菜豆萎蔫病菌的种子检验鉴定技术研究

本研究对我国一类检疫性有害生物菜豆萎蔫病菌Ｃｕｒｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍｆｌａｃｃｕｍｆａ－ｃｉｅｎｓｐｖ．ｆｌａｃｕｍｆａｃｉｅｎｓ（Ｃｆ）进行种子检测鉴定技术的研究，发现５２３，ＮＢＹ＋ＴＴＣ和ＮＢＹ＋刚果红三种培养基均可作为分离培养基；对带菌种子分离的灵敏度为１．８×１０２ｃｆｕ／ｍｌ，病叶柄和茎是分离的最佳部位，病菌可通过种子传给种苗引起种苗发病，发病时间为７～２０天，针刺接种是Ｃｆ最有效的接种方法，接种发病率为１００％。使用标准化的Ｂｉｏｌｏｇ鉴定系统鉴定病原，在种水平的鉴定准确率达９８．５％。     

进境澳大利亚绿豆中菜豆细菌性萎蔫病菌的检测

利用NA培养基从澳大利亚进境绿豆样品中分离到一株疑似菜豆细菌性萎蔫病菌（Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens,Cff）的细菌分离物2000-1,对该分离物进行革兰染色试验、PCR检测、多位点序列分析和致病性测试。分离物在NA平板上菌落浅黄色,圆形,隆起,黏性,有光泽且边缘整齐,革兰染色阳性。特异引物CffFOR2/CffREV4可扩增出306 bp的预期产物。分离物2000-1的16S rRNA序列与Cff菌株ATCC 51876完全一致,与GenBank中Cff菌株P990的序列相似性为99.58%,序列差异为3 nt。基于6个看家基因（atpD、dnaK、gyrB、ppK、recA和rpoB）的系统发育树显示,分离物2000-1与Cff相关种处于同一分支,与其中巴西大麦Cff分离物3185 UNESP亲缘关系最近,而与菌株ATCC 51876处于不同分支。分离物人工接种可引起大豆叶片水渍状病斑,大豆叶片出现萎蔫和焦枯,病斑周围伴有金黄色晕圈。根据以上测试结果,将分离物2000-1鉴定为菜豆细菌性萎蔫病菌（Curtobact...     

利用BIOLOG鉴定系统快速鉴定菜豆萎蔫病菌的研究

 本研究利用美国Biolog公司生产的MicroStation^TM V3.5系统对我国一类危险性病害菜豆萎蔫病菌及其相关菌进行了快速鉴定研究。研究结果表明,来自不同国家和寄主的24株菜豆萎蔫病菌及其相关致病变种,23株准确鉴定至种水平,其中13株鉴定至致病变种水平,种水平的鉴定准确率为95.8%,另外1株至属水平。同时2株苜蓿萎蔫病菌和2株番茄溃疡病菌均鉴定至致病变种水平。经聚类分析研究,结果支持了对格兰氏阳性植病细菌在属、种水平的分类。本研究是首次使用该系统对格兰氏阳性植病细菌进行鉴定研究,试验证明Biolog鉴定系统用于快速鉴定菜豆萎蔫病菌是一个很有用的工具,且由于其标准化程度高、快速准确,符合我国口岸植物检疫的要求。     

菜豆细菌性萎蔫病菌

病害名称 学名:Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccum faciens(Hedges)Collins and jones 异名:Bacterium flaccum faciens Hedges Corynebacterium flaccum faciens(H.)Dowson     

PCR技术快速检测玉米内州萎蔫病菌研究

玉米内州萎蔫病是北美玉米生产中的严重病害,为防止其传入我国,本研究采用Clavibacter michiganensis不同亚种的转录间隔区序列,设计了特异性的PCR引物,对C.michiganensis种下不同亚种的DNA进行了PCR扩增反应,结果表明,只有玉米内州萎蔫病菌的特异性扩增得到大小为170bp的目标片段,且仅有此一条明显的PCR扩增产物,C.michganensis种下其他亚种无扩增产物。PCR反应的灵敏度为4.36×105cfu/mL和1.56×102pg,可以满足检疫的要求。     

