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4个牦牛品种的RAPD遗传多样性研究 总被引:4,自引:0,他引:4
研究采用RAPD分子标记技术对麦洼、九龙、大通和天祝白牦牛等4个牦牛品种共124头牦牛进行了遗传多样性分析.结果表明:①每个RAPD引物扩增的DNA片段数在18~33个,且所有品种均表现多态,标记多态频率平均为38.63%,检测片断大小在0.25~5 kb之间;②用Shannon多样性指数公式计算牦牛品种的遗传多样性指数(H0),结果显示九龙、麦洼、大通、天祝白牦牛的遗传多样性指数分别为0.311、0.262、0.252和0.216;③采用Rogers遗传距离公式分析4个牦牛品种间的遗传距离(DR)结果:天祝白牦牛与九龙牦牛遗传距离最大(0.0414),与大通牦牛的距离最小(0.0383);④根据DR值,将4个牦牛品种聚为两大类,九龙牦牛聚为一类,其它3个牦牛品种聚为一类.大通牦牛和天祝白牦牛在较近的水平上首先聚为一类,然后与麦洼牦牛聚为一大类. 相似文献
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用RAPD标记分析草地早熟禾遗传多样性 总被引:8,自引:5,他引:8
采用RAPD分子标记技术对从美国引进的12份草地早熟禾(Poapra tensis L.)品种的遗传多样性进行分析。结果表明,从60个随机引物中筛选的17个有效引物共扩增出104条带,其中多态性带65条,占总带数的62.5%,平均每个引物扩增出多态性带3.82条;利用NTSY S-PC软件计算品种间Jaccard遗传相似系数(GS),变化范围为0.362~0.971;用非加权组法(UPGMA)聚类分析,建立供试品种的分子系统树状图,以相似系数0.7为标准分为5类,其中新哥来德(NuGlade)、解放者(Liberator)、浪潮(Impact)、午夜(Midnight)、自由Ⅱ(Freedom Ⅱ)、超级伊克利(Total eclipse)和纳苏(Nassau)共7个品种聚为一类,兰神(Nublue)和美洲王(America)聚为一类,其余品种各自为一类;该结果对引进草地早熟禾品种资源评价与利用具有一定的参考价值。 相似文献
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新疆桑种质资源随机扩增DNA多态性(RAPD)研究 总被引:7,自引:0,他引:7
选用重复性较好的 10个随机引物对保存于新疆的 16份桑种质材料进行了RAPD分析 ,共获得 139个RAPD标记。UPGMA聚类图和材料间的遗传距离显示 :新疆的药桑独聚为一类 ,与其它材料的遗传距离在 0 75 0以上 ;皮木 1号与其它材料也有较大的遗传距离 ,在 0 5 0 0以上 ;其余的 10份材料聚为一类 ,相互间的遗传距离均在0 5 0 0以下 ;92 0 4和 94 0 8等创新种质与杂交亲本西庆 1号、西庆 2号、洛玉 1号、洛山 1号有较高的相似系数。 相似文献
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四川地方乌骨鸡种群遗传变异的微卫星DNA分析 总被引:11,自引:0,他引:11
利用10个微卫星标记,对四川不同地区5个乌骨鸡种群的等位基因频率、各群体的遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析,并根据遗传距离对这几个乌骨鸡种群进行了聚类分析。结果表明,各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富,并具有较高的选择潜力。各乌骨鸡种群间有一定的遗传距离,UPGMA聚类分析表明,四川山地乌骨鸡黑羽系与川南山地乌骨鸡被聚为一类,草科鸡与旧院黑鸡被聚为一类。 相似文献
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用RAPD标记分析高羊茅的遗传多样性 总被引:6,自引:5,他引:6
采用RAPD分子标记技术对从国外引进的15个高羊茅品种的遗传多样性进行了研究。从60个随机引物中筛选出12个有效引物,它们共扩增出85条DNA带,其中59条为多态性带,占69.41%,平均每个引物扩增出多态性带4.92条;利用NTSYS-PC软件计算出的不同品种间Jaccard遗传相似系数(GS)变化范围较大,为0.373~0.932;根据得到的遗传相似性矩阵进行非加权组法(UPGMA)聚类分析,建立高羊茅品种的分子系统树状图;以相似系数0.68为标准,可将所有品种分为3类,品种翠丽和贝克各自聚为一类,其余13个品种聚成一类。 相似文献
