头孢喹肟(CEF)影响牦牛瘤胃微生态的宏基因组学分析

为了探讨头孢喹肟(CEF)对牦牛瘤胃微生态的影响,试验将牦牛分为处理组和对照组,处理组静脉注射CEF 1 mg/kg(按体重),对照组未做抗生素处理。采集各组瘤胃液,通过生物信息学分析软件考查CEF对瘤胃菌群多样性及碳水化合物酶类(CAZy)功能的影响。结果表明:CEF可降低拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度,在属水平上CEF对普雷沃氏菌属(Prevotella)和拟杆菌属(Bacteroides)具有抑制作用;CEF对CAZy中糖苷水解酶(GH)、糖基转移酶(GT)、碳水化合物结合模块(CBM)等9类功能酶均产生影响,干扰碳水化合物代谢;牦牛瘤胃微生物中降解植物纤维素主要的CAZy是GH和GT家族。说明CEF可改变瘤胃细菌多样性,影响CAZy功能,使瘤胃微生态失衡。     

日粮能量水平对牦牛生产性能、肉品质和瘤胃菌群的影响

为了探讨冷季能量补饲对牦牛生产性能、肉品质和瘤胃菌群的影响。本研究选取30头((269.75±35.46) kg)2岁大通公牦牛,随机分为3组,每组10头,分别饲喂低、中、高3个综合净能水平(5.51 MJ·kg^-1,6.22 MJ·kg^-1,6.94 MJ·kg^-1)日粮,经15 d预饲期和90 d正试期后屠宰,测定牦牛生长性能、屠宰性能、肉品质、瘤胃发酵参数瘤胃微生物区系。结果表明：高能量组牦牛试验末重、干物质采食量、宰前活重、胴体重、屠宰率和眼肌面积显著高于中、低能量组(P<0.05),瘤胃异丁酸、丁酸、异戊酸和戊酸含量显著高于中、低能量组(P<0.05);高能量组牦牛肉色L^*值显著低于中、低能量组(P<0.05);高能量组牦牛瘤胃细菌Chao1和ACE指数显著低于中、低能量组,普雷沃菌属(Prevotella)相对丰度显著高于中、低能量组,理研菌科RC9菌属相对丰度显著低于中、低能量组(P<0.05)。综上,冷季饲喂高能量(6.94 MJ·kg^-1     

羊骨胶原肽对镉的螯合作用及对镉致鸡肝损伤的干预作用

环境镉(cadmium, Cd)极易在动植物体内富集，不仅危害动物健康，而且影响食品安全，本研究旨在探究羊骨胶原肽(sheep bone collagen peptide, SBCP)对镉的螯合作用及对镉致鸡肝损伤的干预作用。海兰褐雏鸡随机分组(n=10):对照组常规饲养，模型组(Cd组)饲喂氯化镉添加量为140 mg·kg^-1的含镉饲料，SBCP组每天灌胃3 g·kg^-1的肽，Cd+SBCP组饲喂与Cd组相同的含镉饲料并灌胃与SBCP组相同的等剂量肽；42 d后测定各组的镉残留水平和肝抗氧化水平，评估肝损伤程度，分析线粒体凋亡途径相关基因的mRNA表达水平。电感耦合等离子体质谱检测结果表明，对照组和SBCP组肝和胸肌中镉残留的检测值为0,Cd组的镉残留分别为412.57μg·kg^-1(肝)和129.47μg·kg^-1(胸肌),Cd+SBCP组分别为216.06μg·kg^-1(肝)和49.68μg·kg^-1(胸肌);与对照组相比：Cd组肝组织T-SOD和G...     

