猪CD86 mRNA定量检测方法的建立

用RT-PCR技术从猪肺泡巨噬细胞中扩增和克隆了猪CD86基因部分片段,经测序鉴定后,用反向PCR技术构建了CD86的缺失竞争cDNA分子。通过竞争PCR方法,建立了CD86标准竞争曲线,并得到其直线回归方程。本方法操作简单,特异性和敏感性高,可用于猪CD86 mRNA水平的定量检测。     

猪CD80 mRNA定量检测方法的建立

用RT-PCR技术从猪肺泡巨噬细胞中扩增和克隆了猪CD80基因部分片段,经测序鉴定后,用反向PCR技术构建了CD80的缺失竞争cDNA分子。通过竞争PCR方法,建立了CD80标准竞争曲线,并得到其直线回归方程。本方法操作简单,特异性和敏感性高,可用于猪CD80 mRNA水平的定量检测,从而为分析猪的免疫状态提供了一种重要技术手段。     

猪肺炎支原体竞争定量 PCR检测方法的建立及初步应用

[目的]本试验旨在探索一种对猪肺炎支原体（Mycoplasma hyopneumoniae）培养物中的支原体进行快速检测的竞争定量 PCR方法。[方法]设计一对Mhp特异性引物,检测Mhp培养物;又根据支原体种属保守基因序列设计一对引物,通过酶切缺失法构建竞争模板,其携带与目的片段相同的引物结合区。[结果]以一系列稀释的竞争模板的对数值为横坐标（X轴）,竞争模板和目标模板扩增产物的光密度比值的校正值的对数值为纵坐标（Y轴）绘制标准曲线,根据 Y=0所对应的竞争模板的量推算求得支原体的拷贝数。以变色单位的对数值为 X轴,支原体的拷贝数为 Y轴,绘制出标准曲线,两者之间高度相关。[结论]成功建立了一种快速测定 Mhp培养物中支原体量的竞争PCR方法。     

猪IL-18 mRNA定量RT-PCR检测方法的建立

根据GenBank中猪白介素(IL)-18基因序列,设计1对引物,用RT-PCR技术从猪肺泡巨噬细胞总RNA中扩增出其411 bp cDNA片段,将其与pGEM-T Easy载体连接,经转化、筛选阳性克隆、酶切与测序鉴定后,构建出含猪IL-18 cDNA部分片段的重组质粒。后用反向PCR技术构建出与扩增411 bp片段共用同1对引物,但缺失174 bp的竞争重组质粒。通过上述2种质粒的竞争PCR方法,建立了猪IL-18 mRNA的标准竞争曲线,得到其直线回归方程^y=0.583 2x-2.903 4(R2=0.9898)。     

猪GM-CSF荧光定量PCR检测方法的建立

根据GenBank中猪粒细胞一巨噬细胞集落刺激因子（GM-CSF）基因序列设计一对引物,用RT—PCR技术从猪外周血单个核细胞中扩增出296bpcDNA片段,并克隆到pGEM—TEasy载体中。经测序鉴定后,构建出含猪GM—CSFcDNA部分片段的重组质粒。通过重组质粒的Real—timePCR方法,建立了猪GM-CSFcDNA的Real—timePCR标准曲线及其直线回归方程。该方法重复性好,敏感性高、特异性强,可用于猪GM—CSFmRNA水平的定量检测。     

耐热菌的竞争定量PCR检测方法优化与建立

 【目的】研究苹果浓缩汁中耐热菌（Alicyclobacillus acidoterrestris）的定量PCR快速检测法。【方法】通过引物设计、PCR扩增及凝胶纯化试剂盒回收，构建并获得耐热菌的PCR竞争模板；用获得的竞争模板作为定量内标物建立耐热菌的竞争定量PCR（QC-PCR）检测体系。【结果】经对建立的QC-PCR检测体系优化，目标模板检测灵敏度由5×104个分子/PCR 体系，提高到50个分子/PCR 体系，竞争模板和目标模板分子共扩增可检测到5×102个目标模板分子/PCR 体系，并能从人工回添苹果浓缩汁样品中定量检测到5×103 cfu/ PCR体系的耐热菌，整个检测时间为4～5 h，比传统的细菌培养皿培养记数法时间（4～5 d）大大缩短。【结论】本研究建立的耐热菌竞争定量PCR检测法特异、快速，可作为微生物PCR竞争模板构建和建立竞争定量PCR的方法学参考，也可用于商品果汁和苹果浓缩汁工业化生产中耐热菌的快速检测和质量安全控制。     

