三个广东地方鹅种的DNA条形码研究

为开发能有效鉴定广东地方鹅（Ａｎｓｅｒｃｙｇｎｏｉｄｅｓｄｏｍｅｓｔｉｃｕｓ）种的分子技术,通过线粒体细胞色素Ｃ氧化酶亚基Ⅰ（ＣＯＩ）基因序列特征识别,研究了ＤＮＡ条形码在马岗鹅、狮头鹅和乌鬃鹅识别和鉴定中的可行性．结果显示,所选ＣＯＩ基因序列有１５个变异位点,共７个单倍型,乌鬃鹅、马岗鹅和狮头鹅的单倍型多样度分别为０.７３３３、０.３１０４和０.０６９０,核苷酸多样度（Ｐｉ）分别为０.００２９２、０.０００５５和０.０００１１．种内平均遗传距离为０～０.００３０,种间平均遗传距离为０～０.０２２,种间遗传距离明显大于种内遗传距离．３个鹅种的进化树表现为马岗鹅与狮头鹅相互混淆,而乌鬃鹅单独聚为一类．结果表明,获得ＤＮＡ条形码可从分子水平识别乌鬃鹅．     

基于自动扫描技术比较地方鹅品种群体遗传结构

本文运用10对荧光标记微卫星引物分析了皖西白鹅和豁眼鹅的遗传多样性,采用全自动扫描技术提高试验结果的可信度,经比较品种间等位基因频率、优势等位基因、特有等位基因、群体遗传参数等指标,了解2个品种之间存在的差异,为品种保护和开发利用提供参考资料。结果显示,在10个微卫星座位上,皖西白鹅检测到69个等位基因,豁眼鹅检测到52个等位基因。品种间有些座位优势等位基因是相同的,有些座位优势等位基因是不同的,少数等位基因是品种特有的。皖西白鹅的杂合度为0.6220,多态信息含量为0.5629;豁眼鹅的杂合度为0.5285,多态信息含量为0.4810,表明2个鹅品种都有丰富的遗传多样性。皖西白鹅和豁眼鹅之间的Reynolds’遗传距离为0.0682,基因流动值(Nm)为1.5909。     

5个鹅品种微卫星遗传多样分析

选用10个微卫星引物对四川白鹅、豁眼鹅、莱茵鹅、朗德鹅、扬州鹅5个鹅品种进行遗传多样性分析。结果表明:5个鹅品种的10个微卫星座位共检测到272个等位基因,平均基因数为5.4个,5个鹅品种在10个微卫星座位上的基因频率存在一定差异,其平均基因杂合度为0.708 1,平均多态信息含量为0.661 8。其中,扬州鹅平均基因杂合度最高,为0.756 8,遗传多样性最丰富;朗德鹅平均遗传杂合度最低,为0.670 7。     

利用微卫星标记分析湖南4个地方鹅品种遗传多样性

通过选用31个多态性较好的微卫星标记,检测了湖南4个地方鹅品种的遗传多样性.利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的DA遗传距离.结果表明,31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析.4个鹅品种中,平均杂合度范围是0.5010 ～ 0.6705,各鹅种的杂合度都较高,最高的是酃县白鹅(0.6705),最低的是武冈铜鹅,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性.对DA遗传距离的计算表明,用UPGMA法进行聚类分析,结果4个鹅品种被聚为3类:道州黑鹅与酃县白鹅聚为第1类;武冈铜鹅自聚为第2类;溆浦鹅自聚为第3类.     

广东4个地方鹅品种的遗传多样性分析

用磁珠富集法筛选的19对微卫星引物和从GenBank搜索12个微卫星引物检测广东4个地方鹅品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离(DA),分析其遗传多样性。结果表明,31个微卫星引物中有25个微卫星引物在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。4个广东地方鹅品种的平均杂合为0.611 9-0.672 7,均较高,最高的是乌棕鹅(0.672 7),最低的是阳江鹅(0.611 9),且杂合度的高低与PIC的大小体现了较高的一致性,表明广东4个地方鹅品种均具有丰富的遗传多样性;4个鹅品种被聚为2类:狮头鹅和乌棕鹅聚为第1类,阳江鹅和马冈鹅聚为第2类。     

