~(60)Coγ辐射诱导马铃薯(Solanum tuberosum)基因组变异的SRAP标记分析(英文)

[目的]探讨60Coγ射线对马铃薯(Solanum tuberosum)染色体的诱变效应。[方法]采用不同辐照剂量的γ射线对费乌瑞它微型薯进行辐射处理,利用SRAP分子标记,对不同处理的VM1代及VM2代基因组变异进行分析。[结果]VM1代分析结果表明,88对引物有30对表现多态性,引物多态性比率为34.1%,共获得225条扩增条带,其中64条为多态性条带,条带多态性比率为28.4%。多态性表现形式有条带增加和缺失。选择25对有多态性的引物对VM2代进行扫描,5对显带不良,20对中有9对表现多态性,获得多态性条带9条,其中仅4条在VM1中检测到,其余5条是新增的缺失条带。VM1代的多态性条带在VM2代中的检出率仅为9.8%。选择表现稳定、清晰的9条多态性条带进行回收、克隆、测序,获得6个片段的DNA序列。经比对分析,5个片段序列与马铃薯染色体组部分片段的相似性为77%⁸9%,其中3个序列位于抗性基因簇中;另1个片段序列与番茄第5染色体的部分序列相似性为93%。[结论]γ辐照可以导致马铃薯基因组DNA发生变异,多态性条带数与辐照剂量之间没有明显的相关性,变异的多态性条带缺失数高于条带增加数。     

60Coγ辐射诱导马铃薯（Solanum tuberosum）基因组变异的SRAP标记分析（英文）

[目的]探讨60Coγ射线对马铃薯(Solanum tuberosum)染色体的诱变效应。[方法]采用不同辐照剂量的γ射线对费乌瑞它微型薯进行辐射处理,利用SRAP分子标记,对不同处理的VM1代及VM2代基因组变异进行分析。[结果]VM1代分析结果表明,88对引物有30对表现多态性,引物多态性比率为34.1%,共获得225条扩增条带,其中64条为多态性条带,条带多态性比率为28.4%。多态性表现形式有条带增加和缺失。选择25对有多态性的引物对VM2代进行扫描,5对显带不良,20对中有9对表现多态性,获得多态性条带9条,其中仅4条在VM1中检测到,其余5条是新增的缺失条带。VM1代的多态性条带在VM2代中的检出率仅为9.8%。选择表现稳定、清晰的9条多态性条带进行回收、克隆、测序,获得6个片段的DNA序列。经比对分析,5个片段序列与马铃薯染色体组部分片段的相似性为77%~89%,其中3个序列位于抗性基因簇中;另1个片段序列与番茄第5染色体的部分序列相似性为93%。[结论]γ辐照可以导致马铃薯基因组DNA发生变异,多态性条带数与辐照剂量之间没有明显的相关性,变异的多态性条带缺失数高于条带增加数。     

黑龙江省主栽马铃薯品种遗传多样性的SRAP分析

利用SRAP分子标记技术,对黑龙江省34份马铃薯主栽品种遗传多样性进行分析。结果显示,从45对引物中筛选出20对引物能在34份马铃薯品种间扩增出较好多态性片段,共扩增出DNA条带170条,多态性条带84条,多态性比率为49.4%,每对引物平均可扩增出4.2条多态性条带。聚类分析表明,34份马铃薯品种间相似系数为0.514~0.903,平均相似系数为0.671;供试材料可分为3大类7亚类。研究表明,黑龙江省主栽马铃薯品种的遗传相似性较高,遗传多样性程度较低。     

紫色马铃薯“黑美人”辐射处理表型及DNA变异鉴定

利用60 Coγ射线对紫色马铃薯品种黑美人萌芽薯块进行诱变处理。诱变材料表型鉴定结果表明,辐照剂量与出苗率呈显著负相关,其半致死剂量为70Gy,致死剂量为80Gy。辐照处理能显著延缓出苗时间,导致叶片减少、茎杆变细、植株变矮。高剂量处理可提高分枝数。与CK相比,各处理结薯数差异不显著。单株产量随辐照剂量增加而降低,CK处理显著高于其他处理。在表型鉴定的基础上,利用SSR分子标记对辐射材料进行DNA检测。10对引物集团选择结果表明,6对具有多态性,共获得10条多态性条带,平均每对引物有1.7条。单株检测共获得扩增条带28条,其中8条有多态性,多态性比率为28.9%。说明,辐射可引起紫色马铃薯黑美人表型和DNA水平的变异。     

