湖羊产羔性状的微卫星标记与可能生产力的关联性分析

选择位于绵羊第6号染色体上与多胎基因（Fec^B）紧密连锁的微卫星OarAE101、BM1329、BM143和OarHH55标记以及位于第4号染色体上的OarHH35标记对湖羊的产羔性状进行研究,结果显示：湖羊的5个微卫星座位都达到了高度多态水平（PIC〉0．5）,5个微卫星座位可以用于湖羊产羔性状的遗传多样性的评估。方差分析结果表明：5个基因座中OarAE101、BM143各基因型产羔数生产力之间存在极显著差异（P〈0．01）,OarHH35各基因型产羔数可能生产力之间存在显著差异（0.01〈P〈0．05）,BM1329、OarHH55各基因型产羔数可能生产力之间差异不显著（P〉0．05）。在OarAE101标记中107／113的产羔数最小二乘平均值为最大,与基因型103／113、107／107、101／111、113／113、107／111和103／103之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与101／101和103／107之间产羔数最小二乘平均值差异显著（O．01〈P〈0．05）,与115／115和111／111之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。在OarHH35标记中139／139的产羔数可能生产力最小二乘平均值为最大,与基因型139／141、139／127、137／125之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与127／127、125／125和139／125之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。在BM143标记中118／118的产羔数可能生产力最小二乘平均值为最大,与基因型118／106、118／110、106／104和112／114之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与118／116和102／106之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异显著（0.01〈P〈0．05）,与102／104、112／102和116／112之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。研究将在今后湖羊品种的标记辅助选择和分子育种中具有重要的应用价值。     

小尾寒羊产羔性状的微卫星标记研究

选用位于绵羊第6号染色体上与多胎基因(FecB)紧密连锁的微卫星OarAE101、BM1329、BM143和OarHH55以及位于第4号染色体上的OarHH35对小尾寒羊的产羔性状进行标记研究,结果发现5个微卫星基因座在小尾寒羊的PIC都达到了高度多态(PIC>0 5)水平。5个微卫星基因座标记小尾寒羊的产羔性状,以OarAE101效果最好,找到了6个显著标记;其次为BM1329,找到了4个显著标记;BM143和OarHH35分别找到了2个和3个显著标记;在OarHH55基因座上没有找到显著标记。以上所产生的15个显著标记中,与产羔数有极显著正相关(P<0 01)的标记有5个,其相关大小顺序依次为OarAE101的等位基因113bp、BM143的基因型118bp/106bp、OarHH35的等位基因139bp、OarAE101的等位基因103bp和OarAE101的基因型113bp/103bp;与产羔数呈显著正相关(P<0 05)的标记有2个,其相关大小顺序依次为OarHH35的基因型139bp/127bp、BM1329等位基因170bp;与产羔数呈极显著负相关(P<0 01)的标记有4个,其负相关强弱顺序依次为OarAE101基因型111bp/101bp、OarAE101的等位基因111bp、BM1329的等位基因168bp、OarAE101的等位基因101bp;与产羔数呈显著负相关(P<0 05)的标记有4个,其负相关强弱顺序依次为BM143等位基因116bp、BM1329的等位基因186bp、BM1329基因型186bp/168bp、Oa     

波尔山羊2号和8号染色体微卫星标记与产羔性状的关联研究

根据山羊2号和8号染色体遗传连锁图谱,选取8个微卫星标记INRA040、LSCV22、LSCV37、IDVGA64、FCB011、INRA129、SRCRSP10和CSSM47,分析它们与波尔山羊产羔性状的关联。结果表明：所研究的8个波尔山羊微卫星基因座均为高度多态性基因座（PIC〉0．5）。与波尔山羊产羔性状有显著效应的等位基因10个。其中与波尔山羊第1胎产羔数有显著正效应的等位基因1个：LSCV22的189bp;与波尔山羊第1胎产羔数有显著负效应的等位基因4个：LSCV22的179和191bp,SRCRSP10的273和303bp;与波尔山羊第2胎产羔数有显著正效应的等位基因6个：LSCV22的189bp、IDVGA64的281、283和245bp、FCB011的143和165bp。     

