生长相关的微卫星标记在镜鲤繁殖群体中的验证

利用大样本镜鲤繁殖群体分析和验证8个生长相关微卫星标记与体质量和体长的相关性：结果显示：8个微卫星标记在镜鲤繁殖群体中均获得了稳定、清晰的DNA条带,片段大小在100-322bp之间,共检测到33个等位基因、75种基因型。对每个微卫星座位的基因型与体质量、体长性状进行相关性分析发现,HLJ343与体质量、体长显著相关;HLJ319、HLJ302及HLJE339与体长显著相关。本研究用大样本随机群体证实了此4个QTL位点与体质量或体长性状具有相关性,下一步可根据优势基因型指导家系配组,开展基于QTL结果的分子聚合育种研究。     

鸡微卫星DNA标记与其生长性状的相关分析

测定了固始鸡与安卡鸡杂交后自交F2代500多个个体的0,2,4,6,8,10,12周龄体重,检测10个微卫星DNA标记,对标记基因型生长性状值进行方差分析和多重比较。结果表明:对于2,8,12周龄体重,MCW166各基因型间有显著差异(P<0.05);6周龄体重,MCW166各基因型间有极显著差异(P<0.01);对于2周龄体重,ADL169各基因型间有极显著差异(P<0.01),4,6,8周龄体重,ADL169各基因型间有显著差异(P<0.05)。     

大黄鱼微卫星标记与生长性状的相关分析

利用51个大黄鱼微卫星标记,以一个F1 家系为实验材料,分析了微卫星标记与体长、体高、体质量之 间的相关性,发现51 个位点中有9 个位点(LYC0401,LYC0076,LYC0077,LYC0078,KPC43,KPC86, LYC0403,LYC0079,LYC0080)与体长、体高、体质量显著或极显著相关(p<0.05 或p <0.01).其中 LYC0401,LYC0076,LYC0078,KPC43,LYC0403和LYC0079的各等位基因与3性状的相关达到显著或极显 著水平(p<0.05或p<0.01).     

哲罗鲑微卫星标记与重要生长性状的相关性分析

采用10对微卫星荧光标记分析哲罗鲑Hucho taimen同池养殖群体的遗传多样性,通过SPSS13.0的GLM模型筛选出与生长性状(体质量、体长、体高和体宽)相关的微卫星标记。结果显示,10个微卫星位点的平均有效等位基因个数为2.301 4;多态信息含量0.366 6~0.557 6;观测杂合度范围0.652 2~0.989 1,均大于期望杂合度;Fis值为负数,存在杂合子过剩现象。基因座BJT4、BJT6、BJT8、BJT12、BJT18、BJT19、BJTH4和BJTH19均与体质量和体长性状极显著相关(P0.01),BJT6、BJTH6和BJTH17均与体高和体宽性状极显著相关(P0.01),发现存在"一因多效"和"多因一效"现象。不同基因型的多重比较表明,BJT12、BJT18和BJTH4基因座的AA基因型、BJT4基因座的BB基因型、BJT6基因座的AB基因型与体质量、体长呈正相关,BJTH6和BJTH17基因座的AB基因型与体高、体宽呈正相关。研究结果为哲罗鲑的分子标记辅助育种提供依据,同时也为下一步构建哲罗鲑的遗传连锁图谱提供基础数据。     

尼罗罗非鱼生长性状相关微卫星标记的筛选与验证

为筛选尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)生长相关微卫星分子标记用于指导其选育工作,选用29个微卫星标记对尼罗罗非鱼高要F₀群体、高要F₁群体、番禺群体和海南群体的生长性状(体质量、全长、体长、头长、体高和体宽)进行了关联性分析和基因型间比较。结果表明：在高要F₀群体中29个微卫星位点共检测到242个等位基因,平均等位基因数(N_a)为8.345,平均观测杂合度(H_o)为0.621,平均多态性信息含量(PIC)为0.842,各位点PIC值均大于0.5,具高度遗传多样性;29个微卫星标记中有6个标记(GM114、GM213、GM423、GM642、UNH130和UNH985)在高要F₀群体中与至少一种生长性状显著相关(P<0.05);GM213、GM642、UNH130和UNH985 4个标记的不同基因型个体对应的生长性状在高要F₁群体中存在显著性差异(P<0.05),说明其在不同世代中遗传稳定;初筛生长相...     