玉米种质材料遗传多样性的ISSR分析

[目的]明确山西主要玉米品系的主要遗传多样性特点.[方法]利用ISSR分子标记技术,对供试的玉米种质资源进行遗传多样性分析.[结果]用筛选出的9个多态性高、重复性好的引物对供试种质材料进行扩增,共扩增出清晰条带74条,多态性条带56条,多态性条带比率为75.7％.应用DPS软件对试验结果进行聚类分析,构建聚类分析树状图,在遗传相似系数为0.55处,将供试种质材料分为5个类群.[结论]为今后山西玉米育种与杂交亲本的选择提供理论依据.     

金樱子随机扩增多态性DNA分析

[目的]揭示不同产地金樱子30个居群间的遗传多样性和亲缘关系.[方法]采用RAPD分子标记技术,从35条RAPD随机引物中,筛选出8条有效引物进行扩增,用NTSYSpc,ver.2.02软件进行UPGMA聚类分析.[结果]共扩增出86条带,其中多态性条带84条,多态性百分率(PPB)97.67％.30个居群的相似性系数在0.11 ～0.58,聚成A、B、C三大类群.[结论]金樱子具有丰富的遗传多态性,产自贵州地区的金樱子有较近的亲缘关系.     

81个矮牵牛自交系遗传多样性的分析

[目的]对81个矮牵牛自交系的亲缘关系进行分析.[方法]采用十六烷基三甲基溴化铵法提取矮牵牛幼叶基因组DNA,利用扩增片段长度多态性对81个矮牵牛自交系的基因组DNA进行酶切、连接、预扩增、选择性扩增.[结果]采用8对引物组合共扩增出24 351条谱带,多态性条带比率为100％,平均每对引物扩增出3 044个多态性位点.81个矮牵牛自交系的相似性系数在0.2443～0.6233之间,平均值0.4338;每个位点的有效等位基因数1.2236,平均多样性指数0.2422;遗传相似性系数较高的是4号和5号,达到0.6233,较低的是9号和92号,为0.2443.[结论]根据遗传相似性系数进行聚类分析,可将81个矮牵牛自交系分为3个类群:91号、92号聚为Ⅰ类(小花型自交系);58号、73号和78号聚为第Ⅱ类(中花型自交系);其余76个聚为第Ⅲ类(大花型自交系).第Ⅲ类根据不同色系又可分为8个小类群,其中11个通过自然变异选育的自交系为D类,与其他类群的遗传关系较远.     

棉花黄萎病抗性影响因子连锁的分子标记筛选

[目的]研究抗病性影响因子连锁的分子标记与抗黄萎病性状的一致性,筛选抗黄萎病基因,发掘其与棉花抗黄萎病性状的关系,进一步阐明棉花抗黄萎病遗传机制.[方法]研究使用37对抗黄萎病性影响因子设计的引物进行PCR扩增来探明抗病性基因在不同抗、感病棉花品种中的分布,以及与抗黄萎病性状的一致性.[结果]发现VM13、VM23、VM25、BNL0946、BNL1414、BNL1721、em6me2和em1me5这8对引物扩增出不同条带,分别来源于抗病相关蛋白的基因、基因组序列、mRNA序列、SSR和SRAP引物;其中,引物VM13、BNL1414、em6me2扩增条带与抗病品种一致率高于0.857,与感病品种一致率低于0.25.新疆自育品种较多出现的扩增条带,与新疆自育品种一致率介于0.364～0.727,平均值为0.515;与其它地区所育品种的一致率介于0.111 ～0.666,平均值为0.419.[结论]引物VM13、BNL1414、em6me2的扩增条带可以作为黄萎病抗性的分子标记鉴定指标.     

