SSR分子标记及在林木基因组中的应用

主要介绍了SSR分子标记的原理、技术优点、实验技术的流程及在林木基因组中的应用,并展望SSR分子标记将会应用到衰退树种优良基因型的鉴定,从而应用于育种的研究和优良基因型的鉴定与保存等。     

杨树基因组SSR标记在康定柳中的通用性分析

SSR分子标记因具有共显性遗传、高度多态性、重复性和稳定性好、易于实现自动化等优点,在遗传育种等方面有着广泛的应用前景。本研究在杨树基因组中随机选取622对SSR引物对来自5个不同群体的康定柳雌雄各20个个体,共计200个进行了通用性分析。结果表明：杨树基因组SSR标记在康定柳中的通用性达到7.88%。     

分子标记在林业辅助选择育种中的应用

本文主要阐述分子标记在林木辅助选择育种中的应用。利用多种分子标记(RAPD,RFLP,AFLP,STS,SSR,STR等),可以在林木早期生长阶段对一些性状进行鉴别, 构建单种分子标记遗传连锁图谱或几种分子标记共存的混合连锁图谱和对控制数量性状的基因进行定位, 对林木群体遗传结构、遗传变异、遗传分化和基因流动进行研究, 在基因工程中, 能够追踪目的基因行为和对控制质量性状的基因进行鉴别, 对单株进行指纹图谱, 对种子质量进行监测和对品系、品种和无性系进行鉴定。     

刺槐高质量基因组DNA提取方法的研究

高效、稳定的基因组DNA提取是进行分子标记辅助育种研究的关键技术环节之一。以刺槐叶片为材料,将传统的CTAB法进行优化改良,结合组织研磨棒液氮研磨建立刺槐基因组DNA的提取方法。将提取获得的基因组DNA进行SSR分子标记技术研究,获得的条带清晰、稳定．表明提取获得的基因组DNA能很好的满足SSR分子标记的需要。为刺槐遗...     

基于桤木属转录组测序的SSR分子标记的开发

[目的]基于转录组数据开发适用于桤木属树种的SSR标记,揭示其在转录组序列中的分布类型及特征,为桤木属树种分子标记辅助育种提供有利工具。[方法]利用Micro SAtellite(MISA)软件对所有转录组序列进行SSRs搜索,并对SSR位点的数量、分布特征进行统计分析。设计100对SSR引物,采用琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳分离检测方法对3种不同倍性桤木属植物(12份材料)进行遗传多样性检测,确定引物多态性及通用性。[结果]85 769条Unigenes序列中发现8 678个SSR位点,分布在8 298条Unigenes中发生频率为9.67%,转录组序列中平均每14.04 kb长度就有一个SSR位点分布。其中,二核苷酸重复类型数量最多,占65.87%。根据转录组Unigenes序列,利用Primer 3软件共设计出4 531对符合要求的引物,挑选出的100对SSR引物中,获得18对多态性高、稳定性好的SSR引物。[结论]本研究可扩增出多态性位点的引物重复单元以二、三核苷酸重复为主。基于桤木属转录组序列的SSR标记开发是可行的,开发的引物为桤木属遗传多样性分析、分子育种、遗传图谱构建和功能基因的挖掘提供了丰富的候选分子标记。     

枣树分子育种研究进展

分子育种包括分子标记辅助选择育种(MAS)和基因工程育种。目前,分子标记辅助选择育种已成功应用于枣树品种鉴定、遗传多样性检测、亲缘关系研究、QTL分析和遗传图谱构建等方面,对枣树优良品种的选育有着重要的作用;而基因工程育种已经完成了枣部分基因的克隆和遗传转化。文中就分子标记和基因工程相关技术在枣研究领域中的应用情况与新的进展进行了综述。     

分子设计育种研究进展及其在林木育种中的应用

阐述了分子设计育种的概念、研究进展及其在动植物遗传育种中的应用。结合当前林木育种发展现状和育种目标, 介绍了开展林木分子设计育种的研究基础, 包括林木多基因转化技术研究、林木的分子标记辅助选择研究以及林木的生物信息学研究。针对林木分子设计育种现状, 分析了开展林木分子设计育种存在的相关问题, 并对今后的应用前景进行了展望。     

