水产品中4种常见致病菌多重PCR检测方法的建立及评价

根据金黄色葡萄球菌的耐热核酸酶基因nuc、沙门氏菌的侵袭蛋白基因invA、志贺氏菌的侵染性质粒抗原H基因ipaH和副溶血性弧菌的毒力表达调控基因toxR设计引物,建立一种快速检测水产品中上述4种常见食源性致病菌的多重PCR方法。结果显示,沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、志贺氏菌及副溶血性弧菌的多重PCR扩增片段产物大小分别为549、426、348和243 bp,该检测方法具有良好的特异性和灵敏度。设计优化了可用于水产样品中4种目标致病菌的共增菌培养基,该方法应用于35份实际水产样品的检测,并与国标方法对比验证,4种致病菌的整体符合率达94%以上,两种检测方法无显著性差异(P>0.05)。可见,该多重PCR方法可应用于水产品中沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血性弧菌及志贺氏菌4种食源性致病菌的快速检测和分子流行病学调查。     

5种食源性致病菌多重PCR检测方法的建立

本研究建立一种同时特异性地检测5种常见食源性致病菌的多重PCR方法。根据目前食品中常见病原菌副溶血弧菌Vibrio parahaemolyticus、金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus、单核细胞增生性李斯特菌Listeria monocytogenes、肠炎沙门氏菌Salmonella enteritidis、福氏志贺氏菌Shigella flexneri的相关毒力基因,选择具有特异性的副溶血弧菌不耐热溶血毒素基因、金黄色葡萄球菌的耐热核酸酶基因、单核细胞增生性李斯特菌编码溶血素O基因、沙门氏菌侵袭蛋白A基因及志贺氏菌侵袭性质粒抗原H基因,设计5对特异性引物进行多重PCR检测,对反应条件进行优化并评价了其特异性和灵敏度。通过对48份实际样品检测,验证了此多重PCR体系具有很好的可靠性和实用性。     

鲁氏耶尔森菌qPCR快速检测方法的建立和应用

鲁氏耶尔森菌(Yersinia ruckeri)是导致虹鳟(Oncorhynchus mykiss)肠炎红嘴病的病原。本研究以鲁氏耶尔森菌毒力因子rup A基因为靶标设计1对特异性引物,以含有rup A基因部分序列的重组质粒为标准品构建标准曲线,优化建立检测鲁氏耶尔森菌的SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法,并对腹腔注射鲁氏耶尔森菌菌悬液的虹鳟肝、肾、脾、血液样品进行检测。结果显示,设计的引物具有良好的种间特异性,标准曲线线性方程为y=–3.3766x+40.012(R~2=0.9958);最低检测限为57 copy/μL,较常规PCR的灵敏度高出约100倍。应用检测结果表明,本方法可准确检测被鲁氏耶尔森菌感染的虹鳟样品。研究表明,所建立的qPCR方法具有特异、灵敏、快速、定量的优点,可用于快速诊断虹鳟肠炎红嘴病早期病症及定量检测鲁氏耶尔森菌。     

PCR法在鸡毒支原体污染检测中的应用

[目的]利用PCR技术,探究鸡毒支原体(MG)的检测方法。[方法]针对MG脂蛋白的基因序列,建立PCR扩增体系,测定其灵敏度和特异性,并对鸡胚样品进行检测。[结果]PCR扩增得到了400bp的基因片段,最低检出浓度为0.2 pg·μL~(-1);该PCR法仅与MG的DNA反应,与大肠杆菌、猪肺炎支原体、新城疫病毒、沙门氏菌的DNA或cDNA反应结果均为阴性;利用该PCR对鸡胚样品进行检测,核酸阳性率为76%。[结论]该研究初步建立了基于MG脂蛋白基因的特异性PCR检测方法,为MG的临床检测奠定了基础。     

饲料中沙门氏菌的污染现状及检测方法探究

沙门氏菌是一类革兰氏阴性、长有鞭毛的兼性需氧菌,多数存在于动物的排泄物中,其引起食物中毒的发病率极高.本文对沙门氏菌的三种主要检测方法:微生物学检测法、酶联免疫吸附法、PCR快速检测技术的实验方法、注意事项以及优缺点进行探究,对于更为准确快速鉴定沙门氏菌,防止沙门氏菌进一步蔓延具有一定的意义.     

