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通过TCMSP数据库,结合化合物含量信息,从灵芝中筛选出类药性好且含量较高的化合物;通过TCMSP、TCMIP、Swiss Target Prediction、SuperPred等数据库,预测化合物相应靶点;采用STRING数据库,构建靶点蛋白质互作(PPI)网络,并筛选出核心靶点;通过Enrichr数据库,预测核心靶点对应疾病;通过Cytoscape的ClueGo模块,对核心靶点进行基因本体分析(GO)及通路富集分析(KEGG),最终建立化合物-靶点、化合物-靶点-疾病-通路网络。根据试验结果,共筛选出60种化合物的22个核心靶点;核心靶点对应的疾病集中在肿瘤、自身免疫性疾病等;GO分析发现,核心靶点参与了88个生物过程,主要分为8个类别;KEGG分析发现,核心靶点参与了5个代谢通路,分为4个类别;化合物-靶点-疾病-通路网络显示了化合物、靶点、疾病、通路间的相互作用,如Lucialdehyde C、Ganoderic aldehyde A可通过DRD2靶点及22个相关生物功能通路,对30种疾病发挥作用。 相似文献
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不同提取方法对决明子蒽醌类成分及抗氧化活性的影响 总被引:2,自引:0,他引:2
采用回流、索氏、微波及超声4种提取方法,测定4种决明子提取液中的游离蒽醌和总蒽醌的含量;采用DPPH、FRAP两种方法测定其抗氧化活性,并分析蒽醌类成分和抗氧化活性之间的关系。结果表明:在对游离蒽醌的测定中以索氏提取法最高(0.16%),与其他提取方法相比差异显著(P<0.05);在对总蒽醌的测定中,提取率为超声(0.63%)>微波(0.56%)>回流(0.49%)>索氏(0.47%);抗氧化活性测定发现,以回流液的抗氧化能力最强,其次是微波液,二者与超声液和索氏液相比有显著性差异(P<0.05);游离蒽醌的含量与抗氧化活性呈极显著负相关(P<0.01)。 相似文献
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许多研究表明,营养素间有着广泛的互作关系[1],其中有些营养素间的关系已比较明了,如各种家畜日粮中的钙磷比例、硒与维生素E相互节省及铜钼颉颃等,但其他的营养素间的相互关系如铜与维生素A之间的相互作用有待认识.本就铜和维生素A在抗氧化方面的作用及互作效应进行概述.…… 相似文献
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研究表明,铁皮石斛在增强人体免疫力方面具有良好作用。为了明确铁皮石斛潜在的免疫活性成分及其作用机制,本研究从PubChem、SciFinder数据库中收集铁皮石斛小分子化合物及其化学结构相关的研究,然后通过Swiss ADME筛选优效目标化合物。通过Swiss Target Prediction预测优效化合物的靶点集,并通过Genecards数据库获取免疫调节相关靶点集,两者取交集得到铁皮石斛免疫调节相关靶点集,进一步通过Cytoscape软件建立化合物-靶点网络图,将交集靶点导入STRING构建蛋白互作网络(PPI),筛选出核心靶点。通过R的Cluster Profiler包对核心靶点进行功能富集分析,包括基因本体分析(GO)及通路富集分析(KEGG),最终建立化合物-靶点-生物功能网络。最终,共筛选出优效化合物124个,对应靶点421个;与免疫调节相关化合物58个,对应靶点60个;其中黄酮类化合物对应的免疫靶点较多,可能为主要的免疫活性成分。得到9个免疫调节相关核心靶点,GO分析发现这些核心靶点共参与了2 059个条目,KEGG分析获得153个代谢通路。本研究通过化合物-靶点-生物功能网络展示了铁皮石斛多成分、多靶点、多通路的作用特点,为后续作用机制的深入研究和验证提供了可行方向。 相似文献
