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杏RAPD两种凝胶电泳指纹特点及PCR扩增片段的序列分析 总被引:1,自引:0,他引:1
为更好地将RAPD技术应用于杏品种资源鉴定及遗传基础的研究,文章首次在选用11碱基长度引物的优化技术体系基础上,分别使用两种凝胶对16个杏品种RAPD的PCR扩增产物进行电泳检测与DNA指纹比较。结果表明,聚丙烯酰胺凝胶电泳检测出的谱带总数量以及多态性谱带的数量均高于琼脂糖凝胶,前者不存在或很少存在共迁移性的现象。根据两种电泳系统获得的标记信息对16个杏品种的遗传关系的分析发现,两者聚类结果存在一定差异。以此,提出了科学利用两种电泳的RAPD标记技术的策略。对随机挑选的24个片段进行克隆与测序,结果发现24个片段都是对应引物的RAPD扩增产物。在不同的11条序列中有3条是编码蛋白的基因片段,说明了RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时可以扩增编码蛋白的基因片段,能够较全面客观地反映不同杏品种间遗传上的差异。 相似文献
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枇杷RAPD扩增产物的不同电泳检测及其序列特征分析 总被引:1,自引:0,他引:1
为了更好地将RAPD技术应用于枇杷品种资源的鉴定以及遗传基础的研究,在选用11个碱基引物以及严格筛选PCR退火温度的最新RAPD技术优化的基础上,以16个枇杷品种为试验材料,对琼脂糖凝胶以及聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测的RAPD PCR扩增产物效果进行比较。结果表明,聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测出的总谱带数以及多态性谱带数均高于琼脂糖凝胶。根据两种电泳系统获得的标记信息进行枇杷品种遗传聚类分析,结果表明PAGE电泳的分析结果与枇杷的分类情况更为一致。随机对挑选的38个片段进行克隆与测序,发现37个片段都是对应引物的RAPD扩增产物,其中有6条是编码蛋白的基因片段,说明RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,而且可以扩增编码蛋白的基因片段,是能够揭示枇杷品种间基因组信息异同的理想的DNA标记技术。 相似文献
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以16个桃品种为试验材料,选用11个碱基引物以及严格筛选PCR退火温度的RAPD技术,对琼脂糖凝胶及聚丙烯酰胺凝胶电泳检测的RAPD、PCR扩增产物进行比较.结果表明,聚丙烯酰胺凝胶电泳检测出的总谱带及多态性谱带数均高于琼脂糖凝胶,前者不存在或少存在共迁移性的现象.随机选取19个片段,发现其中有6条是编码蛋白的基因片段,说明RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时可扩增编码蛋白的基因片段,能够较全面客观地反映不同桃品种遗传上的差异. 相似文献
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通过2;(w/v)的琼脂糖凝胶和8;(w/v)的聚丙烯酰胺凝胶电泳对扁桃品种基因组DNA的RAPD检测.结果表明:8;(w/v)聚丙烯酰胺凝胶优于2;(w/v)琼脂糖凝胶,主要表现在,8;聚丙烯酰胺凝胶对长度相差100 bp以下的DNA分子的分离较2;的琼脂糖凝胶电泳效果好;且8;聚丙烯酰胺凝胶的分辨范围广,在线性DNA分子(0.1~2.0 kb)范围内也能得到很好的分离效果;用8;的聚丙烯酰胺凝胶分离扁桃品种基因组DNA的RAPD扩增结果,表现出在扁桃品种间DNA水平上差异大,运用此方法提高了扁桃品种的鉴别能力. 相似文献
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永川梨橙1号和永川梨橙5号是优良芽变材料,为确定这两份材料的性状究竞属于遗传变异还是环境饰变及其来源,实验采用RAPD对永川梨橙1号、永川梨橙5号和普通梨橙、锦橙一起进行了分析。结果表明:在70个引物中有6个引物可扩增出条带,共计94条,其中多态性条带数为27条,平均每个引物出现多态带4.5条。特别是引物J039、S150和S304可清晰的区分开这4份材料。聚类分析发现,梨橙和锦橙遗传相似系数在90%左右,永川梨橙1号与普通梨橙遗传上最为相似,而永川梨橙5号与梨橙亲缘关系则相对较远,表明其发生了较大程度的变异,这与其生物学性状的表现是吻合的。 相似文献
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防风及其近缘种的RAPD分析 总被引:2,自引:0,他引:2
采用RAPD分子标识法对防风Saposhnikoviadivaricata(Turcz.)Schischk,硬苗防风Friocyclaalbescens(Franch).wolff,竹节防风P.dielsianumFeddeexwolff,前胡PeucedanumledebourieuoidesK,T,Fu,葛缕子CurumCarvil进行亲缘关系分析。利用SDS法提取防风及其近似种的总DNA,以随机引物进行随机扩增。从100个引物中筛选出8个有效引物,通过距离系数UPGMA法聚类分析,构建聚类关系树系图,获得了理想的RAPD。结果表明,RAPD法可准确鉴定正品防风及其近似种。 相似文献