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以1份美国进口马蹄金(Dichondra repens)品种为对照,用RAPD和SRAP两种分子标记方法研究20份野生马蹄金种质资源的遗传多样性。结果发现,20条RAPD引物扩增出多态性条带130条,多态性比率为68.78%;22对SRAP引物扩增出175条多态性条带,多态性比率为72.31%,表明20份野生马蹄金之间具有较丰富的遗传多样性。聚类结果表明,RAPD标记将供试材料聚为两大类群,SRAP标记也将材料划分为两大类。两种标记下,供试材料呈现出较好的地域性分布规律,地理来源相近的材料能大致聚为一类,部分同聚为一类的材料在形态上也具有相似性。两种标记方法相关系数r0.01=0.910,二者存在极显著正相关,表明应用这两种技术对马蹄金遗传多样性与亲缘关系的分析具有较高的一致性和可信度。 相似文献
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不同地方乌骨鸡种群遗传多样性的微卫星DNA分析 总被引:19,自引:2,他引:19
利用家禽基因组中的10个微卫星标记,对位于不同地区6个乌骨鸡种群的等位基因频率、各群体的遗传杂合度、群体间的遗传距离等进行了分析,并根据遗传距离对这几个乌骨鸡种群进行了聚类分析。结果表明,各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富,并具有较高的选择潜力。各乌骨鸡种群间有一定的遗传距离,UPGMA聚类分析表明,黑凤乌骨鸡与白凤乌骨鸡最先被聚在一起,四川山地乌骨鸡黑羽系与川南山地乌骨鸡被聚为一类,草科鸡与旧院黑鸡被聚为一类。 相似文献
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早熟禾属植物种间关系的RAPD分析 总被引:19,自引:7,他引:12
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对10种早熟禾植物进行了基因组DNA多态性分析,对30个OPRON公司十聚体随机引物进行多态性筛选,28个可产生多态性,18个引物产生的250个DNA片段,用于计算种间的欧氏遗传相似性系数分析,在Statistic统计软件按非加权算术平均数(UPGMA)进行聚类并构建系统发育树状图,结果,10种早熟禾植物种间的亲缘关系,其变幅主要在6.7-8.5之间;其中P.botryoides与P.psilolepis之间的遗传距离最小,为6.7,其次是P.sinattenuata与P.sphondylodes遗传距离较近,为6.8,而P.sikkimensis与P.pratensis,P.sikkimensis与P.psilolepis之间的距离最远,均为10.5,这与形态学分类结果基本一致,说明RAPD分析方法可从分子生物学角度为早熟禾属植物的系统学分类提供更为有利和可靠的证据。 相似文献
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利用15个微卫星座位,分析了新西兰白兔、德系安哥拉兔、美系獭兔、齐卡G系肉兔、福建黄兔5个家兔群体的遗传多样性。结果表明:15个微卫星位点的平均等位基因数和平均有效等位基因数分别为7.400±1.639个和5.694±1.470个;5个家兔群体的平均基因杂合度和平均多态信息含量分别为0.7367和0.6994;新西兰白的平均基因杂合度和平均多态信息含量最高,福建黄兔最低。5个家兔群体的平均总近交系数(F_is)为-0.03,群体内平均近交系数(F_is)为-0.151,群体平均分化系数(F_is)为0.105(P〈0.001)。采用UPGMA法进行聚类分析,5个家兔群体聚为三类:新西兰白兔和德系安哥拉兔聚为一类;齐卡兔G系和美系獭兔聚为一类,福建黄兔独自为一类。 相似文献
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中国高羊茅种质资源遗传多样性的RAPD分析 总被引:6,自引:1,他引:5
高羊茅是广泛应用的冷季型草坪草,但有关我国高羊茅种质资源遗传多样性的研究十分匮乏。本研究利用RAPD分子标记技术,对采自我国云南、贵州、青海、湖北等地的26份逸生高羊茅种质资源进行了遗传多样性分析。试验筛选出引物20条,共扩增出179个条带,其中177个为多态性带,平均每个引物扩增出多态性带8.85条,多态性条带比率(PPB)为98.88%。材料间遗传相似系数为0.419~0.966,说明我国逸生高羊茅种质资源具有丰富的遗传多样性。根据聚类分析结果,可将26份中国本土高羊茅材料分为三大类,其中来自云南省的高羊茅基本聚在同一类,来自其余省份的高羊茅种质资源的聚类结果与其地域分布没有明显联系。 相似文献
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利用RAPD标记鉴定草地早熟禾种质资源的遗传多样性 总被引:1,自引:0,他引:1
