我国科学家成功绘利出鲤鱼全基因组序列图谱

5月6日,“鲤鱼基因组计划”学术报告会暨新闻发布会在北京举行。会上宣布,由中国水产科学研究院水产生物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中国科学院北京基因组研究所共同实施的“鲤鱼基因组计划”成功完成了鲤鱼全基因组测序,并绘制了鲤鱼基因组框架图谱、     

深圳华大基因研究院等单位联合破译首个比目鱼基因组

<正>记者2014年2月从深圳华大基因研究院获悉,来自中国水产科学研究院黄海水产研究所、深圳华大基因研究院、哥本哈根大学、德国维尔茨堡大学、法国农业科学研究院和新加坡国立大学等单位的科研人员成功破译了迄今为止首个比目鱼——半滑舌鳎(俗称"龙脷")全基因组序列图谱。有趣的是,研究人员发现,通过温度诱导,半滑舌鳎     

石斑鱼进入基因组时代,生命密码有望解开

近日,中山大学和深圳华大基因研究院联合宣布已共同完成了石斑鱼全基因组测序和组装,绘制了石斑鱼全基因组序列图谱。这是继大黄鱼和半滑舌鳎之后我国完成的第三个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱,也是世界上首个鲈形目睹科石斑鱼类基因组序列图谱．对石斑鱼的基础理论研究和产业化发展具有极大的推动作用。     

半滑舌鳎繁殖及养殖技术(上)

半滑舌鳎为我国名贵海水鱼类,国外未见相关研究报道。我国有关半滑舌鳎的研究始于20世纪80年代末90年代初,黄海水产研究所进行了半滑舌鳎早期发育及人工育苗技术的初步研究,成功地培育出变态苗种数千尾,为今后的研究奠定了基础。半滑舌鳎肉质鲜嫩,味道鲜美,营养丰富,经济价值高     

石斑鱼:基因组序列绘制完成

近日,中山大学和华大基因在中山大学联合召开新闻发布会,项目负责人林浩然院士宣布"石斑鱼基因组序列图谱"绘制完成。这是我国完成的第三个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱,也是世界上首个鲈形目、石斑鱼类基因组序列图谱。     

世界第一个鲤科经济鱼类基因组计划——“鲤鱼基因组计划”正式启动

鲤鱼基因组计划是我国继水稻、家蚕、黄瓜、牡蛎等基因组计划之后启动的又一项重要经济物种全基因组计划。鲤是我国最具代表性的养殖鱼类之一,也是育成品种最多的水产养殖种类,其基因组测序研究将对鲤的品种培育、病害防治、饲料     

鱼类GRF基因部分片断的克隆及其序列测定

脊椎动物下丘脑分泌的生长激素释放因子(Growth hormone releasing—fac-tor,即GRF)为四十四肽。它刺激垂体前部的细胞增加释放大量的生长激素。GRF在体内半衰期较短，作用效果较为平和。根据已在其它动物获得成功的结果提示，用这种基因序列构建的转基因鱼，将有可能增加释放     

科技

国内首次养成淡水半滑舌鳎 近日,浙江绍兴鸿港农业开发有限公司与中国水产科学研究院黄海水产研究所合作,繁育半滑舌鳎鱼苗成功。据悉,在淡水地区成功养殖半滑舌鳎,这在国内尚属首次。     