宏基因组学揭示二氟沙星对牦牛瘤胃微生态及CAZy谱影响

反刍动物瘤胃微生物结构和功能关系到生态系统正常的物质循环、能量流动。为了探讨抗生素对瘤胃微生态的影响,揭示抗生素对反刍动物瘤胃微生物影响的规律,以牦牛为研究对象,进行二氟沙星(DIF)处理,采集瘤胃液,提取DNA,采用宏基因组学方法分析DIF对瘤胃微生物组成及碳水化合物酶类(CAZy)的影响。结果显示,拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)等相对丰度下降,而厚壁菌门(Firmicutes)、广古菌门(Euryarchaeota)等增加。普雷沃菌属(Prevotella)、拟杆菌属(Bacteroides)等相对丰度下降,而金黄杆菌属(Chryseobacterium)、链球菌属(Streptococcus)等增加;CAZy酶类中,CBM17、CBM25等丰度上调(P0.01或P0.05);GH53、CE8、CE13、CBM21、CBM26及对接蛋白(dockerin)等下调(P0.01或P0.05)。结论:DIF影响瘤胃微生物结构,并不同程度改变各优势门、属的相对丰度,抑制部分有益菌的作用;改变CAZy酶中部分家族基因丰度,影响瘤胃微生物对淀粉及果胶的降解作用,降低瘤胃微生物降解植物纤维素的效率。     

盐胁迫下菊芋生长和生理指标对生物炭的响应

为探究菊芋(Helianthus tuberosus)对不同浓度盐胁迫初期的响应机制，揭示生物炭对不同浓度盐胁迫初期菊芋渗透调节作用和抗氧化系统的短期影响，本研究采用盆栽试验，以菊芋块根为材料，设置8种处理：无盐胁迫空白对照(CK)、1.67 g·kg^-1盐胁迫(Y₁)、3.35 g·kg^-1盐胁迫(Y₂)、5.02 g·kg^-1盐胁迫(Y₃)、无盐胁迫+5%生物炭(S₀)、1.67g·kg^-1盐胁迫+5%生物炭(S₁)、3.35 g·kg^-1盐胁迫+5%生物炭(S₂)、5.02 g·kg^-1盐胁迫+5%生物炭(S₃)，分析不同浓度盐胁迫初期生物炭添加量对菊芋株高、地径、渗透调节物质含量、丙二醛(MDA)含量及抗氧化酶活性的影响。结果表明：1)菊芋能在0～1.67 g·kg^-1土壤含...     

褐藻多酚提取物对奶牛瘤胃发酵性能及主要瘤胃细菌含量的影响

本文旨在探究添加褐藻多酚提取物对奶牛瘤胃体外发酵和主要瘤胃细菌含量的影响。以水稻(Oryza sativa L.)秸秆∶豆(Glycine max)粕=6∶4为发酵底物，试验共分9组，前4组在底物的基础上分别添加0,125,250,500μg·mL^-1褐藻多酚(Phlorotannin, PT);后4组在前4组的基础上添加30 mg聚乙二醇(PEG)。结果表明：褐藻多酚提取物的添加能够显著降低瘤胃pH值和氨态氮浓度(P<0.05),促进瘤胃发酵类型的转变，显著提高了普雷沃氏菌和牛链球菌含量，降低瘤胃甲烷短杆菌的含量(P<0.05);对瘤胃发酵各项参数进行综合评定，无论是否添加PEG,125μg·mL^-1组的多项组合效应值(MFAEI)均最高。综上所述，日粮中添加褐藻多酚提取物为瘤胃发酵提供了一个更具酸性的环境，减少了瘤胃内蛋白质的分解，具有降低甲烷排放的潜能，且在本试验中褐藻多酚的最佳添加量为125μg·mL^-1。     

乳酸菌和烷基多糖苷对玉米秸秆黄贮品质及其体外发酵特性影响研究

研究玉米秸秆中添加乳酸菌和烷基多糖苷时对其黄贮品质与体外发酵特性的影响。采用3×3双因素试验设计,即乳酸菌设3个水平(0、1×10¹⁰、2×10¹⁰ CFU·kg^-1),烷基多糖苷设3个水平(0、0.10、0.20 g·kg^-1),每个处理3个重复。玉米秸秆黄贮完成后,采用体外发酵技术评定其瘤胃发酵特性。结果表明:随乳酸菌添加水平的上升,黄贮玉米秸乳酸含量、比表面积、外观总评分、酸性洗涤纤维和干物质含量显著(P<0.05)提高,氨氮/总氮显著(P<0.05)降低,体外发酵潜在最大产气量显著(P<0.05)增加、总挥发性脂肪酸浓度极显著(P<0.01)增加、产气速率显著(P<0.05)降低;随烷基多糖苷添加水平的升高,黄贮玉米秸外观总评分、酸性洗涤纤维和干物质含量、以及体外发酵后Zeta电位、电子迁移率及干物质消失率显著(P<0.05)升高;黄贮玉米秸粗蛋白质、pH值、乙酸和异丁酸含量以及体外发酵后丁酸、异丁酸、戊酸和异戊酸的摩尔百分比受乳酸菌与烷基多糖苷交互作用(P<0.05)的影响。结果表明:乳酸菌添加量为2×10¹⁰ CFU·kg^-1,烷基多糖苷添加量为0.2 g·kg^-1时,既能够保证玉米秸秆较好的黄贮品质,同时又能提高其降解特性。     