2个山羊品种多胎性状的微卫星标记研究

根据比较基因组学原理,选择与绵羊高繁殖力紧密关联的4个微卫星标记OarAE101、OarHH55、BM1329、BMS2508,分析其在波尔山羊和西农莎能奶山羊中的多态性分布情况。结果表明,4个微卫星标记在波尔山羊中的多态信息含量（PIC）分别为0.834 0、0.722 2、0.802 1、0.685 5,有效等位基因数（Ne）分别为6.719、4.098、5.610、3.542;在莎能奶山羊中的PIC分别为0.765 5、0.738 7、0.670 1、0.682 0,Ne分别为4.849、4.360、3.520、3.609。4个微卫星基因座对波尔山羊和莎能奶山羊的产羔数效应分析表明,在波尔山羊群体中,OarAE101基因座126 bp等位基因对产羔数具有正效应,而134 bp则呈负效应;OarHH55基因座120和124 bp等位基因对产羔数具有正效应,而130 bp/140 bp基因型则呈负效应;BM1329基因座185 bp等位基因对产羔数具有正效应,而176 bp等位基因和215 bp/240 bp基因型均呈负效应;BMS2508基因座118 bp等位基因对产羔数具有正效应,而122 bp/141 bp基因型和148 bp等位基因均呈负效应。在西农莎能奶山羊群体中,OarAE101基因座108 bp等位基因和114 bp/126 bp基因型对产羔数均呈正效应,而124 bp等位基因则呈负效应;OarHH55基因座120 bp等位基因对产羔数呈正效应,而150 bp/165 bp基因型呈负效应;BM1329基因座185 bp等位基因对产羔数呈正效应,而176 bp等位基因和215 bp/240 bp基因型则均呈负效应;BMS2508基因座118 bp等位基因对产羔数呈正效应,而141 bp等位基因和153 bp/160 bp基因型均呈负效应。     

基于重测序数据的湖羊产羔数性状全基因组关联分析

旨在利用全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)挖掘与湖羊繁殖性状相关的候选基因,解析湖羊高繁殖性状的遗传基础。本研究利用206只湖羊母羊的全基因二代重测序数据(群体平均测序深度为6×),结合第一胎产羔数、第二胎产羔数及2胎平均产羔数的表型性状,基于混合线性模型,并利用质控后的1 604 526个SNP标记进行全基因组关联分析。结果:未发现影响湖羊第一胎产羔数、第二胎产羔数和2胎平均产羔数的显著SNP位点,这可能与羊的繁殖性状是一种低遗传力性状、且受微效多基因控制有关。此外表明,本研究所使用的混合线性模型被验证是可信的。     

湖羊不同胎次与产羔数之间的关系分析

通过对江苏西来原羊场20016—2019年湖羊母羊的产羔数据进行统计分析,研究了湖羊不同胎次与母羊产羔数之间的关系.结果表明,该养殖场湖羊平均窝产羔数2.23只,窝产羔数与窝产活羔数随着胎次增加呈先增加后下降的特征,窝产羔数的峰值在第四胎与第五胎之间.湖羊的平均窝产羔数回归方程为Y1=0.326X-0.036X2+1....     

基于微卫星标记鉴定湖羊家系

试验旨在基于微卫星（simple sequence repeats,SSR）多态性探索一种鉴定与划分湖羊家系的方法,通过查阅文献筛选出9个分布于多个常染色体、具有高多态性信息、高杂合度的湖羊微卫星位点BM3051、HH64、TGLA137、MAF33、FCB48、VH72、INRA023、ETH152和MCM527。采集30只湖羊种公羊血液,使用试剂盒提取血液基因组DNA,合成筛选出的9个微卫星引物并使用荧光基团标记,利用降落式PCR进行扩增,扩增产物在基因分型后使用CERVUS3.0.7进行基因型分析,使用POPGENE1.32基于Nei氏遗传距离构建树状聚类图,根据图示的亲缘关系远近划分湖羊家系。结果显示,当双亲基因型未知时,9个微卫星位点的单亲累积排除概率为99.2094%;当单亲基因型已知时,9个微卫星位点的累积排除概率为99.9688%;当双亲基因型未知时9个微卫星位点的双亲累积排除概率为99.9999%,排除概率能够满足遗传育种中亲子鉴定和系谱分析的要求。根据Nei氏遗传距离构建UPGMA聚类图,将30只种公羊划分为6个家系,为育种工作提供了一定参考。本方法能够进行湖羊家系的鉴定与划分,对湖羊育种工作具有一定的应用价值。     

