对虾病原菌2—5B菌株16SrRNA基因片段的克隆和序列测定

用引物ＰＬ１－ＰＬ２ＰＣＲ扩增对虾病原菌－坎普氏弧菌２－５Ｂ菌株１６ＳｒＲＮＡ基因－１２２３ｂｐ的片段，采用ｐＵＣ１９质粒构建ｄＴ载体法完成该片段的克隆。部分序列测定及分析结果表明，该菌株与ＧｅｎＢａｎｋ中坎普氏弧菌标准株序列之间同源性为９６．９４％。     

以重复序列为靶位点的鳜鱼多位点基因打靶载体的构建

以鳜鱼(Siniperca chuatsi)为研究对象，以其重复的rRNA基因间的间隔序列为靶位点构建多位点基因打靶载体，为建立体内多位点基因打靶技术获得关键材料。先构建含TK和Neo基因的通用打靶载体pCTKNeo。采用LA Taq高保真酶扩增获得左、右同源重组引导臂HRDS1、HRDS2，经T质粒克隆后，分别插入到pCTKNeo载体Neo基因的上下游，构建成鳜鱼专用的多位点打靶载体pCTKNeo-HRDS1／2。同样将干扰素基因hIFN插入到pCTKNeo-HRDS1／2载体的Neo基因与HDRS2之间。每次克隆均经PCR、酶切和测序等鉴定DNA片段的插入及插入方向，最终构建成多位点基因打靶载体pCTKNeo-HRDS1／2-hIFN。目前的基因打靶技术存在打靶效率低、安全性等问题，以重复序列为靶位点的多位点基因打靶技术将部分解决这些问题。     

黄鳍鲷白细胞介素1β基因2种表达载体的构建

根据黄鳍鲷白细胞介素1β(interleukin-1β,IL-1β)基因全长cDNA序列(GenBank登录号为AY669059)设计、合成1对特异性引物,扩增编码黄鳍鲷IL-1β基因前体肽的基因序列,通过T-A克隆构建了克隆载体pMD18T-IL1β。以克隆载体pMD18T-IL1β为模板,以设计合成的带酶切位点的引物分别扩增黄鳍鲷IL-1β的前体肽和预测的成熟肽基因序列,经BamHI和SalI双酶切后将其插入表达载体pQE30中,构建了原核表达质粒pQE30-pIL1β和pQE30-mIL1β。经酶切、PCR鉴定并最终通过序列测定表明,基因已正确插入到载体的多克隆位点,序列和读码框都正确无误,为黄鳍鲷IL-1β基因的体外重组表达研究打下了基础。     

1个白斑综合症病毒基因的克隆及其在大肠杆菌M15中的表达

根据对虾白斑综合症病毒（white spot syndrome virus，WSSV）1个可能编码蛋白的开放读码框（open reading frame，ORF）的序列（WSSV A基因），结合pQE30载体的多克隆位点，设计1对引物进行PCR，扩增出大小为0.28kb的A基因片段。把目的片段克隆到pGEM-T Easy载体上，构建出重组质粒pGT-A，再用引物两端酶酶切出目的片段，并按正确的读码框顺序插入到pQE30表达载体上的乳糖操纵子中，构建出带有目的片段的重组质粒pQE30-A，然后将重组质粒转化到大肠杆菌M15细胞，经IPTG诱导，SDS-PAGE和Western blot显示有与A基因预期大小11kD相吻合的融合蛋白带。结果表明，来源于WSSV的这一ORF是1个可表达的基因。     

cDNA芯片结合抑制性差减杂交技术构建对虾白斑综合征病毒表达基因和螯虾免疫相关基因文库

以克氏原螯虾做为对虾白斑综合征病毒（WSSV）的增殖模型，试验组接种WSSV，对照组接种PBS。分别以试验组为检测组（tester）、对照组为驱逐组（driver），进行正向抑制性差减杂交；以对照组为tester、试验组为driver，进行反向SSH。将获得的正、反向差减杂交产物克隆入质粒载体PinPointTM Xa1 TVector，再转化大肠杆菌DH5α,共构建了2个分别含1620和400个克隆的正、反向差减文库。经PCR扩增，1514个差减克隆得到产物，其中正向差减克隆1221个，反向差减克隆293个。获得的PCR产物经浓缩、变性处理，用自动点样仪点制于尼龙膜载体上，制成cDNA芯片，用cDNA芯片对SSH获得的差减克隆进行鉴定，共获得差异表达克隆278个，其中攻毒组高表达克隆255个；对照组高表达克隆23个。     