玫瑰冠鸡微卫星DNA标记与生长性状相关性分析

选用5对微卫星标记对玫瑰冠鸡进行多态性扩增,计算出这些微卫星标记座位的等位基因频率、多态信息含量、群体杂合度;通过标记多态性与生长性状的最小二乘法分析和多重比较,进行了微卫星位点与各生长性状间的相关分析。结果表明,5对微卫星标记平均等位基因为5.6个,最高为7个,最低为4个。微卫星位点ADL176的基因型188-196、200-200分别对12周龄的巨型玫瑰冠鸡的体斜长和胸宽有显著影响(P<0.05)。     

微卫星标记预测半番鸭生长性状的杂种优势

为探究微卫星标记与肉鸭生长性状杂种优势的相关关系,利用8个微卫星标记对M18母本、大型母本、中型母本、小型母本和番鸭进行遗传多态性检测。结果表明,8个微卫星标记座位平均有效等位基因数为2.888 1个,平均多态信息含量为0.633 1,平均基因杂合度为0.518 1;番鸭与M18母本、大型母本、中型母本、小型母本的遗传距离为0.445 2、0.362 3、0.367 1和0.322 4。根据遗传距离,采用对数曲线模型对白羽半番鸭体重杂种优势进行预测,T检验结果显示,预测结果与实测结果无显著性差异,表明本研究建立的根据微卫星标记预测白羽半番鸭部分生长阶段体重杂种优势是可行的。     

湖羊GDF8区域微卫星标记遗传多样性与生长性状相关性分析

选择位于绵羊2号染色体GDF8区域可能与生长性能相关性较大的4个微卫星标记（BMS1591、TEXAN-2、FCB128、BM81124）对湖羊的生长性状进行研究。结果表明：这4个微卫星标记在湖羊中都达到了高度多态水平（PIC〉0．5）,可见这些微卫星标记可用于湖羊的遗传多样性评估。方差分析表明：标记BMSl591各基因型初生重之间存在极显著差异（P〈0．01）;在BMS1591标记中104／114的初生重最小二乘平均值为最大,与基因型94／112、94／114、98／106、102／120和106／120之间初生重的最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）;标记BMS1591的断奶重和6月龄重以及标记TEXAN-2、FCB128、BM81124的初生重、断奶重和6月龄重,各基因型之间差异不显著（P〉0．05）。     

微卫星DNA标记与边鸡生长性状关系的研究

利用 5种鸡基因组的微卫星DNA标记 ,对边鸡共 97只个体进行标记基因型与生长性状的最小二乘分析。结果表明 :有 2个标记位点ADL0 14 6和ADL0 176分别显著影响边鸡的部分生长性状。在ADL0 14 6位点 ,基因型为 14 9 -14 9个体的体重、龙骨长最小二乘均值显著大于基因型为 14 5 - 14 9、14 5 - 160和 14 9 -160个体所对应的性状 (P <0 .0 5 ) ;基因型为 14 9 -14 9个体的胫长最小二乘均值显著小于基因型为 14 5 - 14 9、14 5 - 160和 14 9 -160个体所对应的性状 (P <0 .0 5 )。在ADL0 176位点 ,基因型为 186- 186、186- 192个体的胸宽、骨盆宽最小二乘均值均显著大于基因型为 188- 2 0 2、192 - 2 0 8和 2 0 8 -2 2 2个体所对应的性状 (P <0 .0 5 )。     

黄Ⅳ肉鸡微卫星多态性与生长和屠宰性状的相关分析

利用31个微卫星标记分析了黄Ⅳ肉鸡群体的173个个体各标记座位的等位基因数、基因频率、杂合度和多态信息含量,同时测定群体的14项生长性状和屠宰性能指标,采用方差分析法对标记与性状进行相关分析。结果表明:各位点平均等位基因数为4,平均杂合度为0.330 6,平均多态信息含量为0.487 1。方差分析显示:微卫星标记ABR0322、MCW0104对2周龄体重有极显著和显著影响;MCW0331对4周龄体重有显著影响;ABR0322、MCW0258对6周龄体重有极显著和显著影响;MCW0331、MCW0258对8周龄体重、屠体重和半净堂重有显著影响;ABR0322、ADL0146、MCW0067对胸肌重有显著影响;MCW0183、MCW0258对腹脂重有显著影响;ADL0146、MCW0095、MCW0331对肝重有显著影响;LEI0146、MCW0183、MCW0245、MCW0331对肌胃重影响显著;ADL0278、MCW0258、MCW0331对心重有显著影响;MCW 0331对腿肌重有极显著影响。     

