中国芸芥遗传多样性RAPD标记分析

 选择我国不同生态地区有代表性的芸芥材料 ,利用RAPD标记技术进行分子标记差异分析 ,根据遗传相似系数计算不同材料RAPD数据的遗传距离矩阵 ,按UPGMA方法对研究材料进行了聚类。研究结果表明 ,我国芸芥具有比较大的遗传多样性 ,12个引物共扩增出 131条DNA带 ,其中 10 5条表现出多态性 ,占总带数的 80 .15 % ,不同生态类型地区来源的材料有各自的特征带。 2 0个材料的遗传距离在 0 .1178～ 0 .4 994之间 ,其中以和田芸芥与其它材料的遗传距离最大 ,而神池芸芥与朔州芸芥遗传距离最小。聚类分析表明 ,2 0个材料可分为 4组 ,其中和田芸芥和四川芸芥各自列为一组 ,和田芸芥可能是我国芸芥的一种新类型。组别划分与材料的地理亲缘关系及植物学形态特征相似性有关     

利用RAPD分子标记技术分析玉米种质遗传多样性

通过RAPD分子标记方法对13份玉米材料进行遗传多样性研究,将其划分到相应的杂种优势类群中,通过与材料的系谱和数量遗传学划分结果比较,有一定亲缘成分的自交系多归于一类,说明利用RAPD分子标记方法可以对玉米自交系亲缘关系进行划分.     

芸芥(Eruca sativa Mill.)对菌核病的抗性研究

 经对芸芥和甘蓝型油菜进行苗期菌丝块接种鉴定和花期带菌牙签鉴定表明,芸芥品种总体抗性水平高于甘蓝型油菜。所鉴定的32个芸芥品种中,抗病品种22个,占供试品种68.8％,感病品种10个,占供试品种31.2％,没有中感和高感品种。所鉴定的32个甘蓝型油菜品种中,抗病品种10个,占供试品种的31.3％,感病品种22个,占供试品种的68.8％。在芸芥中有毛类型与无毛类型有一定差异,有毛类型抗性较强。当接种菌核菌后,芸芥体内酚类物质含量迅速增加,36h后达较高水平,以后略有升高。     

福建笋子芥种质资源遗传多样性的RAPD分析

从200个随机引物中筛选出10个引物,对11份笋子芥材料进行RAPD分析,并对笋子芥遗传多样性和分类进行研究.结果表明:10个引物共扩增出93个位点,其中多态性谱带65条,多态性程度为69.9%;平均每个引物产生9.3条多态性谱带,每个引物可扩增出7-13条,谱带大小为100-2000 bp.聚类分析结果表明,遗传距离为0.38时,11份笋子芥可聚成四大类群.     

中国芸芥栽培品种亲缘关系的RAPD分析

 用100个随机引物对18个芸芥品种的基因组DNA进行扩增,结果有10个随机引物得到了稳定一致的RAPD谱带,扩增出的谱带数在2～17条之间,共扩增出91条谱带;采用UPGMA法对扩增出的谱带进行遗传聚类分析,在遗传距离(D)=0.1333处,将供试芸芥品种分为2类8组,揭示了供试芸芥品种的亲缘关系。     

芸芥（E.Sativa Mill.）柱头总RNA提取方法比较研究

为了确立一种适合于芸芥柱头总RNA的提取方法,以芸芥柱头为材料,在常规异硫氰酸胍法的基础上提取和纯化总RNA.结果表明.采用常规异硫氰酸胍法提取的芸芥柱头总RNA,28 S RNA和18S RNA条带的亮度之比接近于1:1,而不是所要求的2:1,产生了明显的降解.改进异硫氰酸胍法提取的芸芥柱头总RNA,28S RNA和18S RNA条带的亮度之比接近于2:1,提取的RNA完整性好,但存在痕量DNA污染.用DNase降解痕量DNA,发现DNA去除较干净,且RNA没有发生降解,可作为反转录底物进行第一链cDNA合成.确立了一种适合于芸芥柱头总RNA的提取与纯化方法,为芸芥自交亲和基因的克隆及功能分析奠定了基础.     

