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采用环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)建立了一种快速、灵敏、高度特异的副猪嗜血杆菌(Hps)检测方法。针对Hps16S rRNA基因保守区域设计6条引物,在Bst大片段聚合酶的作用下,对模板DNA进行梯状等温扩增,并且优化LAMP的反应体系,检验其灵敏性与特异性。结果表明:该方法对Hps的最小检测限为0.2pg/μL,灵敏性高于常规PCR方法103倍;完成反应仅需65min。该方法灵敏度高、特异性好,能够作为Hps的快速诊断方法,对于基层和实验室应用均具有良好前景。 相似文献
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本研究旨在建立一种环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测食品中的肺炎克雷伯菌。选取肺炎克雷伯菌特有的毒力基因区域,设计2对引物(1对内引物、1对外引物),进行体外恒温扩增反应。对反应体系内的甜菜碱、核酸原料(dNTPs)、内外引物比例、Mg2+浓度、反应时间和温度进行优化和选择,并进行特异性和灵敏性试验检测。应用建立的LAMP方法对灭菌鸡肉人工污染加标样品进行检测。结果表明,通过优化试验,筛选到最优反应体系和反应条件;应用优化后的LAMP反应体系对包括肺炎克雷伯菌在内的18种常见微生物进行特异性检测试验,特异性良好。肺炎克雷伯菌LAMP反应体系对基因组的最低检测限是0.875 pg/μL,比传统PCR方法灵敏性高100倍。对人工鸡肉阳性样品进行检测,检测限为30 CFU/mL。本试验成功建立了一种能检测食物中致病肺炎克雷伯菌的LAMP检测方法,该方法利用2对引物针对肺炎克雷伯菌目的基因6个区域进行体外恒温核酸阶梯性扩增,灵敏性更高,反应时间更短,检测成本更低。 相似文献
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牛支原体、无乳支原体和丝状支原体丝状亚种小克隆三重PCR检测方法的建立及初步应用 总被引:3,自引:0,他引:3
本研究旨在建立一种可一次性区分牛支原体、丝状支原体丝状亚种小克隆和无乳支原体的三重PCR诊断方法,为临床诊断和流行病学调查提供可靠检测技术.根据GenBank发表的上述3种病原的基因组序列保守区域设计3对特异性引物建立三重PCR方法;确定其检测敏感性,以猪支原体、鸡支原体、无乳支原体和丝状支原体丝状亚种小克隆基因作模板检验其特异性;同时和病原分离鉴定结果对比其准确性.结果表明在优化体系和条件下能够同时得到扩增长度为448、549、375 bp 3条特异性片段,未扩增出猪、鸡支原体模板特异性片段;其敏感性(可检测到的最小模板DNA含量)为0.8 ng·μL-1;36份临床样品检测结果显示,三重PCR检测结果与分离培养鉴定方法一致,均能鉴定出牛支原体阳性病料.本研究建立的三重PCR诊断方法能够一次性鉴别3种支原体,具有高敏感性、特异性和准确性,可用于临床诊断和流行病学调查. 相似文献
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布鲁氏菌环介导等温扩增(LAMP)可视化检测方法的建立 总被引:1,自引:0,他引:1
应用环介导等温扩增(LAMP)技术建立了布鲁氏菌可视化快速检测方法。针对布鲁氏菌外膜蛋白OMP25基因保守区设计6条特异引物,反应前加入染料羟基萘芬蓝(HNB)作为LAMP扩增的指示剂,63℃恒温反应60min,根据HNB的颜色变化进行结果判定。分别评价所建立LAMP方法的特异性和灵敏性,并对60份牛布鲁氏菌病虎红平板凝集试验(RBT)阳性血清样本,经LAMP和B4/B5-PCR方法进行平行检测。结果显示,本方法最低检出限约为17fg布鲁氏菌基因组DNA。本方法特异性良好,布鲁氏菌反应管均出现特异性LAMP扩增反应,而猪大肠杆菌K99、巴氏杆菌C48-1、猪链球菌ST171、绿脓杆菌等对照组均未出现扩增。针对60份RBT阳性血清的平行检测结果显示,LAMP和B4/B5-PCR这两种方法间的结果符合率为85.0%。B4/B5-PCR检测为阳性的43份样品,经本方法检测全部为阳性;B4/B5-PCR检测为阴性的17份样品,经本方法检测,9份为阳性,8份为阴性。LAMP的敏感性高于B4/B5-PCR方法。实验表明,本文所建立的基于颜色判定的布鲁氏菌LAMP检测方法具有特异、灵敏、设备要求简单等特点,适用于基层兽医部门进行布鲁氏菌的快速检测。 相似文献
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将4只来自哈尔滨郊区丝状支原体呈阴性的小山羊,经气管注射1.25ml丝状支原体菌液,在6至10天内相继死亡。现将生前临床观察,尸体剖检和病理组织学检查结果报告。 相似文献
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建立了一个可以识别丝状支原体丝状亚种SC生物型(MmmSC)的PCR方法。根据丝状支原体丝状亚种SC生物型(MmmSC)相关核苷酸序列,设计合成了MC1、MC2和SC1、SC2两对引物。MC1、MC2是一对簇特异性引物,用于鉴别丝状支原体族6个成员,对MmmSC、MmmLC扩增出与预期结果相符的462bp片段;而SC1、SC2是针对MnnSC的一对特异性引物,只能对MmmSC扩增出277bp的片段,经过VspI、Bsp143I和Dral三种限制性内切酶鉴定与预期结果相符,而不能扩增出MmmLC型Y-goat代表株,说明具有非常好的特异性。对MmmSC进行的敏感性试验显示SC1、SC2引物能够检测到100个CFU,具有非常高的敏感性。 相似文献
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本研究建立了一种快速检测血清1型马立克氏病毒(MDV)的环介导等温扩增(LAMP)方法。该方法使用3对引物扩增血清1型马立克氏病病毒meq基因。本方法与血清2型和3型MDV不发生交叉反应,且LAMP引物与常见的禽类DNA病毒(网状内皮增生病病毒、鸡传染性贫血病毒、禽白血病病毒J亚群)没有结合位点。此外,该法可检测到10拷贝MDV基因组meq基因,比传统的PCR方法灵敏度高出10倍。LAMP混合体系在-20℃条件下可稳定保存90d。此外,该方法对临床样本的检测结果与PCR和病毒分离结果一致。LAMP过程简单,且无需任何特殊的仪器设备。本方法为检测血清1型马立克氏病病毒和控制马立克氏病提供了有效手段。 相似文献
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<正> 1990年7月江西清江种草养畜试验站的羊只突发一种昂头斜颈、走路摇摆身体呈歪斜姿式,时而跌倒又慢慢自行爬起的疾病,当时此病有迅速扩散蔓延的趋势,经有关专家会诊,确诊为羊脑脊髓丝状线虫病,现报告如下:一、发病概况及主要症状该站有成年羊291头,育成羔羊84头。7月12日开始发病,当天发病1头,其后陆续每隔1~2天就发现新病例,其发病16 相似文献