湖羊胎产羔数对羔羊生长发育的影响

为了研究不同胎产羔数湖羊的泌乳量和羔羊的生长速度,以便进行科学饲养管理,该研究随机选择同期产双羔、三羔、四羔母羊各3只,对其产奶量、羔羊初生重及4月龄前日增重进行了测定,分析对生长发育的影响。结果表明:双羔羊初生重最大,平均为3.82 kg,显著高于三羔羊的3.21 kg和四羔羊的2.80 kg(P0.05);所有羔羊在2月龄前生长速度最快,双羔、三羔和四羔平均日增重分别为279.80 g、223.40 g和200.20 g,各组间差异显著(P0.05);虽然断奶应激对羔羊的生长速度有一定影响,但双羔羊2～4月龄日增重仍然最高,为228.50 g,显著高于四羔组(P0.05);另外,双羔羊的总吮乳量和日吮乳量为52.30 kg和0.88 kg,显著高于三羔组和四羔组(P0.05)。因此,湖羊同胞产羔数越多羔羊初生重越小,羔羊吮乳量越少,早期生长速度较慢。但在良好的饲养管理条件下,羔羊断奶后的代偿性生长可在一定程度上弥补初生重小所造成的影响。研究结果为不同胎产羔数湖羊及其羔羊的饲养管理提供科学依据,即多胎湖羊应分群饲养管理,羔羊早期锻炼采食。     

绵羊HAS2基因遗传变异及其与产羔性状关联性分析

利用PCR-SSCP和DNA测序法,首次检测了湖羊、小尾寒羊、洼地绵羊、阿勒泰羊中的HAS2基因,并对该基因第2和第3外显子部分单核苷酸多态性进行分析。结果表明:湖羊、小尾寒羊、洼地绵羊、阿勒泰羊在第2外显子中存在3种基因型,各是pp、pq、qq基因型;在第3外显子中存在2种基因型,为rr、rs基因型;HAS2基因第2外显子中发生1处C→A突变,第3外显子中发生1处A→G突变。经χ2适合性检验,4种绵羊在HAS2基因第2外显子上的基因型分布均不符合Hardy-Wenberg平衡,在第3外显子上的基因型分布全符合Hardy-Wenberg平衡。各基因型频率在4种绵羊间的分布均没有显著差异(P0.05);湖羊2个位点上的所有基因型在产羔数上差异均不显著(P0.05)。初步认为HAS2基因不能作为湖羊高繁殖力的候选基因。     

山西白猪的微卫星标记与其体重、体尺性状的关联分析

 采用单变量动物模型分析了21个微卫星标记对山西白猪初生重、断奶重、6月龄体重、体长、体高、胸围和活体背膘厚等7个性状的影响。结果表明,S0227和S0218标记对6月龄活体背膘厚有显著影响（P<0.05）。在S0227座位上,杂合子AB型个体的6月龄背膘厚最薄;在S0218座位上,BB和CC型个体的背膘最薄。S0101标记对6月龄体高有显著影响（P<0.05）,对6月龄体重的影响也接近显著水平（P=0.0854）。在S0101座位上, CC型个体的6月龄体重最大,显著高于AB型个体,而与其他类型差异不显著;BC型个体的体高最高,显著高于AB型,而与其他类型差异不显著。     

大尾寒羊产羔数对胎次的回归分析

该研究利用SPSS软件分析了大尾寒羊产羔数对胎次的回归,大尾寒羊产羔数对胎次的二次方回归和三次方回归的拟合度(R2)分别为0.9246和0.9269,可见两种模型下的回归方程的拟合度都比较高。产羔数对胎次的二次方回归方程中的所有回归参数均达到极显著水平(P<0.01),说明大尾寒羊产羔数对胎次用二次方回归方程具有一定的应用价值。     

微卫星标记预测肉羊杂种优势的研究进展

杂种优势是一个复杂的数量性状,是育种工作的重要指标,利用微卫星标记技术估算亲本间的遗传差异,再通过对遗传差异的分析预测杂种优势,大大改善了传统育种费时费力的状况。通过对国内外相关文献阅读分析,总结了微卫星标记在预测肉羊杂种优势方面的研究现状,使微卫星标记预测肉羊杂种优势的可行性更加显而易见。     

微卫星遗传标记及其在绵、山羊中的研究进展

本文简介了微卫星标记特点和使用情况,并与其他标记作了对比。着重回顾了近年来微卫星标记在绵山羊育种中的主要研究进展,包括:遗传多样性分析、遗传图谱构建、功能基因定位、个体鉴定、杂育种优势预测等几个方面,这些研究可探明生物进化的历史,有助于资源保护及开发。     

