辣椒花药转录组SSR位点信息分析及标记开发

为开发高效实用的EST-SSR标记,对辣椒(Capsicum annuum L.)花药样品的转录组进行测序,去冗余后得到44 832条转录本序列。对所有转录本进行SSR分析,共检测出7 189个SSR位点,分布于5 721条转录本上。SSR位点出现频率为16.04%,平均每7.90 kb检出1个SSR位点。分析SSR位点特征发现,97.80%的SSR重复序列长度在10～30 bp之间,单核苷酸和三核苷酸为主要重复基元类型,各占SSR总数的45.31%和35.99%;全部SSR位点共有159种重复基元,除单核苷酸重复外,AG/CT、AAG/CTT为优势重复基元,分别占SSR总数的9.72%和8.43%。随机选择29对EST-SSR引物在8个供试辣椒自交系中进行扩增发现,引物有效性为93.10%,多态率为17.24%。本研究中开发的EST-SSR标记可为辣椒的种质资源遗传多样性分析、分子标记辅助育种等提供支持。     

甘蓝型油菜 ‘西农18’ 种子纯度的SSR鉴定

为了建立有效的SSR分子标记方法鉴定甘蓝型油菜‘西农18’品种纯度,以提高‘西农18’大田制种纯度提供分子辅助工具.以甘蓝型油菜杂交种‘西农18’及其父母本为材料,利用SSR分子标记方法对材料进行差异性分析.结果表明,在200对SSR引物中,发现引物BRAS023在杂交种和父母本之间存在显著差异且条带清晰可辨,差异性以杂交种带有父母本的特异带型存在.利用该引物对150株杂交种进行纯度鉴定,结果为86%,与大田杂交种纯度鉴定结果89%相比,SSR标记与大田种植鉴定结果基本一致.这个结果证明,引物BRAS023可用于‘西农18’的纯度鉴定.     

棉花杂交种种子纯度的SSR分子标记鉴定方法

种子的纯度是影响杂交棉发挥其杂种优势的重要原因。本研究基于不同棉花品系之间的遗传变异,筛选出杂交种亲本间具有多态性,且为共显性的SSR核心引物,用于杂交种种子纯度鉴定。通过统计每个检测引物扩增带型的差异或一致性,综合得出杂交种的种子纯度。利用该方法,对4个棉花杂交种种子的纯度进行SSR分子标记鉴定,为棉花杂交种纯度鉴定提供参考。     

利用SSR分子标记鉴定玉米杂交种‘吉祥1号’纯度

纯度是种子质量的重要指标。‘吉祥1号’玉米杂交种是在甘肃省选育并大面积栽培的主推玉米品种。为鉴定该品种的纯度,本研究开展了‘吉祥1号’纯度鉴定SSR标记方法研究。通过比较快速提取法和改良CTAB法2种DNA提取方法在SSR分子标记纯度鉴定中的应用,结果表明:2种方法提取的DNA均适用于SSR分子标记纯度检测,但快速提取法具有简单、快速的特点,更适用于分子标记纯度鉴定。从20对SSR引物中筛选出2个标记bnlg2291k4和bnlg2305k4,用于‘吉祥1号’品种的纯度鉴定,2个标记均能明显的区分亲本和杂交种。在‘吉祥1号’杂交种中人为混入双亲,采用本研究确定的方法可准确鉴定出混入的自交系。     

SSR标记对甜瓜杂交种‘众天翠雪’纯度的鉴定

旨在筛选能够用于甜瓜杂交种纯度和真实性鉴定的SSR引物。利用公认的18对多态性较好的甜瓜SSR(Simple Sequence Repeats)引物对甜瓜杂交种"众天翠雪"及其亲本进行多态性筛选,并在杂交群体中进行验证。13对引物在亲本间具有多态性条带,经过多次重复,筛选到2对引物在亲本间具有多态性、子代中兼具双亲条带,并且在子代群体中检测结果与田间形态鉴定结果一致。引物RF151和RF144能够作为‘众天翠雪’杂交种纯度鉴定的特异引物进行纯度检测。作为共显性标记特性的SSR分子标记可以作为杂交种纯度鉴定的重要工具。     