用nested—PCR方法快速检测鲑鱼肾杆菌

描述了用嵌套式聚合酶链式反应(nested PCR)快速检测鲑鱼细菌性肾病病原鲑鱼肾杆菌的方法。以BKDR和BKDF为引物,扩增鲑肾杆菌编码57kDa主要可溶性蛋白基因中501bp的DNA片段,再用引物BKDR2和BKDF2扩增其中长度为314bp的DNA片段。用其它15种常见鱼类致病菌验证这两组引物的特异性,结果没有非特异性的DNA片段被扩增出来。用酚抽提法和煮沸加冻融的方法获得的细菌裂解产物,PCR检测的灵敏度均可达到1.8×103CFU·mL-1,用Nested PCR进一步扩增PCR扩增的产物,检测灵敏度可再提高100倍。检测鲑鱼肾杆菌菌悬液与鲟卵的混合物,结果表明,该方法能准确、可靠、快速地检测鲑肾杆菌。     

贝类派琴虫PCR检测方法的建立及初步应用

根据派琴虫的基因保守序列设计了特异性引物,对派琴虫的DNA进行PCR扩增并将产物克隆到pMD18-T载体后测序.结果表明,扩增大小为596bp,与预期扩增序列同源性为99.8%.该PCR方法检测灵敏度高,最低可检测1pg的派琴虫DNA;特异性强,对荧光假单胞菌、嗜水气单胞菌、大肠杆菌、葡萄球菌、副溶血孤菌、沙门氏菌、诺瓦克样病毒等贝类病原体的扩增均为阴性.用该PCR技术对广西沿海的104份牡蛎、49份贻贝和20份文蛤病料进行检测,阳性率分别为14.6%、10.6%和15.0%.结果显示,派琴虫广泛存在于中国南方沿海的养殖贝类中,建立的PCR方法可用于贝类派琴虫的临床快速检测.     

爱德华氏菌常规PCR检测体系的建立

根据NCBI公布的爱德华氏菌(Edwardsiella ictaluri)磷酸丝氨酸转氨酶(phosphoserine transaminase,serC)的基因序列,设计一对特异性引物,建立了可快速而准确地检测爱德华氏菌的PCR方法,并对患病鱼组织进行了检测。研究结果表明,使用设计的引物能够扩增出与预计大小一致的124 bp的特异性片段,具有较好的检测特异性,对靶标DNA的检测灵敏度为50 pg/反应,对靶标细菌的检测灵敏度为56 cfu/反应。样品的检测结果与实际发病情况一致,表明成功建立了爱德华氏菌常规PCR检测方法,可用于爱德华氏菌病的诊断。     

广西鸡源肠炎沙门氏菌的分离与鉴定

对广西壮族自治区3个鸡场疑似沙门氏菌感染发病鸡进行细菌分离，并对分离菌株进行染色镜检、生化实验、血清学鉴定、DNA测序、动物回归试验和药敏试验。结果共分离到6株沙门氏菌，生化特征和血清学特征符合肠炎沙门氏菌特性；DNA测序结果与肠炎沙门氏菌同源性为100%;动物回归试验表明，分离菌株能致死SPF鸡，并复制出与临床表现一致的病例；药敏试验结果表明，分离菌株对诺氟沙星和阿米卡星高度敏感，为广西地区鸡源沙门氏菌病的防治提供参考依据。     