菜豆晕疫病菌的检测技术研究

通过选择性培养基的筛选,利用菜豆萎蔫毒素基因序列扩增引物和菜豆萎蔫毒素基因缺失菌株独有的ORF6序列的扩增引物,采用双重PCR技术实现了菜豆晕疫病菌的快速检测。     

日本菜豆种子中菜豆晕疫病菌的检疫鉴定

利用MT选择性培养基从来自日本的菜豆种子样品上分离到1株细菌分离物（编号1160）,对该分离物进行培养性状观察、特异引物PCR检测、多位点序列分析、烟草过敏性反应和致病性测试。结果表明：该分离物菌落在MT上呈白色、略扁平、无水解圈,经菜豆晕疫病菌（Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola,Psp）特异引物PHA19/PHA95及P5.1/P3.1扩增,获到437 bp及500 bp目的条带,并与Psp菌株LMG2245及GenBank中Psp（基因登录号：AB237164、CP000058）的序列相似性均为100%。选择gap1、gltA、gyrB、rpoD 4个看家基因进行多位点序列分析（MLSA）,系统发育树显示分离物1160与Psp菌株LMG2245、1448A聚在同一分支。该分离物人工接种菜豆叶片能引起典型的黄色晕疫病害症状,接种菜豆荚果引起水渍及褐变病害症状;接种烟草叶片可产生过敏性反应。根据上述试验结果,将分离物1160鉴定为菜豆晕疫病菌。这也是全国首次从进境商品中截获菜豆晕疫病菌。     

三重PCR检测黄瓜炭疽病菌、菌核病菌和细菌性萎蔫病菌

 本试验建立一种可同时检测黄瓜炭疽病(Colletotrichum orbiculare)、黄瓜菌核病(Sclerotinia sclerotiorum(Lib.)de Bary)和黄瓜细菌性萎蔫病(Erwinia tracheiphila)等黄瓜主要病害病原菌的三重PCR检测体系。采用正交试验设计方法, 对三重PCR的影响因素分析研究, 进行退火温度优化, 并以3个引物组、Taq DNA聚合酶、dNTP和Mg²⁺ 共6因素3水平进行多重PCR体系优化, 成功建立了适合黄瓜主要病害的三重PCR最佳检测体系, 即25 μL的反应体系中含有0.24 μmol·L^-1 CY1/CY2;0.72 μmol·L^-1 SSFWD/SSREV;0.336 μmol·L^-1 ET-P1/ ET-P2;1 U Taq聚合酶;0.15 mmol·L^-1 dNTP;1 mmol·L^-1 MgCl₂, 最适退火温度为63℃。该方法能够快速从田间黄瓜发病植株和根围土壤中将黄瓜炭疽病菌、黄瓜菌核病菌和黄瓜细菌性萎蔫病菌检测出来, 灵敏度可以达到10 pg·μL^-1。     

进境玉米中玉米内州萎蔫病菌的PCR检测

 为了快速准确检测进境玉米样品中的玉米内州萎蔫病菌Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis(Cmn), 根据GenBank中Cmn的16S-23S序列设计引物CM1/CM4和引物PSM1/CM3。引物PSM1/CM3仅能从供试的4株Cmn菌株中扩增获得208 bp的预期产物, 而其他36株对照菌株均不能扩增出预期条带。灵敏度测试结果表明引物CM1/CM4和PSM1/CM3组合的巢式PCR方法的检测灵敏度高于常规PCR, 检测灵敏度可达40 fg DNA或6.8 CFU目标细菌。常规PCR和巢式PCR方法对进境美国玉米样品的阳性检出率分别为8%和24%, 试验结果表明所建立的PCR方法可用于玉米样品中Cmn的快速检测。     

