贵州黑马羊无角间性综合征座位的分子检测

为了筛选出黑马羊羊群中对羊群有危害且无经济价值的无角间性羊,试验选取不同性状的羊只采用PCR分子标记技术进行检测,从大量的特异性PCR引物中选出可以进行筛选的1对引物。结果表明:以有角黑山羊和黑马羊基因组为模板,用该引物可扩增出413 bp的片段,无角间性羊样本没有扩增片段,因此能够有效区分无角间性羊样本。说明试验建立的检测方法可作为无角间性综合征(PIS)基因座位的分子标记。     

大足黑山羊地方类群多胎性AFLP标记研究

利用分子标记技术AFLP标记,从15对引物中选取扩增效果较好的11对引物,对11只极端多胎个体和6只极端非多胎个体DNA进行扩增,共扩增出766个条带,平均多态率5.36%,其中引物E42/T48中1条294bp的条带在极端非多胎个体中均出现,而在极端多胎个体中只在1个个体中扩增出来,表现出极显著的差异。对差异片段回收、克隆、测序,设计4对引物,对基因组扩增后发现,产生差异片段的原因是片段内部有较长序列的插入或丢失,产生310bp和265bp2个等位基因,其中310bp纯合等位基因的初产羔羊数显著高于310bp和265bp杂合等位基因的初产羔羊数,在大足黑山羊地方类群内可能作为多胎性状分子标记。     

中国美利奴羊(新疆型)四个品系的RAPD分子标记研究

选用120条随机引物分别对中国美利奴羊（新疆型）毛质好、体格大、毛密和超细4个品系的混合DNA进行RAPD扩增，共筛选出3条特异性多态引物，占产生扩增产物引物总数的3，0％，说明各品系问的遗传变异程度较小。用其中的特异性引物OPF15分别对4个品系的部分个体样品进行分析，同样表现出多态性，并出现混合DNA样品RAPD分析结果中未出现的谱带。其中超细型有94．12％的个体（16／17）都产生一条特异的相同谱带，大小约为826bp，而其他3个品系混合DNA及个体的扩增产物均未获得此大小扩增片段，由此，可将该扩增片段作为中国美利奴羊（新疆型）超细型的一个特征性RAPD标记。     

半番鸭羽色性状RAPD分子标记初探

利用随机扩增多态DNA指纹分析技术(RAPD)，时半番鸭全白羽和全黑羽两种羽色极端个体的基因组DNA指纹进行研究，从40个随机引物中筛选出7个引物对22羽半番鸭个体基因组DNA进行分析。结果：7个引物共获得44个条带，其中有5个条带与白羽性状显著相关，表明应用RAPD技术可用于初步筛选有关性状的分子标记。     

山西本地山羊随机扩增多态性DNA与体重和体尺相关性研究

试验首先建立了适合山西本地山羊的RAPD体系及条件,然后从17种随机引物中筛选到9条引物,再用这9条引物对山羊个体进行扩增,最后扩增结果分别做单因子方差和T检验分析.结果表明：标记Q12C、Q14D对吕梁黑山羊体重和体尺有显著影响,Q12C、Q14D、Q04C、Q04E对吕梁黑山羊是增效标记,Q04F对吕梁黑山羊是减效标记;Q04D、Q06F对阳城白山羊体重和体尺有显著影响,P03B、Q14A、Q14D、Q06A、Q12B、Q06G对阳城白山羊是增效标记,Q06F、Q04F对阳城白山羊是减效标记.山西本地山羊基因组DNA多态性丰富,应增加引物和样本数量寻找更多的RAPD标记,为山羊育种的标记辅助选择和基因定位及作图提供科学依据.     

四川5个山(绵)羊品种随机扩增多态DNA分析

本研究参阅文献挑选 80个随机引物 ,从中筛选出 3 0个重复性好的引物 ,对四川黑山羊、南江黄羊、北川白山羊、成都麻羊 4个山羊品种和藏绵羊进行RAPD分析 ,并进一步对 1 3只南江黄羊个体 ,1 8只黑山羊个体的基因组DNA进行PCR扩增。用Nei氏公式计算品种间的遗传距离 ,用UPGMA法构建树状聚类图。结果表明 :黑山羊与南江黄羊的遗传距离最小 ,亲缘关系较近 ;藏绵羊与各品种间的遗传距离都很大 ,亲缘关系远 ;RAPD技术可作为一种有效的分子标记用于山羊品种之间遗传亲缘关系的分析     