基于线粒体全基因组结构的鲳属鱼类分子分类研究

为明确鲳属鱼类的线粒体全基因组序列结构、寻找有效的种间鉴别分子标记,并剖析其系统发育信息,从而为鲳属鱼类的分类学、进化遗传学和种质鉴定提供参考依据,测定了鲳属5种鱼类(中国鲳Pampus chinensis、灰鲳P.cinereus、银鲳P.argenteus、珍鲳P.minor、翎鲳P.punctatissimus)的线粒体全基因组序列,并结合NCBI数据库中已有的鲳属鱼类线粒体全基因组序列进行分析。结果显示:1)鲳属线粒体基因组全序列长度在16 551 bp到18 062 bp之间,其基因组结构与大多数硬骨鱼类一致;比较特别的是,银鲳和镰鲳具有两个tRNA^Met结构,珍鲳出现ND1基因重排以及两个重复的D-loop结构。2)银鲳与镰鲳的D-loop区出现重复CSB3结构,灰鲳与翎鲳D-loop区出现重复TAS结构。3)ND2基因条形码及其微型条形码均可将鲳属鱼类区分开,可作为有效的鲳属鉴别分子标记。4)东海区的银鲳与镰鲳应为同一物种,灰鲳可能为翎鲳的同物异名。     

奥利亚罗非鱼线粒体基因组全序列测定与系统进化分析

采用LA-PCR(long amplification polymerase chain reaction)扩增方法获得奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)线粒体基因组全序列.分析表明,序列全长16 632 bp,包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个长度为931 bp的主非编码区.A、T、G、C碱基的组成分别为27.89％、25.50％、15.62％、30.99％.基因排列与罗非鱼属的其他物种一致.13个蛋白质基因除COX1用TGT做起始密码子外,其他均以ATG为起始,终止密码子除COX2、Cyt b、ND4为不完整的T,其余基因均以典型的TAA做终止密码子.22个tRNA的二级结构都具有典型三叶草结构.系统发育分析显示,罗非鱼属与丽鱼科(Cichlidae)其他物种分开,聚为单系群,其中奥利亚罗非鱼与尼罗罗非鱼亲缘关系较近,莫桑比克非鱼和罗非鱼KM-2006亲缘关系较近.本研究旨在为进一步利用线粒体基因组分析罗非鱼群体遗传多样性、亲缘关系以及丽鱼科系统进化提供基础依据.     

国家863计划半滑舌鳎全人工亲鱼苗种培育达国际领先水平

20O5年3月26日,山东省科技厅组织以中国科学院院士刘瑞玉为组长的专家组,对海阳市黄海水产有限公司与中国水产科学研究院黄海水产研究所承担的国家高技术研究发展计划(863)“海水养殖种子工程北方基地”项目的研究成果“半滑舌鳎全人工亲鱼苗种培育”进行了鉴定,专家鉴定委员会经过认真讨论,一致认为：     

传染性造血器官坏死病毒Sn1203株全基因组序列及系统进化分析

本课题组于2012年从中国东部的虹鳟鱼养殖场分离得到了严重威胁我国鲑鳟鱼养殖的传染性造血器官坏死病毒(IHNV)IHNV-Sn1203病毒株。根据GenBank中收录的IHNV病毒株的序列设计引物,将IHNV-Sn1203基因组序列分成5个片段进行RT-PCR克隆,最终得到完整的IHNV-Sn1203基因组序列。利用Lasergene和MEGA 5.0软件分析了IHNV-Sn1203株的全基因组序列、基因组编码蛋白、基因组末端和未翻译序列、以及病毒基因同源性和系统发育。结果发现,IHNV-Sn1203基因组全长11131nts,共编码6个病毒蛋白,大小分别为核蛋白(N)1176nts、磷蛋白(P)693nts、基质蛋白(M)588nts、表面糖蛋白(G)1527nts、聚合酶蛋白(L)5961nts和非结构蛋白(NV)336nts。IHNV-Sn1203株各基因间均具有保守的基因终止序列(Gene end,GE)、基因间序列(Intergenic regions,IG)、基因起始序列(Gene star,GS)及Kozak序列,以确保病毒基因的转录和翻译效率。系统进化分析发现,IHNV分为E、U、M、L和J共5个基因型,其中IHNV-Sn1203株与中国其他IHNV株具有显著的亲缘关系,属于J基因型中的J Nagano亚型。由G基因的进化分析发现,J基因型的病毒与U基因型亲缘关系最近,推测IHNV病毒最初可能通过进口鱼卵的方式由U基因型引入,随时间的推移逐渐进化为J基因型。     

