我国科学家参与绘制出鸡基因组序列草图

我国科学家12月9日在京宣布，他们参与的破译鸡基因组序列和遗传差异的国际研究计划取得进展，已完成了原鸡基因组和家鸡基因组多态性研究。这项成果以主题科学论文的形式发表在12月9日出版的《自然》杂志上。     

科学家绘出鸡基因组序列草图和遗传差异图

由多国科学家组成的两个小组近日宣布绘出鸡的基因组序列草图和遗传差异图谱 ,这两项成果在禽流感防治、改善家禽和人类健康等领域都将有应用价值。其中鸡遗传差异图谱的绘制工作由中国科学院北京基因组研究所负责。美国国家人类基因组研究所资助的美国华盛顿大学威尔逊博士领导的一个小组经过一年的工作 ,已首次成功测绘并组装出鸡的基因组序列草图。这也是迄今完成的首张禽鸟类物种的基因组序列草图。科学家们选择了家鸡的远祖———红原鸡为测绘对象 ,绘出的草图中约包含 10亿个碱基对。科学家们已将鸡基因组序列草图数据存入公共数据库 …     

科学家绘出鸡的基因组序列草图和遗传差异图

由多国科学家组成的两个小组3月1日宣布绘出鸡的基因组序列草图和遗传差异图谱,这两项成果在禽流感防治、培育优质鸡种、改善食品安全和增进人类健康等领域都将有应用价值。其中鸡遗传差异图谱的绘制工作由中国科学院北京基因组研究所负责。美国国家人类基因组研究所在一份新闻公告中说,在该所资助下,美国华盛顿大学威尔逊博士领导的一个小组经过一年工作,已首次成功测绘并组装出鸡的基因组序列草图并已存入公共数据库。这也是迄今完成的首张禽鸟类物种的基因组序列草图。科学家们选择了家鸡的远祖——红原鸡为测绘对象,绘出的草图中约包含1…     

科学家首次绘制出猪基因组草图

一个由美、英、法等多国科学家组成的国际研究团队宣布,他们已经绘出了首个猪的基因组草图,这项成就将提升猪繁殖、猪肉营养等方面的研究,科学家也可以据此洞悉猪的疾病,有助于猪流感疫苗等涉及人类健康技术的研发。     

大鼠基因组序列发表

大鼠是生理学和药理学实验的重要实验动物,在医学和药物开发中广泛应用。最近,Nature杂志发表了褐家鼠(BrownNorway rat,Rattus norvegicus)的全基因组序列,使大鼠成为继人和小鼠之后第3个被全基因组测序的哺乳动物。大鼠基因组含有约2 5 0 0 0个基因,其中90 %在小鼠和人的基因组中也存在,约10 %是和小鼠共有而人没有的,这些基因包括编码与嗅觉有关的蛋白,这也许是鼠类嗅觉灵敏的原因。大鼠与人相比,其基因组中含有更多的分解毒物的基因,因此它们可能更容易从体内排除毒物,这也使一些科学家认为以大鼠为实验动物作人的一些药物的毒性实验…     

科学家首次绘制出猪基因组草图

11月2日,美国伊利诺伊大学发表新闻公报说,由美、英、法等多国科学家组成的研究小组首次绘制出了杜洛克猪的基因组草图。科学家认为,理解其基因组将提高家猪饲养技术，并开发出针对包括猪流感在内的猪类疾病疫苗。这次科学家绘制出的草图包含杜洛克猪98%的基因。     

科学家首次绘制出猪基因组草图

美国伊利诺伊大学近日发表新闻公报说，由美、英、法等多国科学家组成的研究小组首次绘制出了杜洛克猪的基因组草图。科学家认为，理解其基因组将提高家猪饲养技术，并开发出针对包括猪流感在内的猪类疾病疫苗。     

科学家首次绘制出猪基因组草图

美国伊利诺伊大学发表新闻公报说．由美、英、法等多国科学家组成的研究小组首次绘制出了杜洛克猪的基因组草图。科学家认为，理解其基因组将提高家猪饲养技术．并开发出针对包括猪流感在内的猪类疾病疫苗。     