德国镜鲤微卫星标记与形态性状的相关分析及亲本的选育

利用微卫星标记技术对形态差异较大的2个德国镜鲤(Cyprinus carpio L. mirror)群体的189尾个体进行研究.利用一般线性模型(general linear model,GLM)对15个微卫星位点与德国镜鲤的体重、体长、体高、尾柄长、尾柄高、头长和头高的关系进行方差分析和多重比较,结果表明微卫星引物MFW1与体重和体长显著相关,与体高极显著相关;引物MFW9与头长显著相关;引物MFW11与尾柄长和头高显著相关;引物MFW29与体长、体高和头高极显著相关,与尾柄高显著相关.利用引物MFW1检出10尾含有座位208/208的个体;利用引物MFW9检出25尾含有座位90/90的个体;利用引物MFW11检出3尾含有座位202/188的个体;利用引物MFW29检出10尾含有座位172/162的个体.将上述个体利用SPSS13.0对其进行差异性分析,选育出33尾优良个体,利用PopGene3.2对其遗传距离进行分析,最终选出13尾性状优良且遗传距离较大的亲鱼,其中5尾为保种群体,8尾为北林群体,对其培育并建立选育系.     

Genetic potential analysis of German mirror carp (Cyprinus carpio L.) using microsatellite markers

Using 30 microsatellite markers and combining quantifiable characteristics such as body weight, body length and body width, we evaluated the genetic potential of 3 German mirror carp (Cyprinus carpio L.) populations. Number of effective alleles (Ae), observed (Ho) and expected (He) heterozygosity values and polymorphic information contents (PIC) were all calculated. Two hundred and eighty-seven alleles and 559 genotypes were detected. The DNA fragment length was 109–400 bp. The Hardy-Weinberg Equilibrium was checked and the phenomenon of some disequilibrium was studied according to the χ² test. The results showed that the level of genetic variability was moderate, but genetic potential of Shuanglai population was much lower than that of Huanxin and Songpu breeding populations. PIC of the three populations of German mirror carp were between 0.08787 and 0.5377, both highly and moderately polymorphic markers were 13. The number of the Ae was between 1.1014 and 6.4665. The Ho and He heterozygosity values were 0.0968–0.9892 and 0.0926–0.8554, respectively. The linkage correlation was analyzed using the data of body weight, body length and body width, and 30 loci. The result showed that there existed 2 loci, HLJ319 and HLJ693, associated with body length. The HLJ693 locus was significantly correlated with body weight trait. The HLJ677 locus was linked with body width. And then the result was verified in Recombinant Inbred Lines (RIL) of common carp. It showed that the HLJ319 locus was significantly linked with body length, the same as the result of quantitative trait loci (QTL) location for common carp. __________ Translated from Hereditas (Beijing), 2007, 29(12): 1509–1518 [译自: 遗传 (北京)]     

微卫星分子标记对德国镜鲤两家系遗传多样性的比较分析

利用35个微卫星分子标记对黑龙江松浦实验站2个家系德国镜鲤的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ae)等进行遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,χ2检验估计Hardy-Weinberg平衡,并与其亲本的各项遗传指标进行比较。2个家系共检测到108个等位基因,平均每个基因座扩增得到3.0857个等位基因,片段长度在136~383 bp之间。结果显示,2个家系的多态性指标均适中,多态信息含量分别为0.4376、0.3254,多态性扩增的基因座的有效等位基因数在1.0339~4.6997个不等,平均有效等位基因数依次为2.2706、1.8432,无偏期望杂合度在0.183 1~0.8006之间,平均值分别为0.5123、0.3881。但连锁不平衡分析表明,这2个家系在较大的选择压力下,已偏离Hardy-Weinberg平衡,讨论了出现这种现象的可能原因。     