传染性胰腺坏死病毒VP3蛋白的干酪乳杆菌表达系统构建

根据传染性胰腺坏死病毒(IPNV)VP3蛋白的全基因序列,设计并合成引物,以IPNV(ATCC VR-1318)细胞培养毒提取的核酸为模板,对传染性胰腺坏死病毒VP3蛋白的干酪乳杆菌表达系统进行了构建研究。结果显示:进行RT-PCR扩增得到截短的VP3基因约615 bp目的片段,将其克隆到pMD18-T Simple载体,经酶切、PCR扩增和序列测定后显示目的片段正确;将目的片段分别亚克隆到乳酸菌细胞表面表达型载体和分泌表达型载体,电转化于干酪乳杆菌,获得了阳性重组菌株。结果表明,通过本实验方法可构建表达传染性胰腺坏死病毒VP3蛋白的干酪乳杆菌表达系统,为实现IPNV VP3蛋白在乳酸菌中的表达及免疫原性研究奠定了基础。     

凡纳滨对虾热休克蛋白70的原核高效表达

将凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）热休克蛋白70基因（heat shock protein 70，HSP70）克隆到原核表达载体pET-3c中，经酶切和DNA测序鉴定后，将重组质粒转入表达宿主BL21（DE3），在不同温度、时间下经IPTG诱导表达。收集菌液，进行SDS-PAGE和Western blot检测，并用软件Bandscan分析蛋白表达水平。结果表明，成功构建含凡纳滨对虾HSP70基因的重组表达载体pET-3c／HSP70，表达的目标蛋白相对分子量约为72kD，并能与小鼠抗人HSP70抗体特异性结合。37℃诱导5h目标蛋白表达量最高；但25℃诱导目标蛋白的可溶性比例达80％，目标蛋白占全菌总蛋白70％以上，均较37℃为高。     

中华鲟半胱氨酸蛋白酶抑制剂C基因的原核表达

为了研究鱼类半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)的功能并探索其在水产品加工和病害防治中的应用潜力，将改造后的中华鲟(Acipenser sinensis)cystatin C cDNA亚克隆到原核表达载体pBV220，构建表达cystatinc的大肠杆菌基因工程菌。该工程菌经温度诱导、SDS—PAGE检测，在约12．4kD处有一特异蛋白带，该特异蛋白的含量约为菌体总蛋白的25％。重组半胱氨酸蛋白酶抑制剂经洗涤、溶解、透析、复性后纯度为85％，实现了中华鲟cystatinC在大肠杆菌中的高效表达。木瓜蛋白酶活性抑制实验结果表明该重组cystatinc具有明显的酶活抑制作用。     

青蟹微卫星DNA的筛选及特征分析

利用磁珠富集法,结合生物素标记的(CA)16寡核苷酸探针从青蟹基因组MboI酶切片段中筛选微卫星DNA序列.将得到的片段与pGEM-T Easy载体连接后转化克隆构建微卫星富集文库.经PCR筛选检测,对89个阳性克隆进行测序,其中52个克隆中含有64个微卫星,完全型占87.50%,重复次数超过11次的占78.12%.根据所获微卫星的侧翼序列设计并合成了30对引物,通过优化PCR反应条件,并在35只青蟹个体中进行PCR扩增检测,最终获得了10对具有多态性的引物,为进一步开展青蟹遗传多样性分析、遗传图谱构建等研究提供了基础资料.     

