烤烟感病苗与健康苗根围基质微生物群落结构及其多样性

[目的]了解烤烟感病苗与健康烟苗根围微生物的群落结构与多样性特征,为指导烟草苗期病害的防控提供参考.[方法]采用高通量测序技术对感病与健康烟苗根围基质进行微生物群落结构与多样性分析.[结果]感病与健康烟苗根围基质优势细菌和真菌微生物群落结构存在共性与差异.感病与健康烟苗根围基质优势细菌门均为变形菌门、拟杆菌门和放线菌门...     

经营模式对杉木林土壤微生物组成和多样性的影响

以福建三明福建农林大学莘口教学林场杉木林为研究对象,采用高通量测序方法探究不同经营模式(近自然经营、常规经营、封育经营)对杉木林土壤微生物组成和多样性的影响,分析土壤微生物的组成和多样性与其理化性质的关系.结果表明,不同经营模式下土壤共有的优势细菌类群主要为酸杆菌门、放线菌门和变形菌门,其中,变形菌门的相对丰度以近自然经营模式最高,为22.54%;共有的优势真菌类群主要为子囊菌门和担子菌门,其中,子囊菌门的相对丰度以近自然经营模式最高,为68.60%.与常规经营和封育经营模式相比,近自然经营显著提高了土壤细菌的Shannon多样性指数和真菌的Ace指数.表明近自然经营能显著提高杉木林土壤微生物群落的多样性和丰富度,改善土壤的肥力状况.     

盐分和水分对滨海盐土微生物组成及多样性的影响

文章应用变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)和磷脂脂肪酸(phospholipid fatty acid,PLFA)分析方法,研究不同盐分(1.90,9.41,19.76和26.92 g Na Cl·kg-1土)和土壤含水率(20%,30%和40%)对滨海盐土土壤微生物的影响。结果表明:(1)土壤含水率变化对土壤真菌及细菌多样性影响不显著,土壤盐分增加会减少土壤细菌和真菌的多样性,在含19.76和26.92 g Na Cl·kg-1土的土壤中,细菌与真菌的多样性指数和丰富度指数均显著比1.90和9.41 g Na Cl·kg-1土处理的土壤低,其中40%含水率、土壤盐分26.92 g Na Cl·kg-1土处理的土壤细菌和真菌丰富度指数均为最低。(2)土壤含水率变化对细菌生物量影响不显著;土壤含水率升高会降低土壤真菌生物量,相同盐分条件下,30%和40%含水率的真菌生物量均显著比20%含水率的低。     

基于多样性测序对健康与易感病烟田根际 土壤微生物群落分析

为明确根际土壤微生物群落与根际土壤环境因子的关系,通过多样性测序研究健康烟田与易感病(黑胫病和根结线虫病混合发性)烟田根际土壤微生物群落特征。结果表明,易感病烟田根际土壤微生物群落的Alpha多样性指数显著低于健康烟田;烟田土壤细菌群落在属水平上共检测出687类,其中健康烟田共620类,易感病烟田共560类,而土壤真菌群落在属水平上共检测出123类,其中健康烟田共107类,易感病烟田共103类;病原菌枝孢霉(Cladosporium)、镰刀菌属(Fusarium)、Boeremia在易感病烟田土壤真菌群落的相对丰度高,拮抗菌链霉菌属(Streptomyces)、芽孢杆菌(Bacillus)、类芽孢杆菌(Paenibacillus)在健康烟田微生物群落的相对丰度高;根际土壤的有机质、全氮、碱解氮、全磷、有效磷、全钾、速效钾含量在健康烟田中高。因此,健康烟田根际土壤的微生物多样性、病原菌和生防菌丰度、土壤p H值和养分含量都高于易感病烟田;土壤p H值、有机质、碱解氮、有效磷、速效钾与烟田根际土壤微生物群落的相关性较大。     

