斑马鱼基因组DNA提取方法在蜜蜂上的尝试

基因组DNA的提取是分子生物学研究中不可缺少的一项内容.随着蜜蜂分子生物学的发展,快速高效地提取适合于实验操作的蜜蜂基因组DNA成为各项研究的基础.介绍了一种简便快速提取蜜蜂基因组DNA的方法,可满足基本的分子生物学实验要求.     

适于蚁蚕的基因组DNA提取方法

昆虫基因组DNA提取是对昆虫在分子水平上进行研究的关键,提取的DNA的纯度、浓度及完整性是进行基因工程各项研究所必须的条件。本研究主要对应用4种方法,以柞蚕蚁蚕时期组织材料为样品提取DNA后进行比较分析。结果发现,利用BIOMIGA试剂盒,置于36℃条件,经50μL蛋白酶K 70℃消化6h后,5μLRNase A酶37℃消化10min,提取的DNA质量较好。且样品易于保存,保存时间长,提取时间短的优点,对提高柞蚕研究效率具有实用价值。     

绿蝇基因组DNA提取方法比较研究

通过3种基因组DNA提取方法的试验比较,寻找一种提取效果最好的绿蝇基因组DNA提取方法.经DNA浓度检测与电泳结果分析表明,Collines法的提取效果最好,可应用于绿蝇的基因组DNA提取.     

六种试剂盒提取血液基因组DNA效果比较

为筛选一种高效、快捷的血液基因组DNA提取试剂盒,采集24份新鲜西藏绵羊血液样本,选用6种市售商业化试剂盒（LifeFeng柱式试剂盒DK601和非柱式试剂盒DK602,康为世纪非柱式试剂盒CW0544和柱式试剂盒CW0546,上海生工非柱式试剂盒SK8224和柱式试剂盒SK8254）,比较所提DNA的浓度、纯度、得率以及对嗜吞噬细胞无形体16S rRNA进行巢式PCR扩增,综合评价不同试剂盒DNA提取效果.结果表明,应用LifeFeng柱式试剂盒DK601提取的DNA浓度和纯度均最高,得率较高,分别达到75.63 ng/μL、1.894（OD260/OD280）、18.91 ng/μL;且嗜吞噬细胞无形体16S rRNA基因的PCR扩增条带清晰度最优.因此,LifeFeng DK601可作为提取绵羊血液基因组DNA及嗜吞噬细胞无形体（Anaplasma phagocytophilum）病原鉴定的首选试剂盒.     

牛血凝块基因组DNA提取方法的建立

建立了一种牛血凝块基因组DNA提取方法，其过程为机械性粉碎，高盐EDTA处理后用含蛋白酶K和SDS的细胞裂解液消化，苯酚-氯仿抽提，再以本方法抽提的DNA为模板进行PCR扩增，对PCR产物测序，测序结果与抗凝血DNA的PCR产物测序结果比较。结果表明：本方法提取的DNA成功地应用于PCR扩增。     

绵羊瘤胃微生物基因组DNA提取方法的探讨

本研究针对瘤胃内容物成分复杂、微生物种类繁多,且难于培养和分离这一特点,本着为采用免培养技术研究瘤胃微生物提供前期样本这一目的,对现在常用的五种基因组DNA提取方法进行了比较。试验结果得出应用珠磨-SDS/CTAB/PVP法所提瘤胃微生物基因组DNA质量及纯度较好,总DNA长度大于20kb,OD260/OD280在1.7以上。同时对所提的DNA应用PCR方法进行了检测,可以成功扩增出瘤胃中的古细菌、真细菌和真菌16/18SrDNA片断,进一步证明了此方法的优越性及可行性,为后续一些分子生物学试验提供质量较高的DNA模板。     

从猪血中提取高质量基因组DNA的研究

经研究改进 ,建立了一种从猪血中提取高纯度全基因组DNA的有效方法。经 2 %琼脂糖凝胶电泳检测 ,DNA带型整齐集中 ,无拖尾现象 ,证明DNA分子片段完整 ,没有降解。紫外分光光度计检测 ,DNA的OD2 60 /OD2 80 达 1.75± 0 .0 5 ,证明所提DNA质量较好 ,用于PCR扩增 ,可以得到满意的扩增效果 ,且避免了用苯酚等剧毒试剂 ,是一种理想的DNA提取法     