糖蜜和乳酸菌对光叶紫花苕青贮品质的影响

以光叶紫花苕(Vicia villosa var. glabrescens)为材料,探讨添加剂处理对其青贮品质的影响。试验设置对照(CK)、添加20 g·kg^-1和50 g·kg^-1的糖蜜(M1和M2)、添加5×10⁵ CFU·g^-1和1×10⁶ CFU·g^-1的乳酸菌(L1和L2)、添加20 g·kg^-1+5×10⁵ CFU·g^-1和20 g·kg^-1+1×10⁶ CFU·g^-1的糖蜜与乳酸菌混合剂(M1L1和M1L2)、添加50 g·kg^-1+5×10⁵ CFU·g^-1和50 g·kg^-1+1×10⁶ CFU·g^-1的糖蜜与乳酸菌混合剂(M2L1和M2L2)共9个处理组,贮存60 d后测定青贮的发酵品质与养分含量。结果表明:单独添加糖蜜组以及乳酸菌和糖蜜混合添加组的粗蛋白、可溶性糖、乳酸、乙酸含量均明显高于对照组(P<0.05),且pH和氨态氮含量显著低于对照组(P<0.05),其中M2处理组显著降低了中性洗涤纤维含量(P<0.05),M2L1和M2L2处理组显著降低了中性洗涤纤维和酸性洗涤纤维含量(P<0.05);单独添加乳酸菌除了对青贮饲料的pH有显著影响外(P<0.05),对其他青贮指标没有显著影响。综合各项指标表明,乳酸菌和糖蜜混合添加剂能显著提升含糖量低的青贮饲料品质。     

玉米赤霉烯酮对山羊生长性能、胃肠道发酵模式和菌群结构的影响研究

旨在探究添加不同剂量玉米赤霉烯酮(ZEA)对湘东黑山羊生长性能、胃肠道发酵模式及菌群结构的影响。试验选取24头体重相近((12.82±2.03)kg)的雌性湘东黑山羊，随机分为3组，分别饲喂含0、100和500μg·kg^-1DM的ZEA的日粮。试验预饲期1周，正式期4周，试验期结束时所有试验动物进行屠宰，采集瘤胃和结肠内容物，应用气相色谱仪进行微生物发酵产物检测。同时提取微生物基因组DNA,利用Illumina-NovaSeq测序技术分析瘤胃和结肠微生物菌群结构。结果表明，与对照组相比，ZEA添加量为100和500μg·kg^-1DM时，对山羊的终体重、总增重、日增重以及干物质采食量影响不显著(P>0.05)。500μg·kg^-1DM ZEA的添加显著降低结肠食糜中戊酸的摩尔百分比(P<0.05)。与对照组相比，低剂量ZEA的添加显著降低瘤胃细菌的Shannon指数和Simpson指数(P<0.05),高剂量ZEA的添加则显著降低瘤胃细菌的Simpson指数和Shannon均匀度(P<0.05)。在...     

