四川9个黑山羊品种(群体)微卫星DNA多态性研究

以10个微卫星标记，PCR扩增，12％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、Sanguinetti银染法显色，对四川建昌、金堂、乐至、合江、江安、自贡、嘉陵、营山、白玉9个黑山羊品种（群体），进行微卫星DNA遗传多态性研究。结果表明，10个微卫星座位在9个黑山羊品种（群体）中均为高度多态座位，建昌、金堂、乐至、合江、江安、自贡、嘉陵、营山和白玉黑山羊的平均PIC、H和Ne分别为：0．7352／0．7739／5．0176、0．7244／0．7632／4．4838、0．7503／0．7827／4．8782、0．7702／0．8007／5．2861、0．7402／0．7771／4．5768、0．7465／0．7846／4．8556、0．7511／o．7889／4．9591、0．7604／0．7905／4．8869和0．6970／0．7417／4．2728。嘉陵与营山黑山羊在D=0．386处聚为1类；自贡与江安黑山羊在D=0．428处聚在一起后，在D=0．456处再与合江黑山羊聚为1类；金堂与乐至黑山羊在D=0．437处聚为1类；白玉与建昌黑山羊在D=0．489处聚为1类。最后4种聚为1大类。     

四川九个黑山羊品种(群体)X染色体微卫星DNA多态性研究

以7个微卫星标记,PCR扩增,12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,sanguinetti银染法显色,对四川建昌、金堂、乐至、合江、江安、自贡、嘉陵、营山、白玉9个黑山羊品种(群体),进行X染色体微卫星DNA遗传多态性研究.结果表明:7个微卫星座位在9个黑山羊品种(群体)中均为高度多态座位,建昌、金堂、乐至、合江、江安、自贡、嘉陵、营山和白玉9个黑山羊的平均PIC、H和Ne分别为:0.764 4,0.796 6,5.114 5;0.725 8,0.762 8,4.466 0;0.743 8,0.776 9,4.724 2;0.758 0,0.791 0,5.006 6;0.736 5,0.774 7,4.508 4;0.746 3,0.781 9,4.694 4;0.768 3,0.799 3,5.194 8;0.764 2,0.795 6,5.033 3;0.721 1,0.760 0,4.286 7.嘉陵与营山黑山羊在D＝0.284处聚为一类;自贡与江安黑山羊在D＝0.294处聚为一类;金堂与乐至在D＝0.381处聚为一类,在D＝0.395处再与合江黑山羊聚为一类;白玉与建昌黑山羊在D＝0.456处聚为一类.最后4种聚为一大类.     

10个山羊品种(群体)线粒体DNA D-loop序列多态性分析

对四川10个山羊品种(群体)线粒体DNA D-loop序列多态性及系统进化关系进行了探讨.结果表明:群体间共有多态位点83个,单一多态位点23个,简约信息位点24个,平均核苷酸歧异度为0.001 828,D-loop序列多态性相对贫乏;经聚类,10个品种(群体)分为两大类,合江黑山羊与江安黑山羊先聚在一起后,再与自贡黑山羊聚为1类,营山黑山羊与嘉陵黑山羊聚为1类,两类形成一大类;成都麻羊先与金堂黑山羊聚在一起后,再依次与乐至黑山羊、建昌黑山羊、白玉黑山羊形成另一大类,最后两个大类聚在一起.聚类结果与品种(群体)来源和生态地理分布相一致.     

四川几个山羊品种(群体)与岩羊RAPD分析

以两组40个随机引物，筛选出16个重复性好的多态引物。对四川5个山羊品种、藏山羊两个生态类型、3个杂交群体和岩羊共计113只个体，进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析。结果表明：16个引物扩增出67条带，其中54条带呈现多态。多态率为80．60％。山羊各群体共有条带为23条，山羊和岩羊共有条带为13条。岩羊有4条特异带。不同引物所扩增出的片段在各群体中分布频率不同。山羊群体间相似系数为0．8216—0．9362，其中，安哥拉山羊与建昌黑山羊杂交后代F2和F3之间相似系数最大。为0．9362。山羊各群体与岩羊相似系数为0．4996—0．5064。山羊群体间的遗传距离为0．0638—0．1784。山羊各群体与岩羊的遗传距离为0．4936—0．5403。高原型藏山羊与山谷型藏山羊间的遗传距离小(0．1005)、相似系数大(0．8995)。序列为TTCCGAACCC引物扩增出的片段为750bp，仅在高原型藏山羊中出现，可作为区分这两个生态类型的遗传标记。     

