猪源嗜麦芽窄食单胞菌16 S rRNA基因的克隆和序列分析

从临床病猪无菌采集抗凝血，抽提全血基因组DNA，用能够扩增大多数真细菌16 S rRNA基因的通用引物，扩增出长度为1502bp的嗜麦芽窄食单胞茵的16 S rRNA基因；该基因与国外报道的嗜麦芽窄食单胞茵部分临床和环境分离株核苷酸序列的同源性达99％以上。证实嗜麦芽窄食单胞菌可感染猪。     

“高热病”病猪嗜麦芽窄食单胞菌的分离鉴定

从"高热病"猪的鼻液、支气管和肺组织分泌物的11份病料中,按常规方法进行病原菌分离鉴定,经亚胺培南分离筛选到7株疑似细菌.通过生化试验、16 S rDNA基因序列分析等,鉴定出其中2株为嗜麦芽窄食单胞菌(命名为PSM-1、PSM-2).与GenBank中临床和环境中分离的嗜麦芽窄食单胞菌分离株相比,两株菌的16 S rDNA基因扩增片段的核苷酸序列同源性均在99%以上.动物试验证实,2株细菌具有一定致病性;药敏试验表明,分离菌株对大多数抗生素具有较强耐药性且呈现多重耐药性.     

从山羊鼻内腺瘤病例中分离出嗜麦芽窄食单胞菌的报告

对临床发病的山羊病例进行尸体剖检、病理学诊断和细菌学检查,分析疫病发生的原因。根据尸体剖检和病理学检查诊断为山羊鼻内腺瘤病,并继发有严重的细菌感染。根据细菌分离培养、染色特性、生理生化特性及16S rDNA序列分析鉴定为嗜麦芽窄食单胞菌。     

斑点叉尾嗜麦芽寡养单胞菌的分离鉴定及系统发育分析

从发生在四川、重庆等省市的斑点叉尾急性流行性传染病病鱼的肝脏、肾脏内分离到1株高致病性菌株(CCF00024),人工感染健康鱼表现出与自然病鱼相同的症状,并从中分离获得同种细菌,证实其为斑点叉尾急性流行性传染病的病原菌。形态、生理生化检测表明,该菌为非发酵型直杆菌,严格需氧,革兰氏阴性,极生多鞭毛,对除麦芽糖和甘露糖以外的多种糖类不利用产酸,氧化酶阴性,DNA酶、蛋白酶、脲酶、赖氨酸脱羧酶阳性,MR、VP阴性。在以该菌16S rDNA序列(GenBank登录号AY970826)和GenBank及RDP数据库内同源性较高的细菌16S rDNA序列构建的系统发育树中,分离菌CCF00024与嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)聚在一簇,特别是与S.maltophilia M5-1的同源性最高,序列相似性达99.6%,结合形态和生理生化特点将其鉴定为嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrop homonas maltophilia)。药敏试验结果表明,对磺胺甲口恶唑、磺胺异口恶唑、阿齐霉素、洛美沙星高度敏感,而对新霉素、卡那霉素、氨苄青霉素、头孢唑啉、先锋霉素和链霉素不敏感。     

猪“高热病”的综合防控

猪“高热病”以高热、食欲减退或废绝、皮肤发绀为主要特征,是一种发病急、传播快、发病率和死亡率均较高的传染病。其病因复杂,治疗难度较大,传播速度快,给养猪业带来巨大的经济损失。结合当前养猪业生产现状,对该病在日常饲养管理中预防措施、暴发时的控制措施以及临床防控应注意的问题进行了阐述,以期为有效防控猪“高热病”提供参考。     

“猪高热病”流行的启示

“猪高热病”又名“猪无名高热病”、“高热综合征”,是猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪圆环病毒Ⅱ型(PCV-2)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪细小病毒(PPV)等多种病原混合感染造成的,夏秋季节多发,以持续高热、呼吸道症状为主。该病来势凶猛,传播快,病症复杂、防     