番鸭全血基因组DNA的提取与克隆

以柠檬酸葡萄糖溶液(ACD)抗凝的番鸭全血为材料,采用酚/氯仿抽提法和试剂盒法提取基因组DNA,并对基因组DNA进行PCR扩增、克隆并测序。结果表明,提取的基因组DNA纯度高,用琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA,主带清晰、无拖尾现象,无污染;通过PCR扩增有特异性条带出现,测序结果显示番鸭基因组DNA片段大小为868bp,与预期结果大小一致。     

对猪肝脏基因组DNA提取与纯化的研究

对血液中提取基因组DNA的方法加以改进,获得了一种提取猪肾组织中DNA的有效方法.试验表明,利用SDS裂解,氯仿、异戊醇抽提母猪肝脏中基因组DNA,得到的DNA纯度较高,可用来进一步进行RAPD分析和PCR扩增,用于各种分子生物学实验.     

两种桑树基因组DNA提取方法的比较研究

以8份广西桑树种质资源为材料,比较了改良的CTAB法和植物基因组DNA试剂盒法(离心柱)提取桑树基因组DNA的效果.结果表明:两种方法都能得到桑树样品清晰的DNA电泳条带,DNA纯度高,改良的CTAB法提取的DNA浓度在308.70μg/mL～384.30μg/mL之间,平均值是331.45μg/mL;植物基因组DNA...     

苇状羊茅与多年生黑麦草内生真菌菌丝基因组DNA提取的优化及PCR初步检测

感染内生真菌的禾草在牧草和草坪业上具有重要的生态和经济意义,家畜采食感染Neotyphodiumcoenophialum和N.lolii的苇状羊茅Festuca arundinacea和多年生黑麦草Lolium perenne会发生中毒。研究收集天津口岸1998年以来进境的部分苇状羊茅和多年生黑麦草种子,对经镜检确认带有内生真菌的种子进行分离培养,对疑似菌株的菌丝用改进的Moller等方法进行基因组DNA抽提,测定浓度及纯度,对照原方法,DNA的纯度有较大提高,浓度略有上升。Tubulin2基因的引物IS1~IS3扩增结果显示为单一的条带,结合形态学和序列比对,分离培养得到的菌株可以基本确定为N.coenophialum和N.lolii。根据Gen-bank中N.coenophialum和N.lolii的NC25基因序列设计出引物F1~R1,扩增得到能区分开N.coenophialum和N.lolii的单一条带(相差160 bp),建立了N.coenophialum和N.lolii的PCR检测方法,结果准确可靠。     

聚赖氨酸-海藻酸微囊介导的病毒基因组DNA转染

通过多孔CaCO3微粒吸附伪狂犬病毒(Pseudorabies,PRV)基因组DNA,并在其表面依次交替聚合PLL、Alg至7层;以EDTA溶解去除CaCO3内核,制成聚PLL/Alg包被DNA的载体并感染家兔,观察PRV基因组DNA在体内的复制情况.结果显示,Na2 CO3与CaCl2反应可获得直径4～6 μm的多孔CaCO3微粒,对DNA的吸附效率约为1 mg CaCO3微粒可吸附1 μg DNA.经PLL/Alg包被后获得直径1～2 μm、囊膜厚约200 nm的PRVDNA聚PLL/Alg微囊.肌肉注射含6.5μg PRV DNA的PLL/Alg微囊,可引起试验兔死亡,经PCR检测确定为PRV感染引起的.结果表明,聚PLL/Alg微囊能够介导DNA高效转染,在作为DNA疫苗载体方面具有良好应用前景.     

An efficient protocol for genomic DNA extraction from formalin-fixed paraffin-embedded tissues

Formalin-fixed paraffin-embedded tissues (FFPET) represent the largest source of archival biological material available for genomic studies. In this work we present an advanced protocol for extraction of high quality DNA from FFPET that can be applied in several molecular studies. Although cat mammary tumours (CMT) are the third most frequent tumour in cats the recovery of significant number of samples for molecular studies are in some way restricted to FFPET samples. We were able to obtain high quality DNA from FFPET of thirty six CMT that were subjected to pre-fixation and fixation processes routinely used in the veterinary hospitals. The quality of DNA obtained was tested by PCR amplification using six sets of primers that amplify single-copy fragments. The DNA fragments obtained were further sequenced. This protocol was able to provide FFPET gDNA that can be amplified and sequenced for larger fragments up to 1182bp.     