猪白细胞介素-8荧光定量PCR检测方法的建立

用RT-PCR技术从猪肺泡巨噬细胞总RNA中扩增出猪白介素（IL）-8基因的278 bp cDNA片段,并克隆到pGEM-T Easy载体中,构建成含有猪IL-8 cDNA片段的重组质粒。通过质粒的Real-time PCR方法,建立猪IL-8 cD-NA的Real-time PCR标准曲线。该方法特异性强、灵敏度高、重复性强,可用于猪IL-8 mRNA含量的定量检测。     

猪IL-12p40竞争定量RT-PCR检测方法的建立

根据GenBank中猪IL-12p40的序列设计引物,采用RT-PCR技术扩增377 bp的部分基因片段,并克隆到pGEM-T Easy载体中,构建成含IL-12p40部分基因片段的重组质粒. 利用反向PCR技术构建与扩增377 bp片段共用同一对引物但扩增255 bp片段的竞争重组子. 通过重组质粒与竞争重组子竞争定量PCR方法(qc-PCR),建立了猪IL-12p40的标准竞争曲线和直线回归方程.     

猪脂联素mRNA竞争性PCR定量方法的建立

脂联素是由脂肪组织特异表达分泌的一种细胞因子,随血液循环运输到肌肉和肝脏,调节葡萄糖及脂肪酸代谢。在人、猴子、小鼠中研究发现,当脂肪过度沉积时,脂肪组织中脂联素基因的表达量及血液脂联素水平均降低,而体重下降时,脂联素的表达量和血液脂联素水平又升高。所以体内脂联素的表达与脂肪沉积密切相关。但是脂肪沉积如何调控脂联素基因的表达还不清楚。     

猪痘病毒PCR检测方法的建立及应用

建立猪痘病毒(swinepox virus,SWPV)的PCR检测方法,为SWPV的流行病学调查和临床诊断提供可靠技术支撑。参考GenBank登录的SWPV(AF410153.1)基因组序列,设计合成1对引物,扩增目的片段为975 bp。以SWPV江西分离株SWPV-JX01为模板,对反应条件进行优化,建立了SWPV的PCR诊断方法。特异性、敏感性和重复性试验表明,该方法对临床上常见的其它猪病毒检测结果均为阴性;对模板的最低检测量为2.7 pg;具有良好的重复性。用此方法检测50份疑似猪痘的临床样品,其中阳性率为80.2%。该方法敏感度高,重复性和特异性良好,可用于猪痘病毒的分子流行病学调查和临床病例的诊断。     

检测猪圆环病毒2型TaqMan荧光定量PCR方法的建立

针对猪圆环病毒2型(PCV2)ORF2的序列设计两对特异性引物及TaqMan探针,以感PCV2的PK-15细胞培养上清的DNA提取物为模板,分别扩增499 bp和131 bp的片段,建立了检测PCV2的TaqMan荧光PCR方法。结果表明:TaqMan荧光PCR检测PCV2的最佳探针浓度为0.5 pmol·μL-1;TaqMan荧光PCR两步法操作快捷,扩增131 bp的引物PCF1101/PCR1232检测敏感性高(3.17×102拷贝·μL-1),重复性好。在诸多检测样品中,除检测到PCV2检测指标出现阳性外,猪呼吸与繁殖障碍综合征病毒(PRRSV),日本乙型脑炎病毒(JEV),猪伪狂犬病毒(PRV),猪瘟病毒(CSFV)及PK-15细胞等检测指标均为阴性,表明特异性强;与普通PCR的检测结果(2/10)比较,本法的敏感性和对临床样品的阳性检出率(3/10)更高。上述研究表明,本方法快速、敏感、特异,具有很高的重复性,且可实时监测,能有效检测PCV2。     

