微孔草Actin基因核心片段的克隆及序列分析

提取微孔草Microula sikkimensis叶片的总RNA,并以其为模板,运用RT-PCR方法扩增出Actin基因的核心序列。通过连接、转化后对阳性克隆进行PCR鉴定并测序,序列分析结果表明:微孔草Actin基因核心片段长599 bp,编码199个氨基酸。将该序列与GenBank中已注册的植物Actin基因序列进行同源性比较,发现它们之间的同源性在84%以上,氨基酸序列同源性在95%以上,具有高度的保守性。     

蒙农杂种冰草AcdMYB1基因克隆及表达分析

‘蒙农杂种’冰草(Agropyron cristatum×A.desertorum‘Hycrest-Mengnong’)具有干草产量高，适口性好，抗逆性强的特点，是中国北方干旱地区建立人工草地的适宜草种。本研究利用同源克隆方法从‘蒙农杂种’冰草中克隆得到的1个MYB类转录因子基因(命名为AcdMYB1),对其进行了生物信息学分析和表达分析。结果表明：该基因cDNA序列长度为1 161 bp,包含完整开放阅读框(ORF)为969 bp,编码322个氨基酸，具有MYB转录因子的保守结构域。AcdMYB1与小麦族的山羊草、普通小麦、野生二粒小麦的同类基因亲缘关系最近，序列一致性均在90%以上。组织表达中AcdMYB1基因在穗中的表达量最高，其次为叶、根，茎中表达量最低；在模拟自然干旱胁迫下，能够显著降低AcdMYB1的表达水平。烟草亚细胞定位显示，该蛋白定位于细胞核。本研究为进一步探索‘蒙农杂种’冰草AcdMYB1基因及MYB转录因子家族提供了科学依据。     

塔乌库姆冰草肌动蛋白基因片段的克隆及序列分析

根据其他植物Actin基因的保守序列设计一对简引并性物,以塔乌库姆冰草叶片总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增出Actin基因片段并连接到载体上,阳性克隆经PCR检测后进行测序。结果表明：该片段长约600bp,编码199个氨基酸,所得序列与GenBank中注册的其他植物Actin基因序列同源性均在81%以上,与其他肌动蛋白的氨基酸序列同源性达88%。     

盐生草Actin基因片段的克隆及表达

根据藜科植物的肌动蛋白(Actin)基因编码区保守序列设计一对简并引物,提取盐生草(Halogeton glomeratus)叶片的总RNA,运用RT-PCR技术扩增出Actin基因的核心序列并连接到pMD19-T载体,阳性克隆经PCR检测后进行测序。序列分析表明,盐生草Actin基因核心序列长度为598bp,编码198个氨基酸,并在GenBank中注册,登录号为KF699314,由盐生草Actin基因推导的氨基酸序列与其他几种耐盐植物的同源性均在94%以上,具有高度的保守性。采用荧光定量RT-PCR技术分析其Actin基因在盐生草不同器官的表达情况,结果显示其表达量恒定无差异,表明克隆的Actin基因可作为盐生草内参基因来研究其相关耐盐基因的表达。     

蓖麻蚕核型多角体病毒p6.9基因的克隆及序列分析

基于丰富蓖麻蚕核型多角体病毒(Philosamia cynthia ricininucleopolyhedrovirus,PcrNPV)分子信息的目的,对PcrNPV DNA部分片段进行了测序分析,获得1个DNA结合蛋白基因p6.9的完整序列。该基因的读码框由240个核苷酸组成,编码79个氨基酸,分子质量约为9.8 kD,转录起始位点ATG侧翼序列符合Kozak规则,其上游34bp处具有晚期基因转录的保守起始序列taag,表明该基因为晚期表达基因。将PcrNPV与12种昆虫核型多角体病毒P6.9蛋白氨基酸序列作同源性比较的结果显示:PcrNPV P6.9蛋白氨基酸序列与家蚕(Bombyx mori)NPV P6.9的同源性为59%,与柞蚕(Antheraea pernyi)NPV的同源性为100%,表明PcrNPV与ApNPV的亲缘关系很近。     

