马尾松种质资源遗传多样性的ISSR分析

以35份马尾松种质资源为材料,研究马尾松嫩梢基因组DNA提取的最适方法;建立并优化马尾松ISSR反应体系;采用ISSR标记,结合聚类分析,对我国马尾松种质资源的遗传多样性进行了研究。结果表明:16条引物共扩增出153个条带,多态位点136个,每个引物检测到的条带数介于6~14之间;根据35份马尾松各资源的遗传系数进行聚类,可将35份资源划分为4个大类,即福建邵武、浙江仙居、江西德兴、福建连城各为1类,其余31份资源为1大类。     

湖北省马尾松天然群体的遗传变异和遗传多样性研究

运用同工酶电泳技术对马尾松天然群体的遗传多样性进行了研究,分析了湖北省的7个马尾松天然群体的遗传多样性。结果表明:湖北省的马尾松群体具有较高的变异水平;整个群体的多态位点百分率为1.00,等位基因数为3.63,期望杂合度为0.262;群体内杂合体不足,纯合体过量,处于非平衡状态。     

广西种源红锥栽培群体遗传多样性评价

[目的]揭示红锥栽培群体遗传多样性水平和结构。[方法]采用ISSR分子标记技术对人工选育的广西3个种源的红锥居群进行遗传多样性分析。[结果]9条引物共扩增出113条带,其中62条具有多态性,多态位点比例(PPF)为54.87%,单个居群的多态带百分率PPF为46.90%～47.79%。在物种水平上,期望杂合度(Hpop)和Shannon信息指数(I)分别为0.1366和0.2198。遗传分化系数GST为0.1275,表明经人工选育后的红锥遗传变异发生在居群内的个体占87.25%,12.75%的遗传变异发生在居群间。各群体之间的遗传一致度I为0.9593～0.9765,红锥群体水平的基因流Nm为3.423。[结论]ISSR-PCR方法可以有效地揭示红锥栽培群体遗传多样性水平和结构。     

西施舌不同群体遗传多样性ISSR分析

利用ISSR分子标记技术分析西施舌种群的遗传多样性和遗传分化.用17个引物对江苏赣榆(GY)、启东(QD)及福建长乐(CL)3个种群共68个个体进行扩增,共测到236个位点,其中多态位点234个,每个引物扩增条带数为8～20之间,片段长度200～3 000 bp;GY、QD和CL各种群的多态位点百分率(PPL)分别为94.92%、86.86%和90.25%;GY、QD和CL种群的Shannon's信息指数分别为:0.541 9、0.491 8和0.489 5;Nei's基因多指数分别为:0.370 0、0.336 1和0.330 1;西施舌各种群均具有较高的遗传多样性水平;聚类分析显示GY群体和QD群体先聚一起后,再与CL群体构成姐妹支.     

马尾松无性系苗期生长性状遗传多样性分析

选用桐棉种源马尾松优良单株10株为组培材料进行无性系繁育,以其0.5年生苗木为研究对象,对无性系的苗高、地径生长进行测定和差异显著性分析,利用加权系数法构建选择指数,对各无性系进行综合评价和初步选择。结果表明：无性系苗高生长介于15.9~24.2 cm之间,地径生长介于2.9~3.8 mm之间,无性系间表型性状变异十分丰富。无性系间苗高和地径生长差异均达到极显著水平(P < 0.01);无性系苗高、地径的重复力分别为0.96、0.91,说明生长性状主要受遗传控制;根据综合评价分析选出PC2和PC7两个无性系,其苗高和地径遗传增益分别为15.16%与13.33%和10.35%与5.04%,现实增益分别为15.79%与13.88%和11.44%与5.57%。     