四川9个山羊品种(群体)与岩羊RAPD分析

以两组40个随机引物,筛选出16个重复性好的多态引物,对四川9个山羊品种(群体)和岩羊共计113只个体,进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析.结果表明16个引物扩增出67条带,其中54条带呈现多态,多态率为80.60%.山羊各群体共有条带为23条,山羊和岩羊共有条带为13条,岩羊有4条特异带.不同引物所扩增出的片段在各群体中分布频率不同.山羊群体间相似系数为0.821 6～0.936 2,其中安哥拉山羊与建昌黑山羊杂交后代F2和F3之间相似系数最大,为0.936 2.山羊各群体与岩羊相似系数为0.499 6～0.506 4.山羊群体间的遗传距离为0.063 8～0.178 4.山羊各群体与岩羊的遗传距离为0.493 6～0.540 3.高原型藏山羊与山谷型藏山羊间的遗传距离小(0.1005)、相似系数大(0.899 5),序列为TTCCGAACCC引物扩增出的片段为750bp,仅在高原型藏山羊中出现,可作为区分这两个生态类型的遗传标记.     

用5个微卫星标记分析四川7个地方山羊品种的遗传关系

选用5个微卫星标记对四川7个地方山羊品种(类群)进行了遗传关系分析。结果表明:5个微卫星标记检测到的等位基因数从1～7个不等,平均多态信息含量为0.537～0.716,其中ILSTS004、ILSTS030、McM038和OarFCB011这4个基因座位为高度多态性基因座,CSSM004为中度多态基因座,都能较好地用于山羊群体间的遗传多样性分析。7个山羊群体的平均多态信息含量为0.601～0.696,群体平均杂合度为0.530～0.655,群体间的遗传分化系数为0.1167,表明7个地方山羊群体的遗传多样性较为丰富。群体间的Nei氏遗传距离为0.0822～0.7240,以Nei氏遗传距离为基础构建的系统聚类树表明,藏山羊、建昌黑山羊、成都麻羊和北川白山羊聚为一大类,第2类为乐至黑山羊和金堂黑山羊,最后简阳大耳羊单独成一类。     

5个黑山羊品种(群体)微卫星标记的遗传多样性研究

利用14个微卫星标记分析了攀枝花地方黑山羊、建昌黑山羊、云岭黑山羊、金堂黑山羊、乐至黑山羊5个品种(群体)的遗传多样性及亲缘关系。结果显示,14个微卫星座位多态信息含量(PIC)在0.5129~0.7646之间,均为高度多态位点;5个黑山羊品种(群体)的平均多态信息含量(PIC)为0.6405~0.6856,平均杂合度(H)在0.6985~0.7371之间,说明遗传多样性丰富;群体间平均遗传分化系数(Fst)为0.0296,说明群体间的变异仅为2.96%,群体间存在基因交流;攀枝花黑山羊和金堂黑山羊2个群体之间的Nei氏遗传距离最大(D=0.1286),金堂黑山羊和乐至黑山羊之间的遗传距离最小(D=0.0365);NJ聚类图中,攀枝花黑山羊、建昌黑山羊和云岭黑山羊聚为一类,金堂黑山羊和乐至黑山羊聚为一类,聚类结果与群体的地理分布较为一致。     

四川省部分山羊遗传资源(类群)分析与评价初报

为了筛选用于肥羔山羊生产和品种选育的肉用山羊育种素材,试验选择南江黄羊、简州大耳羊、川中黑山羊(金堂型、乐至型)、川南黑山羊(自贡型、江安型)、营山黑山羊、美姑山羊、建昌黑山羊等山羊遗传资源(类群),以其主产区核心群为研究对象,分别收集、测定各资源(类群)在主产区的生长发育性能、繁殖性能以及产肉性能等指标,并结合肥羔山羊生产特性对各山羊遗传资源(类群)进行综合评价。结果表明:在各自主产区生态条件及饲养方式下,川中黑山羊(金堂型、乐至型)、川南黑山羊(自贡型)、简州大耳羊、南江黄羊的早期生长发育较快;除建昌黑山羊外,其余群体平均产羔率均达到了200%以上;川中黑山羊(金堂型)、川南黑山羊(自贡型)、营山黑山羊、简州大耳羊6月龄公羊胴体产肉率达到75%。根据肥羔山羊生产特性,初步筛选出川中黑山羊(金堂型、乐至型)、川南黑山羊(自贡型)、简州大耳羊、营山黑山羊为肥羔山羊候选育种素材。     