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【目的】基于网络药理学探究滇黄精(Polygonatum kingianum)潜在的抗疲劳机制。【方法】使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、CNKI和DrugBank数据库搜寻滇黄精的主要活性成分,并利用SwissTargetPrediction数据库预测各活性成分的作用靶点;通过Disgenet数据库获取与疲劳有关的靶点;借助Venny 2.1.0和Cytoscape v3.9.0构建滇黄精—活性成分—抗疲劳靶点网络,根据其节点度值筛选滇黄精的主要活性成分。通过String数据库构建蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络,通过节点度值筛选滇黄精抗疲劳的关键靶点。使用DAVID数据库对筛选的关键靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。使用AutoDock Vina软件对滇黄精的主要活性成分与抗疲劳关键靶点进行分子对接。【结果】获得滇黄精活性成分38种;预测得到滇黄精抗疲劳靶点30个;... 相似文献
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利用网络药理学和免疫浸润探讨大蒜素对肝细胞癌的作用机制。利用TCMSP数据库收集大蒜素的有效成分信息,利用PharmMapper数据库筛选大蒜素的作用靶点;通过STRING11.0数据库进行蛋白互作分析,并利用Cytoscape3.7.1软件进行可视化展示。通过GeneCards数据库收集肝细胞癌相关靶点,将化合物靶点与疾病相关靶点进行比对,利用Venny2.1.0工具绘制韦恩图。利用GEPIA数据库对潜在靶点进行表达差异分析和生存预后分析,最后利用TIMER数据库进行肿瘤细胞免疫浸润分析。结果表明,筛选得到大蒜素的潜在靶点有194个,与HCC相关的靶点31个,其中高相关性靶点4个。大蒜素治疗肝细胞癌具有多靶点、多途径、多通路的特点,CCNA2、AURKA、MMP9、ESR1等靶点可能在治疗过程发挥重要作用。 相似文献
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【目的】基于网络药理学构建两面针抗肿瘤的“活性成分-抗肿瘤靶点-抗肿瘤通路”等网络关系,预测其抗肿瘤的作用靶点并对其作用机制进行研究分析。【方法】以口服利用度(OB)及类药性(DL)为限制条件在中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选出两面针主要活性化学成分,在Pharmmapper服务器上筛选和建立两面针靶点数据库。通过OMIM及其他数据库进行抗肿瘤相关基因及蛋白靶点筛选。使用R4.2.1软件做出两面针活性成分、靶点基因和肿瘤。靶点基因相交情况筛选两面针作用靶点。通过Cytoscape 3.6.1软件Merge及Union功能,建立了两面针“有效成分-肿瘤靶点”的可视化交互网络。利用STRING数据库构建抗肿瘤靶点之间的交互网络、PPI网络,利用DAVID数据库对靶蛋白进行KEGG通路注释分析,富集出生物通路,构建出“活性成分-抗肿瘤靶点-抗肿瘤通路”网络。选择其中一个关联度较高的活性化合物作为配体、KEGG富集结果中较为显著的信号通路所涉及靶点作为受体,对活性成分与核心靶蛋白进行分子对接验证。【结果】经筛选和分析获得两面针活性成分21个,抗肿瘤靶点14个,包括EGFR、ESR... 相似文献
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黄精属百合科黄精属,性味甘甜,食用爽口,具有重要的药用和食用价值。为探讨黄精抗炎可能活性成分及作用机制,借助TCMSP数据库筛选黄精活性成分,利用Pharmmapper和Uniprot数据库查找黄精活性成分靶点基因,借助GeneCards和MalaCards数据库筛选人体炎症相关基因,取交集获取黄精抗炎潜在靶点;在Metascape数据库进行GO富集和KEGG通路注释;使用Cytoscape3.6.1软件构建黄精抗炎潜在靶点的“成分-靶点-通路”网络图,STRING数据库构建PPI网络图。共筛选出(+)-丁香树脂醇-O-β-D-葡萄糖苷、中华在线1、甲基原纤细薯蓣皂苷、西伯利亚蓼苷A、3’-甲氧基大豆苷元、β-谷甾醇等12个潜在活性成分和ALB、EGFR、MAPK1、CASP3、ESR1等65个黄精抗炎潜在靶标,生物信息学富集分析中筛选出46个GO条目和13条KEGG通路,主要涉及Pathways in cancer(癌症的途径)、Prostate cancer(前列腺癌)、IL-17 signaling pathway(IL-17信号通路)、Hepatitis B(乙型肝炎)通路。该研究揭示了黄精抗炎多成分、多靶点、多通路的作用机制,为黄精抗炎机制研究和后续试验研究提供依据。 相似文献
