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1.
通过对前期测定的番茄枯萎病菌Fusariumoxysporumf.sp.lycopersic基因组14501条gene序列进行搜索,发现466个简单重复序列(Simplesequencerepeat,SSR)分布在425条unigenes中,发生频率为2.93%.在番茄枯萎病基因组的SSR中,三核苷酸重复占主导地位,占SSR总数的65.88%.优势重复单元为AGC/CTG和AAG/CTT,分别占16.52%和12.66%.基于筛选的SSRs,运用Primer3软件进行引物的批量设计,共设计出451对引物.结果说明番茄枯萎病菌基因组中含有丰富的SSR位点. 相似文献
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RAPD标记检测蔬菜种子纯度中DNA提取方法研究 总被引:10,自引:3,他引:10
对DNA提取方法的SDS法进行改进的研究结果表明:改进了的SDS法操作简便,操作过程可在1小时内完成,适于番茄,辣椒,黄瓜等蔬菜作物的基因组DNA提取,且宜于在种子纯度检测的RAPD分析中应用。 相似文献
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植物抗病基因结构特征及其类似序列的研究进展 总被引:31,自引:2,他引:31
植物抗病基因的克隆一直为植物遗传学家和病理学家所关注。克隆的抗病基因在氨基酸水平上表现出一定程度的相似性, 在一些区段高度保守, 如 N B S、 L R R、激酶、 L Z等。这些保守序列, 不仅有助于对抗病基因的分类及其作用机理的理解, 而且为抗病基因克隆提供了一条新途径。根据这些保守序列合成 P C R 引物, 在许多植物中已扩增出大量的抗病基因类似序列 ( R G A)。遗传作图表明 R G A 与抗病性密切相关。对 R G A 与 R 基因的关系及 R G A 的基因组分布一并进行了讨论。 相似文献
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RAPD是一种建立在PCR基础之上的新的分子标记技术,利用RAPD技术对不同年份采收的豇豆种子进行了研究从豇豆干种子中直接提取的基因组DNA可以用于RAPD分析在20种10bp随机引物中筛选出S207和S2082种引物,并获得了豇豆基因组DNA的指纹图谱筛选出的2种引物均只在1997年采收的豇豆种子的基因组DNA上扩增出1条DNA带研究结果表明,不同年份采收的豇豆种子在遗传性上相当一致,而豇豆种子的基因组DNA在贮藏过程中会受到损伤 相似文献
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抗菌肽Shiva A基因导入杂交水稻恢复系明恢63的初步研究 总被引:1,自引:1,他引:0
利用农杆菌介导法将抗菌肽Shiva A 基因导入杂交水稻恢复系明恢63 成熟胚诱导的愈伤组织中,并再生植株。经PCR检测分析证明Shiva A 基因已整合到再生植株的基因组中。 相似文献
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RAPD标记在高粱基因组分析中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
本实验研究了RAPD标记在高粱基因组分析中的可用性。Mg^2+,酶及引物浓度是优化PCR反应的重要参数。经22个引物对高粱品系,IS3620c和BTX623及其杂交F8的120株后代个体的DNA进行PCR扩增,在获得的55个RAPD标记中,有42个标记定位于已存在的RFLP高粱遗传图谱中,实验结果表明,RAPD标记可以稳定遗传。 相似文献
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板栗基因组DNA几种提取方法比较研究 总被引:19,自引:0,他引:19
通过对板栗基因组DNA几种提取方法获得的DNA质量分析,表明改良SDS法是最为理想的提取方法,能满足RAPD及其他分子生物学研究的需要。 相似文献
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几种茄属植物基因组DNA提取与RAPD分析 总被引:11,自引:1,他引:11
研究了适于茄子及其近缘野生种基因组DNA的提取方法,并对DNA初步进行了RAPD分析。结果表明:SDS-氯仿-异戊醇法不适于茄属植物DNA提纯,而改进的CTAB-酚-氯仿-异戊醇对其成株叶/芽即可获得较高产率及纯度的DNA;PCR反应扩增出不同片段,引物OPG—11扩增片段在栽培品种与野茄中无差异,而在红茄与龙葵中呈现出一定的多态性。 相似文献
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为建立能快速灵敏检测甘蔗宿根矮化病 (ratoonstuningdisease,RSD)的 PCR检测方法。本文通过改进模板 DNA的制备方法,在 PCR基本程序的基础上,以甘蔗宿根矮化病菌 (Leifsoniaxylisubsp.xyli,Lxx)16S-23SrDNA基因间隔区特异性引物,调整 PCR扩增反应体系各组分的浓度、反应的退火温度、循环参数等主要因子,优化 PCR反应体系。此检测体系能从感染 RSD的样品中扩增出大小为438bp的特异性片段,而阴性对照和未感染样品则未扩增出任何片断;未优化仅从稀释30倍的蔗汁总 DNA中扩增出 RSD的特异性片段,优化后可以从稀释3000倍的蔗汁总 DNA中扩增出 RSD的特异性片段。对31份田间采集样品检测,未优化的阳性检出率为 32.26%;优化后阳性检出率 74.19%,与 I-ELISA检测结果一致。应用此检测方法可稳定、快速地检测出蔗株是否感染 RSD,且检测效率高,适合于田间大批量样品快速检测。 相似文献
