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西南牡丹品种起源的ISSR研究 总被引:1,自引:0,他引:1
【目的】通过对西南牡丹21个品种、中原牡丹18个品种、江南牡丹1个品种和1个野生种之间的亲缘关系进行研究,了解西南牡丹品种群的遗传背景,为品种选育奠定基础。【方法】通过改良的CTAB法对41份材料抽提总基因组DNA,采用ISSR分子标记的方法,通过优化的ISSR-PCR反应体系,从60个哥伦比亚大学(UBC)开发的通用引物中筛选27个进行PCR扩增差异比较,利用POPGENE软件计算多态位点百分率(%);依据Nei’s遗传距离,运用NTSYSPC进行UPGMA聚类构建不同品种群和品种间亲缘关系。【结果】利用27个ISSR引物对41个牡丹样本扩增,共获得的317个条带,其中304个为多态性条带,多态性条带比率为95.41%,平均每个引物扩增条带为11.74;41个样本的遗传相似性系数为0.483-0.811,云南牡丹‘丽江紫5’和‘大关粉4’的遗传相似性系数最大,为0.811;云南牡丹‘大关粉4’和中原牡丹‘彩绘’的遗传相似性系数最小,为0.483;UPGMA聚类结果显示41个样本在阈值为0.625时,聚为四支:第一支由19份样本组成,其中包括5个中原牡丹品种和14个西南牡丹品种,其中,云南牡丹‘丽江紫5’与‘大关粉4’亲缘关系最近,而云南牡丹‘丽江紫5’与中原牡丹‘首案红’的亲缘关系最远,其遗传相似性系数仅为0.609;第二支包括10份样本:有‘乌龙捧盛’、‘豆绿’等5个中原品种和‘四川粉紫’、‘昭通粉’、‘丽江粉1’等5个西南牡丹品种,其中天彭牡丹‘紫金荷2’与‘四川粉紫’的亲缘关系最近,遗传相似性系数最大为0.770;天彭牡丹‘紫金荷2’与中原牡丹‘罗婺现瑞’亲缘关系最远,其遗传相似性系数为0.625;第三支包括11个样本:1个江南品种,8个中原牡丹品种;3个西南牡丹品种。亲缘关系最近的是中原牡丹‘菱花湛露’与‘朱砂垒’,其遗传相似性系数为0.779;亲缘关系最远的是‘朱砂垒’和‘凤丹白’;第四支为黄牡丹单独聚为一支。多数花色相同的供试中原品种表现出近缘关系,红色系的天彭牡丹‘胭脂楼’与紫红色系的中原牡丹品种有着较近的亲缘关系,而供试的紫红色系的天彭牡丹分别紫红色、粉色、紫色和红色的中原品种有近缘关系;云南紫牡丹品种与紫色、紫红色系的中原品种有一定关系,粉牡丹则与紫红、浅红、浅紫红、浅紫色等不同色系的中原牡丹和天彭牡丹都有一定的亲缘关系。天彭牡丹总是先与中原牡丹品种相聚,再与云南牡丹相聚;云南牡丹品种除‘狮山皇冠’、‘香玉板’外,不同产地、株型相似和花色相同的云南牡丹品种间遗传相似性较高,总是先聚为一分支后,才与其他中原品种相聚。【结论】西南牡丹品种栽培起源较复杂,天彭牡丹比云南牡丹与中原牡丹有着较近缘关系,云南牡丹不可能是天彭牡丹直接引种驯化产物,推测云南牡丹品种可能是由几个祖先品种演化的产物,但本地黄牡丹参与起源的可能性较小。 相似文献
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【目的】探究西南牡丹品种群与不同种源牡丹品种的亲缘关系,为其栽培起源研究提供基础资料。【方法】以50个中原牡丹品种、20个西南牡丹品种、18个西北牡丹品种、6个国外牡丹品种、1个江南牡丹品种和2个野生种共计96份不同地理种源牡丹为材料,利用36个目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT) 引物进行PCR扩增,筛选多态性比率好的条带,利用NTSYS-pc软件计算品种间的遗传相似性系数,在此基础上,采用UPGMA聚类分析个体间的亲缘关系。【结果】多态性好的引物共有18个,用其对96个牡丹样本进行扩增,共获得182条扩增条带,其中多态性条带172个,多态性比率为94.50%;96个样本间的遗传相似性系数在0.552 3~0.868 1,品种间遗传差异较大,其中遗传相似性系数最大的是西北牡丹品种2与品种3,而紫斑牡丹与豆绿和中甸紫2的遗传相似性系数最小。在遗传相似性系数为0.693 1时,96个牡丹样本聚为8支,第1支由15个中原牡丹品种、4个西南牡丹品种和1个江南品种组成;第2支由2个西南牡丹品种丽江紫3和昭通粉1组成;第3支由35个中原传统牡丹品种聚成;第4支包括3个日本品种、1个法国品种和14个西南品种;第5支由17个紫斑牡丹杂交品种聚成;第6支仅有紫斑牡丹1个样本;第7支仅有黄牡丹1个样本;第8支由美国品种海黄和法国品种金晃聚成。【结论】西南牡丹品种与日本牡丹关系最近,与中原牡丹也有着近缘关系,而与其他种源的品种群关系较远。产地对西南牡丹品种的亲缘关系影响较大。 相似文献