芸芥(Eruca.sativa Mill)总DNA提取方法及RAPD扩增体系研究

以芸芥9370为材料,在SDS法的基础上,通过改变离心时间,操作步骤,建立了一种较快速提取芸芥基因组DNA的方法。使用美国伯乐公司生产的Mycycler TM thermal cycler扩增仪,对影响RAPD扩增的因素进行了比较研究,确定了模板、10×buffer(主要含Mg2 )、、dNTPs、引物和Taq DNA聚合酶的适宜量和最佳的循环次数。试验结果表明在25μL体系中使用18.5μL ddH2O,2μL 10×buffer(主要含Mg2 ),2μLdNTPs,1μL引物,0.5μL TaqDNA聚合酶,1μL模板;反应条件为94℃预变性4 min,然后进行94℃50 s,38℃退火1 min 20 s,72℃延伸2 min,40个循环后,再在72℃延伸10 min,芸芥RAPD扩增效果较好。     

5种食用菌遗传多样性的RAPD分子标记

为了探讨RAPD在食用菌遗传多样性鉴定中的应用,用RAPD方法对5种食用菌子实体和菌丝体进行研究,RAPD可在一次试验中同时观察到大量的DNA多态性片段,该方法具有简单、快速、成本低等优点。电泳分析结果表明,RAPD很明显地区分了这5种食用菌。说明RAPD不仅对食用菌遗传多样性和系统发育研究的应用前景广阔,而且在食用菌的菌株鉴定上具有很大意义。     

利用RAPD标记分析百合种质的遗传多样性

中国是百合属植物的起源中心,栽培和应用历史悠久。如何评价及充分利用我国丰富的百合资源是选育优质百合品种的一个重要课题。本研究以全国各地收集获得的45份百合种质（包括21份野生种和24个栽培品种）为材料,利用RAPD技术对这些百合材料进行遗传多样性的分析及亲缘关系的鉴定。结果表明：从300条引物中筛选获得29条可重复多态性引物（1条野生种特异引物：S249引物）。以45份百合材料总DNA为模板29条引物共扩增出398个多态性位点。UPGMA聚类分析表明：45份材料的遗传距离在0．158～0．504,平均遗传距离是0．370。45份材料可以分为5类：包括云南地区野生种、铁炮百合杂交系、亚洲百合杂交系、东方百合杂交系和其他地区野生种。     

圆鼻巨蜥遗传多样性的RAPD分析（摘要）

[目的]采用RAPD技术对圆鼻巨蜥（Varanus salvator）进行遗传多样性分析。[方法]用20个随机引物对圆鼻巨蜥36个个体的基因组DNA进行PCR扩增。[结果]有10对引物能扩出清晰稳定的条带,共扩增出2952条DNA片段,平均每个个体扩增出82个条带,其中47条具多态性,多态性位点比为57.32%,36个个体间遗传距离为0.0359～0.3359,平均遗传距离为0.13592。Neis基因多样性指数H=0.1819,Shannons多样性指数I=0.2630,表明圆鼻巨蜥具有较高的遗传多样性。[结论]采用UPGMA法构建了36个个体相互关系的分子聚类图,发现没有形成明显的种群分化。     

RAPD Assessment of Genetic Diversity of Yunjie(Eruca sativa Mill.) in China

Genetic diversity of Yunjie (Eruca sativa Mill. ) in China was assessed by analyses of RAPD (randomly amplified polymorphic DNA) markers. Twenty native cultivars representing Yunjie-growing ecotypes in China were selected as material in this study. Twelve out of the 64 tested random decamer primers were able to identify 131 stable RAPD bands from these Yunjie cultivars. Of them 105 bands, or 80.15% of the total, were polymorphic. Most Yunjie cultivars from the same ecotype had their characteristic DNA bands.Cluster analysis by unweighted pair group method of arithmetic means (UPGMA) suggested that the 20 Yunjie genotypes could be divided into four groups. The genetic distances among the 20 cultivars varied from 0. 117 8between Shuozhou and Shenchi to 0. 499 4 between Hetian and Xiliang. Hetian alone could be a new type of Yunjie identified in China because it had the greatest genetic distance from all the other tested cultivars. These results indicate that Chinese Yunjie have abundant genetic diversity. Classification of Chinese Yunjie based on the RAPD information was in good agreement with the relationships between these Yunjie cultivars in their geographic origins and their plant morphology.     

利用RAPD标记分析青麻种质资源的遗传多样性

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)分子标记技术对来自全国各地的48份青麻种质资源的遗传多样性进行了检测.结果表明,青麻具有丰富的遗传多样性,在48份青麻种质资源中.17条RAPD引物扩增出191条带,多态性条带比率(PPB)为87.43%,扩增产物片段大小在0.I-3.0kb之间.     