丽佳鹅、五龙鹅和长白Ⅰ型鹅遗传多样性的微卫星标记分析

丽佳鹅、五龙鹅、长白Ⅰ型鹅是南京市近年从外地引进的优良鹅品种.为深入了解这些品种的种群遗传状况,为其进一步选育利用提供理论依据,选用25个微卫星标记对其遗传结构及系统发生关系进行了分析.结果表明,25个微卫星位点中有8个位点在3个鹅品种中表现为多态性,平均杂合度和多态信息含量分别为0.569和0.500,可作为有效的遗传标记用于分析,其中,WD206的多态性最好,其有效等位基因数、多态信息含量分别达7.860和0.859,AaLu1的多态性最差,其有效等位基因数、多态信息含量分别为1.270和0.202;3个鹅品种在8个微卫星位点上的多态性表现出了明显的差异,长白Ⅰ型鹅最高(0.528),五龙鹅次之(0.444),丽佳鹅最低(0.344);Ds标准遗传距离显示,五龙鹅和长白Ⅰ型鹅的遗传距离较近(0.037 1),与丽佳鹅较远(0.292 6),在UPGMA聚类结果图上,五龙鹅与长白Ⅰ型率先聚为一类,它们与丽佳鹅要在更大距离上才能聚为一类,这与3个鹅品种的源地和选育历史情况十分吻合.     

丽佳鹅、五龙鹅和长白Ι型鹅遗传多样性的微卫星标记分析

丽佳鹅、五龙鹅、长白Ι型鹅是南京市近年从外地引进的优良鹅品种。为深入了解这些品种的种群遗传状况,为其进一步选育利用提供理论依据,选用25个微卫星标记对其遗传结构及系统发生关系进行了分析。结果表明,25个微卫星位点中有8个位点在3个鹅品种中表现为多态性,平均杂合度和多态信息含量分别为0.569和0.500,可作为有效的遗传标记用于分析,其中,WD206的多态性最好,其有效等位基因数、多态信息含量分别达7.860和0.859,AaLu1的多态性最差,其有效等位基因数、多态信息含量分别为1.270和0.202;3个鹅品种在8个微卫星位点上的多态性表现出了明显的差异,长白Ι型鹅最高(0.528),五龙鹅次之(0.444),丽佳鹅最低(0.344);D s标准遗传距离显示,五龙鹅和长白Ι型鹅的遗传距离较近(0.037 1),与丽佳鹅较远(0.292 6),在UPGMA聚类结果图上,五龙鹅与长白Ι型率先聚为一类,它们与丽佳鹅要在更大距离上才能聚为一类,这与3个鹅品种的源地和选育历史情况十分吻合。     

中国中型鹅种的遗传多样性分析

通过微卫星标记技术对我国12个中型家鹅群体(丰城灰鹅、广丰白翎鹅、兴国灰鹅、浙东白鹅、钢鹅、四川白鹅、马岗鹅、织金白鹅、溆浦鹅、雁鹅、武冈铜鹅、皖西白鹅)的遗传多样性进行了分析。结果表明:12个品种的平均杂合度都较高,最高的为浙东白鹅,最低的为雁鹅,杂合度范围为0.4958~0.6547,12个鹅种资源群体平的均杂合度为0.5999,反映了各鹅种的杂合度都较高,遗传多样性丰富;通过计算DS遗传距离发现各群体的遗传距离较远,分化时间较长;NJ聚类结果将12个中型鹅种聚为3类,NJ的聚类结果分析与几个鹅品种的地域分布关系并不密切。     

我省有地方畜禽资源品种17个

据《广东省家畜家禽品种资源志》记载，我省有地方畜禽遗传资源品种17个，分别是鸡6个品种：清远麻鸡、惠阳胡须鸡、阳山鸡、杏花鸡、怀乡鸡和中山沙栏鸡，鹅4个品种：狮头鹅、乌鬃鹅、阳江鹅和马岗鹅，鸭1个品种：中山麻鸭，猪4个品种：大花白猪、蓝塘猪、粤东黑猪和两广小花猪，牛1个品种：雷琼黄牛，羊1个品种：雷州山羊。其中清远麻鸡、惠阳胡须鸡、狮头鹅、乌鬃鹅、大花白猪、蓝塘猪、粤东黑猪、雷琼黄牛、雷州山羊9个地方品种被列入《国家级畜禽遗传资源保护名录》。     

江西4个地方鹅品种遗传多样性的微卫星标记分析

通过选用31个多态性较好的微卫星标记,检测江西4个地方鹅品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(P IC)和群体间的遗传距离(DA)。结果表明:31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析;4个鹅品种的杂合度都较高,平均杂合度为0.584 6~0.643 4,其中最高的是广丰白翎鹅(0.643 4),最低的是莲花白鹅,而且杂合度的高低与P IC值的大小表现出较高的一致性。用DA的U PGM A法进行聚类分析,结果4个鹅品种被聚为3类,莲花白鹅与丰城灰鹅聚为第1类,广丰白翎鹅自聚为第2类,兴国灰鹅自聚为第3类。