微卫星标记OarAE101和BM143在4个山羊品种中的研究

选择与Booroola羊高繁殖力主效基因Fec^B紧密连锁的2个微卫星标记OarAE101和BM143，分析其在湘东黑山羊、南江黄羊、贵州黑山羊、波尔山羊中的多态分布情况。结果表明微卫星标记OarAE101在4个山羊品种中的等位基因数分别为10、8、6和8，BM143在4个山羊品种中的等位基因数分别为10、8、6和8，OarAE101／BM143在湘东黑山羊、南江黄羊、贵州黑山羊、波尔山羊中的多态信息含量值分别为0．8742／0．8052，0．7969／0．8093，0．7564／0．7462和0．7964／0．7340。湘东黑山羊OarAE101基因型为107bp／111bp基因型所对应的产羔数最小二乘均值最高（4．0头／胎），纯合基因型109bp／109bp、107bp／107bp、119bp／119bp、111bp／111bp和125bp／125bp所对应的产羔数最小二乘平均值较高，分别为2．67、2．5、2．4、2．33和2．25只／胎，故等位基因107、109、111、119和125bp对湘东黑山羊产羔数具有正效应。湘东黑山羊BM143基因型为100bp／106bp和106bp／112bp所对应的产羔数最小二乘平均值达3只／胎，BM143等位基因104、106和110bp与湘东黑山羊产羔数有显著正效应。     

绵羊微卫星标记与生长性状的相关研究

以相邻地理区域的4个地方绵羊品种133只个体为研究对象,选用位于绵羊第1～8号常染色体上的11个微卫星基因座,采用微卫星DNA技术和最小二乘线性模型,分析了与绵羊生长性状相关的标记效应.结果表明正常发育情况下,不同生长性状之间相关极显著(P＜0.01),除尻长外的生长性状与年龄相关不显著(P＞0.05).品种因子对所有生长性状的效应(P＜0.000 1)大于年龄和标记因子.在8个基因座上发现与某些生长性状相关密切的标记效应(P＜0.05或P＜0.01).影响相应性状的最有利基因型分别是BMS1248座位的136/136和BM3033座位的136/143与体高,BM6444座位的117/121与管围, BM3501座位的178/198与胸围,BMS710座位的118/130和BMS1724座位的178/168与体长,MAF70座位的142/144与体重,BM1227座位的108/116与尻宽.本研究还推测出上述基因座上对相应性状具有正效应或负效应的若干等位基因.     

Non-Genetic and Breed Variation in Litter Size in the Swedish Sheep Recording Program

Abstract

Litter sizes (LS) for the three largest breeds of sheep represented in the Swedish sheep recording scheme, Pelt (P), Swedish Crossbred (X) and Landrace Finewool (F), were studied. Average LS for different ewe ages were seen to increase from yearling to full maturity, around 4 years of age, and then remained the same until around 9 years of age for P and X, which thereafter showed a slight decrease. Landrace Finewool, a more prolific breed, peaked at 5 and 6 years of age and started to decline the year after. Flock size in itself did not significantly affect LS for any breed. The addition of an effect of flock-year increased the coefficient of determination (R ²) in a linear model. SAS Proc CATMOD estimated noticeable differences between LS distributions for different breeds and ewe ages, and smaller differences between LS distributions for individual ewe deviations from flock average lambing date. It was concluded that the effects of flock-year and age of ewe were the major fixed effects that need to be accounted for when evaluating LS within breed.     

鲁中肉羊HIRA基因多态性及其与产羔数的关联分析

该研究旨在探究鲁中肉羊HIRA基因g.71833755 T>C和g.71874104 G>A两个位点多态性及其与产羔数之间的关系,以期为鲁中肉羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记。利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY~? SNP技术对鲁中肉羊HIRA基因2个多态位点进行检测,并与其产羔数进行关联分析。结果表明:鲁中肉羊HIRA基因g.71833755 T>C位点存在TT、TC和CC三种基因型,g.71874104 G>A位点存在AA、AG和GG三种基因型。g.71833755 T>C位点在鲁中肉羊中表现为低度多态(PIC<0.25),该位点在鲁中肉羊中处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.05);g.71874104G>A位点在鲁中肉羊中表现为中度多态(0.250.05)。HIRA基因g.71874104 G>A位点多态性与鲁中肉羊第2胎、第3胎产羔数显著关联(P<0.05),杂合型AG个体各胎产羔数均高于野生型GG和突变纯合型AA个体;g.71833755 T>C位点多态性与鲁中肉羊第2胎产羔数显著关联(P<0.05),杂合型TC个体第2胎产羔数均高于野生型TT(P>0.05)和突变纯合型CC个体(P <0.05)。综上,g.71833755 T>C位点的C等位基因和g.71874104 G>A位点的A等位基因可能是提高绵羊产羔数的潜在有效的DNA标记。