油料植物光皮树SSR-PCR反应体系优化及引物筛选

建立稳定可靠的SSR-PCR反应体系、筛选具有多态性SSR引物,是木本油料植物光皮树分子标记辅助育种与良种选育的重要基础研究。为给SSR标记技术在光皮树遗传图谱构建、亲缘关系鉴定及分子育种等方面的应用研究奠定基础,利用"Cf-05"正反向引物,采用L16(45)正交试验设计和单因素试验相结合的研究方法,对影响光皮树SSR-PCR反应体系的主要因素(模板DNA、引物、d NTPs、Mg~(2+)、Taq聚合酶浓度及退火温度)进行了试验分析。试验结果表明,光皮树SSR-PCR总体积为15μL的最佳反应体系为:模板DNA用量37.5 ng,正反向引物浓度均为0.6μmol·L~(-1),d NTPs浓度为0.3 mmol·L~(-1),Mg~(2+)的浓度为1.5 mmol·L~(-1),Taq聚合酶用量为1.5 U,最佳退火温度为50℃。运用优化了的光皮树SSR-PCR反应体系,可从71对引物中筛选获得11对能适用于光皮树的SSR引物。研究结果表明,试验所建立的反应体系可进一步用于光皮树SSR遗传多样性分析、遗传图谱构建和分子标记辅助育种等方面的研究中。     

SSR标记技术在杨属植物研究中的应用

SSR标记具共显性和多态性等特点,是一种很有价值的分子标记,微卫星在林木基因组中广泛存在。本文综合国内外SSR标记在杨属植物研究中的应用,并探讨了该技术存在的问题及发展趋势。     

丽江油橄榄品种表型及SSR标记的多样性及聚类分析

基于表型性状及分子标记对丽江不同油橄榄品种进行遗传多样性分析,对品种鉴定及育种工作均有重要意义。以云南丽江主要栽培的19个油橄榄品种为试验材料,利用14个表型性状(5个叶片性状和9个果实性状)及20个SSR引物荧光标记进行多样性及聚类分析。结果表明,各品种油橄榄表型性状存在显著差异,20个SSR位点共检测到124个等位基因变异,平均每个位点等位基因数为6. 2个,利用表型性状及SSR荧光分子标记可完全把19个品种油橄榄完全区分开。由此可知,云南油橄榄选育品种及引种品种均具有高水平遗传多样性,对于表型性状相似的油橄榄品种需结合SSR标记进行品种鉴定。     

分子标记及其在林木种质资源和遗传育种研究中的应用

分子标记是一种新型的遗传标记 ,由于其独特的优越性 ,被广泛地应用于生物学研究的各领域。在全面、系统地介绍当前分子标记主要类型及特征的基础上 ,从指纹图谱的品种鉴别、群体遗传结构的分析、连锁图谱的构建及分子标记辅助选择育种等方面论述了分子标记在林木种质资源和林木遗传育种研究中的应用情况。分子标记为品种鉴别、亲缘关系确定、种质资源遗传结构状况等的研究提供最有效的方法和手段 ,在提高林木遗传育种效率、缩短育种周期、增强定向育种的可靠性等方面展现了广阔的应用前景     

分子标记及其在林木种质资源和遗传育种研究中的应用

分子标记是一种新型的遗传标记，由于其独特的优越性，被广泛地应用于生物学研究的各领域。在全面、系统地介绍当前分子标记主要类型及特征的基础上，从指纹图谱的品种鉴别、群体遗传结构的分析、连锁图谱的构建及分子标记辅助选择育种等方面论述了分子标记在林木种质资源和林木遗传育种研究中的应用情况。分子标记为品种鉴别、亲缘关系确定、种质资源遗传结构状况等的研究提供最有效的方法和手段，在提高林木遗传育种效率、缩短育种周期、增强定向育种的可靠性等方面展现了广阔的应用前景。     

基于转录组序列的楠木SSR分子标记开发

【目的】通过对楠木转录组数据的分析,开发楠木SSR分子标记技术,为楠木遗传多样性分析和资源保护提供保障。【方法】将楠木高通量转录组测序获得的67 331条Unigene进行简单重复序列(SSR)位点挖掘和分析,并结合引物验证,初步证明其可行性。【结果】通过软件分析,共获得9 405个SSR位点,出现频率为13.97%,涉及序列数量为6 667条,发生频率为9.90%。SSR序列中包括166种重复基元类型,其中,单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸为优势重复类型,SSR位点数分别为3 890(41.36%),2 885(30.68%),2 489(26.46%)。SSR位点重复次数差别较大,其中重复10次比例最高,SSR位点数为1 621(17.24%),其次是5次(1 549,16.47%)和6次(1 495,15.90%)。主导重复基元类型为A/T(40.67%),AG/CT(27.59%),AAG/CTT(11.29%)。运用多态性分析的方式初步验证了SSR位点在楠木标记中的可行性。同时,利用Primer 3.0进行引物设计,随机筛选18对进行验证,9对引物可以扩增出预期大小的条带。【结论】通过对楠木高通量转录组序列的SSR信息的研究,获得6 667条SSR序列,主导重复类型为A/T,AG/CT和AAG/CTT。同时随机挑选18对引物对SSR分子标记方法进行验证。本文对楠木SSR标记的研究将有助于楠木基因挖掘、分子标记育种和资源保护。     