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为建立羊痘病毒(CaPV)的环介导等温扩增(LAMP)检测方法,本研究根据GenBank中羊痘病毒的保守基因序列,设计出针对羊痘病毒的LAMP引物,利用LAMP Real Time Turbidimeter LA-320仪优化得到病毒核酸等温扩增最佳条件是62 ℃恒温反应60 min。在此条件下,病毒核酸的最低检测含量为3.1×10-2 pg/μL,灵敏度比OIE推荐的PCR方法高104倍。添加钙黄绿素(calcein)建立的目测法,还可实现对上述病原体检测结果肉眼观察。本研究获得的CaPV LAMP仪器法和目测法可特异性地扩增羊痘病毒属的山羊痘病毒、绵羊痘病毒及牛疙瘩皮肤病病毒核酸,具有反应快速、特异性强、灵敏度高、操作简便、设备要求低等特点。 相似文献
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溶藻弧菌是引起海产鱼类、虾、贝等细菌性疾病的主要病原之一,严重危害水产养殖业的发展,建立快速、准确的检测方法对防控溶藻弧菌及保障水产养殖安全具有重要意义。本研究引入环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)技术,以溶藻弧菌胶原酶基因为靶基因,建立了溶藻弧菌LAMP快速检测方法,45~60 min内即可完成检测。试验结果显示,该LAMP方法可特异性检测溶藻弧菌,且灵敏度高,对纯培养溶藻弧菌的检测灵敏度约10 CFU/mL,对污染水产品中溶藻弧菌的检测灵敏度为19 CFU/mL。本研究建立的溶藻弧菌LAMP检测方法操作简便、检测快速,具有良好的实用性。 相似文献
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Antunes NT Tavío MM Assunção P Rosales RS Aquili V de la Fé C Poveda JB 《Veterinary microbiology》2007,119(1):72-75
In vitro susceptibilities of 16 Mycoplasma mycoides subsp. mycoides large colony type field isolates to 15 antimicrobial agents were determined using a broth microdilution method. The most effective antimicrobials were fluoroquinolones, tetracyclines and macrolides, with MIC values under 2 microg/ml. Resistance to nalidixic acid, gentamicin, streptomycin and spectinomycin was observed. 相似文献
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de la Fe C Assunção P Rosales RS Antunes T Poveda JB 《Veterinary journal (London, England : 1997)》2006,171(3):532-538
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides (LC) (Mmm LC) and Mycoplasma agalactiae are the most important mycoplasma species involved in the contagious agalactia syndrome. A total of 25 field strains from Spain and the two type strains were analysed by SDS-PAGE and immunoblotting. Two polyclonal antisera (PAbs) raised against a pool of strains of each mycoplasma species were used. The results revealed a high degree of protein variability among the field strains. The type strain of Mmm LC appeared to be representative of the field strains of this species, whereas this was not the case with the M. agalactiae type strain. Whereas M. agalactiae is known to possess a gene family regulating surface antigen diversity, there is a need to study the mechanisms used byMmm LC to generate antigenic variability in more detail. 相似文献
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为提高双芽巴贝斯虫(Babesia bigemina)检出率,本研究采用环介导等温扩增技术(LAMP)建立一种快速、灵敏、特异的B.bigemina检测方法。根据GenBank上公布的Babesia bigemina细胞色素b(Cytochrome b,cyt b)基因序列,设计4条特异地识别B.bigemina的cyt b基因6个特殊区域的LAMP引物,优化反应体系和条件,在Bst DNA聚合酶的作用下,65 ℃反应60 min,加入SYBR Green Ⅰ后观察。结果表明,该LAMP检测方法特异性强,与牛巴贝斯虫(Babesia bovis)等DNA不发生交叉反应;敏感性高,对B.bigemina的cyt b基因最小检测值为0.085 fg/μL,是一般PCR方法的1000倍。该方法具有简单、快速、低成本的特点,可用于B.bigemina的基层现场快速检测。 相似文献
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环介导等温基因扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种特异、灵敏、快速的检测方法。为提高犬瘟热病毒(CDV)检测效率、降低检测成本,针对犬瘟热病毒N基因保守区的8个位点设计了6条引物进行RT-LAMP一步法扩增。对反应体系及条件优化,检测特异性、敏感性,扩增产物通过凝胶电泳、显色反应和浑浊度比较进行判定。试验结果表明,该方法特异性强、敏感度高,操作简便、快速、便于观察,适用于门诊和现场检测。 相似文献