短期牦牛放牧对青藏高原高寒草地土壤真菌群落的影响

牦牛放牧是青藏高原重要的人为干扰形式,放牧管理方式以及放牧强度对维持草地健康具有重要作用。为了明晰牦牛短期放牧对高寒草甸土壤真菌群落的影响过程,本研究在川西北典型高寒草甸进行牦牛放牧强度试验,设置了对照(禁牧)、轻度放牧(1头牦牛·hm^-2)、中度放牧(2头牦牛·hm^-2)和重度放牧(3头牦牛·hm^-2)4种放牧强度。结果表明短期(2年)放牧处理通过增加土壤中子囊菌门的相对丰度、降低担子菌门的相对丰度从而改变土壤真菌群落结构;土壤真菌群落多样性与丰富度在各放牧强度间差异不显著,但放牧均有增加土壤真菌群落多样性与丰富度的趋势。通过对真菌群落结构变化进行方差分解,发现放牧强度通过改变土壤养分进而影响真菌群落结构;通过对真菌的共现网络进行模块化分析发现,短期的牦牛放牧对真菌相互作用主要模块的相对丰度影响不显著,而放牧强度通过影响土壤中的养分含量来影响模块相对丰度。     

藏鸡CCL4基因克隆及组织表达谱研究

为探究C-C基序趋化因子配体4(C-C motif chemokine ligand 4,CCL4)基因特点及其在藏鸡各组织中表达水平差异情况。以藏鸡作为研究对象,使用RT-PCR技术克隆藏鸡CCL4基因并进行生物信息学分析,然后利用qPCR技术检测CCL4在藏鸡不同日龄不同组织中的表达情况并构建组织表达谱。结果表明:藏鸡CCL4基因长度为633 bp,其中开放阅读框长270 bp,编码89个氨基酸;藏鸡CCL4基因的核苷酸和氨基酸序列与原鸡同源性为100%;CCL4基因在藏鸡的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和腿肌中均有表达,在脾脏中表达量相对较高。该研究为进一步了解CCL4基因的功能和藏鸡的免疫特性提供理论依据。     

牦牛不同年龄肌肉组织microRNA表达谱及生物信息学分析

旨在挖掘牦牛不同年龄肌肉组织中miRNA表达谱,分析其生物学特征,以探索其在牦牛肌肉发育过程中的调节模式。本研究构建0.5、2.5、4.5和7.5岁肌肉组织的4个小RNA文库,利用Solexa技术进行测序,用生物信息学方法和RT-qPCR技术对测序结果进行分析和验证。结果,获得各miRNAs分别在4个年龄段肌肉组织中的表达量,在7.5岁肌肉组织中发现58个共同与0.5、2.5、4.5岁差异表达的miRNAs,其中53个miRNAs在7.5岁肌肉组织中显著下调,5个显著上调。运用R语言进行GO富集和KEGG信号通路分析,58个miRNAs可能通过PI3K-Akt、MAPK、Ras和肌动蛋白细胞骨架调节通路(regulation of actin cytoskeleton)参与调节牦牛肌肉细胞的增殖与分化,且PI3K-Akt、MAPK、Ras 3个信号通路共同靶向53个靶基因,说明3个信号通路相互关联。随机选择8个miRNAs进行RT-qPCR验证,结果表明其中7个miRNAs的表达趋势与测序结果一致。结果表明,牦牛肌肉发育可能受到多种miRNA的调控并涉及多个信号通路,有助于构建肌肉组织中miRNA的调控网络,为进一步研究miRNA调控哺乳动物肌肉发育奠定了理论基础。     

阿坝藏鸡三个品系线粒体DNA编码分析

试验旨在通过对阿坝藏鸡三个品系进行深入研究,利用COX1和D-LOOP基因某一特定区段作为DNA条形码对阿坝藏鸡三个品系进行分子鉴定,分析其遗传多态性并探讨DNA条形码在藏鸡分支鉴定工作的可行性和有效性。以阿藏1系、阿藏2系、阿藏3系三个品系作为研究对象,利用DNA测序技术测定了COX1和D-LOOP基因的部分序列。两基因在三个品系的单倍型数量、平均核苷酸差异数(K)均不相同,阿藏3系的平均核苷酸差异数高于阿藏1系和阿藏2系;三个品系核苷酸多态度(Pi)相差不大,其中阿藏2系COX1基因核苷酸多态度略高于其他两品系。三个品系内COX1和D-LOOP两基因测算得出的遗传距离分别为2.21~2.40、4.02~4.34,且各品系间相差不大。通过构建两基因的UPGMA树显示,三品系间存在一定程度的基因交流。利用COX1和D-LOOP基因某一特定区段作为DNA条形码的基础,各有其优势特点,两基因工具搭配使用可提高品系鉴定的准确性。     

