基于RAD-seq简化基因组测序的河南斗鸡遗传进化研究

研究旨在基因组水平上揭示河南斗鸡的遗传进化机制。利用RAD-seq简化基因组测序鉴定河南斗鸡与其他18个地方鸡种、2个引入肉鸡品种的SNP标记,计算遗传统计量,分析河南斗鸡的遗传多样性和遗传结构,鉴定受选择基因。结果表明,在河南斗鸡中鉴定出SNP标记259,412个。与其他18个地方鸡种相比,河南斗鸡的观察杂合度Ho(0.1560)和核苷酸多样度Pi(0.1752)均为最低,近交系数Fis为0.1099,遗传多样性相对匮乏;河南斗鸡的平均遗传分化系数Fst最高(0.2187),平均基因流Nm最低(0.9017),在以引入品种为外群的系统发育树中形成一个独立的分支。通过Fst和θπ检验,在河南斗鸡中鉴定出24个受选择区域、129个受选择基因。GO和KEGG分析表明这些受选择基因主要富集在能量代谢、神经系统发育、运动行为、微管细胞骨架等生物学通路。     

河南斗鸡的特征

斗鸡又称打鸡、咬鸡是我国古老的鸡种之一,此鸡种在我国育成流传,已有二千四百多年有文字可查的历史。河南斗鸡,以开封、郑州、洛阳、周口及安阳等地区最多。每逢过年过节,这些地区的斗鸡爱好者依然定期聚集一块进行斗鸡。开封、洛阳都是古代的历史名城,这一带过去玩斗鸡尤为盛行。据我们了解,现有某一正统斗鸡的血缘,可追溯到清朝贵族旗人那里。为了保持斗鸡的血缘,两个地区的斗鸡爱好者往往同喂一窝鸡。河南斗鸡以郑州为主、开封、洛阳现存优良种斗鸡为代表,遗传上仍能保持原先优种斗鸡之血缘关系。但数量已不多。其主要特征是,斗性极…     

斗鸡家族中的佼佼者--皖北斗鸡

皖北斗鸡,历史悠久,品质优良,分布在安徽北部毫州、淮北、蚌埠等地,目前主要集中在怀远、凤阳两县。由于安徽与山东、河南两大斗鸡胜地接壤,因此皖北斗鸡还溶人了鲁西斗鸡和河南斗鸡的血统。     

河南家禽品种资源之一——斗鸡

斗鸡,也称打鸡、咬鸡、军鸡和英雄鸡,是我国古老的鸡种之一。这种鸡不仅其斗性极强,可供玩赏;而且其蛋内浓蛋白高,早期生长发育迅速,肉质较鲜,可为杂交育成肉鸡提供较为优良的遗传基础。斗鸡的饲养距今已有2,000多年的历史,因历来不与其他鸡种杂交,这就保存了斗鸡品种较纯的血统。从畜禽品种资源的角度来看,在育种工作上,它提供了一个宝贵的基因库。一、品种分布与形成我国斗鸡主要分布在河南、陕西、山东、河北、江苏、安徽、湖北等省,以河南数量最多,全省社会存量约有8,000—9,000只,称为“河南斗鸡”(实质上应称“中国斗鸡”)。河南斗鸡,以开封、郑州、洛阳、周口、南阳、漯河等地较多,长期以     

两种分子标记对我国斗鸡遗传多样性的联合分析比较

为了准确评价我国斗鸡遗传多样性,以我国重要的5个斗鸡品种为研究素材,应用SSR标记和mtDNA细胞色素b基因标记联合分析5个斗鸡品种的遗传多样性并作相应的比较。微卫星标记分析结果显示:西双版纳斗鸡群体杂合度最高,为0.662;河南斗鸡群体杂合度较低,为0.532。说明河南斗鸡基因型趋于一致。线粒体DNA细胞色素b基因分析结果:5个斗鸡品种共有6种单倍型,单倍型多样度为0.42857~0.78571;核苷酸多样度为0.00081~0.00659。研究表明,微卫星标记比较适合斗鸡群体遗传多样性分析,评价结果更符合品种的历史形成和实际状态。     

谈河南斗鸡

斗鸡又称打鸡、咬鸡,是我国古老的鸡种之一。河南斗鸡以郑州、开封、洛阳现存优良种斗鸡为代表,遗传上仍能保持原先优种斗鸡之血缘关系。但数量已不多。其主要特征是,斗性极强,能坚持打到最终,至死非但不败走,只要还剩下一点气力,仍继续斗打,称为后盘进行或亲斗,这种斗鸡即是纯     

山东特色畜牧品种系列介绍之九 鲁西斗鸡和蒙山羊

<正>鲁西斗鸡鲁西斗鸡古称唆鸡,俗称咬鸡,是我国特有的观赏型珍贵鸡种,原产于山东西南部古城曹州一带。现济宁嘉祥已建有斗鸡保种场,经提纯选育,斗性和生产性能都有所提高。鲁西斗鸡体型高大魁梧,成年斗鸡具有鹰嘴、鹅颈、高腿、鸵鸟身,公鸡胸肌发达,颈长腿高,尾羽高举,体态英俊威武。头小,脸狭长,毛细。冠呈瘤状,肉     

河南斗鸡

斗鸡是玩赏品种之一,据查,我国斗鸡育成已有2400年的历史。河南斗鸡,以开封、郑州、洛阳、周口及安阳等地区为最多。逢年过节,斗鸡爱好者聚集而进行斗鸡玩赏。现存数量不多。由于历来斗鸡不与其他鸡杂交,所以保存了斗鸡较纯的血统。     

中国斗鸡mtDNA遗传多样性及起源研究

本研究旨在探究中国斗鸡的遗传多样性和起源.运用DNA测序的方法测定了河南斗鸡、鲁西斗鸡、吐鲁番斗鸡、西双版纳斗鸡和漳州斗鸡5个斗鸡品种40个个体的mtDNA细胞色素b(Cytb)的部分碱基序列(535 bp).结果表明,这5个斗鸡品种共有6种单倍型;单倍型多样度为0.428 57～0.785 71;核苷酸多样度为0.000 80～0.006 54;漳州斗鸡与其它斗鸡的遗传距离均较远;基于单倍型构建的系统发生树分析表明中国斗鸡母系起源于多个红色原鸡亚种.结论,漳州斗鸡的遗传多样性最丰富,而西双版纳斗鸡和吐鲁番斗鸡最贫乏;中国斗鸡母系起源于多个红色原鸡亚种.     

斗鸡研究现状

1中国斗鸡品种1.1来源及分布中国斗鸡按其地理分布可分为:中原斗鸡:包括河南斗鸡、皖北斗鸡和鲁西斗鸡。产区位于广大的中原黄河冲积平原一带,地貌类型为沙丘、河地与统淤平地。气候属半干旱半湿润气候,具有明显的季风气候特点。年降水量为