斑点叉尾鲴嗜麦芽寡养单胞菌的分离鉴定及系统发育分析

从发生在四川、重庆等省市的斑点叉尾妇急性流行性传染病病鱼的肝脏、肾脏内分离到1株高致病性菌株（CCF00024），人工感染健康鱼表现出与自然痛鱼相同的症状，并从中分离获得同种细菌，证实其为斑点叉尾鲴急性流行性传染病的病原菌。形态、生理生化检测表明，该菌为非发酵型直杆菌，严格需氧，革兰氏阴性，极生多鞭毛，对除麦芽糖和甘露糖以外的多种糖类不利用产酸，氧化酶阴性，DNA酶、蛋白酶、脲酶、赖氨酸脱羧酶阳性，MR、VP阴性。在以该菌16SrDNA序列（GenBank登录号AY970826）和GenBank及RDP数据库内同源性较高的细菌16SrDNA序列构建的系统发育树中，分离菌CCF00024与嗜麦芽寡养单胞菌（Stenotrophomonasmaltophilia）聚在一簇，特剐是与5．maltophiliaM5—1的同源性最高，序列相似性达99．6％，结合形态和生理生化特点将其鉴定为嗜麦芽寡养单胞菌（Stenotrophomonasmaltophilia）。药敏试验结果表明，对磺胺甲口恶唑、磺胺异口恶唑、阿齐霉素、洛美沙星高度敏感，而对新霉素、卡那霉素、氨苄青霉素、头孢唑啉、先锋霉素V和链霉素不敏感。     

猪“高热病”发病情况与影响因子相关性分析

采用χ2检验方法对猪＂高热病＂发病情况与可能的影响因子进行相关性分析。结果表明猪场发病与猪场场址、场内布局、设施设备等因子无明显相关性（P〉0.05）;哺乳仔猪群和保育猪群发病率与猪场的环境控制、生物安全、疫苗接种、营养保健呈极显著负相关（P〈0.01）;育肥猪群与生物安全和疫苗接种呈极显著负相关（P〈0.01）,与环境控制呈显著负相关（0.05     

“猪高热病”的常见症状分析与防治对策

随着养猪业的快速发展,养猪已经成为农民增收的重要路径,也成为了农村畜牧业中的重要一环。但在生猪养殖的过程中,往往会出现一些病害,如“猪高热病”就是比较常见的一种,它不仅增加了生猪的死亡率,严重降低猪的品质及产量,也影响养猪业的长远发展。“猪高热病”具有较快的传播速度、较广的传播区域、较高的发病率和死亡率、较低的治愈率等特点,会导致猪病扩散和仔猪死亡,给养殖户造成巨大的经济损失,因此加强“猪高热病”的防治工作十分必要。文内就对“猪高热病”的常见症状加以分析,并针对性地提出几点防治对策,希望能对生猪的养殖工作提供一些参考和借鉴。     

“猪高热病”的研究概况及对策

所谓“猪高热病”,是指猪患病后体温升高,用多种抗生素治疗后体温无明显下降,用抗生素加解热镇痛药联合治疗后体温下降,但多数第2次用药无效,病情更严重,出现全身性衰竭而死亡。2006年5月,“猪高热病”在我国的江西发生,6月湖南发生,呈暴发性流行,造成大批死亡。与此同时,广东、安徽、山东等省市也相继流行,并迅速席卷全国。该病发病快、死亡率高,部分猪场全军覆没,以持续高热(40.5℃以上)、呼吸急促、全身发红为主要临床特征。病理剖检以全身淋巴结肿大、出血,肺脏化脓坏死,肝、脾、肾肿大出血,肠粘膜出血坏死,关节腔积液,关节肿大为特征。…     

通过16S rDNA全序列分析及鉴定牛沙门氏菌

通过16S rDNA全序列的DNA同源性分析以及PCR-RFLP分析,对从山东某奶牛场送检的腹泻死亡的犊牛内脏中分离到的一株沙门氏菌进行了血清型鉴定,得到其系统发育树状图。系统发育树分析表明,该沙门氏菌菌株与GENEBANK上发表的27株沙门氏菌的16S rDNA同源性较高,为97-99％,该沙门氏菌菌株与鼠伤寒沙门氏菌LT2（Salmonella typhimurium LT2）的同源性最高,达到了99．7％,表明该沙门氏菌菌株为鼠伤寒沙门氏菌。     

16S rDNA Gene and Drug Resistance Analysis of Vibrio anguillarum Isolated from Tincaeus

Strain SK-1 was isolated from naturally infected Tincaeus. Its morphological, physiological and biochemical experiments, 16S rDNA sequence were performed, and its antibiotic sensitivity was analyzed by Kriby-Bauer disc diffusion method. The results showed that strain SK-1 was gram negative bacteria,with short rod shape and oxidase-positive.Its physiological and biochemical characteristics were consistent with the physiological and biochemical characteristics of Vibrio anguillarum. The length of this 16S rDNA sequence was 1447 bp, which showed 99% homology with Vibrio anguillarum, GenBank database number was KF978124. Phylogenetic analysis indicated it grouped together with Vibrio anguillarum. So it was confirmed that strain SK-1 was Vibrio anguillarum. The antibiotic sensitivity presented that strain SK-1 was highly sensitive to 13 antibiotics such as doxycycline,tetracycline,minocycline, and middle sensitive to 9 antibiotics such as streptomycin, ceftriaxone, trimethoprim, and resistant to bacitracin and lincomycin. These results will be beneficial to the identification of Vibrio anguillarum and prevention and control of bacterial disease in Tincaeus.     