鰤鱼诺卡氏菌SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用

根据GenBank中蛳鱼诺卡氏菌16S-23S rRNA基因序列设计并合成一对特异性引物,经反应体系优化后建立了检测蛳鱼诺卡氏菌的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法。结果显示,该方法线性关系良好,标准曲线的相关系数为0.998;溶解曲线分析显示产物为单一的特异峰;检测灵敏度可达10 6μg/μL的DNA含量,与嗜水气单胞菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、副溶血弧菌、麦氏弧菌不发生交叉反应,具有良好的特异性。应用建立的方法在蛳鱼诺卡氏菌病爆发时期,对16份鱼体组织、养殖水体、饲料等样品进行了检测,结果 7份为阳性,与细菌分离、培养检查结果 100%相符。既能检测发病鱼,又能检出未发病且已感染的病鱼,对病害的早期防控体现应用价值。结果表明,建立的实时荧光定量PCR方法具有特异、敏感、快速、定量等优点,可用于蛳鱼类致病鱼诺卡氏菌的快速检测。     

Molecular cloning of Yersinia ruckeri aroA gene: a useful taxonomic tool

The aroA gene of Yersinia ruckeri , which encodes 5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate (EPSP) synthase was cloned by complementation of the aroA mutation in Escherichia coli AB2829 by using pUC18 plasmid as a vector. Nucleotide sequence of the aroA gene revealed an open reading frame of 427 amino acids showing a high degree of homology to other bacterial AroA proteins. A pair of primers with 23 and 20 nucleotides were selected from the 5' and 3' termini, respectively, and formed the basis of a specific polymerase chain reaction (PCR) assay. A 1165-bp deoxyribonucleic acid (DNA) fragment was amplified from all lysed Y. ruckeri strains. An identical size fragment was also amplified from lysed Y. pseudotuberculosis , Y. aldovae , Salmonella enteritidis and E. coli , but not from other enterobacteria. Alu I restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the PCR amplified products allowed for differentiation between Y. ruckeri and the other bacteria. Specificity and sensitivity make this PCR assay a useful method for rapid identification and diagnosis of Y. ruckeri infections.     

温和气单胞菌PCR快速诊断方法的建立

根据NCBI公布的温和气单胞菌(Aeromonas sobria)丝氨酸蛋白酶的基因序列,设计并选取一对能够快速而准确地检测温和气单胞菌的PCR引物,建立PCR快速检测体系,并对患病的鱼组织进行检测。研究结果表明,使用设计的引物能够扩增出与预计大小相符合的131 bp的特异性片段,具有较好的检测特异性,对靶标DNA的检测灵敏度为1.0 pg/20μL,对温和气单胞菌的检测灵敏度为50 cfu/20μL。样品的检测结果与实际发病情况一致,表明本研究成功建立了温和气单胞菌常规PCR检测体系,该体系可以用于温和气单胞菌的诊断和样品的检测。     

套式PCR在中华绒螯蟹颤抖病病原螺原体检测中的应用

提取人工分离、培养的中华绒螯蟹颤抖病病原螺原体的基因组DNA,并进行梯度稀释作为PCR模板,根据GenBank已有螺原体16S rRNA基因序列设计出套式PCR外部引物,将螺原体特异性引物作为内部引物,利用套式PCR对梯度稀释的模板进行扩增,得到271 bp产物,对照已有的一步PCR检测法,检测灵敏度提高100倍,最小检测达15.5 fg数量级螺原体DNA,从而建立更为灵敏的中华绒螯蟹颤抖病病原螺原体的检测方法。     

Multiplex nested-polymerase chain reaction for the simultaneous detection of Aeromonas hydrophila, Edwardsiella tarda, Photobacterium damselae and Streptococcus iniae, four important fish pathogens in subtropical Asia

A multiplex nested-polymerase chain reaction (PCR)-based (m-nested PCR) method was developed for simultaneous detection of four important freshwater/marine fish pathogens in subtropical Asia, including Aeromonas hydrophila, Edwardsiella tarda, Photobacterium damselae and Streptococcus iniae . The specificity of the oligonucleotide primers used for PCR detection was confirmed to generate specific amplicons for the corresponding pathogens. Moreover, non-specific amplicons were observed when the primers were tested using pure DNA extracted from 31 related bacterial strains belonging to 23 species or tissue homogenates of infected tilapia. This m-nested PCR approach could detect 19 colony forming unit (CFU) for A. hydrophila , 62 CFU for E. tarda , 280 CFU for P. damselae subsp. piscicida and 179 CFU for S. iniae in infected tilapia kidney homogenates, consistent with the results derived from bacteriological methods. The assay described in this paper is a sensitive and effective method for simultaneous detection of multiple fish pathogens.     