蒙古冰草肌动蛋白基因(MwACT2)克隆与表达分析

本研究应用RT-PCR和RACE技术,从蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)中分离到1个肌动蛋白基因,命名为MwACT2。序列分析表明:MwACT2基因全长1506bp,含有1个1131bp的开放型阅读框,MwACT2蛋白长度为376个氨基酸残基,分子量为41.606KDa,理论等电点为5.29,含有actin保守位点,属于actin家族成员。该基因编码的氨基酸序列与Genebank中乌拉尔图(Triticum_urartu)肌动蛋白(登录号:EMS62134.1)氨基酸具有99%的一致性,属于非跨膜蛋白。利用半定量RT-PCR技术分析MwACT2基因的表达,结果表明该基因表达稳定,经高盐、干旱、低温处理后的表达强度无显著差异。     

猪IP-10蛋白真核表达载体的构建

根据GenBank上发表的猪IP-10蛋白的核苷酸序列设计并合成1对特异性引物,采用RT-PCR方法扩增出目的片段,将扩增产物连接到表达载体pcDNA3.1上,进行序列测定和分析。结果表明,所克隆的目的基因的核苷酸长为312bp,共编码104个氨基酸。该基因片段与已发表的猪IP-10蛋白基因核苷酸序列同源性为100%,氨基酸同源性为100%。本试验为重组猪IP-10蛋白的生产及功能研究奠定了基础。     

山羊卵巢组织繁殖力相关差异表达基因片段的生物信息学分析

为考察山羊多羔性的遗传基础,以不同繁殖力的河北中部本地固有山羊为研究对象,在发情期卵巢组织用差异表达PCR方法筛查到4条基因差异片段作为山羊繁殖力性状候选基因。对这些候选基因进行同源性和转录因子结合位点分析,发现4个差异片段中2条为新发现的表达片段。1条与野猪中获得的克隆片段THY010003E05的同源性为81%,但功能未知。另1条差异片段的序列与牛pcnp的mRNA序列的同源性为94%,并据此对山羊pcnp基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学的相关软件和方法,对山羊PC-NP蛋白的理化性质、二级结构、信号肽、核定位序列、磷酸化位点、跨膜区域以及蛋白质功能域等进行预测。结果,山羊pcnp基因完整CDS序列与牛的pcnp基因完整CDS序列同源性为100%,编码区为537bp,编码179个氨基酸;推测与其他已报道的物种一样,山羊PCNP蛋白也是主要位于细胞核中的亲水蛋白,二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主,局部为延伸链和β转角;预测出与PCNP蛋白相互作用的5种蛋白,另外还发现了3个LCR(Lowcomplexity region)区域。由此推测,PCNP在物种间相对保守,而且其最可能在细胞核中行使功能,对细胞周期或某些基因的表达产生影响,进而影响山羊繁殖力。     

冰草P基因组ISSR扩增特异DNA片段的克隆及序列分析

利用回收特异ISSR扩增片段的方法,从冰草中分离到1个P基因组特异DNA片段--UBC811535.经克隆、Southern杂交、测序和生物信息学分析表明,片段的序列长535bp,G+C含量为44%,片段相对小麦族A、B、D、V、H、Ns、R、St等基因组是特异的,与小麦Em基因的一段存在66%的同源性,与GenBank上注册的其他序列同源性较低,是冰草P基因组新的特异DNA序列(GenBank登录号为EU652952).序列中含有200bp以上的开放阅读框架,但无终止密码子,可能为基因的一部分.     

紫花苜蓿肌动蛋白基因的提取

选取紫花苜蓿叶片为材料,提取总RNA,利用蒺藜状苜蓿的肌动蛋白基因设计特异性引物,扩增出目的基因的cDNA进行测序,测序结果在NCBI基因库中利用Blast与其他高等植物肌动蛋白基因序列进行了比对、分析,结果证明所提取的基因为紫花苜蓿肌动蛋白基因的片段。     

Evaluation of the cardiac actin gene in Doberman Pinschers with dilated cardiomyopathy