荷包红鲤与德国镜鲤正反杂交组遗传结构的微卫星分析

用11对微卫星引物对两个杂交组合（荷包红鲤♀×德国镜鲤♂,德国镜鲤♀×荷包红鲤♂）的遗传结构进行了分析。结果表明：11对引物均能表现很好的多态性,可用作两个杂交组合遗传结构的分析,且得到的MFW 30可以用来鉴别正反杂交组的双亲;正反杂交组多态信息含量（PIC）均值分别为0.5072和0.5359,属高度多态性;子代的有效等位基因数分别为2.6594和2.9211,均大于母本而小于父本;在反交组子代中杂合度为0.9212,要高出双亲,正交组中为0.7515,介于双亲之间,均显示出子代的高遗传变异水平;Hardy-Weinberg平衡的卡方检测发现,正反杂交子代分别有8个和10个位点发生大幅度偏离平衡;双亲间遗传距离正交组为0.2699,反交组为0.3578,显示出能产生杂交优势的潜力且正交组要低于反交组;UPGMA聚类图显示,子代在正交组中与母本近,在反交组中与父本近,两者都提示杂交子代与荷包红鲤的亲缘关系较近。     

草鱼羧肽酶A4基因部分序列多态性及生长性状关联分析

[目的]筛选出更多与草鱼生长相关的SNP位点标记,为草鱼分子育种研究提供理论依据.[方法]根据草鱼EST数据库中属于消化酶的羧肽酶A4基因的cDNA序列设计引物,采用PCR产物直接测序法,对含预计SNP位点的cDNA序列进行扩增、测序,并寻找新的SNP位点.[结果]cDNA上预计的SNP位点不存在,但在内含子3上检测到两个SNP位点,分别位于内含子的第40、241个碱基处,命名为A40G位点和G241T位点.经创造酶切位点的限制性片段长度多态检测(CRS-RFLP),发现A40G位点AA型占50.3%、AG型占23.8%、GG型占25.9%,G241T位点的GG型占48.6%、GT型占47.9%、TT型占3.5%.利用一般线性模型(GLM)将两个SNP位点与草鱼6个生长性状进行关联分析,结果表明,A40G位点的GG型个体在体重、体长、体高均高于AA型和AG型,但差异不显著(P>0.05);G241T位点TT型个体最重,GG型最轻,但差异不显著( P>0.05);A40G和G241T两个位点组成的7种双倍型个体的体重、体长、体高、尾柄高等重要生长性状差异也不显著(P>0.05).[结论]在草鱼羧肽酶A4基因的内含子3上发现两个SNP位点(A40G位点和G241T位点),每个SNP位点都可分为3种基因型,但两个SNP位点的不同基因型以及由其组成的双倍型与草鱼的重要生长指标均不存在显著相关.     

利用164个微卫星标记分析镜鲤家系的遗传多样性和经济性状

利用来源于细菌人工染色体文库(Bacterial artificial chromosome,BAC)的164个微卫星标记分析了镜鲤Cyprinus carpio L.家系遗传多样性及标记与体质量、体长、体高、体厚4个性状间的相关性.结果表明:镜鲤家系68个个体在164个微卫星位点上共扩增出402条条带,观察杂合度(Ho)为0.220 6 ～1.0000,平均为0.62,多态性信息含量(PIC)为0.243 9～0.702 8,平均为0.42,总体表现为中度多态(0.25≤PIC≤0.50),遗传多样性水平较高;利用SPSS 17.0的GLM模块分析标记与性状间的相关性,有25个标记与相应性状相关(P＜0.05),其中6个标记与性状的相关性达到极显著水平(P＜0.01),使用独立样本T检验和Duncan’s多重比较找到了每个位点的优势基因型;利用NCBI的Blast模块将各位点序列与斑马鱼的序列进行比对,有11个位点与斑马鱼基因相关,一致度均在80％以上,其中6个基因功能已知.     