鸡艾美耳球虫18SrDNA序列与系统进化分析

为了确定鸡艾美耳球虫（Eimeria）不同种以及来自不同地区同种不同株之间的亲缘关系,研究其分类地位,对实验室保藏的柔嫩艾美耳球虫（Etenella）、毒害艾美耳球虫（Eneeatrix）、巨型艾美耳球虫（Emaxima）、堆形艾美耳球虫（Eaaervulina）等4种15株鸡球虫孢子化卵囊的18SrDNA基因进行克隆、测序,并与从GenBank下载的鸡球虫18SrDNA序列一起,使用软件DNAstar 5．0 MegAlign进行系统发育分析。结果显示,4种艾美耳球虫种间同源性在94．6％～99．4％之间,7株柔嫩艾美耳球虫的株间同源性在99．0％-99．9％之间,5株巨型艾美耳球虫的株间同源性在96．9％～99．8％之间。用该4种鸡球虫的18SrDNA序列与GenBank下载的另外4种鸡球虫18SrDNA序列构建系统发育树,显示这8种鸡艾美耳球虫形成2个分支,即堆形艾美耳球虫（EASH）、巨型艾美耳球虫（EMSH）、变位艾美耳球虫（Emivati）、和缓艾美耳球虫（Emitis）、布氏艾美耳球虫（Ebrunetti）、早熟艾美耳球虫（Epraecox）构成1个分支,柔嫩艾美耳球虫（ENSH）、毒害艾美耳球虫（ETAS）构成另1分支。巨型艾美耳球虫、柔嫩艾美耳球虫各株的系统发育树均根据地域关系产生2个分支。柔嫩艾美耳球虫、毒害艾美耳球虫的亲缘关系较近,不同地理区域的同种不同株的亲缘关系相对较远,种间和种内的鉴定结果与普通生物学结果一致。本研究提示18SrDNA基因可用于鸡球虫不同种／株的分类鉴定,为艾美耳球虫分子遗传学鉴定提供了理论基础。     

刚地弓形虫18S rDNA基因的克隆与序列分析

采用PCR方法从弓形虫RH株和CN株总DNA中分别扩增到18S rDNA基因，与pGEM-T easy vector连接，并进行DNA测序分析。结果表明，2个虫株均扩增出1745bp的片段，用DNAMAN软件对其与GenBank上2个虫株相应序列进行同源性比较，4个虫株的同源性为99．34％。刚地弓形虫虫株在不同宿主和不同区域上存在着一定的差异。     

新疆和陕西三叶草属根瘤菌16S rDNA多态性及系统发育研究

为阐明西北部分地区三叶草属(Trifolium L.)根瘤菌遗传多样性及系统发育地位,于2007年12月采用16S rDNA PCR-RFLP与16S rDNA全序列分析,对50株分离自新疆和陕西地区的三叶草属根瘤菌进行系统研究。结果表明:所有供试菌株产生了5种16S rDNA基因型,归属于根瘤菌属(Rhizobium)、土壤杆菌属(Agrobacterium)、叶杆菌属(Phyllobacterium)3个系统发育分支,表现出较为丰富的共生固氮体系多态性。其中,CCNWXJ0140在系统发育树中与三叶草叶杆菌模式菌株P.trifolii PETP02关系较近,序列相似性为98.9%,也扩大了可与三叶草形成共生关系的根瘤菌种类的范围。通过不同地区同一寄主的三叶草根瘤菌的比较,发现其共生关系因地理分布不同而具有多样性,因此,对于丰富三叶草根瘤菌资源及其开发利用具有重要意义。     

乳白香青分泌吲哚乙酸内生细菌的16S rDNA鉴定

对乳白香青2株分泌吲哚乙酸（IAA）的内生细菌的16S rDNA基因片段进行扩增、测序,并与GenBank中的4条相似序列进行比对分析,构建系统发育树。研究结果表明,2菌株分泌IAA的能力均较强,其IAA的产量分别为62.03和36.50μg/mL。形态学鉴定表明,RA5菌体为杆状,大小为（2.22-4.50）μm×（1.00-1.22）μm,革兰氏阳性;RC5菌体杆状,大小（1.59-2.98）μm×（0.62-1.04）μm,革兰氏阴性。系统学分析初步确定RA5为蜡状芽孢杆菌（Bacillus cereus）,RC5为芽孢杆菌属（Bacil-lus）的成员。     