安哥拉山羊与建昌黑山羊及其杂种后代的DNA指纹分析

以 (CA/GATA/TCC) 5探针 ,HinfI酶切 ,研究安哥拉山羊和建昌黑山羊及安哥拉山羊与建昌黑山羊级进杂交的F2 、F3的DNA指纹图谱。结果 ,在供试山羊中 ,个体平均检出 1 8.2± 0 .4条谱带 ,安哥拉山羊、F2 、F3的鉴别机率分别为 1 .38× 1 0 - 12 ,1 .1 8× 1 0 - 13,0 .50× 1 0 - 10 ;群体内相似系数安哥拉山羊为0 .4 539,F2 为 0 .4 0 77,F3为 0 .61 1 1 ;亲子鉴定的父权概率W =0 .9889;安哥拉山羊与建昌黑山羊比较 ,2 .3kb和 8.6kb谱带为安哥拉山羊的特异谱带     

四川9个黑山羊品种(群体)的DNA指纹分析

以寡核苷酸探针(CA G/A TA T/CC)5H/infⅠ酶切,研究四川9个黑山羊品种(群体)的D NA指纹图谱。结果表明,在供试黑山羊中,个体平均可检测出18.4±1.18条谱带,未发现有共同的谱带,亦未检出性别特异谱带。9.0kb和2.2kb为建昌黑山羊共有谱带,9.0kb为金堂黑山羊共有谱带,9.0kb、6.2kb和5.5kb为白玉黑山羊共有谱带,其余各黑山羊品种(群体)内无共有谱带。9个黑山羊品种(群体)内相似系数为0.420～0.560,遗传距离为0.380～0.560。其中,合江黑山羊、江安黑山羊、自贡黑山羊间的遗传距离较小(为0.380～0.390),金堂黑山羊和乐至黑山羊间的遗传距离也较小(为0.384),白玉黑山羊分别与其他8个黑山羊品种(群体)间的遗传距离较大(0.450～0.560)。     

成都麻羊乳上皮黏蛋白MUC1的遗传多态性研究

采用SDS-PAGE研究成都麻羊乳上皮黏蛋白MUC1的遗传多态性,并以金堂黑山羊、乐至黑山羊、自贡黑山羊、藏山羊作对照进行比较分析。结果表明:成都麻羊与对照山羊乳MUC1的多态性丰富,成都麻羊有7种基因型、5个等位基因优势基因为C、D、E,金堂黑山羊7种基因型、6个等位基因优势基因为B、C、D,乐至黑山羊6种基因型、6个等位基因优势基因为B、C、D,自贡黑山羊5种基因型、5个等位基因优势基因为A、C、D,藏山羊3种基因型、3个等位基因优势基因为C、D。乳MUC1的基因型、等位基因的分布品种间有差异;根据乳MUC1等位基因频率对供试山羊品种进行聚类分析,成都麻羊与金堂黑山羊的遗传距离最小(D=0.2507)先聚为一类,再依次与乐至黑山羊(D=0.2831)、自贡黑山羊(D=0.3721)、藏山羊(D=0.4752)聚为一大类,结果较好的反映了成都麻羊与对照山羊品种间的亲缘关系。     

四川各地黑山羊品种(群体)乳的生化组成与酪蛋白多态性研究

采用常规方法测定四川9个黑山羊品种(群体)乳常规营养组分含量.采用碱性尿素电泳方法分析酪蛋白多态性.结果表明,四川9个黑山羊乳蛋白含量范围为41.36～46.37 g/L,以营山黑山羊最低(41.36 g/L),金堂黑山羊最高(46.37g/L),差异极显著(P＜0.01);乳糖含量范围为44.00～47.30 g/L,以建昌黑山羊最低(44.00 g/L),金堂黑山羊最高(47.30g/L),差异不显著(P＜0.05);乳脂率范围为55.45～60.52 g/L,其中以白玉黑山羊最低(55.45 g/L),自贡黑山羊最高(60.52 g/L),差异极显著(P＜0.01).乳蛋白组分:CN(68.42%～71.01%),β-Lg(14.46%～15.87%),IgG(7.04%～7.34%),α-La(5.35%～5.96%),SA(2.02%～2.40%).各蛋白组分经显著性检验,营山黑山羊和嘉陵黑山羊的CN相对含量显著低于其他黑山羊品种(群体)(P＜0.01).在9个山羊品种(群体)中α-酪蛋白基因型存在多态性,多态型对乳脂率影响显著,其中α-酪蛋白DD型乳脂率显著低于CC型、CD型(P＜0.05).     