牙鲆微卫星分子标记与生长性状的相关性分析

研究利用30对牙鲆微卫星标记,对牙鲆雌核发育家系91个个体基因组DNA进行检测,在30对微卫星标记中,共检测到124个等位基因。其中,各座位的等位基因数3～8个,等位基因片段大小为80～170bp,平均有效等位基因数3.257。其中poli11座位的等位基因数目最多为8。平均多态信息含量为0.6197,平均杂合度为0.6672。利用SAS8.2中的一般线性模型(GLM)对30个微卫星标记与牙鲆的生长性状进行连锁显著性检验。发现在30个微卫星座位中,有8个座位分别与体重、体长、体高显著相关。其中,poli6TUF位点与体重相关;poli30TUF、poli107TUF、poli108TUF、poli116TUF、poli123TUF、poli130TUF6个座位与体长显著相关;poli145TUF与体重、体长显著相关,而与体高相关性不显著。poli9-8TUF与体重、体长、体高3个性状均显著相关(P<0.05)。将基因型与生长性状进行Duncan多重比较,找到4种与生长性状相关的基因型。     

威宁黄牛SOCS4基因多态性及其与生长性状的关联分析

[目的]了解威宁黄牛SOCS4基因多态性及其与生长性状的关联性,为深入研究SOCS4基因遗传效应及其功能和调控机制奠定基础.[方法]随机抽取106头威宁黄牛,采集血样后提取总DNA,利用PCR-SSCP检测SNP位点及基因型,并分析SOCS4基因SNP位点与不同个体生长性状的相关性.[结果]在SOCS4基因中共发现两个SNP位点,分别是第1内含子的T+435C和3+UTR的G+13700C,均有3种基因型.在威宁黄牛群体中,T+435C位点是以T为优势等位基因,G+13700C位点则以C为优势等位基因,但只有T+435C位点与威宁黄牛的生长性状存在显著关联(P＜0.05,下同),且在公牛和母牛中呈不同关联性特征.在公牛中,T+435C位点与胸围显著相关,TT型个体胸围均值显著高于CC型个体;而在母牛中,T+435C位点与管围、胸深、腰高和坐骨端宽等生长性状显著关联,且均以CC型个体值高于其他基因型个体.[结论]威宁黄牛SOCS4基因多态性不丰富,且只有内含子区的T+435C位点与其生长性状存在明显关联,即T+435C位点可作为威宁黄牛生长性能的辅助选择分子标记.     

黑龙江野鲤与德国镜鲤杂交组合的亲子鉴定分析

利用微卫星多态性进行鱼类亲子鉴定,在鱼类选育中具有重要意义。采用8个微卫星标记对黑龙江野鲤♀×德国镜鲤♂(正交组合),及德国镜鲤♀×黑龙江野鲤♂(反交组合)进行亲子鉴定。结果显示:(1)正交组中父母本和子代观测杂合度分别为0.607 1、0.714 3和0.681 8,多态信息含量依次为0.442 1、0.281 3和0.553 5;反交组中父母本和子代观测杂合度分别为0.708 3、0.538 6和0.743 8,多态信息含量依次为0.673 5、0.375 9和0.624 1,表明8个位点具有较高的多态性。(2)正交组中,8个位点累计排除率为99.92%,亲本与子代的配对率为98.00%(置信度为95%);反交组中,8个位点累计排除率为99.99%,亲本与子代的配对率为99.00%(置信度为95%)。(3)关于使用微卫星标记数与鉴定率的探讨,对3、4、5、6、7、8个微卫星标记时的累计排除率和亲子配对率进行比较,结果表明,正反交组分别利用6和8个多态性良好的引物就能正确鉴定。研究亮点:(1)将亲子鉴定技术运用在黑龙江野鲤和德国镜鲤杂交育种过程中,能够更加准确地构建家系,有效地避免近亲交配,防止种质退化;(2)对微卫星标记数与鉴定率的探讨结果表明,正反交组分别利用6和8个多态性良好的引物就能正确鉴定。     

油用型红花主要农艺性状与单株籽粒产量间的相关及通径分析

对来自世界各地的50份油用型红花品种(系)的主要农艺性状进行相关和通径分析。相关分析结果表明,10个相关性状对单株粒重的影响顺序是单株有效果球数,总果球数,单株无效果球数,百粒重,总分枝数,二级分枝数,一级分枝数,株高,分枝高,顶花球直径。多元回归分析表明,单株有效果球数,总果球数,单株无效果球数,百粒重,顶花球直径是影响单株粒重的主要因素。通径分析表明,单株有效果球数,单株总果球数对产量的直接影响较大,是红花品种选育的主攻方向。综合考虑,单株产量高的油用型红花株型应是:株高和分枝数适中,单株有效果球数和总果球数多,无效果球少,顶果球直径和百粒重较大者。