科学家首次绘制出猪基因组草图

新华网华盛顿11月2日电（记者任海军）美国伊利诺伊大学2日发表新闻公报说,由美、英、法等多国科学家组成的研究小组首次绘制出了杜洛克猪的基因组草图。科学家认为,理解其基因组将提高家猪饲养技术,并开发出针对包括猪流感在内的猪类疾病疫苗。     

我国已获得较完整的木薯基因组草图

<正>在海南博鳌举行的首届中国农业科技创新论坛上,中国热带农业科学院热带生物技术研究所所长彭明宣布,以中国热带农业科学院王文泉研究员为项目负责人的研究团队仅用1年的时间,已经完成3个木薯品种的基因组深度测序,同时采用几种超高通量测序技     

番鸭全血基因组DNA的提取与克隆

以柠檬酸葡萄糖溶液(ACD)抗凝的番鸭全血为材料,采用酚/氯仿抽提法和试剂盒法提取基因组DNA,并对基因组DNA进行PCR扩增、克隆并测序。结果表明,提取的基因组DNA纯度高,用琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA,主带清晰、无拖尾现象,无污染;通过PCR扩增有特异性条带出现,测序结果显示番鸭基因组DNA片段大小为868bp,与预期结果大小一致。     

基因组领域又一重大科技突破 我国率先完成家蚕基因组序列“框架图”

我国率先完成家蚕基因组序列"框架图"我国科学家今天在此间宣布,已在世界是我国科学家继完成人类基因组计划中国卷和水稻基因组计划后,在基因组领域的又一重大科技突破,标志着我国在家蚕基因组研究方面已处于世界领先水平.     

猫杯状病毒全基因组的克隆及序列分析

采用RT-PCR和重组PCR扩增了猫杯状病毒(feline calicivirus,FCV)CH-GD株的全基因,并进行了序列测定,用DNAStar软件对其核苷酸序列和氨基酸序列进行比较分析。结果表明,首次分离于中国广东的CH-GD株与各参考毒株有较大的差异。CH-GD株与各参考毒株之间的同源性仅为75.4%~77.1%,明显低于各参考毒株之间的同源性(78.9%~99.9%)。同时遗传进化树显示,14个分离株形成两大分支,CH-GD株独自在一分支,各分离株无明显的地域性差异。对FCV衣壳蛋白6个区(A~F)的分析结果发现,CH-GD株中A~F区的特点与报道的相符。此外还发现,CH-GD株有3个区域的3个连续的氨基酸发生了变异,与参考毒株相比,CH-GD株在这3个区域的抗原性和亲水性也都发生了相应的变化。     

广西猪瘟流行毒株全基因组的克隆与序列分析

参考已发表的猪瘟病毒(CSFV)Shimen株、HCLV株、Paderborn株的核苷酸序列，设计并合成11对引物。应用RT—PcR技术，成功地分11个片段扩增了CSFV广西流行毒株GXWZ02的全基因组，将这11个基因片段克隆，并测定了其核苷酸序列。应用计算机生物软件Vector NT1将11个基因片段进行拼接。确认CSFV GXWZ02株全基因组序列的长度为12296个核苷酸(GenBank收录号AY367767)。将GXXZ02株与国内外已发表的Slhimen、HCLV、39、Brescia、Eystrup、Glentorf、Alfort187、Pader190rn、CS、ALD、GPE、P97、LPC毒株进行全基因组核苷酸序列和推定的氨基酸序列比较，核苷酸同源性分别为85．4％、84．6％、88．7％、85．7％、85．7％、85．3％、85．6％、95．3％、85．7％、85．7％85．4％、83．4％、84．3％，推定的氨基酸同源性分别为92．6％、91．7％、94．2％、93．1％、92．9％、92．3％、93．0％、97．7％、92．6％、93．0％、92．6％、90．5％、90．6％。GXWZ02与Shimen、HCLV的全基因组序列及推定的氨基酸序列有明显差异，表明GXWZ02株在遗传性和抗原性上发生了较明显的变化。系统发育树分析，所比较的14株CSFV被分为2个群：GXWZ02、Paderborn和39这3个毒株被归为群Ⅰ，其余的11个毒株被归为群Ⅱ，GXWZ02与Paderborn的亲缘关系最接近。将GXXZ02与Shimen、HCLV基因组中单个基因分别进行核苷酸及推定的氨基酸序列同源性比较，结果显示，基因E^ms、E2、P7、NS2、NS5A的遗传变异程度大。而NS3、NS4A、NS4B的遗传性则相对保守。     