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为区分常用香菇品种L808和申香215,以香菇武香一号为对照,对3个品种进行了拮抗试验、ISSR分析和农艺性状比较,结果表明:武香一号与L808和申香215拮抗反应明显,L808与申香215品种间无明显拮抗反应;在农艺性状比较方面,同一栽培条件下,品种L808和申香215在形状、颜色性状上无明显区别,但是在菌丝体长速、生长发育各个阶段时间节点、子实体大小、单菇重、生物学效率等性状上存在明显差异;在ISSR分子标记中申香215和L808存在特异性条带,能够有效区分2个品种。 相似文献
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刘巍 《西南林业大学学报》2017,37(5):22-27
利用8对引物对辽宁省主栽的28个杨树品种材料进行AFLP分析。结果表明:8对引物共扩增谱带数983条,其中多态性带972条,平均多态性比例98.75%,表明各品种间在DNA水平上存在广泛差异。参试品种间遗传差异较大,遗传距离为0.468 7~0.996 0,辽宁杨与辽育3号(0.468 7)、014杨与108杨(0.475 5)、177杨与中辽1号(0.493 3)间的遗传距离较小,亲缘关系较近。利用UPGMA法对数据进行聚类分析,相似系数在0.369 0~0.625 8之间;当相似系数为0.533,可将28个杨树品种分为8类;当相似系数为0.559,第3类的15个品种又可以分为5个组,分类结果与生产中生长表现基本一致。辽宁杨与辽育3号相似系数最高(0.625 8),从分子水平上验证了其亲缘关系很近。 相似文献
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为探究华北地区樱属主栽品种间的亲缘关系及遗传多样性,本研究用筛选出的14条扩增带型清晰、多态性较好的引物,对樱属31个品种进行ISSR分析。结果显示:14条引物共获得多态性谱带141条,多态性比例100%,表明供试材料间遗传多样性较高。樱属31份材料间的遗传相似性系数在0.5177~0.9220之间,表明品种间亲缘关系较近。通过UPGMA聚类分析,在遗传相似性系数为0.6时,可将31份材料分为2个类群,在0.69时可进一步分为5个亚类群,聚类结果与传统分类保持一致,这为我国华北地区樱属植物品种鉴定、引种提供理论参考。 相似文献
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利用SSR分子标记技术对5个贵州柑橘地方品种的遗传背景进行分析.结果表明,24对SSR引物在5个地方品种和参与DNA指纹比对的14个栽培品种中共检测到92个等位基因,每个位点的等位基因数变幅为2~7个,平均为3.8个;多态性信息含量(PIC)变化范围在0.36~0.78之间,平均为0.49.经过DNA指纹比对,发现其中5对引物扩增的8条特征谱带可作为地方品种鉴别的参考性标记.利用NTSYS软件进行相似性系数计算,采用UPGMA法聚类,结果显示,相似性系数为0.80,可将5个地方品种划分在不同的亚组中;地方品种米柑和牛肉红金橘均单独成组,其遗传背景独特;土柑与皱皮柑的亲缘关系较近;大果型冰糖橙与冰糖橙的遗传背景相同;红香柚与强德勒柚的遗传背景基本一致. 相似文献