基于宏基因组分析菌渣微生物群落组成和功能多样性

为探究双孢菇菌渣发酵过程中微生物菌群组成变化和功能多样性,对双孢菇菌渣加猪粪混合堆肥的0、8 、16和20  d样品进行宏基因组测序,分析菌渣堆肥过程中微生物群落组成的变化并挖掘其功能基因。结果表明：（1）双孢菇菌渣有机肥发酵初期0  d时与发酵8 、16  和20  d时的微生物群落组成变化较大,同时在KEGG数据库中进行功能多样性分析和聚类分析发现0  d、8  d样本距离相对较近,16  d和20  d样本距离相对较近。（2）从不同时间段的菌渣有机肥中一共鉴定出28  257个种,其中发酵0 、8 、16  和20  d样本物种分别占物种总数的61.04%、85.35%、86.08%和85.40%。（3）自然发酵0  d时优势菌门为厚壁菌门,随着发酵时间的增加优势菌门逐渐变为变形菌门、拟杆菌门和放线菌门等;芽孢杆菌科及类芽孢杆菌科在发酵过程中一直为关键菌科;优势菌种为热噬淀粉芽胞杆菌和嗜热芽孢杆菌。（4）菌渣发酵过程中功能基因主要位于碳水化合物代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢和辅因子和维生素的代谢途径;碳水化合物酶占比较多的为糖基转移酶和糖苷水解酶,最低为多糖裂解酶,分别占比为38.8%、38.1%和1.2%;丰度最高的3个抗性基因分别为多耐药性抗性基因、大环内酯抗性基因和四环素抗性基因。     

发酵烟叶表面微生物的多样性及其应用现状

阐述了烟叶微生物发酵机理,介绍了发酵烟叶表面微生物种群的多样性,综述了微生物及微生物制剂在烟叶发酵中的应用研究。     

不同农田中水解酶活性和微生物组成的比较研究

对西峰市区的油菜地、小麦地、果园地及空闲地中的转化酶、脲酶、磷酸酶、蛋白酶及纤维素酶的活性及微生物的组成进行了比较研究,结果表明:不同农田中转化酶活性无明显差异,油菜田中纤维素酶和磷酸酶活性较高,空闲地以脲酶和蛋白酶活性较强,小麦地除脲酶活性较高外其它几种酶水解活性均较低。而细菌总数油菜地和小麦地较高,果园地和空闲地较少。果园地纤维分解菌居多,小麦地以解磷菌较高,不同农田中反硝化细菌无明显差异。     

巨杉的叶表皮结构及其与红杉和水杉的比较

杉科植物巨杉是美国特有植物.叶片鳞状钻形,双面气孔型.叶面非气孔区的表皮细胞长方形,细胞长轴与叶片长轴的方向一致.叶片远轴面和近轴面各有2条气孔带,每条气孔带由2～5行气孔组成.叶片中部的气孔带最宽,气孔数量最多.叶片顶部近轴面的气孔数量比远轴面的气孔数量明显多,叶片中部远轴面和近轴面的气孔分布和数量近似,叶片基部远轴面的气孔明显比近轴面的气孔多.气孔椭圆形,多数气孔的长轴与叶片长轴的方向一致.保卫细胞肾形,细胞壁加厚.副卫细胞的形态特征和垂周壁的角度与周围表皮细胞的不一致.巨杉与其近邻北美红杉和中国特有植物水杉相比,巨杉和北美红杉的表皮细胞壁直,水杉的多数表皮细胞的壁明显弯曲;巨杉叶表皮细胞的大小与水杉的近似,而北美红杉表皮细胞的长度明显比巨杉和水杉表皮细胞的长度大;巨杉叶片的远轴面和近轴面都有气孔分布,水杉的气孔主要分布在叶片的远轴面;北美红杉既有类似巨杉的气孔分布方式,又有类似水杉的气孔分布方式;巨杉气孔的形态和大小与北美红杉的更近似.      

污染土壤微生物多样性研究方法的比较

土壤微生物是气候和土壤环境条件变化的敏感指标,土壤微生物的多样性和群落结构变化在一定程度上反映了土壤的质量。随着土壤污染面积的扩大,土壤微生物多样性受到了极大影响,即许多土壤微生物类群的多样性降低。总结了近年来几种国内外主要应用于污染土壤微生物多样性的研究方法,分别对其发展动态、优缺点及实用性进行了比较分析,并对土壤污染生态学中的研究应用前景作出展望。     

不同桉树叶片、果实和枝条内生真菌群落组成及多样性分析

内生真菌群落在不同植物的不同组织中具有不同的组成和分布,采用ITS高通量测序技术比较4种不同桉树叶片、果实和枝条内生真菌群落组成和多样性差异. 4种桉树(Eucalyptus spp.)内生真菌群落结构分析结果表明,子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)是所有样本的优势菌门,但在不同样本中的相对丰度有差异.生物多样性分析结果显示,在同一组织和不同组织中托里桉和柠檬桉的内生真菌群落均相似,而窿缘桉与无性系广9在同一组织中内生真菌群落相似,在不同组织中内生真菌群落差异较大. 4种桉树在枝条中的多样性指数无明显差异,而窿缘桉果实、无性系广9的叶片和果实内生真菌群落的Chao1、Observed species和PD whole tree指数均显著高于托里桉和柠檬桉. LEfSe分析表明,柠檬桉(枝条和果实)和窿缘桉(叶片和果实)中的差异物种分布在子囊菌门,托里桉(果实)和无性系广9(叶片和枝条)中的差异物种在子囊菌门和担子菌门中均有分布.桉树中蕴含了丰富的内生真菌菌群,因树种和组织的不同而存在较大差异,无性系广9叶片和窿缘桉果实部位拥有更丰富的内生真菌群落,...     