贵州马铃薯推广品种SSR分子标记及遗传多样性分析

为了鉴定马铃薯品种的亲缘关系,采用10对SSR分子标记引物,对19份贵州马铃薯生产品种进行SSR分子标记及遗传多样性分析。结果表明:10对SSR引物中5对获得60条清晰条带,其中49条为多态性条带,多态性比率为81.67%,平均每个引物的多态性条带数为9.80条。19份马铃薯品种的遗传相似性系数为0.43~1.00。经聚类分析,在遗传相似系数为0.56处全部参试材料聚在一起,在遗传相似系数为0.63处可明显聚为3个类群。第Ⅰ类群包括11份材料,第Ⅱ类群包括7份材料,第Ⅲ类群只有1个材料。在相似性系数0.65处,57.89%的参加品种聚在一起,表明参试品种的遗传背景较为狭窄。     

利用RAPD分子标记对30份山茶属种质资源进行分类分析

[目的]对30份山茶属种质资源进行分类分析.[方法]利用RAPD分子标记技术研究30份山茶属种质资源的遗传多样性,并进行分类分析.[结果]17个RAPD引物共扩增出138条带,多态性条带为129条,多态性比率为93.5％,材料间的遗传相似系数（GS）变化范围为0.605 ～ 0.855.[结论]利用NTSYS软件对RAPD扩增结果进行聚类分析,可将30份资源分为5大类群,其分类结果与张宏达分类体系基本一致.     

内蒙古自治区马铃薯常见品种差异性分析

本研究利用单序列重复(Simple Sequence Repeat,SSR)分子标记技术对内蒙古36份马铃薯品种进行基因组扩增分析.结果表明,供试的11对引物共扩增出70条条带,其中多态性条带66条,多态性百分率94.2％,平均扩增片段数和扩增多态性均呈现较好的效果.聚类分析结果表明,按不同聚类方法可分别将36份材料聚...     

基于ISSR分子标记分析新疆野杏遗传多样性

[目的]通过ISSR分析标记技术,分析新疆野杏种质资源的遗传多样性,为该资源的利用和保护提供理论依据和技术支持.[方法]利用ISSR分子标记对新疆伊犁霍城县大西沟的61份野杏单株进行遗传多样性分析.[结果]用21条引物对样品进行PCR扩增,共扩增出437条条带,其中多态性条带408条,多态性条带比率为92.46;.通过软件计算出有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon信息多样性指数(Ⅰ)分别为1.577 5、0.334 1、0.499 0.引物平均多样性信息指数(PIC)为0.91.说明野杏的遗传多样性较为丰富.利用NTSYS-PC2.1软件进行UPGMA聚类,各个样品间的遗传相似系数在0.62～0.95.[结论]新疆霍城大西沟的野杏具有丰富的遗传多样性,遗传多态性比率达到90;以上,引物平均多样性信息指数(PIC)较高,接近1.61份野杏单株间的遗传相似度较高,亲缘关系较近.     

T5代水稻变异株系的AFLP分析和特异片段序列分析

以香稻1号为材料,对64对PstⅠ-MseⅠ选扩引物进行筛选,确定19对引物能扩增出适量且清晰的条带。以19对引物对具有不同表型性状的4种T5代变异株系及其对照进行AFLP分析,结果表明,变异株系基因组较香稻1号发生了明显变化。回收克隆了变异株06-5-114-11-2的p38-114特异片段和06-5-108-11-3的p82-108特异片段,并在NCBI数据库中进行序列比对,结果显示,p38-114片段与序号为NM_001074855.1的mRNA序列相似性为99%,p82-108片段与序号为NM_001061652.1的mRNA序列相似性为100%。     