SSR标记对甜瓜杂交种‘玉贵人’纯度的鉴定

为了精准快速地筛选出鉴定甜瓜杂交种纯度的SSR引物,本研究利用18对甜瓜SSR核心引物对甜瓜杂交种‘玉贵人’及其亲本进行引物筛选和种子纯度鉴定。结果筛选出2对引物(CmS57和CmS59)在子代中兼具双亲条带并且在亲本间具有多态性,且条带清晰,间隔明显,并利用这2对引物在杂交群体中进行验证,纯度鉴定结果为97.8%和100.0%;SSR分子标记的鉴定结果与田间调查结果的误差为1.1%。表明本研究筛选出的引物CmS57和CmS59能够作为特异引物对甜瓜杂交种‘玉贵人’进行种子纯度检测,也说明应用SSR分子标记技术对甜瓜种子的纯度鉴定是可行的。     

秋水仙素对辣椒生长的影响及多倍体诱导效应研究

以秋水仙素为诱变剂,比较了不同浓度和不同处理时长组合下辣椒(Capsicum annuum L.)的生长差异和多倍体诱导效应.结果表明:和对照植株相比,所有处理变异植株在形态上表现为叶片宽大,叶色较深,茎变粗且节间距长,气孔增大;相关指标都表现出显著或极显著的差异,而且随着处理强度的增加差异更为明显.秋水仙素诱导产生的变异植株经染色体倍性鉴定植株表征为嵌合体(2 n=24或2 n=48).相同处理时长下,不同浓度秋水仙素溶液对辣椒多倍体诱导效应差异显著,而对相同浓度下不同处理时长对植株叶片数和气孔面积影响差异不显著(P>0.05),其它指标差异极显著(P<0.01).秋水仙素浓度与处理时长之间存在交互作用,不同处理之间除气孔面积差异不显著之外,其它指标间差异显著或极显著.结合加倍率和植株死亡率综合分析后认为,用0.05%的秋水仙素溶液处理6天诱导效果最佳,诱导诱导加倍率可达26.1%.     

‘北斗75’青萝卜杂交种纯度SSR分子标记鉴定

品种纯度是衡量种子质量的关键指标之一。为高效、准确鉴定‘北斗75’青萝卜杂交种纯度,本研究筛选确定了一个条带清晰、多态性高的引物P26,在‘北斗75’青萝卜亲本及F1代间有共显性差异,并进一步利用引物P26对‘北斗75’青萝卜杂交种纯度进行鉴定。结果表明,与形态学鉴定进行比较,两种鉴定方法结果偏差≤2.00%,其方差分析显示两种方法差异不显著;纯度鉴定结果显示,所有样品种子纯度结果均>98%,说明该引物对于‘北斗75’青萝卜杂交种的纯度鉴定方法稳定可靠;利用该引物对13个青萝卜商品种进行检测,结果在其他品种中扩增出不同的条带,说明引物P26具有很高的特异性,可以特异性区分‘北斗75’青萝卜商品种,具有一定的研究价值。     

利用SSR标记鉴定玉米杂交种纯度技术规程

在对玉米籽粒DNA提取和SSR扩增片段检测方法等研究的基础上,建立了一套利用SSR标记进行玉米杂交种纯度鉴定的技术规程.该规程主要特点为从粉碎干种子提取DNA和利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离SSR扩增片段,便于对大量种子样品进行分析,对仪器设备要求较低,简单快速,易于推广.     