环介导恒温扩增技术检测血卵涡鞭虫

血卵涡鞭虫病是海水甲壳类的重要寄生虫病,其流行范围广、死亡率高、危害非常严重。本研究根据GenBank中已登录的血卵涡鞭虫(Hematodinium sp.)ITS1序列设计了1套引物,该引物可识别目标基因中6个不同区段。以此套引物建立了一种基于环介导恒温扩增技术(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)的血卵涡鞕虫病诊断方法。特异性试验结果表明,该套引物对血卵涡鞕虫检测具有较高的特异性,能有效检出血卵涡鞕虫。敏感度试验结果表明,该LAMP技术的灵敏度比常规PCR技术高4个数量级。分别运用LAMP和常规PCR技术对25份临床疑似病例进行检测,LAMP方法共检出感染病例25份,常规PCR检出感染病例23份。该技术能在65℃恒温条件下45～60min完成目的DNA的扩增,可直接通过肉眼观察反应产物中是否产生白色沉淀或经SYBRGreenI染色后通过颜色变化、扩增产物的琼脂糖凝胶电泳来定性判断结果,这将为血卵涡鞕虫病的临床诊断提供一种更加简便、快速、实用的方法。     

植酸酶对肉鸡生产性能和胴体品质及肉质性状的影响

为了研究植酸酶不同添加量对肉鸡生长和胴体品质的影响。选择2周龄青脚麻鸡142只,随机分成4组。试验Ⅰ组、Ⅱ组和Ⅲ组用500g/t植酸酶分别代替60%、70%和80%的磷酸氢钙,试验Ⅳ组为对照组。试验结果表明:用植酸酶取代60%的磷酸氢钙,肉鸡的日增重和饲料报酬均优于其它试验组和对照组(P<0.05)。添加植酸酶后,肉鸡的屠宰率、全净膛率、半净膛率、腿比率和胸肌率与对照组相比较无显著差异;熟肉率、滴水损失率等肉质指标与对照组比较亦差异不显著,而肉的嫩度第Ⅲ组劣于其它各组。综上所述,在肉鸡日粮中以500g/t的植酸酶代替60%的磷酸氢钙可以提高肉鸡的生长性能,是最佳的替代比例。而对屠宰性能和肉质无明显影响。     

The most frequent infectious causes of abortion in sheep in north Bavaria with special reference to Chlamydia and Salmonella infections

Between 1980 and 1987 1153 ovine fetuses and placentas were examined after abortion. In 68.5% of the cases a cause of abortion could be diagnosed as follows: 43.5% Chlamydia psittaci var. ovis, 10.7% Salmonella abortus ovis, 3.7% Coxiella burnetii, 3.3% Listeria monocytogenes and 0.4% Campylobacter fetus intestinalis. Hemolyzing Escherichia coli and Streptococci, Yersinia pseudotuberculosis, Salmonella typhimurium, Salmonella enteritidis, Corynebacterium pyogenes and other facultative pathogens isolated in pure culture out of fetal organs as well as non-infectious reasons (fetal deformities) were the causes of abortion in only 7%.     

实时荧光定量 PCR 法快速检测赤潮环状异帽藻

以环状异帽藻(Heterocapsa circularisquama)ITS1区为靶序列设计了一对特异性引物,运用Real-time PCR方法,对环状异帽藻进行了定性定量检测。以其他9种赤潮微藻为对照验证其特异性。结果表明,仅含环状异帽藻DNA模板的样品有扩增,其他藻没有检测到扩增信号。以超声波破碎得到的藻液为标准品,所得标准曲线具有高度线性相关,相关系数R2为0.989,并且可以在30个循环内检测到0.5个细胞。对在不同培养条件下获得的环状异帽藻DNA样品进行检测,都能获得扩增信号。利用该方法建立的标准曲线对初步模拟现场样品进行定量检测,与显微镜计数结果基本一致。