贵州黑山羊遗传结构的RAPD分析

用27条多态性引物对15份贵州黑山羊个体基因组进行RAPD分析结果共扩增出258条带,其中多态带为119条,多态频率在0-77．78％之间,平均多态频率为46．12％．单个引物获得的扩增带数在4-14条之间,平均每条引物扩增出9．56条带、扩增带分子量范围为230bp-2800bp、用Nei氏公式计算品种内个体间的遗传相似性指数平均为0．9023结果表明：贵州黑山羊个体间的遗传变异较大,具有较丰富的遗传结构。     

AFLP标记检测大足黑山羊地方类群遗传多样性的研究

利用AFLP标记技术,从15对引物中选取11对扩增效果较好的引物,对17只大足黑山羊个体DNA进行扩增。结果共扩增出766个条带,其中59条为多态条带,平均每对引物扩增出69．6个条带,平均多态率为5．36％.     

GnRHR基因部分序列多态性及其与会理黑山羊产羔数相关性研究

设计3对引物,应用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术检测GnRHR基因外显子1和外显子3在会理黑山羊和波尔山羊中的单核苷酸多态性(SNP),同时研究该基因与会理黑山羊产羔性状的相关性。结果表明:引物P1扩增片段具有多态性,其余2对引物的扩增片段都不存在多态性;对于引物P1扩增片段,在会理黑山羊和波尔山羊中均检测到AA和AC基因型;测序分析发现AC型与AA型相比在外显子1有2处突变(A74G、G101A),但未引起氨基酸改变;会理黑山羊AA和AC基因型频率分别为0.72和0.28,AC型平均产羔数比AA型显著多0.48只(P0.05)。因此,GnRHR基因可以作为会理黑山羊多胎性状的一个有效分子标记。     

攀西黑山羊群体的AFLP遗传多样性研究

 研究采用随机片段长度多态性分析了攀西地区的5个黑山羊品种（类群）的遗传多样性。结果表明：15对引物共扩增出1003条多态条带,多态频率平均为99.01%,5个黑山羊群体的遗传多样性指数变异范围为0.0136~0.2131,其中建昌黑山羊平均遗传多样性指数最高（0.1346）,攀枝花黑山羊次之（0.1329）,乐至黑山羊最低（0.1101）。5个群体遗传距离范围为0.0062~0.0281,攀枝花黑山羊与建昌黑山羊之间的遗传距离最小（DR=0.0062）,云岭黑山羊与攀枝花黑山羊之间的遗传距离次之（DR=0.0128）,乐至黑山羊与金堂黑山羊间遗传距离最大（DR=0.0281）,金堂黑山羊与其它4个类群遗传距离较大（DR=0.0173-0.0281）,说明攀枝花黑山羊与建昌黑山羊的亲缘关系最近,与云岭黑山羊的亲缘关系较近,乐至黑山羊与金堂黑山羊的亲缘关系最远,金堂黑山羊与其它4个类群遗传距离均比较远。聚类结果与群体地理分布、生态条件差异情况基本一致。     

以随机扩增多态性DNA(RAPD)技术筛选意大利蜜蜂重要农艺性状遗传标记

为了获得意大利蜜蜂重要农艺性状的分子遗传标记 ,本研究以 30种RAPD随机引物对平湖浆蜂、美意、澳意、苏意等 4个在产浆、采蜜和抗病性上存在较大差异的意蜂品系的基因组DNA进行RAPD_PCR扩增筛选。试验结果显示 ,随机引物W 1 8(5′_CGGACGGCGG_3′)和W2 3(5′_GTACCGCCCG_3′)的扩增图谱呈多态性。其中 ,在引物W 1 8所扩增出的 9条片断中 ,2 35 2bp和 36 4bp条带为美意所特有 ,表明可将之用于鉴别美意 ;2 0 92bp条带仅出现于蜂蜜高产的美意和澳意中 ,意味着该条带为一个蜂蜜高产性状的遗传标记 ;而 6 32bp条带在王浆高产品系平湖浆蜂中出现的频率 (0 91 )显著高于 (P <0 0 1 )美意(0 0 4 )、澳意 (0 0 2 )和苏意 (0 0 0 ) ,说明 6 32bp条带可能为王浆高产性状的一个遗传标记。在W2 3引物扩增条带中 ,6 5 1bp条带为澳意所特有 ,可用于澳意鉴别     