对虾病毒HHNBV DNA构建质粒的研究与分析

用ＰＵＣ１８构建了对虾病毒ＨＨＮＢＶＤＮＡ重组质粒，提取后经斑点杂交及酶切分析，证实质粒中插入片段为病毒ＤＮＡ，其中０５＃质粒的插入片段大于２Ｋｂ，与质粒的分子量相近。对０５＃质粒酶切后的Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交亦取得了满意的结果。同时，还对０５＃质粒的插入片段进行了内切酶图谱分析，共进行了ＥｃｏＲｌ、Ｈｉｎｄｌｌｌ、Ｓｍａｌｌ、Ｐｓｔｌ、ＰＵＶｌ、Ｈｉｎｄｌｌ６种限制性内切酶分析，结果表明，只有Ｐｓｔｌ在插入片段的一端有一个酶切位点，酶切位点的确切位置有待于进一步确定。     

鳗源嗜水气单胞菌β—溶血素基因的克隆及表达

应用PCR技术,从1株鳗源嗜水气单胞菌ML316中扩增得到β 溶血素基因AHL316HEM,将AHL316HEM克隆到pGEM TEasyVector,经分析验证后重组到pcDNA3.0中,构建了重组质粒PDLH。转化重组质粒PDLH的大肠杆菌(Escherichiacoli)DH5α能在血琼脂培养皿中形成明显的β 溶血斑,重组菌纯化的胞外产物溶血价为1.28×104HU·mg-1,同时重组菌的胞外产物能被原始菌株的高免血清特异性地识别。结果证实,克隆到鳗源嗜水气单胞菌β 溶血素基因,重组质粒PDLH能够表达具有天然生物学活性的β 溶血素,为构建嗜水气单胞菌核酸疫苗奠定了基础。     

中国对虾皮下及造血组织坏死杆状病毒（HHNBV）DNA探针的制备及应用

ＨＨＮＢＶ是１９９３年中国对虾暴发性流行病的主要病原之一。从纯化的病毒中提取ＤＮＡ，用ＥｃｏＲｌ限制性内切酶酶切成ＤＮＡ片段，与ＰＵＣ１８体外重组，建立ＨＨＮＢＶＤＮＡ文库。从中筛选出三个重组质粒（５＃、８＃、９＃），它们所插入的片段大小分别为：２．８Ｋｂ、０．８Ｋｂ、１．６Ｋｂ，它们分别用光敏生物素标记成探针，与感染ＨＨＮＢＶ的病虾ＤＮＡ呈阳性反应，以此利用制备的ＨＨＮＢＶＤＮＡ探针的高敏感性和特异性来检测虾病。     

杂色鲍哈维弧茵耐药质粒的鉴定和分析

文章对引起杂色鲍（Hallotis diversicolor）肌肉萎缩症的病原菌哈维弧菌（Vibrio harveyi）质粒上的磺胺耐药基因进行研究,结果显示,该菌株对复方新诺明完全耐药,其质粒上含有sulⅡ耐药基因。接合转化试验显示该质粒具可转移性,可使受体菌对磺胺制剂复方新诺明产生耐药性,鉴定为耐药质粒,并测定了该耐药质粒的全基因组序列,序列总长为10 940 bp,初步分析显示有7个具有一定功能的ORF框。进一步构建重组表达质粒pR-SET-A-sulⅡ,表达了目的蛋白（31 kDa）。     

Molecular cloning of Yersinia ruckeri aroA gene: a useful taxonomic tool

The aroA gene of Yersinia ruckeri , which encodes 5-enolpyruvylshikimate 3-phosphate (EPSP) synthase was cloned by complementation of the aroA mutation in Escherichia coli AB2829 by using pUC18 plasmid as a vector. Nucleotide sequence of the aroA gene revealed an open reading frame of 427 amino acids showing a high degree of homology to other bacterial AroA proteins. A pair of primers with 23 and 20 nucleotides were selected from the 5' and 3' termini, respectively, and formed the basis of a specific polymerase chain reaction (PCR) assay. A 1165-bp deoxyribonucleic acid (DNA) fragment was amplified from all lysed Y. ruckeri strains. An identical size fragment was also amplified from lysed Y. pseudotuberculosis , Y. aldovae , Salmonella enteritidis and E. coli , but not from other enterobacteria. Alu I restriction fragment length polymorphism (RFLP) of the PCR amplified products allowed for differentiation between Y. ruckeri and the other bacteria. Specificity and sensitivity make this PCR assay a useful method for rapid identification and diagnosis of Y. ruckeri infections.     