OBJECTIVE: To evaluate the coding region of the cardiac actin gene in Doberman Pinschers with dilated cardiomyopathy (DCM) for mutations that could be responsible for the development of the condition ANIMALS: 28 dogs (16 Doberman Pinschers with DCM and 12 mixed-breed control dogs). PROCEDURE: Ten milliliters of blood was collected from each dog for DNA extraction. Polymerase chain reaction (PCR) primers were designed to amplify canine exonic regions, using the sequences of exons 2 to 6 of the cardiac actin gene. Single-stranded conformational polymorphism analysis was performed for each exon with all samples. Autoradiographs were analyzed for banding patterns specific to affected dogs. The DNA sequencing was performed on a selected group of affected and control dogs. RESULTS: Molecular analysis of exons 2 to 6 of the cardiac actin gene did not reveal any differences in base pairs between affected dogs and control dogs selected for DNA evaluation. CONCLUSIONS: Mutations in exons 5 and 6 of the cardiac actin gene that have been reported in humans with familial DCM do not appear to be the cause of familial DCM in Doberman Pinschers. Additionally, evaluation of exons 2 to 6 for causative mutations did not reveal a cause for inherited DCM in these Doberman Pinschers. Although there is evidence that DCM in Doberman Pinschers is an inherited problem, a molecular basis for this condition remains unresolved. Evaluation of other genes coding for cytoskeletal proteins is warranted.     

西伯利亚白刺肌动蛋白基因的分离与特性分析

利用兼并PCR及RACE技术克隆了西伯利亚白刺的肌动蛋白基因(Nitraria sibirica Actin, NsAct),并对其基因结构和表达特性进行了分析。所克隆的NsAct cDNA全长序列为1 831 bp,包含1 134 bp的开放阅读框,编码377个氨基酸;基因组DNA全长序列为2 913 bp,包含5个外显子和4个内含子。系统进化分析结果显示,NsAct与其他植物的肌动蛋白基因具有较高的同源性,与芒果(无患子目)亲缘关系最为接近。基因表达特性分析的结果显示,该基因在根、茎、叶中的表达量基本一致;在干旱、盐、低温及外源脱落酸胁迫下,表达量无明显变化,这些结果验证了该基因作为分子内标的可靠性。     

绿色荧光蛋白在家蚕细胞中的表达

利用家蚕细胞质肌动蛋白基因（A3）启动子和NPV病毒即刻早期蛋白IE启动子在家蚕细胞中表达GFP，实验结果表明是可行与有效的。     

安氏隐孢子虫肌动蛋白部分编码基因的表达及免疫保护性

以筛选安氏隐孢子虫T7噬菌体展示文库获得的肌动蛋白（CA42）部分编码基因的序列设计特异性引物,扩增目的基因CA42,构建重组表达载体pET-28a-CA42,通过大肠杆菌BL21的诱导表达,产物经SDS-PAGE和Western-blotting鉴定。然后纯化重组蛋白,免疫BALB／c进行体液和细胞免疫水平的检测,并观察重组蛋白对微小隐孢子虫的交叉保护性效果。结果显示,成功构建重组原核表达质粒pET-28a-CA42,Western-blotting显示重组蛋白约为19ku,能被安氏隐孢子虫免疫小鼠的多克隆抗体识别。重组蛋白免疫BALB／c小鼠的抗体水平差异显著（P〈0．05）,CD4^＋T淋巴细胞数差异均显著,CD4^4／CD8^＋T淋巴细胞数的值与佐剂对照组和空白对照组相比差异均显著（P〈0．05）。各组小鼠经接种微小隐孢子虫卵囊后,试验组与各对照组相比卵囊减少率为32．2％,差异均显著（P〈0．05）。结果表明,成功表达了重组安氏隐孢子虫肌动蛋白,纯化的重组蛋白具有一定的免疫原性和交叉保护性。     

斯氏艾美尔球虫肌动蛋白解聚因子在HeLa细胞中的表达

为真核表达斯氏艾美尔球虫(Eimeria stiedae)肌动蛋白解聚因子(ADF)基因,本研究采用RT-PCR技术扩增ADF基因,构建pVAX- 1-ADF真核重组质粒,并转染HeLa细胞.采用RT-PCR方法检测ADF mRNA转录水平、western blot检测ADF蛋白表达水平.琼脂糖凝胶电泳结果表明PCR扩增出一条大小为350 bp的特异性片段,与预期值相符.Western blot检测显示,转染pVAX- 1-ADF的HeLa细胞在大约13ku处出现特异性表达条带,与预期值相符.本研究构建了E.stiedae ADF基因真核表达质粒pVAX- 1-ADF,并且在体外真核细胞中表达,为进一步寻找防治E.stiedae的疫苗候选基因奠定了基础.     