马尾松1代育种群体不同种源亲本表现评价

为深入了解选自优良种源的育种亲本在遗传改良中的表现,以马尾松1代种子园半同胞子代测定试验林为研究对象,通过分析子代家系生长量、亲本育种值、实际改良增益及选择2代优树等,评价广西桐棉、古蓬、云开大山3个优良种源在马尾松传统改良中的表现与价值。结果表明,19年生马尾松一代种子园半同胞子代家系平均树高为15.99 m,平均胸径为19.66 cm,平均单株材积为0.246 0 m~3,比本地商品种和湿地松对照分别提高了65.10%和35.16%。与优良种源对照相比,获得了8.30%的树高实际改良增益、12.70%的胸径实际改良增益、33.33%的材积实际改良增益。来自不同种源的亲本在子代测定中的表现存在一定差异,在育种值方面,选自桐棉、古蓬、云开大山3个种源的亲本分别为0.001 2、-0.000 8、0.001 1。子代树高生长量以古蓬种源亲本最高,平均为16.11 m,胸径生长量以桐棉种源亲本最大,平均为19.86 cm。16株2代优树中,母本来自桐棉、古蓬、云开大山种源的分别有2、10、4株。母本来自云开大山种源的家系,生长表现非常突出的单株比例更高。结果还表明,亲本来自桐棉种源的家系相对桐棉种源混系对照在树高上获得了较高的实际改良增益;而来自古蓬种源的家系相对古蓬种源混系对照在胸径上获得了较大的实际改良增益。     

古银杏雄株的ISSR遗传多样性分析

应用ISSR分析技术对19个省市的97株古银杏雄株进行遗传多样性分析,并对它们的亲缘关系进行分析鉴定。结果表明:银杏雄株具有丰富的基因多样性和遗传多样性,选用的13个引物共扩增出114条DNA条带,其中多态性DNA条带83条,占72.8%;有效等位基因数为1.8117,基因多样度为0.4374,Shannon信息指数为0.6253;利用UPGMA法对扩增结果进行聚类分析,把97株古银杏雄株分为2大类,一类表现出较强的地理相关性,另一大类结果表明遗传距离与地理位置远近不完全相关。     

福建三明马尾松天然林空间结构特征研究

研究福建省三明市马尾松天然林角尺度、混交度、大小比数、开敞度和林层比5个空间结构参数,分析其空间结构特征。结果表明,马尾松天然林树种组成丰富,林分中共出现25个树种,其中马尾松为优势树种。全林分的角尺度均值为0.57,属于聚集分布;混交度均值为0.56,处于中度混交和强度混交之间;以胸径、树高和冠幅计算全林分的大小比数均值分别为0.49、0.48和0.53,均接近于中庸状态;开敞度均值为0.17,生长空间严重不足;林层比均值为0.43,垂直方向上的成层性较为简单。林分的空间稳定性较低。研究结果为该地区马尾松天然林经营提供了依据。     

福寿螺3个地理群体遗传多样性的ISSR分析

[目的]探讨我国不同地区福寿螺的遗传多样性和遗传结构。[方法]应用ISSR分子标记技术对我国江苏苏州、福建漳州、广东珠海3个不同地理群体福寿螺的遗传多样性和遗传结构进行了分析。[结果]从77个ISSR引物中筛选出3个引物对福寿螺3个群体60个样品进行扩增,得到33个清晰的扩增位点,多态位点为31个。江苏、福建和广东3个福寿螺群体的Shannon′s指数分别为0.353 6、0.424 70、.279 6,由此分析,其遗传变异主要来自于群体内个体间。福寿螺UPGMA聚类图显示,广东群体和福建群体首先聚在一起,再与江苏群体聚类。3个群体的遗传多样性处于相同水平上,且遗传多样性高低依次为福建群体>江苏群体>广东群体。[结论]3个地区福寿螺群体产生一定的遗传分化,表明福寿螺具有广适性的遗传特性。     

猫爪草遗传多样性的ISSR分析

应用ISSR分子标记技术对信阳5种叶型猫爪草进行了ISSR分析,探索不同叶型猫爪草间的遗传多样性。结果表明,11个ISSR引物共扩增出137条带,多态性条带106条,多态性比率为77.37%。引物ISSR12能够区分猫爪草的5种叶型。提示ISSR标记适合于构建猫爪草的DNA指纹图谱、品种鉴定和遗传多样性分析。     