用RAPD技术筛选中国荷斯坦牛产奶量性状遗传标记

选用320条10碱基随机引物在由36头高产（305d产奶量〉8500kg）和32头低产（305d产奶量〈5600kg）中国荷斯坦牛所组成的2个DNA池间进行RAPD-PCR扩增，从中筛选出稳定性好、带型清晰且在2个DNA池间有明显差异的RAPD引物24条。用筛选到的24条引物对所有个体进行PCR检测，得到了5个与奶牛产奶量性状相关的RAPD标记，并对其中4个进行了克隆测序和SCAR标记转化以及生物信息学分析。结果表明：SCAR标记yield—s139与产奶量密切相关，应用电子克隆方法已将该标记由921bp延伸到2141bp，经同源性比较发现，此标记对应于奶牛基因组中LINEs家族中的一个重复元件，推测该元件附近可能存在与产奶量性状相关的QTLs或主效基因。     

利用形态性状以及SSR标记鉴定4个川西北老芒麦品种（系）

基于23个形态性状和SSR分子标记,对在川西北推广应用的老芒麦(Elymus sibiricus)3个国审品种(‘川草2号’、‘阿坝’和‘康巴’)及1个新品系(‘雅江’)进行了鉴定研究。各品种表型性状与遗传背景差异较明显。新品系‘雅江’表现出优良的农艺性状,株高、叶长、叶宽、茎粗等形态性状均值显著优于3个对照品种(P0.05)。13对多态性好、特异性强、条带清晰的SSR引物在4个品种(系)中共扩增出90条条带,其中具有多态性的条带共68条,引物多态性条带比例(PPB)、多态性信息含量(PIC)及Shannon多样性指数(H)的平均值分别为76.32%、0.309及0.451,在供试品种(系)中均表现出较高的多态性。基于形态数据的欧氏距离和基于SSR数据的遗传距离矩阵之间具有较强的相关性(r=0.696,P=0.08),表明联合形态学标记和遗传标记能很好地用于品种鉴定,并且基于形态数据以及SSR分子标记的UPGMA聚类结果基本一致。筛选出4对引物可用于供试品种鉴定,并绘制了DNA指纹图谱。新品系‘雅江’具有明显区别于其它3个主推品种的形态特征和遗传背景,这为川西北高原老芒麦主要品种的遗传关系分析及品种的知识产权保护提供了数据支撑。     

微卫星标记与永康灰鹅体重、体尺及屠体状的相关分析

采用最小二乘分析法,分析了30对鹅微卫星标记与永康灰鹅体重、体尺和屠宰性能的关联性。结果表明：30对引物中,有28条引物表现丰富的多态性,其中有16个标记与永康灰鹅体重和体尺的8个性状存在不同程度的相关;3个标记分别与屠宰率、半净膛率、全净膛率、胸肌率和腿肌率等5个屠宰性状存在不同程度的相关。这些标记位点可能是控制永康灰鹅体重、体尺和屠宰性状的主效基因,或与控制性状的主效基因连锁。     

应用随机扩增多态性进行山羊致病性大肠杆菌的分子多态性分析

为了解山羊致病性大肠杆菌广西分离株的分子多态性,应用随机扩增多态性方法(RAPD)对山羊致病性大肠杆菌进行分型研究.从8条随机引物中筛选出4条能在10株大肠杆菌中具有较好多态性扩增的随机引物,4条随机引物共扩增出18条DNA片段,10个菌株无共有带谱,显示出良好的扩增多态性.菌株Nx31与Nx32曾被认为是同一菌株的两次分离,但是在RAPD分析中,两株细菌的带谱存在明显的差别,表明RAPD比传统的血清学分型具有更高的分辨性.     

SSR标记与桑树发芽率、节间距性状的相关性研究

利用微卫星(SSR)标记技术寻找与桑树发芽率和节间距性状基因紧密连锁的分子标记,可为高产桑树品种的选育提供分子遗传学方面的依据。用10对SSR引物对172份桑树品种(品系)的基因组DNA进行扩增,结果在获得的67个标记中有66个具有多态性,多态性比率为98.51%。分析供试桑品种(品系)基因组SSR标记与桑树发芽率、节间距性状的关联性发现:SSR标记mulstr4-3、mulstr6-4、mlstr6-6、ss19-1与桑树的发芽率呈显著性相关,相关系数分别为0.209、-0.215、-0.208、0.226;SSR标记mulstr3-3、mulstr4-1、ss04-1、ss04-3、ss18-1与桑树枝条的节间距呈显著性相关,相关系数分别为-0.255、0.424、-0.248、0.216、0.229,其中标记mulstr4-1可能与控制节间距性状的基因相连锁。     

