Study of polymorphism of satellite DNA of improved and local horse breeds

Interbreed differentiation of 12 improved and local horse breeds is studied based on 17 DNA microsatellites. Genetic differences between breeds are established; private alleles are noted in the majority of breeds. Genetic distances between breeds are calculated, an analysis of which shows considerable genetic differences between local and improved breeds.     

家鹅ND4基因多态性与遗传结构研究

四川白鹅、狮头鹅、豁眼鹅、伊犁鹅、朗德鹅和莱茵鹅是具有独特种质特性的家鹅品种.该试验利用直接测序法测定了具有独特种质特性,在鹅杂交育种中被广泛应用的四川白鹅等6个家鹅品种线粒体ND4基因的部分核苷酸序列(621 bp),共检测到了4种单倍型,4种单倍型的频率分别为0.467、0.033 3、0.467、0.033 3,单倍型多样性为0.582;各品种间的核苷酸分化系数(Nst)在0至1之间;6个家鹅各品种内核苷酸多样性(Pi)很低,各品种间的遗传距离(D)很小,遗传相似度高,而且同属于灰雁或鸿雁的家鹅品种之间的遗传相似度比分属于灰雁、鸿雁的家鹅品种之间的遗传相似度更高.另外,对这6个家鹅品种的遗传结构形成原因和杂交利用进行了初步分析.     

用20个微卫星标记研究鲁西黄牛和渤海黑牛的遗传多样性

用20个微卫星座位分析了鲁西黄牛、渤海黑牛及用作参照的秦川牛品种的遗传多样性。3个中国黄牛品种在20个座位的等位基因数为4~25个,平均等位基因数接近9个。各座位等位基因长度与欧洲普通牛相似,但平均等位基因数高于报道的欧洲普通牛和部分中国其它黄牛品种。3个品种在不同座位均发现部分特有基因,以渤海黑牛居多,在3个座位检测到7个特有基因。平均有效等位基因数达到6个以上,平均杂合度接近0.8,平均多态信息含量约为0.85,这几项变异参数在3个品种间没有明显差异,但高于欧洲普通牛群体和报道的中国部分黄牛群体的相应值。结果表明,3个品种在当地生态条件下,经数千年的选育积累了丰富的遗传变异,属宝贵的遗传资源。遗传相似度分析结果显示,渤海黑牛先与秦川牛聚为1类,再与鲁西黄牛聚在一起,引证了鲁西黄牛受瘤牛血统影响较大的结论。     

用异种免疫方法测定猪品种差异的研究

本文用异种免疫方法研究了不同品种猪的血清反应差异。对五个差异较显著的品种(太湖猪、新淮猪、约克夏、内江猪、克米洛夫)进行研究。采用免疲比浊法进行交叉血清反应,应用免疫相关系数比较不同品种、不同类群的差异程度。发现同源抗原抗体反应浊度大于异源反应浊度,品种差异越大,交叉反应越弱,反之越强。并对太湖猪的三个类群(梅山、枫泾、二花脸)和姜曲海、长白猪用同种方法进行试验。其结果与上相符,即太湖猪不同类群之间差异最小;太湖猪与姜曲海之间的差异次之;太湖猪和姜曲海与长白猪之间的差异最大。 试验表明,不同品种以及品种中不同类群间也存在血清交叉反应强度和亲缘关系的对应关系。     

基于线粒体COⅠ基因15个鸡种的DNA编码研究

 【目的】探明地方鸡种与引进鸡种遗传多态性特点,探讨COⅠ这一特定基因的特定区段作为DNA条形码在识别鸡种方面的可行性和有效性。【方法】以13个中国地方鸡种和2个国外引进品种为研究对象,利用DNA测序技术测定了线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（cytochrome c oxidaseⅠ,COⅠ）基因部分序列。【结果】选择的这段COⅠ基因序列有38个突变位点,15个鸡种单倍型多样度平均为0.963,核苷酸多样度平均为0.00518,其中引进鸡种明显低于地方鸡种（除藏鸡外）;15个鸡种品种间Kimura双参数遗传距离为0.056%—0.917%,种内遗传距离为0—0.346%,15个鸡种的DNA分类和形态学分类基本一致,引进鸡种与地方鸡种分歧较远。【结论】利用线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ（COⅠ）这一特定基因的特定区段来做DNA条形编码的基础,进行不同鸡品种鉴定,具有可行性和有效性。     

鸡品种随机引物扩增多态DNA的研究

用12个随机引物对6个鸡品种60个个体核DNA进行了RAPD扩增,共检出223条扩增片断,多态性片断188条,占843%。反映了品种内和品种间的遗传变异。12个引物对60个个体分别扩增出16,21,22,17,17,20,22,12,18,23,18,16条带。品种内和品种间遗传相似度变异范围为07981～08685和05993～07813。肉鸡AA品种内变异程度最大,且与伊莎褐遗传距离最大为04007。海兰白和海赛克斯褐首先聚类。肉鸡AA在UPGMA法中与海兰褐聚类后再与其它4种蛋鸡聚类。在NJ法中与海兰褐和其它4种蛋鸡的聚合同时聚类。说明了肉鸡AA与5种蛋鸡品种的距离较远。12个引物在6个鸡品种共检测到7条品种特异带和3条与性别相关带。     