广西古蓬,水浪种源马尾松天然林的ISSR分析

摘　要：　利用ISSR分子标记技术对广西古蓬和水浪两个种源区的马尾松天然林中共85个样品进行遗传多样性分析,从100个ISSR引物中共筛选出10个多态性引物,对这85个马尾松个体进行PCR-ISSR扩增,其中古蓬47个样品三个组共检测到192个位点,其中多态位点数为177个,水浪38个样品两个组共检测到168个多态位点。对两个种源马尾松采用POPgene 32 软件进行分析,结果表明：在古蓬马尾松天然林群体内,总的多态位点百分率（P）为94.35%,总的Shannon信息指数（I）为0.4278,Nei’s基因多样度指数（h）为0.2765;而水浪种源的马尾松群体内,总的多态位点百分率（P）为94.38 %,总的Shannon信息指数（I）为0.5190,Nei’s基因多样度指数（h）为0.3510;表明种水平的遗传多样性较高。古蓬马尾松组间的基因分化系数（Gst）为0.0481,水浪的为0.0363。表明马尾松的主要变异存在于组间,古蓬3个组的基因流为9.8877。水浪两个组的基因流为13.2643,表明基因流不是引起马尾松组间分化的主要因素。     

Genetic Diversity of Natural Myrica rubra Sieb.et Zucc Populations in Guangxi Revealed by ISSR Markers

The present study was conducted to assess the molecular characterization and genetic diversity amongst natural populations of Myrica rubra in Guangxi Zhuang Autonomous Region, China, thus to provide scientific evidence for germplasm conservation and exploitation. Using ISSR （inter-simple sequence repeats） markers, the level of genetic variation and the molecular characterization of 10 natural populations of M. rubra, originated from Guangxi Zhuang Autonomous Region in China, were performed. Based on 11 primers, 123 clear and reproducible DNA fragments were generated, of which 95 （77.24%） were polymorphic. The average value of Nei＇s gene diversity （He） was 0.268. The coefficient of genetic differentiation （Gst） was 0.341, revealing that 34.1% of the total molecular variance existed among populations. The Mantel statistical testing showed that the genetic distance was correlated to the geographic distance, but the correlation was not significant. Ten populations were divided into two big clusters according to unweighted pair group method with arithmetic mean （UPGMA） analysis. One consisted of populations of Rongxian （RX）, Hepu （HP）, Liangqing （LQ）, Marshan （MS）, Lingshan （LS） and Shansi （SS）, which originated from the southern Guangxi, while the other was composed of Guanyang （GY） and Lingui （LG） populations of northern Guangxi, Huanjiang （HJ） populations of northwestern Guangxi and Shanglin （SL） populations of southern Guangxi. The level of genetic variation in wild M. rubra population distributed in Guangxi is high. Gene drift within the population was responsible for genetic variation in wild M. rubra in Guangxi, and the effect of the genetic flow among inter-populations was not significant. Classification of wild M. rubra populations was correlated to climate and environment. The molecular characterization and diversity assessment of M. rubra is of immense value for planning conservation of its genetic resources and their exploitation for further studies.     

ISSR标记在生姜品种遗传多样性中的应用

以8个姜品种的芽为试验材料,利用ISSR分子标记技术对它们进行遗传多样性分析。结果表明：筛选出的24条ISSR引物,共扩增出166个条带,其中55条为多态性条带,多态性比率为35.67%;8个姜品种的遗传距离在0.212 8~0.842 1之间,在λ=0.44处,可将供试的8品种分为3大类。供试8个姜品种多态性不高,5个自育品种和其他3个供试品种在遗传距离、亲缘关系、聚类结果各不相同,可进一步进行研究。     

海南逸生辣椒遗传多样性的ISSR分析

为了探明海南7个逸生辣椒品种的亲缘关系,为地方辣椒种质资源的合理利用与科学保护提供依据,采用ISSR分子标记技术对采自海南农村的7个逸生辣椒品种进行多态性和聚类分析。结果表明:1)从19对ISSR引物中筛选出12对进行PCR扩增,共扩增出50条DNA条带,多态性条带45条,多态率达87.22%。2)聚类分析将海南7个逸生辣椒品种分为2大类,簇生椒归为一类,其余6个品种的遗传距离相近,归为小米椒+朝天椒类。3)按海拔进行聚类分析发现,低海拔对辣椒的遗传多样性表现出规律性的变化。     