林木分子标记辅助选择育种

生物外部形态的多样性来源于内部基因的多态性理论的发展，使遗传分子标记在林木选择育种中显示了巨大的潜力。该文通过简述RFLP、RAPD、AFLP、STS和SNP等几种常用分子标记的特点，概述了其在林木育种研究中针对QTL进行标记辅助选择育种的应用情况，并描绘了其广阔的应用前景。     

枸杞分子标记辅助育种技术体系建立及应用

正(2017年自治区财政林业科技项目)该项目是自治区林业推广基础研究项目,在引进美国密苏里州立大学葡萄分子标记辅助筛选和应用及西南大学棉花分子标记育种研究成果的基础上,通过消化吸收和自主创新,对宁夏优势特色植物枸杞进行分子标记辅助育种。通过项目的实施,开发用于枸杞品种鉴定的     

微卫星（SSR）分子标记应用于濒危植物保护的研究进展

简要阐述了微卫星（SSR）的基本概念和特点,并从濒危植物遗传多样性和遗传结构分析、探索物种起源与进化历史、揭示物种濒危机制和确定优先保护单元等方面对SSR分子标记在濒危植物保护研究中的应用进行了概括和总结。     

SSR分子标记与林木遗传育种

阐述了一种新兴的基于PCR的微卫星分子标记技术在林木遗传育种中的应用情况及发展趋势.由于微卫星位点多态性高、共显性、中性突变及遍布于整个基因组,因此使之广泛应用于遗传连锁图谱的构建与QTL定位、亲缘关系分析、遗传结构分析、基因流监测、基因突变以及系统发生等领域.文中指出SSR标记可以为林木遗传改良、种质资源保存、濒危物种保护、基因定位及分子克隆等许多应用研究领域提供理论依据,它将是一种近乎理想的新一代的分子标记.     

油橄榄品种表型和SSR标记的多样性及聚类分析

[目的]利用表型性状和分子标记,对我国油橄榄品种进行鉴定和遗传多样性研究,有利于种质资源保存和利用,对了解油橄榄品种的组成结构及未来的引种和育种工作都具有重要意义。[方法]以甘肃省陇南市17个油橄榄品种为研究材料,利用表型上15个数量性状、18个质量性状和8个SSR荧光标记分别进行多样性和聚类分析。[结果]各性状在品种间存在显著差异,数量性状和质量性状的表型多样性指数分别介于1.579 2.089和0.3621.091,8个SSR位点共检测到51个等位基因变异,平均每个位点等位基因数为6.375个,利用表型性状和SSR标记可以将17个品种完全区分开。[结论]17个油橄榄品种具有较丰富的表型和遗传多样性,基于表型数量性状、质量性状和SSR标记的聚类分析结果,判别品种间遗传关系的结果有一致的,也存在一定差异。对于表型性状相似的品种,需结合SSR标记进行品种鉴定。     

竹类植物SSR引物开发策略及应用

微卫星(SSR)指的是以核苷酸为单位,串联重复的DNA序列,分布于真核生物的整个基因组中。SSR标记是基于DNA长度多态性的分子标记技术,广泛应用于群体遗传结构分析、构建遗传图谱、基因定位、亲缘关系等领域。本文综述了竹类植物中的SSR引物开发方法及应用,旨在为SSR分子标记在竹类植物中的应用提供参考。     

RAPD技术在林木遗传育种中的应用

RAPD是用以检测种一级水平基因多样性的分子遗传标记技术。该文对RAPD标记的基本原理进行了介绍 ,并综述了近年来RAPD分子标记在林木种质资源研究 ,分子遗传图谱的构建 ,数量性状位点定位 ,分子标记辅助育种 ,群体遗传结构及多样性等方面的应用 ,最后指出了存在的问题与展望