化学生物学课程中引入BARD数据库内容的探索

化学生物学课程是一门新兴的课程,其课程内容涉及海量小分子的筛选和生物活性研究,公共数据库对加速研究过程起到辅助性作用。在教学中引入生物检测研究BARD数据库内容,其提供接入到美国国立健康研究院NIH启动的分子文库项目产生的生物检测数据中。新数据可以通过一系列用户友好型工具投递到BARD数据库中,研究人员也可以利用其中发表的数据。同时,第三方开发人员可以使用应用程序界面制作独立工具或插件整合到BARD数据库中。BARD的工具套件可以满足数据发表者、用于可检验的假设的数据发掘者和工具开发人员。     

基于Android平台的武夷山生态与生物多样性野外数据采集系统

为准确、快速地获取武夷山生态与生物多样性野外调查数据,通过分析武夷山生态与生物多样性野外调查数据采集工作流程,制定数据采集规范,研制基于Android平台的武夷山生态与生物多样性野外数据采集系统。调查人员手持移动智能终端进行野外实地信息采集,通过无线网络将外业系统采集的数据传给内业系统分析处理。外业系统负责调查点位置信息自动获取、生境信息记载、图像采集、声音采集等操作;内业系统负责实时接收调查结果,经分析处理后打印输出或导出 EXCEL存档。该系统将移动智能终端采集取代传统的纸笔记录,简化野外考察的流程,提高了生态与生物多样性调查的数据质量,为武夷山生物多样性野外考察提供便携的数据采集工具。     

浅析透射电子显微镜在生物学科中的应用

透射电镜具有高分辨率、直观性的特点,是研究微观组织结构的强有力工具,在材料、医学、生物、化学、物理等各个研究领域发挥着不可替代的重要作用。本文结合生物样品的特点,介绍了透射电子显微镜的成像原理、生物样品的制备,综述了透射电子显微镜作为生物组织、细胞及细胞器超微结构观察工具在生物学科中的应用,为透射电镜的初学者以及科研工作人员全面了解和使用透射电镜提供参考。     

水产养殖废水污染危害及其处理技术研究

水产养殖是一个发展迅速的产业,同时在养殖过程产生的大量养殖废水也造成了很大的污染。因此,讨论水产养殖废水对水产品和环境的危害以及相关的处理技术具有重要意义。通过阐述水产养殖产业发展现状,分析养殖废水的危害及其物理、化学和生物处理技术,以期为水产养殖业的可持续发展提供一定参考。     

水稻遗传育种相关生物信息数据库和工具的研究进展

水稻Oryza sativa L.是主要的粮食作物，也是单子叶植物研究的模式植物。面对日益严峻的环境和人口压力，培育高产、优质、环境适性强的水稻品种是解决当前粮食安全问题的有效途径。随着多组学技术的快速发展，积累了海量的水稻遗传育种相关的数据。生物信息数据库和在线分析工具是存储这些数据的载体，用以整合、可视化和共享数据，并为数据的深入挖掘和利用提供工具，从而为育种决策提供数据支撑。本综述系统梳理了近20年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具，并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结。最后，讨论了现有的水稻生物信息数据库和在线分析工具的问题与不足，并对它们在大数据和人工智能时代的发展方向进行了展望。     

次生代谢产物的生物分子特性决定基因适合度

种群内与生物代谢相关基因的突变,必然会导致新酶、新代谢产物的形成,从而使生物体具有化学物质的多样性。新物质对生物体及细胞的生存或有利,或不利。该研究从选择进化的角度论述了代谢相关基因发生突变所产酶产物的生物分子活性是决定该基因能否保存的必要条件。同时指出,鉴于产物的生物分子性质可分为3个基本类型,而且选择压力对每种类型的选择存在差异性,从而使生物体具有化学多样性,并进一步形成代谢的多样性。     

鹿角珊瑚中肿瘤坏死因子TNF-α抑制剂的计算机虚拟筛选

[目的]通过计算机虚拟筛选,从鹿角珊瑚化合物构建的数据库中寻找作为TNF-α抑制剂的先导化合物。[方法]采用Chem Office Ultra 2008的Chem Draw绘制分子化学结构,Chem Finder构建配体数据库,Molecular Operating Environment v2008.10(MOE)寻找TNF-α受体的三维结构活性部位,对配体小分子进行2次3D衍生,然后对接打分,筛选最理想的类药分子。[结果]鹿角珊瑚中分离的成分及其衍生物中含有多个TNF-α受体蛋白对接效果很好的化合物,并且有2个化合物的效果活性接近阳性对照配体。[结论]鹿角珊瑚中分离的成分及其衍生物中2个化合物有助于肿瘤治疗的发展。     

生物信息学及其在农业上的应用前景

1生物信息学的概念 21世纪是生命科学的时代,也是信息的时代.随着人类基因组计划的实施,有关核酸、蛋白质的序列和结构数据呈指数增长,面对大量而复杂的数据,只能运用计算机技术进行数据管理、误差控制和相关分析.同时随着计算机处理能力的提高和因特网技术的扩展,为全世界范围内存贮和传递海量的生物信息提供了硬件基础和便利,从而也产生了新的交叉学科,生物信息学(Bioinformatics)[1].     

基于ArcGIS水文要素数据提取方法的研究

在实际研究中,很多现有的水文资料数据并不能直接用于当前水资源研究工作中,这时就需要从已有数据中提取部分水文要素数据构成新的水文数据层。作者通过介绍GIS的技术特点,分析其在水文研究工作中的应用,以水系图为应用案例,介绍了基于ArcGIS软件对水文要素数据提取的五种处理方法和工具,即通过属性选择符合条件的数据;通过ArcCatalog模块实现数据提取;利用追踪工具提取水文要素数据;利用导出数据提取相关水文要素;利用select工具通过属性提取相关要素。为利用ArcGIS软件平台研究水文水资源工作的初学者提供操作参考,加深对GIS水文运用的基本认识和理解,进而提高实践应用能力,以便能更好地为社会提供优质的水文水资源科技成果。     

生物技术与现代医疗

生物技术亦称生物工程,是依据生命科学的有关理论,利用生物学、物理学、化学、工程学等技术,从分子、亚细胞、细胞等水平对生物分子、细胞和生物个按预定设计进行操作和改造,以更快更有效地获得符合人们需要的生物分子、细胞或细胞株系、生物个体或品种和相应的产物、产品。其内容有基因工程、细胞工程、酶工程、蛋白质工程及生物反应工程等。