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:用8个微卫星标记对闽南黄牛的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究。结果:8个微卫星标记在所检测的闽南黄牛群体中都表现出较丰富的多态性,在4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因,每个微卫星标记平均检测到7.2个等位基因(3~11);8个微卫星标记的平均多态信息含量(PIC)为0.6471,各群体的平均多态信息含量(PIC)差并不显著;全部群体平均杂合度为0.2930;各群体平均有效等位基因数为3.37。此表明闽南黄牛在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;根据奈氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析,结果表明4个群体间的遗传变异不大。 相似文献
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利用8对微卫星标记对江苏省野生及家养中华蜜蜂群体遗传多样性进行分析,评估群体内的遗传变异和群体间的遗传分化,结果表明,共检测到31个等位基因,每个位点的等位基因数从1~7不等,平均等位基因数为3.875;所有位点平均的期望杂合度和PIC值分别为0.4424和0.4054。野生及家养中华蜜蜂群体8个微卫星位点平均有效等位基因数分别为3.83和4.17,平均基因杂合度为0.0778和0.0993,两个群体均表现出较低的群体杂合度和遗传多样性。群体分化系数为4.9%(P<0.001),两个群体的Reynolds’遗传距离和Nm值分别为0.05024和4.852。江苏省野生及家养中华蜜蜂群体均表现出较低的群体杂合度和遗传多样性水平,且有相互交流的迹象。 相似文献
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豫东肉山羊是河南省以波尔山羊为父本,槐山羊或马槐杂交山羊为母本培育的新品种,在组建豫东肉山羊核心群的过程中,由于历史原因,存在亲缘记录不完整问题。为此,采用12对国际通用微卫星引物对豫东肉山羊核心群内310只(300只母羊,10只公羊)健康个体进行微卫星(SSR)分析,并运用生物信息学方法进行遗传多样性参数统计和家系构建。结果显示,采用12个微卫星位点,在豫东肉山羊核心群中共发现144个等位基因,平均等位基因数11.8个。其中等位基因数量最多的微卫星位点是CSSM66,等位基因数26个,等位基因数量最少的微卫星位点是BMS0812,等位基因数5个。遗传多样性分析结果表明, 12个微卫星位点的平均多态含量(PIC)0.646,其中位点BM1329、BMS0812、BM6404属于中度多态位点,剩余9个位点均属于高度多态位点,豫东肉山羊核心群体平均期望杂合度(He)0.683,平均观测杂合度(Ho)0.625。根据不同公畜的亲缘关系分为7个父畜家系,可囊括185只母畜,另外115只母畜划分至无家系类别。综上, SSR家系的构建,对于厘清群体亲缘关系和科学扩繁具有一定的应用价值和实践意义。 相似文献
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利用微卫星标记技术,选用16个微卫星位点对60只闽西南黑兔群体遗传多态性和遗传结构进行分析。结果表明,在所检测的闽西南黑兔群体中,16个微卫星位点共检测到了75个等位基因,各位点的等位基因数在3~7之间,平均等位基因数为4.688个,平均有效等位基因数为3.443。各位点平均基因频率取样方差V(pij)为5.7546×10-3。16个微卫星位点平均观察杂合度HO为0.764,范围在0.200~1.000之间,平均期望杂合度He 0.685,其范围在0.410~0.811之间,各位点多态信息含量(PIC)变动范围为0.359~0.776,平均PIC为0.629,其中有13个位点处于高度多态(PIC〉0.5),16个微卫星位点的平均固定指数(F)为-0.115。在所检测的16个微卫星位点上,经x2平衡检验,闽西南黑兔群体偏离Hardy~Weinberg程度不大。 相似文献
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8个微卫星位点在甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系中的遗传多样性研究 总被引:3,自引:1,他引:2
利用8个微卫星位点对甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系进行遗传检测,计算了等位基因频率、有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量。结果表明,位点BM3501的有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量都最高(Ne=7.30,H=0.866,PIC=0.848);位点BM3413的有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量都最低(Ne=2.33,H=0.573,PIC=0.478);8个微卫星位点在甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系中多态性丰富,除位点BM3413表现为中度多态外,其余位点均表现为高度多态。因此,甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系遗传杂合度较高,遗传多样性丰富,选择余地较大;8个微卫星位点可用于甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系遗传多样性评估,并可用于对其羊毛性状和肉用性状的进一步研究。 相似文献
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试验旨在分析岷县黑裘皮羊群体内遗传多样性,筛选出理想的遗传标记,为岷县黑裘皮羊的选育保种提供理论依据。选取144只岷县黑裘皮羊,颈静脉采血并提取DNA,对24对微卫星引物进行PCR扩增,用毛细管电泳技术进行基因分型,计算其等位基因数、等位基因大小及频率、有效等位基因数、杂合度和多态信息含量。结果显示,24个位点共检测到210个等位基因,平均等位基因数为8.75;群体等位基因频率为0.0104~0.7396,等位基因片段大小为97~285 bp;有效等位基因数为1.7581~8.2433个;群体平均观测杂合度为0.4839;平均期望杂合度为0.6959;平均多态信息含量为0.6527。其中MAF70位点等位基因数、有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量最高;OarFCB128位点观测杂合度最高;OarAE129位点等位基因数最少,SRCRSP9位点期望杂合度、多态信息含量最低;OarFCB304位点观测杂合度最低。Hardy-Weinberg平衡分析结果表明,所选位点中有19个处于非平衡状态。结果表明,岷县黑裘皮羊的遗传背景复杂,群体内遗传多样性丰富,可为其遗传资源的评估和选育保种工作提供理论依据。 相似文献