饲草重大生物灾害防控形势与对策

随着我国饲草种植加工规模化集约化水平提高,饲草重大生物灾害问题日益凸显,对饲草产业和草食畜牧业发展构成了威胁。本文分析了我国饲草生产形势和饲草病害、虫害、鼠害和杂草等生物灾害危害情况,提出了饲草重大生物灾害的防控对策和保障措施。     

家兔矮小同源盒基因(Shox2)的克隆和表达分析

为了研究新西兰白兔矮小同源盒基因(Shox2)序列,预测其结构和功能,以及研究Shox2基因的时空表达特征,本研究克隆了新西兰白兔Shox2基因全长CDS区,分析其编码蛋白的同源性、亲疏水性、二级和三级结构特点、系统进化树等生物信息学特征,并用Western blot法验证融合蛋白TrxA-Shox2。分别在胚胎中期(E20.5d)、胚胎后期(E28.5d)、幼龄期(出生后10d)、成年期(A)4个时间点采集3只动物的肾、大血管、真皮、心、大脑、肝、肺、脾、肌肉、胆囊共10种组织,采用实时荧光定量PCR技术研究Shox2基因的时空表达图谱。结果,成功克隆了新西兰白兔Shox2基因(登录号:KP726285)。Shox2基因CDS区全长666bp,翻译221个氨基酸。生物信息学分析显示,Shox2为碱性、不稳定蛋白,Shox2蛋白氨基酸二级结构中α-螺旋区域占61.99%,无规则卷曲区域占33.48%,延伸链占4.52%。Western blot验证了融合蛋白TrxA-Shox2的表达。家兔Shox2蛋白氨基酸序列与眼镜猴、猩猩、褐家鼠、人的氨基酸序列同源性较高,说明Shox2蛋白在进化中较保守。Shox2基因mRNA在很多器官都有表达,在E20.5d的家兔胚胎中,Shox2mRNA在肾、肌肉和胆囊的表达量高,在E28.5d时表达量较高的是脾、心,幼龄期时表达量较高的是真皮、肝,成年期时表达量较高的是真皮、脾。本研究成功克隆了新西兰白兔Shox2基因,预测了其结构和功能。Shox2基因mRNA在很多器官都有表达,不同的组织和不同时间特征的表达量变化可能与Shox2功能高度相关,并受到严格的调控。     

一起猪非典型瘟病毒感染的诊断

2017年8月四川省某规模化猪场出现临产母猪产弱子、发抖、死胎,且死胎率达30%,哺乳仔猪成活率明显降低,其中以全身性或局部性阵发痉挛为典型症状。用RT-PCR扩增及序列分析确诊该猪场感染了一种新型的猪非典型瘟病毒(APPV)。这是四川省首次检测到并报道APPV,可为该病的研究和防控提供了一定的参考。     

小鼠卵巢组织定量PCR分析中内参基因的筛选

旨在选择小鼠卵巢组织中合适的内参基因,为研究卵巢发育过程中基因表达提供可靠数据。以不同年龄(0日龄、3周龄、5周龄、8周龄)小鼠卵巢组织为试验材料,Trizol法提取样本总RNA,并合成cDNA,根据已报道的小鼠(Mus musculus)各组织中相对稳定表达的8个常见内参基因(Gapdh、β-actin、β-tubulin、18S rRNA、16S rRNA、H2afz、Ubc、Rpl13a)的GenBank登录序列设计引物,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法构建卵巢cDNA等梯度(1∶10)稀释后的标准曲线;利用geNorm分析候选内参基因的表达稳定性(M);NormFinder筛选表达最稳定的内参基因;BestKeeper计算qRT-PCR结果的标准差(SD)和变异系数(CV),从而预测候选内参基因的稳定性。结果表明,8个内参基因的引物特异性较强,具有良好的线性关系;候选内参基因的表达稳定度排序:Gapdh=β-actin>18S rRNA>Ubc>16S rRNA> H2afz>Rpl13a>β-tubulin;其中Gapdh表达稳定性最好,且标准差及方差系数最小(SD:0.32,CV:1.95),H2afz标准差及方差系数最大(SD>1.0,CV:5.76)。综上表明,本研究成功获得出生后小鼠卵巢发育过程中稳定表达的内参基因(Gapdh和β-actin),可作为其基因表达研究中的最佳候选内参。     