利用AFLP鉴定沙田柚新种质

[目的]鉴定沙田柚新种质的遗传分类,为其利用提供参考.[方法]选用64对AFLP引物组合,对12份柚类种质资源进行遗传多样性分析及分类研究.[结果]从64对引物中筛选出12对AFLP引物组合,在12份柚类材料中扩增出399条清晰条带,每对引物扩增条带数为25~49条,平均每对引物扩增条带33.25条;多态性条带91条,多态性比例为22.8%.供试材料相似系数在0.752~0.956,AFLP鉴定结果显示桂柚1号与沙田柚相似系数为0.956,早熟沙田柚与沙田柚相似系数为0.920;早熟酸柚和福建酸柚两个品种与其他柚类亲缘关系较远;以0.830为相似系数的阈值,可以将12份柚类材料分为5类.[结论]AFLP分子标记技术能将12份柚类材料区分开;早熟沙田柚与桂柚1号是不同于沙田柚的变异新种质,可以直接作为品种资源加以利用.     

紫茉莉品系观赏性状与遗传多样性的AFLP分析

[目的]紫茉莉(Mirabilis jalapa Linn)是中国传统乡土花卉,研究不同种质的观赏性状,对利用这些资源进行杂交育种筛选后代、提高育种的针对性和加快育种进程具有重要的意义.[方法]本研究对具代表性的9个紫茉莉品系进行了株高、花型、花色、童期等观赏性状的比较,并利用扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)分子标记技术进行分析.[结果]紫茉莉的观赏性状主要包括株高、花型、花色、童期等,传统分类法可分为高株系统和矮株系统,花型为重瓣和单瓣,其花色有白色、粉色共9种颜色,多样性丰富.通过AFLP技术,采用8对引物组合共扩增出2 569条谱带,其中多态性条带2 488条,多态性条带比率为96.85％,平均每对引物扩增出321个位点,311个多态性位点.9个品系的相似性系数在0.2357～0.6493之问,平均值为0.4425,每个位点的有效等位基因数为1.2044,平均多样性指数为0.2127,遗传相似性系数最高的是5号和8号,达到0.6493,最低的是3和7,为0.2357.[结论]根据遗传相似性系数进行聚类分析,可将紫茉莉品系分为矮株型Ⅰ类和高株型Ⅱ类,分子聚类结果与表型性状特征分类结果较为一致,而在每一类中具体的观赏性状聚类存在一定差异.通过形态性状与分子标记为紫茉莉品系的研究,为进一步育种利用提供参考.     

中国水稻二化螟5个地理种群遗传差异的RAPD分析

以中国水稻二化螟5个地理种群的基因组DNA为材料,对其进行随机扩增多态性DNA(RAPD)分析.从50个引物中筛选出29个稳定性好、多态性高的引物,单个引物扩增出的DNA条带数从2～15条不等,其片段大小为200～3 000 bp,5个地理种群共扩增出条带220条,其中为多态片段的97条,平均每条引物扩增出条带7.59条.通过公式计算多态性位点、遗传相似性指数和遗传距离,结果表明:(1)5个地理种群遗传变异较高,其中以广西省全州市多态位点百分率最高(52.73%),吉林省柳河县多态位点百分率最低(34.55%);(2)5个二化螟地理种群间的遗传相似性指数的变异范围为0.551 88～0.849 00,遗传距离指数为0.121 42～0.448 12,平均遗传距离指数为0.312 28;安徽省庐江县与湖北省武汉市地理种群间的遗传距离最小,而吉林省柳河县与广西省全州市地理种群间的遗传距离最大.     

苦楝SRAP分子标记及遗传多样性分析

[目的]为快速分析苦楝Melia azedarach不同种源提供方法,揭示苦楝遗传多样性,为苦楝的开发、利用及选择育种提供一定的理论依据.[方法]从783对SRAP引物组合中筛选出20对多态性较高的引物组合,对苦楝国内全分布区的37个种源和肯尼亚1个种源样品进行SRAP遗传多样性分析.[结果]20对引物组合共扩增出242条谱带,其中多态性条带101条,多态性百分率平均值为40.89％,每对引物组合扩增条带5～17条,平均每对引物扩增条带12.1条;其多态性信息量(Polymorphism information content,PIC)值介于0.188 ～0.488,平均值为0.299.基于UPGMA法聚类以0.350为阈值可将38个苦楝种源划分为7类,在此基础上,去掉2个种源,将其余36个种源划分5个地理类群.[结论]SRAP分子标记可以很好地反映苦楝的遗传多样性,聚类类群划分结果有明显的地理趋势和气候生态特征.     