猪细小病毒和猪圆环病毒2型多重PCR检测方法的建立与应用

根据GenBank中已发表的猪细小病毒(PPV)和猪圆环病毒2型(PCV2)基因序列,对各病毒基因区进行同源性分析,确定PPV的VP2和PCV2的ORF2基因为各病毒的诊断靶序列,设计特异性引物,在建立各病毒单项PCR技术的基础上,优化多重PCR反应条件,建立了2种病毒的多重PCR技术,可同时扩增PPV的313 bp和PCV2的447 bp的特异性片段。用多重PCR技术与单项PCR技术对比检测试验证明二者的总符合率为100%。表明建立的多重PCR检测方法,具有特异、快速、准确的特点,可同时鉴别诊断这2种病毒。从10个发病猪场和门诊病例的病猪采集的211份样品,用山西省农科院畜牧兽医研究所动物基础医学研究课题组研究的多重PCR检测方法,检出猪圆环病毒2型阳性56份,阳性率为27%;猪细小病毒病阳性42份,阳性率为20%;二者混合感染17份,阳性率为8%。这为掌握山西这2种病毒的感染情况提供了依据。     

猪流行性腹泻病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立

基于猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的N基因,建立了PEDV的TaqMan探针RT-PCR检测方法。以标准质粒绘制log10拷贝数与Ct之间标准曲线的线性相关系数值为0.996,检测灵敏度为100拷贝/μL,对传染性胃肠炎病毒、繁殖与呼吸障碍综合征病毒、伪狂犬病毒和圆环病毒2型等几种猪病毒的检测结果均为阴性,批内和批间的变异系数均小于1%,表明该方法具有良好的特异性、灵敏性和稳定性。对不同代次细胞培养上清中的病毒样品进行检测,结果表明该方法能够满足PEDV野毒株分离过程中的病毒定量检测需要。     

猪磷酸二酯酶7A mRNA荧光定量PCR检测方法的建立与初步应用

为研究磷酸二酯酶(PDE)7A基因在猪体内的分布,本试验通过构建含有目的基因片段标准质粒的方法,成功建立荧光定量PCR检测PDE7A基因的标准曲线,可检测到最低1×102copies/μL的初始模板量,重复试验变异系数为2.22%～3.71%,具有较高的灵敏度和可重复性。用该方法检测到PDE7AmRNA在试验用小型猪的心肌中表达量最高(比率为4.54×10-2),骨骼肌次之(1.44×10-2),其他内脏器官较少。     

Establishment of Real-Time TaqMan-Fluorescence Quantitative RT-PCR Assay for Detection and Quantification of Porcine Lipoprotein Lipase mRNA

Porcine lipoprotein lipase （LPL） cDNA was cloned as the standard for real-time quantifying LPL mRNA and the TaqMan-fluorescence quantitative PCR assay for detection was established. The total RNA extracted from Longissimus dorsi of porcine was reverse-transcribed to cDNA. LPL cDNA was ligated with pGM-T vector and transformed into Escherichia coli TOP10. Plasmid DNA extracted from positive clones was verified by PCR amplification and sequenced. LPL was amplified by real-time fluorescence quantitative PCR from the plasmid DNA. The concentration of DNA template purified was detected by analyzing absorbance in 260 nm and then the combined plasmid was diluted to series as standard for fluorescence quantitative PCR （FQ-PCR）. The method of LPL mRNA real-time PCR was well established, which detected as low as 103 with the linear range 10^3 to 10^10 copies. The standard curves showed high correlations （R2 = 0.9871）. A series of standards for real-time PCR analysis have been constructed successfially, and real-time TaqMan-fluorescence quantitative RT-PCR is reliable to quantitatively evaluate FQ-PCR mRNA in L. dorsi of porcine.     

TaqMan荧光定量RT-PCR检测猪脂蛋白酯酶mRNA方法的建立

【目的】克隆猪cDNA,作为猪LPL mRNA定量检测的标准品,建立检测方法。【方法】用RT-PCR,从猪背最长肌的总RNA中逆转录扩增LPL的cDNA,将纯化的LPL cDNA与pGM-T载体进行连接,转化宿主菌TOP10,提取重组质粒DNA,PCR鉴定并测序分析,对质粒标准进行实时荧光定量PCR 检测。纯化质粒并检测260 nm吸光度,确定原液的重组质粒拷贝浓度并以此制备荧光定量PCR梯度浓度标准品。【结果】建立了猪LPL mRNA实时定量PCR检测方法,特异性好,检测灵敏度达103拷贝,线性范围为1×103 ～1×1010拷贝,阈值与PCR体系中起始模板量的对数值之间有着良好的线性关系（R2＝0.9871）。【结论】成功克隆了LPL实时荧光PCR定量标准,且TaqMan荧光定量RT-PCR的方法可对猪背最长肌LPL mRNA的表达进行准确定量。