脂肪酸的组成进行了分析，结果显示，该鱼肌肉中可检测到16种脂肪酸，且以C16、C18、C22三个系列脂肪酸为主；饱和脂肪酸占脂肪酸总量的26．29％，不饱和脂肪酸占脂肪酸总量的73．71％，其中单不饱和脂肪酸占53．45％，多不饱和脂肪酸占20．26％。     

大西洋鲑肌肉营养成分分析

利用常规方法测定大西洋鲑肌肉中水分、粗蛋白、粗脂肪、灰分、粗纤维、无氮浸出物等营养成分进行分析检测。结果表明:大西洋鲑肌肉鲜样中水分含量为73.62%,粗蛋白含量为19.40%,粗脂肪含量为4.52%,灰分含量为1.93%,,无氮浸出物含量为0.53%。大西洋鲑肌肉(干样)蛋白质中含有氨基酸16种,氨基酸总量为73.69%,必需氨基酸7种,必需氨基酸总量为31.40%,鲜味氨基酸4种,鲜味氨基酸总量为30.29%,蛋白质,鲜美程度优于草鱼、白甲鱼和鳙鱼,略低于鳜鱼和黄鳝,是一种具有较高开发养殖价值的水产优良品种。     

黄尾密鲴肌肉营养成分分析

黄尾密鲴的含肉率为 82 .6 0 % ,肌肉中蛋白质占 17.90 % ,脂肪占 1.4 0 % ,水分占 79.32 % ,灰分占1.2 1%。含有 18种氨基酸 ,总量为 17.32 % ,其中人体 8种必需氨基酸占总量的 4 2 2 6 %。测定了Zn、Fe、Mg等微量元素和K、Ca、Na、P、Mn等营养元素的含量     

不同管理方式下秋季刺参养殖环境中菌群结构分析

2017年11月(秋季),在辽宁省大连市青堆子海域(N39.78°,E123.32°)的自然纳潮、微孔曝气和养水机调水3种管理方式的矩形海参(Apostichopus japonicus)养殖池塘中,按照《国家海洋调查规范》(GB/T12763)规定的方法采集水样和泥样,用高通量测序技术研究秋季不同水质调控方式下刺参养殖池塘水体和底泥中菌群群落结构特征。试验池塘面积为5.1 hm²,南深北浅,泥沙池底,实验期间各池塘不投饵和药。结果显示:三种池塘的底泥菌群多样性要高于水体中;养水机池塘水体中的菌群多样性高于其他两种池塘,微孔曝气池塘底泥中菌群多样性最高。水样和泥样中第一优势菌门都是变形菌门(Proteobacteria);次优势菌门有所不同,养水机、微孔曝气和自然纳潮池塘中,水样和泥样分别为:厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和绿湾菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)。三种池塘内优势菌群群落构成相同,但其各自门、纲和属的...     

应用高通量测序技术分析大菱鲆幼鱼肠道及其养殖环境的微生物群落结构

采用基于Illumina测序平台的高通量测序技术,对大菱鲆(Scophthalmus maximus)幼鱼肠道及其养殖水体、生物饵料中细菌种类及丰度进行研究。测序结果显示,养殖水体、生物饵料和大菱鲆幼鱼肠道等19个样品共获得有效序列547621条,可聚类于3771个可分类操作单元(OTUs),归属于养殖水体、生物饵料、健康幼鱼和发病幼鱼的操作分类单元(OTU)个数分别为3038、1090、87和777,其中,健康幼鱼与生物饵料、健康幼鱼与养殖水体特有的OTU个数分别为57和0,发病幼鱼与生物饵料、发病幼鱼与养殖水体特有的OTU个数分别为481和31。表明幼鱼肠道微生物多样性与生物饵料密切相关。根据细菌注释结果,拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)在大菱鲆幼鱼肠道中占优势地位,其中,健康幼鱼肠道微生物共聚类为8个门,发病幼鱼的肠道微生物可聚类为19个门。与健康幼鱼相比,发病幼鱼肠道门水平上的3种主要优势菌群落结构出现失衡。此外,对各样品中丰度最高的100位OTU分析显示,幼鱼肠道优势菌种类与生物饵料中的优势菌种类密切相关,而每个发病幼鱼肠道优势菌种类具有一定的独立性。本研究旨在为大菱鲆健康养殖和微生态调控提供实验依据。     

棒花鱼肌肉主要营养成分分析

对棒花鱼进行了主要营养成分分析,并对其营养价值进行了评价.结果表明:棒花鱼肌肉粗蛋白含量为16.82％,水分含量为79,46％;棒花鱼肌肉中测出18种氨基酸,总量为14.05％,必需氨基酸总量为5.87％,占氨基酸总量的41.48％,必需氨基酸构成符合FAO/WHO对于膳食蛋白质营养评价理想模式.4种风味氨基酸总量为4...     