木薯细菌性萎蔫病菌的检疫方法研究

本文对木薯细菌性萎蔫病菌的致病性测定、细菌的分离、细菌的培养条件和培养基选择、细菌的生理生化测定、分子生物学鉴定方法等方面进行了系统研究，确定了该病菌的菌落鉴定特征，建立了从木薯繁殖材料上进行病原菌检测的快速、灵敏、准确的PCR检测方法。     

落葵上发现短小杆菌属(Curtobacterium)一个新的致病变种

 1994年在江苏省南京及镇江地区新发现了落葵细菌性叶斑病,从病斑所分离的10个细菌菌株经柯赫氏法则验证,均确系该病的病原菌。采用形态观察、表型特征和生理生化特性测定、数值分析、血清学反应、细胞化学成分分析和DNAG+C mol%测定进行了鉴定,并与植物病原棒形细菌15个标准菌株进行了比较。该病原菌为革兰氏阳性细菌,不规则短杆状,有一根鞭毛,亚极生或侧生,结合其生理生化特性、细胞化学成分和DNAG+C mol%测定结果,认为应属于短小杆菌属(Curtobacterium)的萎蔫短小杆菌(Cur.flaccumfaciens),数值分析也支持这一结论。此外,据血清学反应结果及其对短小杆菌属的其它植物寄主的致病情况,认为该病原菌应是萎蔫短小杆菌种下一个新的致病变种,定名为Curtobacterium flaccumfaciens pv.basellae pv.nov.(萎蔫短小杆菌落葵致病变种)。     

引起糖甜菜细菌性叶斑病的萎蔫短小杆菌新致病变种

 1995年在内蒙古临河市新发现了糖甜菜细菌性叶斑病,从病斑所分离的10个细菌菌株经柯赫氏法则验证,均确系该病的病原菌。采用形态观察、表型特征和生理生化特性测定、数值分析、血清学反应、细胞化学成分分析、DNA G+C mol%和DNA-DNA同源性测定进行了鉴定,并与植物病原棒形细菌15个标准菌株进行了比较。该病原菌为革兰氏阳性细菌,不规则短杆状,有一根鞭毛、亚极生或侧生,结合其生理生化特性、细胞化学成分和DNA G+C mol%和DNA-DNA同源性测定结果,认为应属于短小杆菌属(Curtobacterium)的萎蔫短小杆菌(Cur. flaccumfaciens),数值分析也支持这一结论。此外,据血清学反应结果及其对短小杆菌属的其它植物寄主的致病情况,认为该病原菌应是萎蔫短小杆菌种下的一个新的致病变种,定名为Curtobacterium flaccumfaciens pv. beticola pv. nov. Chen et al.,2000(萎蔫短小杆菌糖甜菜致病变种)。     

Characterisation of Curtobacterium flaccumfaciens Pathovars by AFLP, rep-PCR and Pulsed-Field Gel Electrophoresis

The bacterial species Curtobacterium flaccumfaciens encompasses a group of closely related phytopathogens subdivided into pathovars that exhibit differences in host range. To date, reliable differentiation of pathovars and identification of unknown isolates to the pathovar-level can only be achieved on the basis of host testing. In this study, representative strains from C. flaccumfaciens pathovars and related species were examined using a range of genomic fingerprinting techniques to ascertain their application as additional or potential alternatives to host testing. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) and repetitive sequence polymerase chain reaction (rep-PCR) analyses enabled the categorisation of some, but not all strains, in their respective pathovars. In contrast, all strains were correctly assigned to pathovars using HindIII and XbaI macro-restriction digests in conjunction with pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). Fingerprints generated by PFGE not only supported the current pathovar rankings within C. flaccumfaciens, they also identified subgroups within pathovars flaccumfaciens, oortii and poinsettiae.     