黑山羊在四川省昭觉地区的适应性观察

为了解决四川省昭觉地区本地山羊近亲繁殖和品种退化严重的问题,特从四川省凉山彝族自治州会理县、美姑县分别引进建昌黑山羊母本和美姑黑山羊父本进行杂交并观察其适应性,对引进的黑山羊及F_1代羊生产指标进行测定。结果显示：F_1代母羊平均日增重122.87 g,F_1代公羊平均日增重143.62 g,与原产地羔羊日增重相当;引进的12~24月龄黑山羊与原产地黑山羊体尺差异不大,体重均比原产地黑山羊高;引进的24月龄以上黑山羊母羊体重比原产地黑山羊高出了23.14%。说明引进品种能够很好地适应昭觉地区的环境,且引进黑山羊杂交生产的F_1代黑山羊能在该地正常生长。     

西藏山羊高海拔适应性的选择信号筛选

试验旨在对西藏山羊常染色体的选择信号进行筛选,发掘重要的种质特性基因。基于西藏山羊、新疆山羊和太行山羊群体的Illumina 50K芯片分型数据,通过过滤等位基因频率较低和未定位的变异位点,得到高质量的SNPs标记;通过计算遗传分化系数（Fst）来分析群体遗传结构,同时对群体进行主成分分析（principal component analysis,PCA）和系统进化树构建以确定其群体结构;借助Di和XP-EHH两种不同的方法,以前5%为阈值,通过SNPs注释得到西藏山羊基因组受选择基因,并利用相关的生物信息学数据分析库对候选基因进行功能富集分析。结果显示,在3个群体中共鉴定出48 358个SNPs标记,3个群体有相近的遗传距离（Fst<0.05）,西藏山羊的遗传分化程度（Fst=0.0376）明显高于新疆山羊（Fst=0.0256）、太行山羊（Fst=0.0257）,表明西藏山羊群体已经产生一定程度的遗传分化。通过选择信号分析,在西藏山羊群体中共筛选到36个受到较强选择的位点和211个候选基因,其中EGFR、AKT1、PDHB和PFKP等基因与高海拔适应性相关。这些基因主要富集在嘌呤代谢通路、代谢途径和HIF-1信号通路等。利用基因组SNP标记可以更全面地揭示西藏山羊高海拔适应性的选择进展,为种质资源的保护和利用提供重要参考。     

攀西黑山羊群体的AFLP遗传多样性研究

 研究采用随机片段长度多态性分析了攀西地区的5个黑山羊品种（类群）的遗传多样性。结果表明：15对引物共扩增出1003条多态条带,多态频率平均为99.01%,5个黑山羊群体的遗传多样性指数变异范围为0.0136~0.2131,其中建昌黑山羊平均遗传多样性指数最高（0.1346）,攀枝花黑山羊次之（0.1329）,乐至黑山羊最低（0.1101）。5个群体遗传距离范围为0.0062~0.0281,攀枝花黑山羊与建昌黑山羊之间的遗传距离最小（DR=0.0062）,云岭黑山羊与攀枝花黑山羊之间的遗传距离次之（DR=0.0128）,乐至黑山羊与金堂黑山羊间遗传距离最大（DR=0.0281）,金堂黑山羊与其它4个类群遗传距离较大（DR=0.0173-0.0281）,说明攀枝花黑山羊与建昌黑山羊的亲缘关系最近,与云岭黑山羊的亲缘关系较近,乐至黑山羊与金堂黑山羊的亲缘关系最远,金堂黑山羊与其它4个类群遗传距离均比较远。聚类结果与群体地理分布、生态条件差异情况基本一致。     

四川5个山(绵)羊品种随机扩增多态DNA分析

本研究参阅文献挑选 80个随机引物 ,从中筛选出 3 0个重复性好的引物 ,对四川黑山羊、南江黄羊、北川白山羊、成都麻羊 4个山羊品种和藏绵羊进行RAPD分析 ,并进一步对 1 3只南江黄羊个体 ,1 8只黑山羊个体的基因组DNA进行PCR扩增。用Nei氏公式计算品种间的遗传距离 ,用UPGMA法构建树状聚类图。结果表明 :黑山羊与南江黄羊的遗传距离最小 ,亲缘关系较近 ;藏绵羊与各品种间的遗传距离都很大 ,亲缘关系远 ;RAPD技术可作为一种有效的分子标记用于山羊品种之间遗传亲缘关系的分析     