Biological potentials for a family of disintegrin and metalloproteinase (ADAMDEC)-1 in mouse normal pregnancy

Our previous research has indicated local expression of ADAMDEC-1, a family of disintegrin and metalloproteinase, was confirmed in the mouse placentas and enhancement was found in the sites for spontaneous abortion. Present study was aimed to identify biological effects of ADAMDEC-1 in pregnancy process. Syngeneic pairs of C57BL/6J mice and heterogenic mating pairs of CBA/J and DBA/2 mice were used. Pregnant mice were treated with recombinant ADAMDEC-1 protein. Vasculogenesis effects was evaluated using the Matrigel plugs including vascular endothelial growth factor singularity or combination with ADAMDEC-1. ADAMDEC-1 single effects were evaluated by tubal formation and proliferation assays using HuEht-1 endothelial cells. Expression of ADAMDEC-1 was not exactly corresponded with the time periods for miscarriage initiation. ADAMDEC-1 was distributed in normal placentas and fetuses, especially at extraembryonic ectoderm, decidua cells, uterine natural killer (uNK) cells in decidua, trophoblasts in labyrinthine zone, and hematopoietic cells in umbilical blood and fetal liver. ADAMDEC-1 treatment did not affect reproductive performances, while it elevated uNK cell recruitment in placenta and enlarged lumen sizes of the intraplacental vessels. In vitro analysis also indicated ADAMDEC-1 promoting effect on tubal formation and cell length of HuEht-1. qPCR analysis showed that ADAMDEC-1 modified placental gene expression especially for linkage of actin filament rearrangement. Our findings suggested that ADAMDEC-1 is correlated on cell shape, stability, and movement via modification of actin cytoskeleton. ADMADEC-1 suspected to regulate cellular activity of endothelial cells, trophoblasts, and uNK cells and may support normal developing of mouse placentas.     

Changes in Actin Distribution of Ram Spermatozoa under Different Experimental Conditions

The purpose of this study was to determine the presence of actin in ejaculated ram spermatozoa and the changes of localization that actin undergoes as a consequence of certain in vitro -induced physiological states. Using indirect immunofluorescence (IIF), three different patterns of staining (defined immunotypes) were established in ejaculated sperm. The three sperm immunotypes showed actin labelling in flagellum, neck and post-acrosomal area, differing on the labelling in the acrosomal region that was complete in immunotype 1, partial (frequently concentrated in the apical area, punctuate form) in immunotype 2, and totally absent in immunotype 3. The main subpopulation in ejaculate was immunotype 1 that represented 68% of total sperm, while 21% corresponded to immunotype 2 and only 10% corresponded to immunotype 3. Selection of high-quality sperm using a dextran/swim-up procedure hardly influenced the proportion of each immunotype resulting in a slight increase in type 1 sperm. Cold-shock treatment and in vitro capacitation induced a partial loss of actin labelling in the acrosomal area, whereas the ionophore-induced acrosomal exocytosis provoked a total loss of the acrosomal actin labelling, a phenomenon partially inhibited by phalloidin.     

结缕草肌动蛋白基因全长cDNA的克隆及序列分析

根据植物肌动蛋白(Actin)基因编码区的保守序列设计引物,提取结缕草叶片的总RNA,进行RT-PCR。并采用RACE技术扩增出1560bp的Actin基因全长cDNA序列。序列分析表明,该基因的开放阅读框(ORF)为1134bp,编码377个氨基酸,5′非编码区117bp,3′非编码区309bp。所得序列与GenBank中收录的其他植物肌动蛋白核苷酸序列的一致性均在85%以上,氨基酸序列的一致性高达97%以上。将其命名为ZjACT,GenBank登录号为GU290545。根据高等植物肌动蛋白相似性构建的系统进化树显示,结缕草肌动蛋白与大麦和圆锥小麦肌动蛋白之间的亲缘关系最为密切,在进化中分化时间最为接近。进一步分离克隆了结缕草Actin基因的基因组DNA序列(登录号GU290546),它由4个外显子和3个内含子组成。本研究有助于揭示植物Actin基因家族的进化历史,为研究植物Actin基因家族功能和进化上的多样性奠定理论基础,同时也为开展草坪草和牧草Actin基因的功能分析和利用研究提供参考。