火鸡隐孢子虫18S核糖体DNA部分序列测定与系统发育分析

从长春地区鸭的粪便中分离纯化了火鸡隐孢子虫（Cryptosporidium meleagridis）卵囊，根据隐孢子虫18S rDNA基因序列设计合成引物，用PCR扩增了卵囊基因组DNA大小586bp的片段，PCR产物经电泳鉴定后用试剂盒回收纯化，纯化后PCR产物直接测序，将测得的序列用Dnastar软件分析并与国外已发表的相应序列进行了同源性比较，并绘制了系统发育进化树。结果初步建立了火鸡隐孢子虫的PCR检测方法，序列分析显示长春外国语源火鸡隐孢子虫与国外9株隐孢子虫相应序旬同源性在82.7%-99.8%之间，其中与国外火鸡源火允隐孢子虫相应序列同源性为85.3%；与C.felis同源性最低，与C.muris同源性最高。本研究为火鸡隐孢子虫病诊断及该病分子流行病学研究打下了良好基础。     

副猪嗜血杆菌16S rRNA基因的克隆及序列分析

本研究旨在从分子水平对副猪嗜血杆菌湖南分离株进行鉴定,并用16S rRNA序列分析不同血型副猪嗜血杆菌之间的遗传关系。利用PCR扩增副猪嗜血杆菌的16S rRNA,应用ClustalX 1.81程序对序列进行比对,再用Phylip 3.67程序MP法和Mage 4.0程序NJ法绘制种系发育树,并用Puzzle 5.2程序构建最大似然树,同时利用DNAStar 5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示,所获得的16S rRNA序列长度均为783 bp,湖南分离株与已知5型副猪嗜血杆菌位于同一分枝。结果表明,湖南分离株属于5型副猪嗜血杆菌,为副猪嗜血杆菌的分子流行病学和其相关疾病的诊断奠定基础。     

不同病例动物源大肠杆菌的分离鉴定及16SrDNA同源性分析

为研究不同病例发病动物的发病原因,并对不同病例病料分离出的细菌进行16S rDNA同源性分析,本试验对10种不同病例发病动物病料进行细菌分离培养并对分离获得的细菌进行微生物学鉴定,设计1对16S rDNA基因引物,对分离出的10株细菌进行PCR扩增、测序及16S rDNA同源性分析。结果显示,分离获得的10株细菌经微生物学鉴定均为大肠杆菌,10株大肠杆菌中哺乳类动物病例犬乳房炎、犬子宫蓄脓、犬肺炎、犬皮肤化脓疮、奶牛乳房炎、犊牛腹泻6株大肠杆菌之间16S rDNA同源性为100.0%,家禽类动物病例肉鸽腹泻、肉鸡腹泻、野鸡腹泻和白孔雀腹泻4株大肠杆菌之间16S rDNA同源性也为100.0%,10株不同病例动物来源大肠杆菌之间16S rDNA同源性为97.5%~100.0%。本试验探明了10种不同病例发病动物的发病原因均为大肠杆菌感染引起,且10株大肠杆菌16S rDNA之间具有高度同源性。     

大肠杆菌属16S rDNA实时荧光定量PCR方法的建立及应用

根据GenBank大肠杆菌属16S rDNA基因序列设计并合成PCR引物及针对大肠杆菌属的特异Taqman探针,以大肠杆菌标准菌株的PCR扩增产物作为阳性模板制定标准曲线,建立大肠杆菌属实时荧光定量PCR检测方法。该法Mg2＋最佳工作浓度5 mmol/L,探针最佳工作浓度0.12μmol/L,标准曲线相关系数为0.998,能够定量和特异性检测大肠杆菌而与肠道优势菌群的代表种葡萄球菌、双歧杆菌和芽孢杆菌呈阴性反应,检测大肠杆菌16S rDNA基因的灵敏度达40.8 copies/μL。应用建立的方法对20、26、324、1、47、56日龄樱桃谷鸭的气管、食道、十二指肠、空肠、回肠、盲肠和直肠进行检测结果表明（以每个细菌含1个16S rDNA基因拷贝数计）,大肠杆菌属细菌总量,气管内为7.06×10^7～3.01×10^8个;食道内为1.73×10^8～3.23×10^8个;十二指肠内为2.29×10^8～2.39×10^9个;空肠内为1.28×10^8～1.69×10^9个;回肠内为1.86×10^8～1.90×10^10个;盲肠内为6.01×10^8～1.38×10^9个;直肠内为1.07×10^8～4.67×10^10个。樱桃谷鸭从食道到直肠的大肠杆菌属细菌的数量呈现上升趋势,盲肠和直肠分布量较多。