大鲵虹彩病毒的全基因组序列及其结构变化

<正>大鲵(或称娃娃鱼)是世界上现存最大的濒危珍稀两栖动物,为我国所特有、被列为国家二级保护野生动物。虹彩病毒在全球范围普遍流行,是侵染众多鱼类、两栖类及爬行类等水生动物的重要病毒病原。虹彩病毒是包括蛙和大鲵在内的两栖类自然种群显著下降或消亡的原因之一,而鉴定虹彩病毒病原并阐明其基因组结构特征是研发相应病害防控技术的前提。最近,中国科学院水生生物研究所张奇亚研究员、桂建芳研究员和南昌大学洪一江教授联手就大鲵虹彩病毒的全基因组序列及其结构变化开展研究,在新分离鉴定导致大鲵致死性出血病病原——大     

我国首次披露海带等全基因组测序成果

2013年11月，我国科学家在青岛首次披露了海带、栉孔扇贝和南美白对虾全基因组测序的部分成果。在此间举行的国际基因组学大会上，中国海洋大学博士池姗介绍了海带全基因组测序的部分成果：经过对海带基因组研究，预测海带基因组包含3．5725万个基因，海带的基因比其他真核藻类基因大很多。     

鱼源致病菌皮特不动杆菌Ap-W20的全基因组序列及其毒力特征分析

皮特不动杆菌是一种新兴的鱼源致病菌,为了对该菌的致病机理进行研究并为该菌引起的鱼类疾病防治提供技术储备,实验选取皮特不动杆菌菌株Ap-W20进行了全基因组测序,并对其毒力特征进行了分析。结果发现,Ap-W20全基因组序列总长为4 399 705 bp,GC含量为38.78%,共预测到4 230个编码序列(CDS),存在4个质粒,GenBank数据库登录号为CP027658～CP027662。ANI分析结果证实,Ap-W20属于皮特不动杆菌,且ApW20与已知人源皮特不动杆菌AP₈82(96.69%)和环境源皮特不动杆菌PHEA-2(96.55%)相似度较高。Ap-W20与AP₈82、PHEA-2的比较基因组学分析发现,Ap-W20中的基因岛、前噬菌体和质粒数量最多,这很可能与它们各自的分离环境和致病力有关。通过与毒力因子数据库(VFDB)比对,在Ap-W20全基因组中预测到286个毒力基因,主要与黏附和抗吞噬等有关。Ap-W20中还存在Ⅰ、Ⅱ和Ⅵ型分泌系统、多套双组分调控系统以及细菌素合成基因簇等,表明鱼源皮特不动杆菌可能存在复杂的致病机制。...     

云南：建成本省首个土著鱼基地

黄海水产研究所王印庚研究员等人完成的“防治海水鱼类盾纤毛虫病的中草药复合配方”获国家发明专利授权（专利号：ZL200510044755．2）     

金乌贼全人工育苗在我国首获成功

山东省日照市水产研究所自2007年开展金乌贼人工育苗和增养殖技术研究,经4年攻关,于2010年3月23日在研究所新基地利用人工培育的金乌贼亲体经越冬后成功孵化出幼乌,在我国首次育成金乌贼全人工苗种。     

日本多家机构联合启动鳗鱼全人工养殖计划

<正>日本水产综合研究中心、日本近畿大学以及日本静冈县水产技术研究所于4月共同启动大量养殖鳗鱼的研究项目。该项目的截止日期为2016年,主要进行鳗鱼大量取卵技术的开发、人工养殖饲料和饲养容器的开发等。该研究的主要目的是大量养殖鳗鱼苗。此前,在日本一直都依赖于从海里捕获鳗鱼苗,然后经由人工养殖,养大后再食用。由于近年很难捕获鳗鱼苗,从而导致了鳗鱼价格的高涨。2010年水产综合研究中心将鳗鱼苗养到成年鳗鱼,再从其身上取卵进行繁殖,获得了"全人工养