鳡鱼肌肉脂肪酸组成分析

为了给鳡鱼的营养学研究及饲料研制提供基础数据和理论分析依据,采用盐酸水解法处理鳡鱼肌肉的样品,以美国SUPELCOINC公司生产的PUFA-1、PUFA-2进行定性,按归一化法计算脂肪酸含量,对鳡鱼肌肉中的脂肪酸进行了测定和分析。结果表明:鳡鱼肌肉中含有13种脂肪酸,其中饱和脂肪酸4种,不饱和脂肪酸9种。饱和脂肪酸的质量分数占脂肪酸总质量分数的24.69 %,不饱和脂肪酸的质量分数占脂肪酸总质量分数的75.30 %,其中单不饱和脂肪酸的质量分数占脂肪酸总质量分数的28.79 %,多不饱和脂肪酸的质量分数占脂肪酸总质量分数的46.51 %;鳡鱼肌肉中的脂肪酸主要由C16∶[KG-*1/2]1、C18∶[KG-*1/2]3n-3、C18∶[KG-*1/2]2n-6和C16∶[KG-*1/2]0等4种脂肪酸组成,这4种脂肪酸的质量分数之和占脂肪酸总质量分数的69.35 %。鳡鱼肌肉脂肪酸种类组成及比例与其他鱼类相比有一定差异,较符合人体需求。     

镜鲤肌肉品质性状的微卫星标记分析

利用233个微卫星标记检测镜鲤（Cyprinus carpio L.）一个家系的107尾个体的基因型,采用GLM方法对肌肉脂肪含量和蛋白质含量4种经济性状进行单标记回归分析。 Permutation检验结果显示：有17个标记分别与肌肉脂肪和蛋白质含量具有显著相关性（P〈0.05）,其中,有4个标记（HLJ030、HLJ2560、HLJ3633,和HLJ3554）与肌肉蛋白质含量呈极显著相关（P〈0.01）,表明这些标记与性状间可能存在连锁关系。对同一标记不同基因型之间进行了多重比较,找到了与这两种性状相关的优势基因型,为鲤的肌肉品质性状选育提供了有效的依据。     

虹鳟鱼肌肉营养成份的分析

采用国标所规定的方法，对虹鳟鱼肌肉的营养成分进行了测定，其粗蛋白为20．5％，粗脂肪为3．34％，水分为73．6％；用氨基酸自动分析仪测定了18种氨基酸含量，并与青鱼、草鱼、兴国红鲤、鲢鱼、鳙鱼的营养物质含量进行对比分析，结果表明：虹鳟的蛋白质含量、脂肪含量以及必需氨基酸的含量均高于上述几种淡水鱼类。     

基于高通量测序的长江口中华绒螯蟹雌蟹食性分析

为探究长江中华绒螯蟹雌蟹抱卵前后的食性,在长江口东滩水域采集生殖洄游期中华绒螯蟹雌蟹,采用高通量测序技术,解析其抱卵前后的食物种类组成及其食性特征。试验结果显示,37个食物样品的高质量序列为53 288～90 598个。通过聚类分析共得到423个运算分类单元(OTU),筛选有效序列后,经比对获得的食物类别包括藻类、高等植物、鱼类、甲壳类、软体动物、轮虫、原生动物等。雌蟹抱卵前食物组成中占比较高的类别为高等植物、甲壳动物和鱼类;而在抱卵后食物组成中占比较高的种类为高等植物和藻类。抱卵前的Chao1指数和ACE丰富度指数显著大于抱卵后的,抱卵前、后的Shannon和Simpson多样性指数均无显著性差异。研究结果表明,中华绒螯蟹雌蟹摄食宽度较广,属于机会主义摄食者,亲蟹抱卵前后的食性具有一定的差异性。研究结果揭示了生殖洄游期中华绒螯蟹雌蟹的食物种类组成及雌蟹在抱卵前、后的食性变化特征,并为长江口中华绒螯蟹资源增殖和保护提供科学依据。高通量测序分析技术具有生物检测灵敏度较高的特点,可在一定程度上揭示水生动物的食物种类组成信息,但仍需与传统的胃含物形态学分析方法相结合,以便更准确全面地解析其食...     

棕点石斑鱼的肌肉营养成分分析

试验结果表明,棕点石斑鱼的含肉率为77.3%,肌肉中粗蛋白、粗脂肪、粗灰分和水分的含量分别为18.8%、2.2%、1.16%和77.1%;18种氨基酸总量为18.22%(占鲜样),其中人体必需的8种氨基酸含量为6.88%,占氨基酸总量的37.36%,4种鲜味氨基酸含量为7.11%.其氨基酸构成比例符合FAO/WHO标准.必需氨基酸指数(EAAI)为514.DHA和EPA含量丰富,占脂肪酸总量的28.2%.     

点带石斑鱼的肌肉营养成分分析

点带石斑鱼(Epinephelus malabaricus)的含肉率为74.1%,肌肉中粗蛋白、粗脂肪、粗灰分和水分的含量分别为19.14%、1.41%、0.99%和76.63%;18种氨基酸总量为21.85%(占鲜样),其中人体必需的8种氨基酸含量为8.87%,占氨基酸总量的40.59%,4种鲜味氨基酸含量为8.53%.其氨基酸构成比例符合FAO/WHO标准.必需氨基酸指数(EAAI)为103.DHA和EPA含量丰富,占脂肪酸总量的21.88%.