三个山羊群体血液蛋白多态性研究

采用垂直平板不连续缓冲系统聚丙烯酰胺凝胶电泳法 ,研究了安哥拉山羊和建昌黑山羊及其高代杂种羊 (F3 ) 9个血液蛋白基因座 (Alb、Pr、Pa、Tf、Hp、Hb、LDH、Akp、Amy)的遗传多态性。结果表明 :安哥拉山羊与F3 血液Alb、Pr、Pa、LDH、Amy呈单态 ,Tf、Hp、Hb、Akp呈多态 ;建昌黑山羊血液Alb、Pr、Pa、Tf、Hp、Hb、LDH、Amy呈单态 ,Akp呈多态。根据所测座位的基因频率计算了群体平均基因杂合度和一致度 ,以及群体间遗传相似系数和遗传距离 ,安哥拉山羊的平均基因杂合度与一致度分别为 0 .1131和 0 .886 9,建昌黑山羊的相应值分别为 0 .0 6 2 1t 0 .9379,F3 则分别为 0 .110 3和0 .8897。安哥拉山羊与F3 的遗传距离小 (0 .0 0 39)、遗传相似系数大 (0 .996 1)。     

基于Cytb基因多态性研究西藏地区8个藏山羊群体遗传结构及母系起源

旨在基于Cytb基因多态性探讨藏山羊群体间遗传结构及其母系起源。对西藏8个地区157只藏山羊的细胞色素b基因(Cytb)全序列进行扩增和测序,分析群体遗传多样性,计算群体间遗传分化指数,构建系统发育邻接树等。结果显示,藏山羊Cytb全序列为1 140bp,在8个群体中共检测到33个变异位点,定义了30种单倍型,单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.736和0.001 8,表明西藏地区藏山羊群体具有较丰富的遗传多样性。78.6%的群体间发生了显著的遗传分化(P0.05),组内群体间的变异极显著(F_(SC)=0.321,P0.001);系统发育邻接树分为了4个单倍型组(Haplogroup A-D),提示藏山羊有4个母系起源;单倍型网络图显示,不同地理来源的藏山羊没有完全聚类在同一群簇。在历史驯养过程中,藏山羊发生过群体扩增事件。本研究表明,西藏地区藏山羊有4个母系起源,并呈现出较丰富的遗传多样性,虽然群体间有一定程度的遗传分化,但没有形成明显的地理分隔格局,遗传结构差异在缩小。本研究结果为藏山羊遗传资源的保护和利用提供了科学依据。     

新疆狗牙根种质遗传多样性的SSR分析

利用SSR分子标记技术,对采自中国新疆的51份野生狗牙根（Cynodon dactylon）及19份新疆农业大学选育的材料进行遗传多样性研究。结果表明,11对引物共得到多态性条带数55条,平均每对引物扩增出5条带,每对引物检测到36个等位基因,平均每对引物检测到5个等位基因。每个SSR位点的多态性信息量(PIC)在0.650.83,平均0.78;SSR标记揭示的新疆70份材料间的遗传相似系数变化范围为0.500.84,表明新疆狗牙根具有较丰富的遗传多样性。UPGMA聚类分析表明,SSR标记能够将新疆70份材料区分开;供试材料可聚为4类,其中Cd071单独聚成1类,野生材料聚为2类。表明这些材料遗传差异较大,各生态地理类群间的遗传分化与其所处的生态地理环境具有一定的相关性。     

四川6个山羊品种(群体)乳的生化组成研究

用MilkScan-1340A/B型全自动综合乳质测仪和SDS-PAGE分别测定了成都麻羊、南江黄羊、金堂黑山羊、建昌黑山羊、北川白山羊、波尔山羊和波尔山羊(♂)与成都麻羊(♀)杂交一代羊乳的常规成分和乳蛋白组分。结果表明,乳中干物质波尔山羊为(160·57±8·61)g/L,显著高于成都麻羊和南江黄羊(P<0·05),其余品种(群体)间差异不显著;波尔山羊乳脂和乳蛋白含量分别为(60·62±2·81)g/L和(46·73±3·15)g/L,显著高于成都麻羊、南江黄羊和金堂黑山羊(P<0·05),其余品种(群体)间差异不显著。乳蛋白组分中,α-乳清蛋白、β-乳蛋白、免疫球蛋白的相对含量在山羊品种(群体)间差异均不显著;酪蛋白相对百分含量波尔山羊为(67·57±1·45)%,显著低于成都麻羊和南江黄羊(P<0·05)。