美国水稻品种农艺性状和品质性状的温度钝感特性研究

对32份美国稻品种和12份国内水稻骨干亲本材料的农艺性状与品质性状的钝感值进行了评价,从中选择表现最为钝感的14份优质品种与国内5份相对较钝感的材料,进行了品质性状的对比分析。结果表明:美国水稻品种在垩白率、糙米率、精米率上表现钝感,垩白率尤其钝感,筛选出C94-303、Lemont等几个对温度表现钝感的品种,可作为重庆等高温伏旱区选育优良“三系”杂交稻亲本加以利用。     

凉山半细毛羊与山谷型藏绵羊染色体核型的比较

以微量全血培养法制备染色体标本,对凉山半细毛羊和山谷型藏绵羊的染色体核型进行了比较。结果表明,凉山半细毛羊和山谷型藏绵羊二倍体细胞核型均为公羊2N=54,XY;母羊2N=54,XX。2品种羊6号、24号染色体相对长度差异显著(P<0.05),1号、15号、23号、25号染色体相对长度在P<0.10水平上存在差异,其余染色体相对长度差异均不显著(P>0.10)。第1号、2号、3号染色体的臂比指数差异不显著(P>0.10)。同源染色体不等长现象在凉山半细毛羊和山谷型藏绵羊中均存在,凉山半细毛羊条比值较山谷型藏绵羊高,其中1号染色体在P<0.10水平上显著高于山谷型藏绵羊。     

中国黄牛六个毛色座位的遗传分化

根据国内２５个地方黄牛品种毛色资料，统计出６个具有显隐性毛色基因座位的等位基因频率，计算了不同座位的基因固定指数，品种内，品种间及群体的基因多样度，以及品种内和群体的ｓｈａｎｎｏｎ值，结果表明，中国不同黄牛品种具有不同程度的基因多样度，牛的毛色变异中有３４．１％是由品种间的差异造成的，毛色座位在品种间的分化程度较大。     

三个外来品种猪染色体的比较研究

分析和比较了长白猪、大约克夏猪、杜洛克猪的常规核型、G带、C带和Ag-NOR带。结果表明,3个品种常规核型及G带无明显差异,C带品种间存在多态性,长白、大约、杜洛克猪的Ag-NOR数分别为2.012,2.064,2.045个,众数均为2个。     

基于线粒体COⅠ基因狼山鸡和鹿苑鸡DNA条形编码分析

以狼山鸡和鹿苑鸡为研究对象,利用DNA测序技术测定线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因序列,探讨COⅠ基因的特定区段作为DNA条形码在识别地方鸡品种方面的可行性和有效性.结果表明:选择的这段COⅠ基因序列有15个突变位点,共9个单倍型,其中狼山鸡有3个特异单倍型,鹿苑鸡有5个特异单倍型,这为寻找品种鉴定依据奠定了基础;平均单倍型多样度为0.835,平均核昔酸多样度为0.004 19,2个品种间核苷酸分歧度为0.003 89,表明2个地方鸡品种COⅠ基因序列具有较高的遗传多样性.     

不同肉牛品种间杂种优势预测

[目的]预测西门塔尔杂交牛（西杂牛）与不同品种牛之间的杂种优势。[方法]以西杂牛为母本,利木赞牛、红安格斯牛、夏洛莱牛、德国黄牛为父本,利用微卫星标记对不同牛种间的遗传距离进行分析,并预测杂种优势。[结果]西杂牛与德国黄牛的遗传距离最大,为1.2598,其次是利木赞牛（1.0546）、红安格斯牛（0.8867）和夏洛莱牛（0.5997）。[结论]西杂牛与其他品种牛之间的杂种优势依次为德国黄牛〉利木赞牛〉红安格斯牛〉夏洛莱牛。     

5个鸭品种生长激素基因座位遗传多态性检测

应用PCR-SSCP技术首次分析5个品种鸭生长激素基因座位5'端调控区、外显子与部分内含子和3'端调控区中的多态位点,对具有多态性的位点进行测序,以探讨鸭生长激素基因遗传变异情况,比较不同品种该基因座位遗传多样性差异.结果在5个品种鸭中共检测到5个多态位点,多态位点频率在5个不同品种鸭中存在明显差异.序列比较分析结果表明:鸭生长激素基因座位5'端与3'端调控区和外显子序列具有极高的保守性,在5个鸭品种间不存在任何差异,所测出的序列与已知鸭GH序列相应部分完全一致.检测出的6处突变点(包括4个替换、1个插入和1个缺失)均位于内含子区域.推测鸭生长激素基因表达差异可能受内含子序列影响.     