不同品种肉牛产肉性能、牛肉营养品质及风味物质的比较

本文旨在比较不同品种肉牛的产肉性能、牛肉营养品质及风味物质的差异。试验选取6月龄健康西杂牛、犏牛和宣汉黄牛去势公牛各6头,平均体重分别为(616.67±9.50)kg、(457.01±15.73)kg、(462.67±12.57)kg。所有试验牛均在相同饲养条件下人工育肥至30月龄。结果表明:1)西杂牛的胴体长、胴体深、胴体胸深、后腿长、后退宽和后腿围均显著高于犏牛和宣汉黄牛(P<0.05),西杂牛的腰部肉厚、肋部肉厚和大腿肉厚显著高于犏牛(P<0.05)。2)西杂牛的金钱展、前腱子、上脑、外脊、里脊、大黄瓜条、小黄瓜条、霖肉和臀肉的产量都显著高于犏牛和宣汉黄牛(P<0.05)。犏牛的辣椒条和眼肉产量占胴体重比显著高于西杂牛(P<0.05),宣汉黄牛的上脑、眼肉和外脊产量占胴体重比显著高于西杂牛(P<0.05)。3)西杂牛背最长肌中钙、磷、钠、钾和镁含量均显著高于犏牛和宣汉黄牛(P<0.05)。4)犏牛背最长肌中的总氨基酸、必需氨基酸含量以及必需氨基酸/总氨基酸、必需氨基酸/非必需氨基酸均显著高于西杂牛和宣汉黄牛(P<0.05),犏牛背最长肌中的鲜味氨基酸和甜味氨基酸含量显著高于西杂牛(P<0.05),犏牛的背最长肌氨基酸评分也要优于西杂牛和宣汉黄牛。5)犏牛背最长肌中的谷氨酸钠含量显著高于西杂牛(P<0.05),犏牛背最长肌中硫胺素和肌苷含量均显著高于宣汉黄牛和西杂牛(P<0.05)。综上所述,西杂牛的产肉性能和肉中矿物质含量要高于犏牛和宣汉黄牛,犏牛肉的氨基酸组成和评分以及风物物质含量要优于西杂牛和宣汉黄牛。     

“大黑山”饲用薏苡不同刈割高度营养品质分析

试验以1.5、2、2.5m和3m四种不同刈割高度,对“大黑山”饲用薏苡鲜草茎和叶营养品质进行分析,为“大黑山”饲用薏苡适时刈割及营养品质提供参考。结果表明:“大黑山”饲用薏苡在不同生长期茎中粗脂肪、粗蛋白质、粗灰分、中性洗涤纤维、酸性洗涤纤维、水溶性总糖、全磷、全钙的平均含量分别为1.13%、5.11%、5.19%、61.25%、41.46%、13.77%、0.17%、0.38%;叶中的平均含量分别为3.25%、15.81%、9.64%、63.46%、33.55%、4.36%、0.30%和0.95%。试验表明“大黑山”饲用薏苡适宜贵州省的土壤气候条件,营养品质较高,动态变化规律明显,可在不同生长时期刈割以满足牛、羊及其他动物营养需求。     

采用全自动在线固相萃取-高效液相色谱法检测畜禽产品中氟喹诺酮类药物残留量

为建立畜产品中6种氟喹诺酮全自动在线固相萃取-高效液相色谱的检测方法,实验采用全自动在线固相萃取-高效液相色谱替代了前处理使用固相萃取小柱净化过程,净化效果较好。实现了恩诺沙星、环丙沙星、洛美沙星、培氟沙星、诺氟沙星和丹诺沙星6种氟喹诺酮类药物同时检测。本方法采用1%乙酸乙腈溶液提取,稀释后使用全自动在线固相萃取-高效液相色谱仪检测。6种氟喹诺酮平均回收率为81.9%~106.8%;相对标准偏差小于3.52%;定量限均为2.5μg/kg。该方法操作简单、经济、灵敏度高,结果准确可靠。