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利用扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP)分子标记技术,对26份鸡冠花种质资源进行亲缘关系探讨。结果表明:1)采用8对引物组合共扩增出8 063条谱带,其中多态性条带为7 959条,多态性条带比率为98.71%,平均每对引物扩增出1 007.9个位点和994.9个多态性位点。26份种质的相似性系数居于0.264 2~0.664 8,平均值为0.464 5,每个位点的有效等位基因数为1.078 0,平均多样性指数为0.208 7,遗传相似性系数最高的是1和3号,达到0.664 8,最低的是13和24号,为0.264 2。根据遗传相似性系数进行聚类分析,在遗传相似性系数0.46处切割时,可将图中26个鸡冠花种质资源分为3个类群:24号杂交种粉色头状鸡冠花单独聚为一类,8号多头红色鸡冠花单独聚为一类;其他24个鸡冠花材料聚为一类。根据不同的花型和花色,24个鸡冠花材料又可分成6个小类群。分子聚类结果和形态聚类结果较为一致。24号杂交粉色头状鸡冠花和8号多头鸡冠花‘威信’,与其他24个鸡冠花材料的亲缘关系较远;来源于相同地区的种质资源,如19和25号同为来自于甘肃的品种亲缘关系较近;来自科研所自育品种16和23号单独聚为一类,与其他种质的亲缘关系较远。 相似文献
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运城市主栽香菇菌株菌丝特性及亲缘关系的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
《山西农业科学》2017,(2):197-199
以运城市主栽的15个香菇菌株为试验材料,采用拮抗试验、感官评定和测量不同菌株在平板培养皿的生长情况,对试验菌株的亲缘关系进行判定。结果表明,高香1号、931和武香1号为同一品种,水头808、向阳2号、808和灵仙为同一品种,其他为亲缘不同的品种。 相似文献
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以干香菇为原料研究了香菇脆片生产过程中护色漂烫、超声波辅助浸渍、真空油浴及脱油的最佳工艺。通过正交试验,探讨了褐变抑制剂柠檬酸、L-半胱氨酸、漂烫温度、时间对香菇脆片色泽的影响,麦芽糖、麦芽糊精在超声波辅助浸渍下对香菇的可溶性固形物含量的影响,以及真空油浴温度、时间、真空度、脱油时间对香菇脆片的含油率、酥脆度的影响,并分别以亮度指数L、固形物增量、感官评分为指标,优化了香菇脆片生产工艺条件。结果表明,复水后的香菇添加0.6%的柠檬酸、0.09%的L-半胱氨酸于95℃的溶液中漂烫3 min,沥干后添加5%麦芽糖+10%麦芽糊精于浸渍液中,采用超声波辅助浸渍15 min,然后调味、冷冻,在真空度0.090 MPa、温度90℃条件下真空油浴30 min、真空脱油5 min后真空包装,可以获得感官良好、含油少的香菇脆片产品。 相似文献
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为进一步探究树上干杏亲缘关系,本研究利用SSR分子标记引物技术,通过PCR扩增及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,对树上干杏等9个杏品种(类型)的18对SSR多态性引物进行鉴定,获得DNA指纹图谱,从DNA水平鉴定伊犁树上干杏品种与其他杏品种(类型)之间的亲缘关系远近.对各杏品种(类型)间亲缘关系进行聚类分析,结果表明:杏1(... 相似文献
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为了比较香菇渣和平菇渣作为土壤改良剂还田对土壤的影响,进行了将不同比例(25%,50%,75%)香菇渣和平菇渣分别添加到土壤中恒温培养100 d,每隔20 d测定其土壤中有机质含量、氮素含量及全磷含量的研究。结果表明:25%和50%香菇渣,特别是50%香菇渣对土壤有机质含量的增加有一定的积极意义;同时,香菇渣对土壤有效氮的影响比较显著,能更好地为土壤提供持续的氮素营养;除此之外,还发现两种菇渣均能有效提高土壤全磷含量,说明菇渣是一种很好的土壤改良剂,具有很强的应用前景。 相似文献
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研究不同粒色大麦品种(系)的遗传差异,为有色籽粒大麦的品种选育奠定基础。
基于大麦7条染色体上的51个简单重复序列 (simple sequence repeats,SSR)标记位点,分析25份不同粒色大麦品种(系)的遗传差异。