贵州天门冬种质资源遗传多样性的ISSR分析

为了给合理地保护、利用与开发天门冬种质资源提供科学依据,采用ISSR分子标记技术对分布于贵州省不同生态环境的24份天门冬材料进行了遗传多样性分析。结果表明,8个引物共扩增出多态性带158条,多态性位点百分率为98%;材料间遗传相似系数在0.670 8～0.993 8,平均值为0.765 7。ISSR技术适合分析天门冬的遗传多样性,贵州天门冬具有较丰富的遗传多样性,可分为4个大类,野生种基本符合地域性分布规律。     

樱亚属部分园艺品种遗传多样性的ISSR分析

为探究樱亚属部分园艺品种的亲缘关系和遗传多样性,运用ISSR分子标记从100条引物中筛选出15条多态性好的引物对208份樱花品种进行遗传分析。结果表明：15条引物共扩增出91条清晰条带,其中83条具有多态性,平均多态性条带比率为91.21%。樱花品种水平上多态位点百分率(PPB)达94.03%,Nei′s基因多样性指数(H)为0.309.5,Shannon′s信息指数(I)为0.466.7。各栽培区平均PPB为55.65%,H为0.199 9,I为0.298 0,各遗传参数均以浙江地区的最大,福建地区的最小。总的基因多样度(H_t)为0.310 7,地区间基因分化系数(G_st)为0.356 6。Nei′s遗传距离和遗传相似系数的UPGMA聚类分析结果一致,可将208份品种分为2类,一类为福建、山东和云南地区的品种,另一类为贵州、湖北、浙江和上海的品种。樱花品种具有丰富的遗传多样性,遗传变异主要存在于地区内,品种分布具有明显的地域特征。     

缅甸蟒养殖种群的遗传多样性分析

利用微卫星标记分析缅甸蟒养殖群体的遗传多样性,结果表明：在42个缅甸蟒个体中,共检测到76个等位基因,平均有效等位基因数为578个,平均期望杂合度为0815,平均多态信息含量为078,8个微卫星位点呈现高度多态性;仅有3个位点显著偏离了Hardy Weinberg平衡;缅甸蟒海南养殖群体表现出较高的遗传多样性水平。突变-漂移平衡分析结果表明,群体部分位点杂合显著过剩,并未显著偏离突变-漂移平衡,近期没有经历过瓶颈效应,群体数量无明显下降。     

枳壳道地产区主流品种遗传多样性的ISSR分析

采用ISSR分子标记技术对江西、湖南、四川3个枳壳道地产区的主流品种进行遗传多样性分析,为筛选优良品种提供参考。15个引物共扩增114个位点,其中多态性位点108个,多态位点百分率为94.73%;观测等位基因数(Na)1.9467,有效等位基因数(Ne)1.5740;Ne i’s基因多样性(He)33.15%;Shannon’s信息指数(I)0.490 7;UPGMA聚类分析可将所有样品分为4类。枳壳具有较高的遗传多样性,其遗传变异主要存在于不同的品种间;聚类结果与传统的外观形态鉴别分类具有一致性;在进行优良品种选育时,应加强不同品种之间的基因交流,以提高种质的质量。     

茄子种质资源的ISSR遗传多样性分析

利用ISSR分子标记分析茄子种质多样性,从100条引物中筛选出20条能够扩增出多态性条带稳定清晰的ISSR引物,对48份茄子材料的DNA进行扩增,共获得了186条谱带,其中多态性带153条(占所有谱带的82.2%).利用UPGMA法建立了48份茄子及其近缘野生种间的遗传关系聚类图.聚类结果表明,48份供试种质间的遗传相似系数分布在0.52～0.98之间,可将其分为5大类群.其中又将44份栽培品种分为5组,其品种间相似遗传系数在0.84～0.98之间,表明栽培品种的遗传背景比较窄.聚类结果与茄子的果形以及地理来源有一定的相关性,而与果色呈现不完全相关.     

海巴戟ISSR遗传多样性分析

利用ISSR分子标记对202份海巴戟种质材料进行遗传多样性和聚类分析。结果表明：13条ISSR引物共扩增出65个位点,每个引物平均扩增出5个位点,其中多态性位点63个,占总数的9692%。在相似系数为063时,202份海巴戟种质分为5个类,表现出一定的地域分布规律。检测到有效等位基因数 Ne=16042,基因多样性 H=03488 ,Shannon′s信息指数 I=05206,说明202份海巴戟种质间存在着较高的遗传多样性。