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人工授精技术在养猪生产中已经普及,但在精液稀释过程中往往不分品种地使用相同稀释剂。本研究选取某猪场杜洛克公猪51头、长白公猪32头、大白公猪42头,历时1年,分别采集精液数量1 664份、1 196份和1 248份,在使用同一长效稀释剂的情况下,研究其精液在常温保存中0~10 d的品质变化规律。结果表明,随着保存天数的增加,精液品质逐步下降,但3 d内精液品质未见显著性变化;不同品种公猪精液在保存过程中品质变化呈现出品种特异性,大白公猪精液保存效果最差,杜洛克、长白公猪精液的有效保存时间分别可以达8、9 d。 相似文献
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为了验证牛精清及牛用精液冷冻稀释液在猪精液冷冻中的有效性,将牛精清(0、2.50%、5.00%、10.00%)加入猪精液冷冻稀释液(葡萄糖1.10%、柠檬酸1.48%、Tris 2.42%、NAC 0.02%、卵黄20.00%、甘油6.00%、青霉素0.06%、链霉素0.10%)中,或用改良猪精液冷冻稀释液(另加入0.10 mmol/L他克林)、牛精液冷冻稀释液及改良牛精液冷冻稀释液,对猪精液进行冷冻处理。结果表明,在本试验条件下,牛精清对猪精子冷冻保存没有正面作用;改良牛用稀释液用于猪的精液冷冻,效果与改良猪用稀释液相当,优于未改良牛用稀释液。 相似文献
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旨在研究雪峰乌骨鸡HSP70基因多态性及其与鸡冻精品质的关系,以期筛选出鸡精液抗冻性相关分子标记,为鸡精液冷冻保存及其分子育种提供技术支撑。选取100只同一批次、性成熟的白羽雪峰乌骨种公鸡,测定采精量、精子密度和冻精活力等指标。翅静脉采血,提取基因组DNA并扩增HSP70基因,构建精液品质低、中、高3个混池并测序。单个样本测序后,比对测序峰图,完成基因分型,统计不同基因型个体数,并进一步进行精液品质关联分析。结果发现:HSP70基因436 bp处存在G>A突变,G为优势基因,将群体分成AA、AG和GG这3种基因型,各基因型频率依次为22%、44%和34%,该位点遗传多样性分析PIC=0.371 4,为中度多态位点,Hardy-Weinberg平衡适合性检验得χ2=1.148 0(P>0.05),该群体符合Hardy-Weinberg平衡规律。基因多态与精液品质关联分析表明,GG基因型个体采精量和精子密度极显著(P<0.01)高于AG型、AA型个体,且冻后活力显著(P<0.05)高于AG型个体,极显著(P<0.01)高于AA型个体;AG型个体采精量和精子密度极显著(P<0.01)高于AA型个体,冻精活力差异不显著(P>0.05)。综上所述,HSP70基因突变G/A位点与鸡冻精品质显著相关,可以作为雪峰乌骨鸡个体精液抗冻性的候选基因,基因型GG的个体精液更具抗冻性,其次为AG型个体。 相似文献
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分子蒸馏精制肉桂油的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
[目的]为精制肉桂油的高效提取提供理论依据。[方法]采用刮膜式分子蒸馏技术精制肉桂油,研究温度、真空度、进料速度、刮膜转速对肉桂精油得率和纯度的影响,采用GC-MS对分离物中肉桂醛含量进行分析,确定分子蒸馏精制肉桂油的最佳工艺条件。[结果]4个因素对试验的影响顺序为:真空度〉温度〉进料速度〉刮膜转速,理论最优组合为:蒸馏温度63℃,真空度50 Pa,进料速度1.0ml/min,刮膜转速320~340 r/min。根据综合评分结果和验证试验结果,确定分子蒸馏的最佳工艺条件为:蒸馏温度63℃,真空度50Pa,进料速度2.0 ml/min,刮膜转速270~290 r/min。在该条件下,肉桂精油的得率为92.14%,肉桂醛纯度为63.39%。所制肉桂油颜色由黄中带黑色转为淡黄色,色泽清亮,无可见悬浮物,香味纯净。[结论]确定了分子蒸馏精制肉桂油的最佳工艺条件。 相似文献