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对用含蛋白质45%的配合饲料饲养的东北六须鲇的肌肉营养成分进行了分析。结果表明:东北六须鲶肌肉鲜样中粗蛋白质、粗脂肪和水分的含量(均为质量分数)分别为16.47%、2.36%、和79.94%;新鲜肌肉中17种氨基酸的总量为15.74%,其中8种人体必需氨基酸为7.68%,必需氨基酸的构成比例基本符合FAO/WHO的标准,氨基酸评分(AAS)和A/E值均显示,东北六须鲶蛋白质的第一限制性氨基酸为蛋氨酸和胱氨酸;脂肪酸中含有高比例(25.6%)的多不饱和脂肪酸(PUFA),高于其它名优养殖鱼类。 相似文献
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新疆塔里木马鹿遗传多样性的微卫星分析 总被引:3,自引:1,他引:3
利用5个微卫星标记对新疆塔里木马鹿遗传多样性进行了检测。统计了塔里木马鹿3个群体的等位基因组成、平均有效等位基因数(E)和平均基因纯合率(Rh),利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(h)、多态信息含量(PIC)。结果表明5个微卫星位点在库尔勒、阿拉尔和沙雅县塔里木马鹿3个群体的平均多态信息含量分别为0.5884、0.5754、0.5344,除微卫星位点BM5004外均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于塔里木马鹿遗传多样性分析;塔里木马鹿三个群体总平均PIC、h、Rh和E分别为:0.5661、0.5995、0.4474和2.7。分析认为塔里木马鹿遗传变异度较高,遗传多样性相对丰富,具有较大的遗传潜力。 相似文献
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YANG Xiang-di CAO Ji YANG Chun LI Yuan ZHOU Ling-li LUO Wang WANG Gu-yang LI Ke-zhi 《中国畜牧兽医》2016,43(1):182-190
A total of 10 fluorescent labeling microsatellite markers detected by capillary electrophoresis were selected to analyze the genetic diversity of tree shrew(T.belangeri chinensis).Microsatellite Toolkit and PopGene softwares were used to calculate the genetic correlation indexes to assess the genetic diversity of the population.64 alleles with 6.4 alleles per locus were identified among 10 microsatellite loci.The average effective number of alleles, observed heterozygosity, expected heterozygosity and polymorphic information content were 3.7892, 0.6156, 0.6963, and 0.6367, respectively.Seven of all loci were high polymorphic, and three were moderate polymorphic.Five loci extremely significantly deviated from Hardy-Weinberg equilibrium(P<0.01).These novel polymorphic microsatellite markers indicated high genetic diversity, which will be used to evaluate genetic diversity in tree shrew. 相似文献
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应用微卫星标记对江苏省无锡市祖代鸡场有限公司太湖鸡的保种群体进行了遗传变异的分析,计算了群体的杂和度(H)和多态信息含量(PIC)。研究结果表明:30个微卫星标记在太湖鸡保种群体的杂和度为0.504~0.858之间,平均杂和度为0.688,群体的遗传多样性丰富;其中24个微卫星标记在太湖鸡中多态信息含量为高度多态,可作为有效遗传标记用于太湖鸡保种群的遗传分析,而且各座位杂和度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性。本研究结果为太湖鸡开发利用研究提供了基础,也为太湖鸡的合理保护提供了科学根据。 相似文献
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选取10个微卫星位点,结合荧光标记(FAM) PCR扩增技术,运用毛细管电泳检测扩增产物,利用Microsatellite Toolkit、PopGene软件计算遗传相关指标,探讨广西树鼩群体的遗传多态性。结果发现,在10个微卫星基因座中,共检测到64个等位基因,平均等位基因数为6.4个,平均有效等位基因数为3.7892,平均观察杂合度和平均期望杂合度为0.6156和0.6963,平均多态信息含量为0.6367,其中7个是高度多态位点,3个属中度多态位点。此外,在10个微卫星基因座中,有5个位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。结果表明广西树鼩遗传多态性较丰富,所选微卫星位点基本可用于评估广西树鼩群体遗传多样性。 相似文献
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利用选自家禽基因组的10个微卫星标记,对四川常羽乌骨鸡5个群体(四川山地乌骨鸡白羽系、黑羽系;黄忠山地乌骨鸡;黄忠山地乌骨鸡绿壳蛋系;草科乌骨鸡)的遗传多样性进行了检测,计算了各群体的群体杂合度、群体间遗传距离,并根据遗传距离进行了聚类分析。结果表明所选择的微卫星标记在各群体中表现出较高的多态性;四川5个乌骨鸡群体遗传多样性比较丰富,群体平均杂合度为0.5383到0.6659;各群体间的遗传距离有一定的差异;聚类分析将5个群体聚为三类。 相似文献
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采用FAO-ISGA联合推荐的10对微卫星引物,结合荧光标记PCR技术,分析了中国9个地方绵品种的遗传多样性。结果表明,10个微卫星座位上共检测到153个等位基因,有效等位基因数在2.3064~13.7632之间,位点多态信息含量和观察杂合度为0.5395~0.8559和0.3972~0.8475,位点的遗传分化系数在0.042~0.149之间。Structure遗传结构关系、DA/UPGMA聚类图、MVSP聚类分析图三者的结论基本相吻合,与绵羊的起源进化、亲缘关系、地理分布相一致。 相似文献