五个品种(系)鸡的RAPD亲缘关系分析

本试验用DNA池法从40条随机引物中筛选出29条多态性、重复性好的引物,对贵州黄鸡、兴黔黄鸡、乌骨鸡三个培育品种(系)和地方品种兴义矮脚鸡及引进选育品种矮脚黄鸡共五个品种(系)进行随机扩增多态亲缘关系分析。结果表明,29条引物共扩增出稳定、清晰、重复性好的条带190条,其中多态性片段127条,在300bp￣3000bp之间。单个引物扩增出的RAPD条带在4￣13条之间,平均为6.55条。五个品种(系)间的亲缘关系符合它们的育种背景[1,2,3]。     

基于ISSR分子标记分析陆川猪种群遗传差异

试验旨在探究陆川猪种群之间的遗传差异,对陆川猪种群进行遗传多样性分析,为种质改良与创新提供参考。以29份陆川猪种及部分广西地方猪种样品为试验材料,采用了3条带型清晰、重复性好的ISSR引物,通过对PCR扩增及电泳得到的DNA片段条带进行聚类分析并构建聚类树状图,并对陆川猪种群进行遗传差异分析。结果显示,ISSR分子标记上共发现182条条带,其中84条多态性条带,3条ISSR引物扩增出来的总DNA片段条带与多态性DNA片段条带差异较大且分布不均匀,表明所选择的3个ISSR分子标记在陆川猪种群中具有丰富的多态性;陆川猪种群之间遗传相似系数变异范围为0.43~1.00,表明种群间的遗传差异变化较大,遗传背景丰富;UPGMA聚类分析表明,陆川猪与长陆二元杂猪、巴马香猪、环江香猪均可聚为一类,大陆二元杂猪、三元杂猪和龙宝猪聚为一类。本研究证实了所选的3条ISSR引物可作为有效的遗传标记用于陆川猪种群间的遗传差异分析,丰富了当前的陆川猪ISSR分子标记资源,同时也表明陆川猪种群具有丰富的遗传多样性。     

Comparison of Greek breeds of horses using RAPD markers

To assess genetic markers able to distinguish between five Greek breeds of horses, the random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique was used. A total of 40 primers were initially screened in all breeds to identify primers that consistently revealed well-amplified, polymorphic bands. Despite the variability that was found within breeds, no specific RAPD marker for the discrimination of the breeds was detected. This is probably due to the extensive cross-breeding that has taken place over the years, resulting in a mixing of breeds. The high phenotypic divergence of the pony of Skyros from all the other Greek breeds of horses could be explained in terms of micro-evolutionary processes, such as natural selection owing to differential fitness. In addition, to determine the genetic affinities between breeds, all samples were screened with five primers. These primers produced a total of 93 bands, 51 of which were polymorphic. Data analysis for genetic polymorphism revealed a degree of divergence between breeds. According to the discriminant analysis (DA) classification, 100% of the individuals examined in this study could be classified correctly into their breeds. The results of this study show that RAPDs could be a powerful tool for the classification testing of individual horses, as well as for the determination of the genetic variation found among breeds, which is important for a proper management policy designed to protect this species.     

利用SSR分子标记构建四倍体杂交冰草的遗传连锁图谱

为构建四倍体杂交冰草分子遗传连锁图谱,对深入开展冰草产量、抗性等重要性状的QTL定位及分子标记辅助育种提供依据,以四倍体杂种F₂分离群体的347个单株及亲本蒙古冰草和航道冰草为材料,采用SSR分子标记技术和Joinmap 4.0软件进行了遗传作图研究。试验从256对SSR引物中筛选出条带清晰稳定、多态性丰富的适宜引物30对,PCR扩增得到224个SSR标记位点,平均每对引物扩增出7.47个位点,其中多态性标记位点185个,占82.6%。偏分离分析显示,在185个SSR多态性标记位点中有24个标记产生偏分离,占13.0%,符合植物遗传作图时通常偏分离标记比率<30%的要求,可用于遗传作图。构建了1张四倍体杂交冰草的分子遗传连锁框架图谱,该图谱包含14个连锁群、185个标记,其长度范围在123.0~202.6 cM之间,连锁群LG4最长、LG12最短,各连锁群的平均长度167.32 cM,覆盖基因组总长度2342.5 cM,标记间的平均距离12.66 cM。