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应用紫外可见分光光度法和高效液相色谱法测定福建8种决明属植物种子生品蒽醌类物质的含量,并对决明子药材评价指标进行初步分析.结果表明:不同决明属植物种蒽醌类物质总含量及组成有明显不同,钝叶决明的橙黄决明素、大黄酸含量最高,分别为1.383,0.557 mg·g-1;决明的大黄酚含量最高,为0.902mg· g-1;双荚决明和望江南的大黄素甲醚含量较高,分别为1.850、1.310 mg·g-1.翅荚决明、羽叶决明、圆叶决明均未检出橙黄决明素,大黄酸、大黄素,大黄酚、大黄素甲醚.随着植物种的变化,决明属植物种子的大黄素甲醚变异系数最高为0.302,橙黄决明素变异系数次高为0.278.大黄酸与大黄酚、橙黄决明素的相关系数分别为o.809,o.749. 相似文献
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利用桂皮精油处理冷藏猪肉,旨在为冷却猪肉开发一种适宜的保鲜剂.将桂皮精油配制成0.4%、0.8%和1.2%3种不同体积分数的保鲜剂,分别对鲜猪肉进行处理,然后于0~4℃条件下贮藏,再定期测定其肉样的理化、微生物及感官指标,并对肉样新鲜度进行综合评价.结果表明:桂皮精油对冷却猪肉有较好的保鲜作用,能延长冷却猪肉的贮藏期,... 相似文献
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《(《农业科学与技术》)编辑部》2008,(2)
[Objective] Through inductive culture,emodin and chrysophanol contents in cassia seed were increased.[Method]MS culture medium was used to bourgeon seedlings of cassia seed and to induce cotyledon callus of cassia seed while HPLC method was adopted to determine emodin and chrysophanol contents.[Result] Emodin and chrysophanol contents in cotyledon callus were 0.099% and 0.312%,respectively,while they were 0.029% and 0.190% respectively in cassia seed.[Conclusion]The method of inducing cotyledon callus was helpful for increasing emodin content in cassia seed. 相似文献
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ZHOU Jia-yu LIAO Hai LI Li-ping LIU Le HE Kui-bang MA LiCollege of Pharmacy Southwest Jiaotong University Emei 《(《农业科学与技术》)编辑部》2008,(2)
[Objective] Through inductive culture,emodin and chrysophanol contents in cassia seed were increased.[Method]MS culture medium was used to bourgeon seedlings of cassia seed and to induce cotyledon callus of cassia seed while HPLC method was adopted to determine emodin and chrysophanol contents.[Result] Emodin and chrysophanol contents in cotyledon callus were 0.099% and 0.312%,respectively,while they were 0.029% and 0.190% respectively in cassia seed.[Conclusion]The method of inducing cotyledon callus was helpful for increasing emodin content in cassia seed. 相似文献