山东省猪种mtDNA CytB基因遗传多样性及系统进化研究

 【目的】利用mtDNA CytB基因为标记,从分子水平探讨12个猪种166个样本（8个山东省猪种,3个引进猪种和梅山猪种）的遗传多样性和各猪种间的亲缘关系,为山东省猪种合理利用以及生物多样性保护提供基础资料。【方法】对各猪种样本mtDNA CytB基因进行PCR扩增和测序,采用现代生物信息学方法进行数据处理分析。【结果】山东8个猪种种内遗传变异和种间遗传距离均较小,有共享单倍型。山东各猪种和梅山猪与大约克的遗传距离也较小,但与引进猪种杜洛克和长白的遗传距离较大。利用分子系统进化树和CytB基因4个SNP位点的分类方法将上述样本分为2个独立的支系,第一支以中国猪种为主,将除鲁烟白猪的一种单倍型在内的所有山东猪种、梅山猪和大约克的两种单倍型聚为一类,第二支以引进猪种为主,将长白、杜洛克、大约克的一种单倍型和鲁烟白猪的一种单倍型聚为一类。【结论】山东猪种有共同的母系祖先,品种内母系遗传多样性较贫乏;外来猪种引入山东后主要是用作父本以提高生产速度和瘦肉率等,对本地猪种未有母系贡献;利用CytB基因4个SNP位点对欧洲单倍型和亚洲单倍型的分类方法,可以方便地估测利用中外猪种结合培育的猪新品种（配套系）的母系血统情况。     

定量免疫电泳技术对黄牛品种间遗传差异的研究

本文用定量免疫电泳技术对4个黄牛品种间的遗传差异作了免疫遗传学研究。结果表明,所研究的4个品种间的遗传相似度分别为:文山牛—昭通牛为0.922,文山牛—黑白花牛为0.917,文山牛—莫瑞灰牛为0.742,昭通牛—黑白花牛为0.795,昭通牛—莫瑞灰牛为0.603,黑白花牛—莫瑞灰牛为0.818基于上述遗传相似度,本文还作了4个品种亲缘关系的聚类分析。     

六个绵羊品种遗传距离的微卫星分析

利用30个微卫星DNA标记对乌珠穆沁羊、苏尼特羊、内蒙古细毛羊、宁夏滩羊、小尾寒羊和无角多赛特羊共237个体进行遗传距离分析,结果表明：（1）苏尼特羊和乌珠穆沁羊遗传距离为0．0833最小,无角多赛特羊与其它5个绵羊品种的遗传距离在1．0146-1．2876之间,滩羊、内蒙古细毛羊和小尾寒羊彼此之问及与乌珠穆沁羊和苏尼特羊的遗传距离为0．3623-0．6020;（2）聚类图将6个绵羊品种划分为4个分支,即苏尼特羊和乌珠穆沁羊,内蒙古细毛羊和小尾寒羊,宁夏滩羊,无角多赛特羊。（3）6个绵羊品种间遗传距离和聚类图与品种的历史演化和资料记载基本符合,为绵羊种质资源的利用和保护提供了科学依据。     

猪myostatin基因5’调控区的酶切多态性分析

用 PCR- RFLPs分析方法 ,对长白、大白、杜洛克、军牧 号、民猪 5个猪种的 myostatin基因 5’调控区进行了酶切多态性分析。结果表明 ,长白、大白、杜洛克以等位基因 T为主 ,检测的 4 0头军牧 号的等位基因全部是 T,民猪 3种基因型均有 ,且频率近乎相等。统计分析表明 ,3种基因型的分布在长白、大白、杜洛克、军牧 号间差异不显著 ,而民猪同这 4个品种间的差异极显著     

高寒地区大豆主要经济性状遗传相关和选择指数的研究

研究了大豆荚粒性状的遗传变异度,验证了从引进品种(系)中进行系统选育的效果;测定了荚粒性状之间的遗传相关,为进行间接选育适应青海省地方品种积累科学资料;寻求比进行直接产量选育具有更高效率的选择指数。结果证明高寒地区进行大豆系统选育是行之有效的。     

江西地方猪六个品种血清蛋白质多态性及其亲缘关系的研究

本文采用经摸索和改进而建立起来的淀粉凝胶电泳方法,一次电泳同时测定猪血清转铁蛋白、前白蛋白、后白蛋白、铜蓝蛋白、血液结合素及淀粉酶等6种蛋白质的多态性,对江西省的乐平花猪、玉山乌猪、南城黑猪、冠朝猪、萍乡二头乌及修水杭猪等6个地方猪种的上述6个位点进行了测定。利用其基因频率,计算了其平均杂合度、标准遗传距离,并进行聚类分析,然后与湖南、东亚及欧美猪种进行分析与比较。结果表明,江西6个地方猪种的基因构造基本一致;中国猪种与东亚猪种之间的亲缘关系较近,而与欧美猪种之间的亲缘关系则较远。     

定量免疫电泳技术对黄牛品种间遗传差异的研究

 本文用定量免疫电泳技术对4个黄牛品种间的遗传差异作了免疫遗传学研究。结果表明,所研究的4个品种间的遗传相似度分别为:文山牛—昭通牛为0.922,文山牛—黑白花牛为0.917,文山牛—莫瑞灰牛为0.742,昭通牛—黑白花牛为0.795,昭通牛—莫瑞灰牛为0.603,黑白花牛—莫瑞灰牛为0.818基于上述遗传相似度,本文还作了4个品种亲缘关系的聚类分析。