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猪支原体肺炎LAMP-LFD快速检测方法的建立及初步应用 总被引:1,自引:0,他引:1
旨在采用环介导等温扩增(LAMP)和横向流动试纸条(LFD)相结合的方法,建立一种快速、特异,过程可视化的猪肺炎支原体(Mycoplasma hyopneumoniae,Mhp)检测方法。针对猪肺炎支原体(Mhp)P36基因设计5套特异性引物和1条异硫氰酸荧光素(FITC)标记的探针,进行LAMP扩增反应。将生物素标记的LAMP产物与FITC标记的探针进行特异性杂交,并使用横向流动试纸条完成扩增产物的检测。经优化,LAMP最佳反应条件为65℃,反应15 min,从基因组DNA提取到LFD结果判断只需40 min左右,比常规PCR技术缩短近2 h。LAMP-LFD可特异性地检出猪肺炎支原体(Mhp),对猪鼻支原体(Mhr)及猪圆环病毒(PCV)等常见猪病病原的检测结果为阴性。灵敏性试验表明,LAMP-LFD对Mhp的检测灵敏度为1×100个拷贝DNA,是普通PCR的1 000倍。利用本方法可从采集的88份临床疑似病料样品中检测到64份阳性,国标PCR方法可检测到56份阳性,符合率可达90.9%。综上,本研究建立的LAMP-LFD方法可特异、准确地应用于Mhp的检测,而且灵敏度高、操作简单、仪器设备依赖性低、检测成本低、耗时短,适合基层实验室、应急检测或现场监测等使用,具有较高的推广价值,有望发展成为Mhp快速检测的有效手段。 相似文献
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环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一门新兴的分子生物学技术,该技术具有操作简单、不需要大型仪器设备、成本低廉、反应时间短、结果判定简单等优点,且具有比常规分子生物学方法更高的灵敏度和特异性.目前该技术在细菌、病毒及支原体等病原微生物的快速检测和早期诊断中已广泛应用.通过对国内外LAMP研究进展及该技术在细菌、病毒、支原体等致病菌中的诊断应用进行综述,以期介绍该技术的优缺点和应用现状,从而为今后的广泛应用提供参考依据. 相似文献
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As a new molecular biology technique,the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) has the advantages of easy to operate,no need of specialized devices,low cost,short reaction time and so on.It has higher sensitivity and specificity than the common molecular biology techniques.It has been widely used in rapid and early infection by variety of pathogens including bacteria,virus and mycoplasmas.We reviewed the research progress on LAMP techniques and the diagnostic applications in the bacteria,viruses,Mycoplasma and other pathogens at home and abroad,so as to understand the advantages and disadvantages of LAMP and application situation,and provide a reference for its widespread application in the future. 相似文献
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Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC, the aetiological agent of contagious bovine pleuropneumonia (CBPP), is considered the most pathogenic of the Mycoplasma species. Its virulence is probably the result of a coordinated action of various components of an antigenically and functionally dynamic surface architecture. The different virulence attributes allow the pathogen to evade the host's immune defence, adhere tightly to the host cell surface, persist and disseminate in the host causing mycoplasmaemia, efficiently import energetically valuable nutrients present in the environment, and release and simultaneously translocate toxic metabolic pathway products to the host cell where they cause cytotoxic effects that are known to induce inflammatory processes and disease. This strategy enables the mycoplasma to exploit the minimal genetic information in its small genome, not only to fulfil the basic functions for its replication but also to damage host cells in intimate proximity thereby acquiring the necessary bio-molecules, such as amino acids and nucleic acid precursors, for its own biosynthesis and survival. 相似文献