草地早熟禾是一种重要的冷季型草坪草,广泛种植于温带地区,且拥有众多的商品品种和丰富的野生资源。本研究收集了国内外72份草地早熟禾材料,对它们苗期的株高、叶宽、叶色及分蘖情况进行了考察,结果显示材料间的表型差异显著。此外,又在材料间进行了RAPD扩增产物的多态性鉴定,20条引物共扩增出115条多态性条带,多态性比率达91%。UPGMA聚类显示,材料被聚成两大类:一类为4个国内品种/系(“沪夜”、“沪青”、“沪禾2号”和“杂禾”),另一大类为剩余的所有材料。当遗传相似系数增大后,后一大类分成3组,组Ⅰ以国外引进品种为主,组Ⅱ和组Ⅲ则集中了更多的野生材料。RAPD聚类分析结果与材料背景来源之间存在一定程度的相关,但与苗期表型性状没有相关性。 相似文献
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为丰富樱桃属分子标记,我们利用樱桃LTR引物和ISSR引物,筛选REMAP引物组合,建立了适合樱桃的REMAP标记的技术体系,并利用该标记对40个贵州地方樱桃种质亲缘关系进行分析。结果显示,适宜樱桃REMAP-PCR体系为: 总体系25 μL,MgCl2 2.0 mmol·L-1、 Taq酶0.75 U 、引物0.4 mmol·L-1 、模板DNA10 ng、dNPT 0.4 mmol·L-1,8%非变性PAGE对PCR扩增产物检测效果最好。利用上述体系筛选出10对REMAP引物组合,扩增出234个位点,平均多态性比率是92.29%。聚类分析显示,以相似性系数0.69为阈值,可以将供试材料分为3类:33种贵州地方栽培品种聚为一类,玛瑙红樱桃与4种野樱桃聚在一类,“红皮”樱桃与“青皮”樱桃聚在一类。 相似文献
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采用RAPD分子标记技术,分析了新选育党参(Codonopsis pilosula)8个品系和2个主栽品种的遗传多样性和亲缘关系。结果显示,14条引物共扩增出159个位点,其中多态位点26个,多态性位点比率为46.43%,材料间遗传相似系数范围在0.771 9~0.964 9,说明甘肃省主栽党参品种资源具有较丰富的遗传多样性。根据聚类分析结果,党参品种DS6与所有其他供试材料的亲缘关系最远,可单独聚为一类;DS3与DS8的亲缘关系最近,其相似系数为0.964 9。 相似文献
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湖南省10个现行栽培桑树品种的AFLP指纹图谱分析 总被引:1,自引:0,他引:1
利用扩增长度多态性(AFLP)分子标记技术,构建湖南省现行推广的10个桑树品种的指纹图谱,作为该省区桑树遗传育种辅助选择和品种鉴定的重要依据。从36对AFLP引物中筛选出带型丰富、多态性较高的5对引物对10份桑树品种材料进行扩增,共检测到344条多态性条带,多态性比率达27.88%。品种之间的遗传相似系数以及UPGMA聚类分析结果与基于形态学方面的分类结果一致,在遗传相似系数0.79处,10个桑树品种聚为3类:三倍体品种湘桑6号单独聚为一类,其余9个品种聚为一类,其中广东桑品种苗33又单独聚为一类,8个鲁桑品种聚为一类。 相似文献
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为了研究不同鸽种群之间的遗传多样性,本研究利用简化基因组(GBS)技术对太湖点子鸽、塔里木鸽、银王鸽、石歧鸽、豫中鹁鸽进行测序,共获得有效数据44.49 Gb,平均测序深度为0.88×,共检测到361 937个高质量SNP位点;通过对SNP进行系统进化树和主成分分析,可大致将5个鸽种群划分为4个大类,银王鸽与石歧鸽聚为一类,新疆塔里木鸽、豫中鹁鸽和点子鸽均各自聚为一类,表明鸽种群间的亲缘关系主要受地域起源影响。本研究结果在分子水平为鸽群亲缘关系分析和系统分类提供理论支撑,并为我国地方鸽种质资源的开发和利用提供了科学依据。 相似文献
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试验旨在探明不同青稞品种(系)秸秆的饲用品质。试验以西藏普遍种植的7份青稞品种(系)为试验材料,通过聚类分析、相关分析和主成分分析,明确7份青稞品种(系)秸秆的饲用价值。结果表明,通过聚类分析青稞秸秆的营养品质可分为三大类,14-3492、QTB25、13-6927聚为一类,藏青3000、藏青2000、QTB13聚为一类,喜拉22单独为一类。试验材料中粗蛋白(CP)含量与粗脂肪(EE)、灰分(Ash)、钙(Ca)含量呈正相关,与磷(P)含量呈显著正相关(P<0.05),与酸性洗涤纤维(ADF)、粗纤维(CF)、中性洗涤纤维(NDF)含量呈负相关。秸秆营养成分综合评价排序为14-3492>QTB25>13-6927>藏青3000>藏青2000>QTB13>喜拉22。研究表明,综合考虑秸秆营养品质的情况下区内种植饲用青稞时可优先选择14-3492、QTB25、13-6927品种(系),有利于提高饲草的转化率,促进畜牧业发展。 相似文献