不同自然分布区刺梨遗传多样性的RAPD分析

 收集了 4省 30个野生刺梨样品 ,采用 16个随机引物扩增的RAPD标记 ,对不同自然分布区刺梨的遗传多样性进行分析。这些引物共产生 94条带 ,其中 6 2条 (6 5 .96 %)表现多态性 ;样品的多态性百分率、样品组合的相似系数及聚类分析结果都表明 ,来自贵州的样品蕴藏有最丰富的遗传多样性 ,贵州的刺梨是进一步遗传改良最重要的遗传资源 ;而川西的 5个样品的遗传差异性最小 ;来自鄂西高海拔地区的 3个样品具有较高的遗传差异性 ,其果实性状上表现出很大的特异性 ,在刺梨的新品种培育上显示了特殊价值。     

玉米轮回选择群体遗传多样性RAPD分子标记评估

采用RAPD标记技术,评估中国西南地方优良种质巫溪（W）、美国玉米带坚秆综合种BSSS#-9（B）、墨西哥热带种质墨黄九（M）及以它们为主体亲本人工合成的WBMC#-0基础群体、改良一轮的WBMC#-1群体的遗传变异。结果表明：（1）15个10-mer随机引物共扩增89个DNA片段,其中显示多态性的片段,在W、B、M、WBMC#-0、WBMC#-1中分别为68、67、71、76和82个,其多态片段比例依次为76.4%、75.3%、78.9%、85.4%和92.1%;(2)5个群体各89个片段的平均杂合度W为0.285、B为0.252、M为0.296、WBMC#-0为0.327、WBMC#-1为0.346,以WBMC#-0和WBMC#-1较大;(3)5个群体各89个片段的平均遗传距离W为0.2533、B为0.2246、M为0.2481、WBMC#-0为0.3006、WBMC#-1为0.3119,也以WBMC#-0和WBMC#-1较大;(4)累加各引物扩增的基因型种类,W为136、B为117、M为128、WBMC#-0为151、WBMC#-1为150。以上结论说明,人工合成的广基玉米群体,遗传多样性比亲本群体丰富,且这种多样性属DNA变异,并非环境造成。经过一轮选择后的C#-1群体保持了群体内广泛的遗传变异。     

Genetic Diversity of Testa Pigments and RAPD Marker of Yellow-Seeded Rapeseed (Brassica napus L.)

14 yellow-seeded rapeseed lines (Brassia napus L. ) from different genetic sources were used toanalyze diversity of testa pigments content, oil and protein content, and RAPD markers. The results showedthat the anthocyanin and melanin were the most important pigments in testa and their content were responsiblefor the variation in seed color ranging from orange to black yellow, 14 yellow-seeded lines could be classifiedinto 3 groups., high anthocyanin content group with anthocyanin content over 2.54 mg g-1 DW, the seed colorwas light yellow or orange; low pigments content group with low content of anthocyanin and melanin, the testawas transparent and the seed color was light yellow, greenish yellow or twany; high melanin content groupwith melanin content over 178.4U(A290nm), the testa was black, the seed color was black yellow. Oil eantentchanged from 36.2% to 45.5%, protein content from 21.1% to 27.7%, and the correlation analysis revealedthat the oil content is highly significantly negatively correlated with the protein content. The cluster analysisshowed that the extensive genetic variation existed among 14 yellow-seeded lines by using unweighted pairedgroup method with arithmetic average (UPGMA) based on RAPD markers which were amplified with decamerprimers, the genetic similarity among them ranged from 0.25 to 0. 909, and 14 yellow-seeded lines could putinto 2 clusters corresponding to genome difference.     

应用RAPD分析亚麻种质资源遗传多样性研究

[目的]对40份亚麻种质资源进行分类。[方法]通过RAPD技术分析,利用类平均法（UPGMA）进行了聚类分析。[结果]从供试材料中筛选出11条具有多态性的RAPD引物。RAPD引物共扩增到71条清晰的多态性条带,多态性比率为88.8%。对标记结果进行了UPGMA聚类分析,聚类结果表明地理位置相近的品种聚为一类。[结论]为大批量亚麻种质资源的鉴定和分类以及资源的有效利用提供了理论依据。     

发根农杆菌介导芸芥的遗传转化及其次生代谢物的研究

[目的]研究发根农杆菌介导芸芥的遗传转化条件,并测定次生代谢物的含量。[方法]通过发根农杆菌R1000介导的遗传转化,建立芸芥发状根的诱导和培养体系,采用氯化钯分光光度法和高效液相色谱法对该发根培养物合成硫苷的能力进行初步分析,并分析乙酰丁香酮（As）、浸染液pH值和浸染时间等因素对发状根转化频率的影响。[结果]子叶的转化率明显高于下胚轴;AS最佳浓度为100mg／L,浸染液最佳pH值为5．4,最佳浸染时间为20min。PCR的鉴定结果表明,发根农杆菌R1000的rolB基因已成功地转入并整合到该发根培养物的基因组中。[结论]该方法建立了芸芥发状根培养体系,并初步分析了该发状根中硫苷的含量,为以后的研究奠定了一定的基础。