健康草莓体内可分离培养微生物的多样性

研究草莓体内能够分离培养的微生物的群落组成和结构,对健康草莓稳态菌群的构建和保持具有重要意义.以健康草莓为研究样本,对其根、茎、叶内的真菌和细菌进行分离培养,分别利用真菌rDNA-ITS引物和细菌16S rRNA引物进行PCR扩增,然后基于测序及其生物信息学分析鉴定微生物种类.结果表明,从健康草莓根、茎、叶部获得了真菌...     

马鹿花5种种植模式土壤微生物多样性比较

采用PCR-DGGE技术对马鹿花5种种植模式土壤微生物多样性进行分析,结果表明:(1)5种种植模式土壤微生物垂直方向呈现随土层深度的增加其Simpson指数逐渐降低的趋势,且马鹿花-墨西哥柏林、马鹿花-蓝桉林Simpson指数高于其对照,马鹿花-三年桐林、马鹿花纯林Simpson指数低于其对照;(2)水平方向上马鹿花-蓝桉林总体丰富度、多样性指数及均匀度指数均最高,马鹿花-墨西哥柏林丰富度最低,马鹿花-三年桐林多样性及均匀度指数最低,相同条件下马鹿花纯林模式比马鹿花-三年桐林更优,中厚的棕壤较深厚的棕褐壤更适宜种植马鹿花.     

仔猪空肠和回肠微生物多样性分析

[目的]微生物作为影响机体营养物质消化吸收的重要因素,在仔猪肠道生长发育过程中起至关重要的作用。本研究分析了马身猪与晋汾白猪仔猪在生长发育时期的空肠、回肠微生物组成变化,旨在揭示肠道菌群与血清生化指标和肠道结构的关系。[方法]收集马身猪和晋汾白猪在3个发育时期（1日龄,28日龄和70日龄）仔猪空肠、回肠组织以及内容物（n=3）,通过16S rRNA高通量测序与生信技术分析微生物多样性,HE染色测定肠道形态结构,相关性分析将微生物菌群与血清免疫指标和肠绒毛结构关联。[结果]仔猪初生期小肠绒毛最长,保育末期隐窝深度最高。晋汾白猪仔猪肠道微生物分布于28个门和518个属;马身猪仔猪肠道微生物分布于19个门和325个属。其中,厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门为仔猪优势菌门,且乳酸杆菌丰度均较高。此外,仔猪肠道微生物多样性与血清免疫指标（LPS、TNF-α、IL-6、DAO、D-LA）以及隐窝深度显著相关,而与绒毛长度显著不相关。[结论]地方品种马身猪仔猪肠道微生物组成更加保守,乳酸杆菌、Ferruginibacter等在猪抗逆性能方面发挥重要作用,Quinella、Haliangium等在营养吸收...     

贵州不同气候油菜秆腐烂后微生物群落组成及其多样性

为给贵州山区秸秆饲料发酵生产实践提供技术依据,采集贵州4个不同气候区长期堆放自然腐烂的油菜秸秆,用微生物培养法研究了不同气候类型对降解微生物数量、种类及群落多样性的影响.结果表明:微生物三大类群细菌、放线菌、真菌的数量差异较大,细菌总数＞放线菌总数＞真菌总数.ShannonWiener和Simpson指数在赤水、贵阳两...     

基于高通量测序分析高粱紫斑病叶片的微生物组成及多样性

本研究采用ITS高通量测序(扩增子测序)技术对已感染紫斑病(A和B)和未感染紫斑病(CK)的高粱叶片进行检测,以明确其真菌的群落组成及多样性。结果表明：高粱紫斑病病叶中真菌菌群组成丰富,总共检出820种真菌,3个样品共同拥有的为155种,所有菌群分属于9门29纲60目122科和206属。3份样品Shannon指数分别为3.98、4.67、4.11,按大小排序为B>CK>A。同时,含量排名靠前的属之间亲缘关系比较复杂,且没有出现前人报道的高粱尾孢Cercospora sorghi,可能的原因是引起该病害发生的病原菌发生了变化,或是存在由多种真菌共同作用从而导致病害发生的可能性。本研究结果能帮助我们更好地了解高粱紫斑病发病期叶片真菌的组成和分布的多样性,为该病害的研究和防治提供更好的指导作用。     