侵染勿忘我花卉的蚕豆萎蔫病毒的鉴定

从勿忘我（Ｍｙｏｓｏｔｉｓｓｉｌｖａｔｉｃａ）上采集到１病株，接种昆诺阿藜，接种叶褪绿斑，系统顶枯，最后整株枯死。蚕豆接种叶呈黑色坏死斑，主茎变褐、全株萎蔫。矮牵牛接种叶褪绿斑，系统花叶。用诱捕修饰法制片，观察到病毒粒体球形，并在病毒粒体外面包被着一层抗体。琼脂双扩散试验呈阳性反应     

黄瓜细菌性茎枯萎病病原鉴定及温度对其致病力的影响

自2003年以来, 在我国北京?辽宁和山东等地的黄瓜上发现了一种重要细菌病害—黄瓜细菌性茎枯萎病, 对黄瓜生产造成了严重危害?从发病的黄瓜叶片?茎部和果实上分离的菌株接种到黄瓜后, 症状与自然发病症状完全一致?经过多位点序列分型和BOX-PCR技术, 以及LOPAT?GATTa和Ayers碳源利用试验等, 确定该病害的病原菌为丁香假单胞流泪致病变种 Pseudomonas syringae pv. lachrymans?以黄瓜细菌性茎枯萎病菌A2为供试菌株, 黄瓜细菌性角斑病菌丁香假单胞菌流泪致病变种 P.syringae pv. lachrymans pslb8为对照菌株, 对其进行不同温度下致病力?体内和体外生长能力测定, 结果表明:20℃条件下, A2菌株的致病力?体内和体外生长能力均强于pslb8菌株, 相对低温的条件更有利于黄瓜细菌性茎枯萎病病原菌的侵染和病害的发生?     

菜豆种子普通细菌性疫病菌检测

 由Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli和Xanthomonas fuscans subsp. fuscans引起的菜豆普通细菌性疫病是严重影响菜豆生产的限制因子之一,可造成严重的产量和品种损失。染菌种子是病原菌传播的主要途径。本研究对5个菜豆主要产区的60份菜豆种子样品进行普通细菌性疫病菌检测。在MT选择性培养基上有36份种子样品浸提液检测到目标病原菌, 种子样品带菌量为2.49×10²~5.20×10⁷ CFU/粒。选择36个分离物接种感病品种“英国红”植株,所有分离物均引起接种植株发病。特异PCR检测结果表明,有20个分离物为X. fuscans subsp. fuscans,16个分离物为X. axonopodis pv. phaseoli。试验结果表明,我国一些菜豆主产区商业种植和研究用种子多数污染普通细菌性疫病菌,建议建立无菌种子生产区和加强种子管理,以有效控制病害发生。     

进境菜豆种子中普通细菌性疫病菌的分离和鉴定

对经甘肃口岸进境的30批菜豆Phaseolus vulgaris种子进行了普通细菌性疫病菌的检测,利用选择性培养基MT从波兰进境菜豆种子上分离到1株细菌597,对该分离物进行菌落形态特征观察、致病性测定、16S rDNA及16S-23S rDNA ITS序列分析和特异性PCR检测。结果表明,该分离物在MT培养基上菌落呈黄色、圆形、黏稠、表面光滑向外隆起、菌落周围有水解圈。分离物597接种菜豆幼苗后导致叶片枯萎,接种点干枯。结合菌落形态、16S-23S rDNA ITS序列、特异性PCR检测结果,将分离物597鉴定为地毯草黄单胞杆菌菜豆致病变种Xanthomonas axonopodis pv.phaseoli。     

小麦矮缩病毒NASH快速检测方法的建立及应用

以非放射性物质地高辛为标记物,采用PCR法制备了特异性强、灵敏度高的DNA探针。通过优化反应体系,建立了小麦矮缩病毒(Wheat dwarf virus,WDV)的核酸斑点杂交(nucleic acid spot hybridization,NASH)快速检测技术体系。该方法诊断准确率高,操作简单,周期短,整个检测过程仅需5h左右。利用建立的NASH技术开展WDV流行学调查,发现近年来WDV在我国陕西韩城、山西太原和河北石家庄等地区点片发生,没有大面积暴发成灾。