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RAPD技术在粤星番茄种子纯度检测中的初步研究 总被引:4,自引:0,他引:4
应用20个随机引物对华南地区番茄主栽品种之一-粤星及其亲本的基因组DNA进行了RAD分析,发现7个引物可以在粤星及其亲本的RAPD图谱中形成多态性差异,其中引物P18可应用于粤星番茄种子中混杂的母本类假杂种的检测。 相似文献
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用反转录聚合酶链反应(RT-PCR),从纯化的腺胃病变型鸡传染性支气管炎分离株病毒基因组RNA扩增出约1.7kb的IBVS1基因。将该扩增产物于HindⅢ和BamHⅠ位点克隆到pUC18质粒载体中,对重组质粒载体进行酶切分析,得到与S1基因预期大小一致的插入片断。经S1探针Southern杂交检测,表明插入片断为S1基因。利用该法筛选到4株阳性重组质粒转化子。 相似文献
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褐飞虱不同生物型基因组DNA的RAPD分析 总被引:11,自引:3,他引:11
试验了两种DNA提取方法抽提褐飞虱基因组DNA的效果及其用所获得的DNA进行RAPD扩增的技术条件,结果发现,采用蚜虫DNA的提取方法(略有改进)来抽提高飞虱基因组DNA,并用S系列的随机引物、RAPD的通用反应体系及94℃变性,36℃退火和72℃延伸的扩增条件来对其进行随机扩增,可获得满意的效果,不同致害类群的群体间和同一致富类群的个体间的RAPD多态性均有差异,单雌纯化只能将个体间的差异缩小, 相似文献
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一种适合枣合酸枣基因组DNA的提取方法 总被引:7,自引:0,他引:7
研究比较了CTAB法和SDS法在枣和酸枣基因组DNA提取中的效果,并分析了取样时间、部位、样品状况、抗氧化剂和不同纯化处理等对所提DNA质和量及其RAPD扩增效果的影响。结果表明:用改良后的CTAB法优于SDS法,可有效地去除多糖,所提DNA的质和量均能满足PCR扩增要求。取样时间与部位对所提基因组DNA的质量无影响,但与产量有关,以旺盛生长期的幼叶或嫩梢尖为佳。样品采用液氧处理-70℃低温保存, 相似文献
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甜瓜抗CMV转基因植株的分子生物学研究 总被引:1,自引:0,他引:1
本研究建立了转目的基因植物基因整台及表达的分子生物学鉴定系统,并用报告基因检测、SDS-PAGE、Dot-ELISA、PCR特异扩增、Western-Blot等方法,研究了用叶盘法经Ti质粒转化的甜瓜再生植株CMV-CP基因的整合与表达。结果表明:再生植株基因组中整合了CMV-CP基因,长度为1kb,并能有效表达。表达产物分子量为24Kd,确为CMV的外壳蛋白,其表达量占细胞总蛋白约5%。 相似文献
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利用设计合成的根肿病菌 (Plasmodiophorabrassicae)特异性寡聚核苷酸引物D85 81 9Fw/D85 81 9Rv,根据本研究组成员对十字花科蔬菜根肿病菌核糖体基因ITS区段克隆测序结果 (未发表 )而设计的引物ITSFw/ITSRv和真菌核糖体基因ITS区段通用引物ITS1 /ITS4,对分离自十字花科作物(白菜、青菜、甘蓝、芥蓝、花椰菜等 )根肿病菌全基因组DNA进行PCR(PolymeraseChainReaction)特异性扩增试验。试验结果表明 ,这 3对引物均能从十字花科根肿病菌全基因组DNA中扩增… 相似文献
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变量施肥智能空间决策支持系统VRF—ISDSS:地理信息系统ArcView GIS在精细 总被引:5,自引:0,他引:5
邝继双 《河北农业大学学报》2000,23(3):91-94,97
介绍一个具有数据库、知识库、方法库与模型库,用于精细农业中变量施肥的决策支持系统VRF-ISDSS。系统包括农业区的基础地理信息、作物生产知识、作物生长养分需求的数学模型和分析方法,系统利用知识库的知识对决策方案进行调节和优化,实现了智能决策。系统是在ArcView GIS地理信息系统平台上进行二次开发而成的,能够处理与分析作物生长环境参数的空间分布和作物产量的空间分布和作物产量的空间分布等信息,并能够生成相应的分布图和变量施肥处方图。能够进行精细农业变量施肥的智能决策与空间决策,使得本系统不同于传统的农业决策支持系统以及单纯的农业地理信息系统。VRF-ISDSS还具有信息服务与科学计算等功能。 相似文献
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猪的21—羟化酶基因位点限制性片段长度多态性研究 总被引:1,自引:0,他引:1
采用纯种大约克和纯种二花脸猪血样提取基因组DNA,分别用11种限制必内切酶消化,以非放射性狄高辛试剂盒标记4.8kb21-羟化酶(CYP21)基因方为探针,经Southern杂交对猪的CYP21基因位点的限制性片长度多态性(RFLPS)进行了研究。结果在BanI、HindⅢ、KpnⅠ、PstⅠ和TaqⅠ5种限制性内切酶位点检测出了PFLPS,且BanⅠ和KpnⅠ酶切位点的多态性为首次发现;而在其他 相似文献