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山茶属植物RAPD分析中琼脂糖凝胶电泳条件的研究 总被引:8,自引:2,他引:6
为了摸索适宜于山茶属植物DNA琼脂糖凝胶电泳分析,分析了电压,缓冲液,琼脂糖密度、EB(Ethyle Bromide)密度染色时间及操作方法对山茶属植物RAPD分析中琼脂糖凝胶电泳实验结果的影响。结果表明,适宜于山茶属植物DNA琼脂糖凝胶电泳条件是:琼脂糖凝胶密度为18g/L,电泳缓冲液为TBE,电压为6 ̄9V/cm,电泳时间为溴酚兰和二甲苯青之间跑出约5cm,电泳开始时先让缓冲液与凝胶保持水平电 相似文献
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砀山酥梨自然保护区梨种质资源RAPD分析 总被引:1,自引:0,他引:1
利用RAPD技术,采用从80个随机引物中筛选的12个随机引物,对砀山地区梨树24个品种的基因组DNA进行扩增,通过3种编码方式(0-1编码,0-3编码,强带编码)对扩增的谱带进行标记并进行聚类分析.结果表明,运用特异性条带可鉴定梨树的品种类型、营养系变异和杂交种;白梨与沙梨具有较近的亲缘关系.在RAPD带型分析中,以0-3编码比0-1编码和强带编码反映的信息更全面. 相似文献
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以金花梨及其12个变异系为材料,进行了梨黑星病抗性的田间调查。再以金花梨及其18个变异系为试材,采用改进的CTAB法提取基因组DNA进行RAPD分析。结果表明,金花梨各变异单系的梨黑星病抗性发生了一定程度的变异,其中J4抗梨黑星病能力最强,其次为J10、J14、J5、J15;经RAPD分析,发现所用40个引物中有5个引物扩增出多态性,证明金花梨各变异单系在基因上发生了变化,为其抗病性发生变异的真实性提供了证据。 相似文献
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库尔勒香梨基因组DNA提取及RAPD体系建立 总被引:22,自引:1,他引:21
通过比较试验,使用SDS-氯仿-异戊醇法,添加BME及Vc,简便、快速地从库尔勒香梨成熟叶中提取大分子量DNA,有效地去除了梨属植物组织中所含的多酚类、单宁、色素及多糖类物质,该DNA能很好地被酶切并用于RAPD分析。 相似文献
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金花梨基因组DNA提取及其RAPD分析 总被引:4,自引:0,他引:4
以金花梨嫩芽为试材 ,通过在磨样时添加不同量的抗氧化剂Vc ,对CTAB法作了一定的改进 ,比较了不同处理的提取效果 ,再分别以成熟叶片、新梢和嫩芽为材料 ,采用改进的CTAB法提取基因组DNA ,进一步比较了不同材料的提取效果 ,并以金花梨及其 18个变异单系的基因组DNA为模板 ,4 0个随机引物进行RAPD分析。结果表明 :以嫩芽为试材 ,在磨样时每克鲜样添加 0 10g的Vc ,能够提取到高质量的基因组DNA ;采用改进的CTAB法 ,用成熟叶片、新梢和嫩芽均能提取到可直接用于RAPD分析的基因组DNA ;大部分引物可以在不同模板上扩增出条带 ,但仅有 5个引物可以同时在金花梨及其 18个变异单系基因组DNA上扩增出条带 ;用RAPD结果对金花梨及其 18个变异单系进行聚类分析 相似文献
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本试验对3种新型高效杀虫剂防治梨木虱进行试验研究。试验结果表明,百磷3号、甲基异柳磷和水胺硫磷对梨木虱均有较好的防治效果,施药后 15 d的防效分别为 93.3%、92.4 %和 89.4%。 相似文献
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新疆梨种质资源亲缘关系的ISSR和RAPD分析 总被引:3,自引:0,他引:3
[目的]探讨新疆梨种质资源亲缘关系以及遗传多样性,旨在为供试梨资源的分类提供科学依据.[方法]采用ISSR和RAPD分子标记对48份梨种质资源进行聚类分析和遗传关系研究.[结果]14条ISSR引物共扩增出113条清晰的谱带,其中101条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.19条RAPD引物共扩增出163条清晰的谱带,其中多态性谱带138条,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.基于ISSR和RAPD两种标记,利用UPGMA分别构建了48份梨资源的聚类树状图.ISSR和RAPD分别聚类以及两种标记混合聚类均将48份梨种质分为3类:第Ⅰ类群中包括1份种质;第Ⅱ类群中包括23份种质;第Ⅲ类群中包括24份种质.[结论]两种标记适合于梨种质资源亲缘关系和遗传多样性分析,可为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据. 相似文献