全血中DNA的5种不同提取方法比较研究

比较几种从血液中提取DNA方法所需要的时间、样本量、提取的DNA纯度、产量以及成本等。结果表明,几种方法所提取的DNA质量都能达到分子生物学的试验要求,但在DNA的纯度、产量、试验时间和价格等方面存在差别。实验人员可根据自己的实验要求、实验室以及经济条件等选择适当的方法。     

从鸡血中快速提取高质量基因组DNA方法的研究

介绍了一种经改进建立的从鸡血中快速提取高纯度基因组DNA的方法。该方法提取DNA耗时较短,只需2.5~3 h即可拿到DNA样品。提取的DNA样品经紫外分光光度计检测,DNA样品的A260/A280达1.782 2±0.009 3;经琼脂糖凝胶电泳检测,DNA样品的带型清晰、整齐,无拖尾现象;微卫星PCR扩增效果理想。结果表明,该方法所提DNA纯度较高,质量好,分子片段完整,完全能满足分子生物学实验的要求。     

快速提取病毒核酸用于PCR或RT-PCR

PCR或RT—PCR因其操作简便快速、灵敏度高已越来越广泛的应用到病毒核酸的检测中，但其检测效率在很大程度上受到核酸提取速度和质量的影响。经典的病毒核酸提取方法主要包括变性剂裂解、蛋白酶K处理、有机溶剂抽提、乙醇或异戊醇沉淀等操作。众多的步骤和多次的转移操作以及在每个步骤上消耗的时间往往会降低核酸提取的效率。本文介绍了一种改进的异硫氰酸胍法，经多次提取鸭瘟疱疹病毒（Duck plague herpesvirus，DPV）的基因组DNA和鸭肝炎病毒（Duck hepatitis virus，DHV）的基因组RNA，显示出该法具有简单快速、安全可靠、低成本和高效率的特点。     

沙拐枣DNA提取方法改进及PCR扩增检测

利用改进的提取沙拐枣Calligonum mongolicumDNA的CTAB方法,从沙拐枣当年鲜根提取总DNA,以琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测,并进行PCR扩增试验。结果显示,所提取的DNA片段大小在20 kb以上,OD260/OD280比值为1.880~1.900,OD260/OD230比值为2.000~2.040,DNA的浓度0.380~0.470μg/mL,DNA纯度较高,可直接用于随机扩增的DNA多态性(RAPD)标记,条带清晰、迁移率低而整齐。     

鸭瘟病毒基因组的提取和限制性酶切分析

利用高渗缓冲液裂解感染鸭瘟病毒的鸭胚成纤维细胞,加入核酸酶消化细胞DNA,再抽提病毒DNA的方法提取鸭瘟病毒基因组,结果证明,这种方法可以最大限度地消除细胞DNA的污染,得到纯净的病毒基因组DNA.用10种限制性内切酶对鸭瘟病毒疫苗株和分离株的基因组进行酶切分析,酶切产物电泳结果表明,Sma Ⅰ、Sal Ⅰ、Pst Ⅰ、Not Ⅰ、Hind Ⅲ、EcoR Ⅴ和BamH Ⅰ 7种限制酶产生酶切图谱二者几乎完全一致,EcoR Ⅰ和Sac Ⅰ仅有个别条带不同,BglⅡ产生的条带迁移率差别较大,但条带数量相同.     

微波加热快速提取芽孢杆菌与乳酸菌DNA

试验旨在研究快速、简单、高效提取芽孢杆菌与乳酸菌DNA的方法。在微波炉额定功率800 W下,对芽孢杆菌和乳酸菌进行微波处理40~150 s,离心获取上清,收获细菌DNA,将样本DNA PCR扩增后进行琼脂糖凝胶电泳验证,测定其纯度和产量后测序。结果显示,在微波炉功率800 W条件下加热40~150 s均可有效提取芽孢杆菌与乳酸菌DNA。所得DNA质量较好（D_{260 nm}/D_{280 nm}在1.8~2.1之间）。DNA浓度符合PCR检测要求,目的条带清晰,所得测序结果满足常规分子生物学研究。该微波提取方法具有简单、快速、高效的特点,且具有广泛的实用性,为乳酸菌与芽孢杆菌快速分子检测提供了简便手段。