基于SRAP分子标记的贵州5种忍冬属药用植物遗传多样性分析

[目的]分析贵州5种忍冬属药用植物的遗传多样性,为忍冬属药用植物鉴定、良种筛选及开发利用提供理论依据.[方法]采集贵州6份忍冬属药用植物材料的嫩芽为试验材料,采用SRAP分子标记研究其遗传多样性,并利用NTSYS-pc2.1计算各材料间的遗传相似系数,利用UPGMA进行聚类分析.[结果]从154对SRAP引物组合中筛选出15对重复性好、条带清晰、多态性丰富,且扩增条带(100~1000 bp)数目≥5的引物组合.15对SRAP引物共扩增出197条带,其中178条为多态性条带,多态性条带比率为90.36%,平均每对引物扩增11.87条多态性条带.引物组合Me8-Em10扩增的多态性条带数最多(16条);引物组合Me2-Em2扩增的多态性条带最少(8条);引物组合Me4-Em2扩增条带数为15条,均为多态性条带,但从5种忍冬属药用植物的扩增条带数不同.聚类分析结果显示,6份忍冬属药用植物材料间遗传相似系数为0.4213~0.8477,平均0.5672;其中,野生忍冬与栽培忍冬间遗传相似系数最大(0.8477),二者亲缘关系最近,灰毡毛忍冬与野生忍冬遗传相似系数最小(0.4213),二者亲缘关系最远.在遗传相似系数0.4873处,6份忍冬属药用植物分为两大类,第Ⅰ类包括灰毡毛忍冬、红腺忍冬和黄褐毛忍冬,均为山银花的基源植物;第Ⅱ类包括野生忍冬、栽培忍冬和红白忍冬,均为金银花的基源植物.[结论]贵州5种忍冬属药用植物具有丰富的遗传多样性,SRAP分子标记能有效分析其遗传多样性及亲缘关系,其引物组合Me4-Em2可用于鉴别5种忍冬属药用植物.     

基于SRAP分子标记的马铃薯品种遗传多样性分析

[目的]研究10个马铃薯品种之间的遗传差异性,了解其亲缘关系.[方法]利用SRAP分子标记技术,共计56对引物组合,对10份马铃薯的DNA进行遗传多样性分析,共筛选出10对背景干净、条带清晰、扩增条带丰富、重复性好的SRAP引物组合进行PCR扩增.[结果]扩增出的96条条带中多态性条带有36条,占比为37.50％.以阈值0.758作为标准,可将马铃薯分为四大类:地泰高原红土豆、云南乌洋芋、威芋3号、云斯特和转心乌;威芋7号和黔芋7号;云南七彩土豆;黑金刚和黑美人.[结论]选用SRAP分子标记技术能较好地区分供试品种之间的亲缘关系,且品种之间的遗传差异性较大,SRAP分子标记技术有助于马铃薯遗传资源的进一步挖掘和利用,对下一步马铃薯改良杂交材料的组配利用和新品种选育具有指导意义.     

新疆野生阿魏侧耳遗传多样性的RAPD分析

[目的]揭示新疆野生阿魏侧耳种质资源的遗传多样性,为进一步驯化和保护阿魏侧耳野生资源提供基础材料和科学依据.[方法]利用RAPD分子标记技术分析32个阿魏菇菌株的遗传多样性.[结果]从28条随机引物中筛选到6条引物,共扩增出84条DNA条带,多态性条带83条,多态比率为98.8;.供试菌株两两间的相异系数从0.104 2～0.748 5,D=0.60时,32个供试菌株分为5个类群.[结论]新疆野生阿魏侧耳种质资源存在一定的遗传多样性,具有较好的驯化选育潜力和保育价值.