Detection and identification of Flavobacterium psychrophilum from gill washings and benthic diatoms by PCR-based sequencing analysis

A nested polymerase chain reaction (PCR) amplification technique was used to detect Flavobacterium psychrophilum from washings of fish gill surfaces and benthic diatoms as environmental samples. Gill washing samples were prepared from kawamutsu, Zacco temminckii (Temminck & Schlegel) and oikawa, Z. platypus (Temminck & Schlegel). Benthic diatom samples were collected from stone surfaces. All samples were collected from rivers in Wakayama Prefecture, Japan from November 2003 to January 2004. Following simple DNA extraction using a chelating resin, nested PCR techniques targeting 16S-rDNA and gyrB regions were performed, and PCR products were cloned and sequenced. With nested PCR amplification for the 16S-rDNA gene, ambiguous PCR products were detected from two of six samples, and by cloning and sequencing analysis were found not to be DNA fragments amplified from F. psychrophilum. Using nested PCR for the gyrB gene, however, five of six samples were clearly positive for F. psychrophilum in agarose gel electrophoresis, and were found to be identical with nucleotide sequences of F. psychrophilumgyrB deposited in DNA databases by sequencing analysis. Results indicate that nested PCR for the gyrB region is a useful technique to detect low levels of F. psychrophilum from environmental samples contaminated with many other organisms.     

大鲵虹彩病毒TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立

利用PCR技术扩增出大鲵虹彩病毒(giant salamander iridovirus, GSIV)主要衣壳蛋白(MCP)编码区长度为1 392 bp 的片段, 克隆到 pMD19-T载体上, 构建重组质粒 pMD19-T-MCP。经PCR鉴定确认正确后, 以10倍梯度稀释 pMD19-T-MCP重组质粒, 作为标准模板进行 TaqMan实时荧光定量PCR扩增, 制作标准曲线, 建立了大鲵虹彩病毒的 TaqMan实时荧光定量PCR检测方法。制作的标准曲线有极好的线性关系, 且线性范围宽, 相关系数为0.990 19。组内重复试验的CT值标准偏差为0.52%。检测结果显示, 该方法对大鲵虹彩病毒的检测有高度的特异性, 与锦鲤疱疹病毒、弗氏柠檬酸杆菌、嗜水气单胞菌以及鲤上皮瘤细胞基因组DNA之间均无交叉反应, 特异性好, 检测总DNA灵敏度为10个病毒核酸分子拷贝数, 约1.1×10-3 pg/μL病毒核酸, 较之常规PCR的敏感度高出约1 000倍。研究建立的大鲵虹彩病毒TaqMan实时荧光定量PCR方法灵敏度高、特异性强, 对大鲵虹彩病毒病的快速诊断与病毒病原定量检测有重要意义。     

草鱼呼肠孤病毒衣壳蛋白VP7基因真核表达载体pCI-VP7的构建及鉴定

将编码草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)主要衣壳蛋白VP70.9kb的基因片段连接至克隆载体pMD19-T中,筛选阳性克隆并测序,经检测为正确序列后,再将目的片段克隆入真核表达载体pCI,筛选得到阳性重组质粒pCI-VP7。然后构建pCI-VP-GFP重组表达质粒(即GFP基因与VP7的一段上游基因融合表达),用PCR及酶切方法鉴定克隆的正确性。并用脂质体法将其转染入真核细胞COS-1和CIK进行瞬时表达,荧光显微镜观察及RT-PCR特异性检测。结果表明,GFP基因与VP7的一段上游基因被成功转染到COS-1和CIK细胞,并得到了很好的表达。进而证明pCI-VP7可以成功的表达,为GCRV基因疫苗的研制提供了实验资料。     

常见淡水鱼肉制品快速鉴别方法的建立

近年来,随着肉制品掺假问题日益突出,特别是鱼肉制品中掺入廉价成分,混淆鱼肉品种,以次充好的掺假造假问题引起广泛关注.为解决这一问题,有必要针对常见的青鱼(Mylopharyngodon piceus)、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鲢(Hypo-phthalmichthys molitrix...