利用SSR标记鉴定掖单13号种子纯度

以掖单13号玉米杂交种及其亲本自交系为材料,对15对SSR引物进行筛选,选出适合该杂交种纯度鉴定的SSR位点引物;建立了利用SSR分子标记技术检测掖单系列玉米杂交种纯度鉴定的方法。该操作程序简单、快速、对仪器设备要求较低,易于推广。     

牛角椒品种SSR标记鉴定技术研究

以20个牛角椒品种为初筛材料,40个牛角椒品种为复筛材料,从120对SSR引物中筛选出21对适合牛角椒品种鉴定的引物,21对引物共检测出62个等位基因变异,等位基因变异范围为2~7个,每个位点平均等位基因变异数为3个。138个牛角椒品种遗传聚类分析结果显示,21对引物能够将所有品种进行有效鉴别,品种间遗传相似性介于0.419~0.984之间,至少存在1个位点的差异,由该21对SSR引物形成的引物组合可用于牛角椒品种的鉴定。     

利用SSR标记快速鉴定玉米杂交种农大108和豫玉27的种子纯度

本文利用SSR标记技术分别筛选出玉米杂交种农大108和豫玉27的特异性引物,结合单籽粒DNA快速提取方法,建立了两个品种的种子纯度鉴定试剂盒.实验表明,应用此试剂盒可快速、有效地鉴定两个杂交种的种子纯度.     

SSR分子标记在玉米种子纯度鉴定中的应用

SSR是建立在PCR技术上的一种广泛应用的分子标记，具有含量丰富、多态性高、共显性等优点。本文简要介绍了SSR分子标记技术的原理和特点，重点介绍了SSR分子标记技术在玉米种子纯度鉴定上的研究进展，并就其在玉米种子纯度方面的应用潜力进行了探讨。     

利用SSR技术快速准确鉴定杂交玉米种子纯度

利用一种快速、廉价的DNA提取方法,提取了两个玉米杂交种及其亲本的DNA用于SSR分子标记分析。分析结果显示,10对被分析的引物中有4对在两个杂交种双亲之间显示出多态性,可以用于相应的杂交种纯度分析。另外,分别利用同工酶技术和SSR分子标记技术同时分析了来自这两个杂交种的种子样品的纯度,分析发现,对于一个杂交种,两种方法都能可以鉴定,并且两者检测的结果是一致的,但是对于另外一个杂交种,由于其父母本非常接近,同工酶不能将其区分。因此,这些结果显示SSR分子标记技术可以很好地用于杂交玉米种子的纯度鉴定,即使是这个杂交种是来自两个非常接近的自交系的。     

鉴定甘蓝型油菜杂交种种子纯度的SSR分子标记引物筛选

为了建立一套快速可靠的甘蓝型油菜杂交种纯度的鉴定方法,选择具有代表性的6份油菜品种(组合),采用20对SSR甘蓝型油菜首选核心引物对供试材料进行引物筛选,并将筛选出的引物应用于杂交种的种子纯度鉴定.目前已为其中每个杂交种(组合)平均筛选出1～3对引物,经大田验证可用于杂交种的真假鉴定和纯度鉴定,应用前景十分广阔.     

利用SSR标记鉴定结球甘蓝杂交种真实性及纯度

本研究利用公开发表的50对甘蓝SSR引物对5份结球甘蓝杂交种构建指纹图谱,对新调入的4个批次结球甘蓝杂交种与对照品种是否属于同一品种(即真实性)进行鉴定,并依据指纹图谱筛选双条带引物,对其中某一批次的10份杂交种进行纯度鉴定。指纹图谱鉴定结果表明:新调入4个批次杂交种中有3个批次与对照属于同一品种,1个批次与对照属于不同品种,与田间形态鉴定结果完全吻合。利用筛选出的SSR标记对10份甘蓝杂交种进行纯度鉴定,其中8份鉴定结果与田间形态鉴定结果一致,两种鉴定方法显著相关。本研究为利用SSR标记进行甘蓝杂交种真实性及纯度鉴定的实践可行性提供理论依据和参考。