鹅圆环病毒福建株全基因组的克隆及序列分析

为明确鹅圆环病毒(Go CV)福建株的基因组特点,设计反向引物,从一例生长不良鹅中PCR扩增获取Go CV福建株基因组序列。结果表明,Go CV福建株(命名为FJ2016株)基因组全长为1 821 bp,其编码的复制相关蛋白长度为882 bp,编码293个氨基酸;其编码的抗原相关蛋白长度为753 bp,编码250个氨基酸。从遗传进化关系可见,Go CV在遗传进化上可以分为2个大的分支(Go CV-1与Go CV-2),FJ2016株处于Go CV-1分支。从核苷酸同源性比较可见,FJ2016株和yk2株核苷酸同源性最高,达98.2%;但与2GK株核苷酸同源性仅为82.4%;与疣鼻天鹅源圆环病毒Sw株(EU056310)核苷酸同源性为73.7%,低于80%。FJ2016株和Go CV-1分支代表株核苷酸同源性在97.3%~98.2%之间,与Go CV-2分支代表株核苷酸同源性在93.1%~93.5%之间。该病例为福建地区首次报道存在鹅圆环病毒感染。     

鸡痘病毒基因组酶切片段的克隆及酶谱分析

以鸡胚成纤维细胞培养的中国鸡痘病毒鹌鹑化弱毒株，经蔗糖密度梯度离心法纯化，电镜观察示所得病毒为典型鸡痘毒颗粒，以蛋白酶Ｋ法抽提病毒基因组，电泳结果为典型的大分子量ＤＮＡ特征，经ＥｃｏＲＩ或ＥｃｏＲＩ／ＨｉｎｄⅡ酶切，插入ＰＵＣ１９载体相应位点，经转化、筛选、鉴定后得相应酶切片段的基因组文库，对其中２３个克隆片段用双酶法进行酶谱分析，绘制出相应克隆片段的酶切图谱，每个克隆片段中均有１－５个可以利用的     

口蹄疫OX株全基因组cDNA的分子克隆、序列测定及分析

采用RT-PCR法对FMDV OX株基因组全序列进行了分子克隆与测序。结果表明不含poly(C)序列和poly(A)尾巴的OX株基因组全序列长8104nt,开放读码框(ORF)长6969nt、编码2322aa,5’UTR长1040nt,3’UTR长95nt。应用分子生物学软件将OX株与FMDV其它参考毒株进行序列比较,并对其基因特征进行分析。结果显示,OX株与OTwyl／97的核苷酸同源性最高,在基因组功能未知区和3A编码区具有两处明显的缺失现象,其一是在3A编码区有30nt的连续缺失,这与OTwyl／97株相同,其二是在功能未知区域有44nt的缺失,这与OTwyl／97株相同,与OAkesu58相似(43nt缺失)。     

鸭肠炎病毒基因组末端的克隆及序列分析

根据已知的鸭肠炎病毒基因组序列设计2对引物RTLT1、RTLT2,取基因组自连产物进行PCR反应,分别得到全长16071、978 bp的序列。将PCR产物克隆至pMD18-T载体,对重组质粒进行PCR和酶切鉴定,将阳性质粒测序,结果显示2对引物扩增的重叠序列部分完全一致。该段序列G+C含量高达75%,含有大量直接和反向重复序列,并发现4个末端特征序列,分别为具有回文结构的α序列、包含两测末端接合位点的β序列、高度保守序列的γ序列和AnTn序列。将该序列与马疱疹病毒Ⅰ型(EHV-1)、牛疱疹病毒Ⅰ型(BHV-1)、水痘带状疱疹病毒(VZV)、猪伪狂犬病毒(PRV)末端序列进行比较,证实所得到的序列为鸭肠炎病毒基因组末端序列,这些特征序列的发现对进一步了解DEV复制机制有很大帮助。