墨兰品种健叶与感染胶孢炭疽菌病叶的表面结构及氨基酸含量比较

【目的】明确墨兰品种健叶与感染胶孢炭疽菌病叶的叶片表面结构及氨基酸含量的变化,为墨兰品种抗病性利用提供理论依据。【方法】以中感墨兰品种太平洋为样本,利用扫描电镜观察感染胶孢炭疽菌墨兰叶片表面超微结构的变化;以不同感病水平墨兰品种金华山(低感品种)、太平洋(中感品种)和万代福(高感品种)为样本,利用氨基酸自动分析仪检测感病墨兰叶片除色氨酸外其余17种氨基酸含量的变化。【结果】中感墨兰品种太平洋感染胶孢炭疽菌后,叶片表面超微结构发生明显改变,蜡质层破裂,表皮细胞受损,气孔功能渐失,严重影响叶片功能与整体观感。3种不同感病水平的墨兰品种感染胶孢炭疽菌后,氨基酸种类未发生改变,但总氨基酸含量均明显提高,其中以低感墨兰品种金华山提高最多,高感墨兰品种万代福提高最少,3个品种间差异显著;各种氨基酸在不同感病水平墨兰品种间的变化量差异显著,甲硫氨酸(Met)在高感墨兰品种中变化量最大,胱氨酸(Cys)在中感墨兰品种中变化量最大,天门冬氨酸(Asp)、组氨酸(His)和赖氨酸(Lys)在高感与低感墨兰品种中变化量较大,甘氨酸(Gly)和苏氨酸(Thr)在中感与低感墨兰品种中变化量较大,其他10种氨基酸则均在低感墨兰品种中变化量最大;丙氨酸(Ala)、谷氨酸(Glu)、苯丙氨酸(Phe)、缬草氨酸(Val)、丝氨酸(Ser)、精氨酸(Arg)和苏氨酸(Thr)7种氨基酸是影响墨兰品种感病强弱的主要氨基酸种类。【结论】胶孢炭疽菌侵染影响墨兰品种叶片表面结构和氨基酸含量,营养物质变化量与墨兰品种感病水平高低有关。     

东海毛颚类种类组成和多样性

根据1997～2000年东海23°30′～33°N、118°30′～128°E海域4个季节海洋调查资料,对东海毛颚类种类组成、多样性分布特征及与环境关系进行分析。结果表明:春、夏季毛颚类种类最丰富(25种),冬季次之(23种),秋季种数最低(21种);冬、春季毛颚类种数仅与表层温度相关,夏季与表层温度、表层盐度二元线性相关,秋季与表层盐度相关;冬、春季毛颚类多样性和丰富度指数值由北向南,由近海向外海逐渐增高,夏季近海和外海差异缩小,秋季多样性指数值为4季最低。     

化感物质棕榈酸对茄子根际土壤微生物组成及微生物量的影响

研究棕榈酸处理对茄子根际微生物种群结构、微生物生理功能性类群和微生物量的影响.结果表明:棕榈酸降低了茄子根际土壤中真菌的数量及其组成比例,组成比例最低降至0.001%;增加了细菌和放线菌的数量及其组成比例,组成比例最高分别增至98%和4.31%;经棕榈酸处理的茄子植株根际微生物几种生理功能性类群显著高于清水对照,氨化细菌、硝化细菌、固氮菌、纤维素分解菌最高分别增至375375.01×105cfu·g-1、2.5×105cfu·g-1、109.2×105cfu·g-1和0.78×105cfu·g-1;极显著地增加了茄子根际土壤微生物量碳、微生物量氮、微生物量磷,最高分别增至7.6μg·g-1、12.61 μg·g-1 和14.25μg·g-1.棕榈酸增加了茄子植株的株高和茎粗,最高分别增至23.28cm和0.9cm,大体表现出随浓度增加而增强的趋势.     

东海毛颚类种类组成和多样性

根据1997～2000年东海23°30′～33°N、118°30′～128°E海域4个季节海洋调查资料,对东海毛颚类种类组成、多样性分布特征及与环境关系进行分析。结果表明:春、夏季毛颚类种类最丰富(25种),冬季次之(23种),秋季种数最低(21种);冬、春季毛颚类种数仅与表层温度相关,夏季与表层温度、表层盐度二元线性相关,秋季与表层盐度相关;冬、春季毛颚类多样性和丰富度指数值由北向南,由近海向外海逐渐增高,夏季近海和外海差异缩小,秋季多样性指数值为4季最低。