在25份参试品种(系)基因组中,51个SSR位点发生2~16个等位变异,PIC值变幅为0.491~0.922。品种(系)间的遗传相似系数变幅为0.569~0.872,其中wn6与wn16的遗传相似系数最小,wn16与wn17的遗传相似系数最大。聚类分析结果显示:3个黑色籽粒品系(wn-16、wn-17、wn-18)聚为第1类,3个紫黑色籽粒品种(wn-13、wn-14、wn-15)和6个蓝色籽粒品种(wn-20、wn-21、wn-22、wn-23、wn-24、wn-25)聚为第2类,5个褐色籽粒品种(wn-1、wn-2、wn-3、wn-4、wn-5)、3个黄色籽粒品种(wn-6、wn-7、wn-8)和4个紫色籽粒品种(wn-9、wn-10、wn-11、wn-12)聚为第3类。
相同粒色的大麦品种(系)具有较高的遗传相似性,wn-6与wn-16、wn-6与wn-18、wn-1与wn-24等配对品种(系)的遗传相似系数较低,可用作有色籽粒大麦品种选育的杂交亲本。
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[目的]从分子水平上了解贵州省甘蓝型油菜主推品种的遗传多样性。[方法]利用国家油菜区域试验DNA指纹鉴定使用的40对SSR引物对贵州省9个甘蓝型油菜主推品种进行多态性检测,并进行聚类分析。[结果]试验共扩增出条带191个,其中多态性条带143个,多态性比率为75%。经聚类分析,9个油菜品种被分为A、B 2簇,其中A簇包含7个品种,B簇为贵州省油料研究所选育的2个品种。A簇在相似系数0.643 4处又分为A1和A2 2个亚簇,A1亚簇为贵州省油菜研究所选育的3个品种,A2亚簇为贵州省油料研究所选育4个品种。[结论]同一单位选育出的品种都有更为接近的遗传背景;在该研究所用品种中,贵州省油料研究所选育的品种遗传基础相对较广,但黔油17与黔油29的遗传相似性系数达0.87,遗传基础较为相近。 相似文献
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海岛棉部分引进和自选品种遗传多样性的SRAP分析 总被引:1,自引:1,他引:0
[目的]探讨海岛棉种质遗传多样性,为海岛棉种质资源的利用和优良品种的选育提供参考.[方法]利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术对168份海岛棉材料进行遗传多态性分析,从224对引物组合中筛选出16对扩增条带清晰、多态性高的组合分析供试材料.[结果]共检测到129个多态性位点,每个引物组合扩增的位点数为3~12个,平均扩增位点806个.聚类分析结果表明,不同材料间的相似系数为0.27~0.89;在相似系数049水平上可将供试海岛棉材料分为4种类型,第1大类大部分是早期引进的国外品种,包括了埃及和中亚品种;第2大类包含了大部分新库系列和部分中亚品种,美国比马棉也聚在此类;第3大类主要包含了新海系列和部分中亚、苏联品种;第4大类仅有49(吉扎85)一个材料.[结论]海岛棉的相似系数变化幅度较大,材料差异较大,遗传多样性比较丰富. 相似文献
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【目的】利用SSR标记进行毛葡萄遗传多样性的分析,阐明毛葡萄种质的亲缘关系,为有效利用野生毛葡萄种质及挖掘优良基因提供参考。【方法】利用筛选的多态性SSR引物对70份毛葡萄进行SSR扩增,评价不同种质遗传多样性,并分析亲缘关系。【结果】从40对SSR引物中筛选出16对多态性引物,共扩增出123 条带,每对引物可检测到等位位点数3-15个,多态率26.7%-100.0%。PopGene分析结果表明,毛葡萄种群Nei’s 基因多样性平均指数为0.4412,多样性信息平均指数为0.6308,具有较高的遗传多样性。Nei’s相似性系数分析结果表明,70份毛葡萄种质的遗传相似系数在0.60-0.89。UPGMA 聚类分析结果表明,在遗传相似系数0.61 处,70 份毛葡萄材料可分为3大类群:第一类包含两份毛葡萄材料,编号为70和91,均来自广西罗城县;第二类包含5份材料,编号为28、1、129、3和131,除131外,其余4份来自广西罗城县;其他63份归为第三类,其中50份为广西罗城县毛葡萄。【结论】广西罗城县毛葡萄具有丰富的遗传多样性,可为毛葡萄种质资源的利用和品种选育提供参考。 相似文献