藏山羊RAPD及RFLP标记的初步研究

利用简单随机抽样获得亚东山羊（ｎ＝６）,高原型藏山羊（ｎ＝１５）样本,以吕梁山羊为对照进行基因组ＤＮＡＲＡＰＤ及ＲＦＬＰ标记的分析。结果表明,序列为５′－ＴＧＧＴＧ－ＣＡＣＴＣ－３′的随机引物可以作为区分亚东山羊与高原型藏山羊的标记引物,Ｓ及ＭＡＰＤ在某种程度上揭示了类群间遗传相似性;ＥｃｏＲⅠ,ＨａｅⅢ单酶切,ＥｃｏＲⅠ／ＨｉｎｄⅢ双酶切亚东山羊和高原型藏山羊基因组ＤＮＡ分别产生可观察的ＲＦＬＰ条带。     

香蕉枯萎病菌4号小种B-1,6-半乳聚糖酶的纯化与鉴定

收集了１％柑桔果胶作为碳源诱导培养的香蕉枯萎病菌（Ｆｕｓａｒｉｕｍｏｘｙｓｐｏｒｕｍｆ．ｓｐ．ｃｕｂｅｎｓｅ）４号小种菌液,通过ＰＭ－１０膜超滤、ＳｅｐｈａｃｒｙＳ－１００凝胶过滤柱层析和超滤除杂蛋白等步骤进行分离,ＳＤＳ-ＰＡＧＥ电泳获得单一约５０ｋＤａ的蛋白条带．经过质谱鉴定,获得其肽质量指纹谱,最后与数据库比较,与尖孢镰刀菌番茄专化型的β－１,６－半乳聚糖酶（ｇｉ：１１９５０７９２８）匹配度最高．克隆获得该蛋白的ＤＮＡ序列Ｆｏｃ４ｇａｌ１共１３６８ｂｐ,包含２个内含子和３个外显子;开放阅读框为１２６３ｂｐ,预测编码４２０个氨基酸残基,１－２０个氨基酸残基为其信号肽序列,理论等电点为５.２６,分子量约４７.２ｋＤａ．本研究成功纯化鉴定了香蕉枯萎病菌４号小种β－１,６－半乳聚糖酶,并克隆了该蛋白的基因序列．     

十字花科蔬菜根肿病菌的PCR快速检测

利用设计合成的根肿病菌 (Ｐｌａｓｍｏｄｉｏｐｈｏｒａｂｒａｓｓｉｃａｅ)特异性寡聚核苷酸引物Ｄ85 81 9Ｆｗ/Ｄ85 81 9Ｒｖ,根据本研究组成员对十字花科蔬菜根肿病菌核糖体基因ＩＴＳ区段克隆测序结果 (未发表 )而设计的引物ＩＴＳＦｗ/ＩＴＳＲｖ和真菌核糖体基因ＩＴＳ区段通用引物ＩＴＳ1 /ＩＴＳ4,对分离自十字花科作物(白菜、青菜、甘蓝、芥蓝、花椰菜等 )根肿病菌全基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ(ＰｏｌｙｍｅｒａｓｅＣｈａｉｎＲｅａｃｔｉｏｎ)特异性扩增试验。试验结果表明 ,这 3对引物均能从十字花科根肿病菌全基因组ＤＮＡ中扩增…     

藏山羊RAPD及RFLP标记的初步研究

利用简单随机抽样获得亚东山羊,高原型藏山羊样本,以吕梁山羊为对照进行基因组ＤＮＡ ＲＡＰＤ及ＲＦＬＰ标记的分析。结果表明,序列为５‘－ＴＧＧＴＧ－ＣＡＣＴＣ－３’的随机引物可以作为区分亚东山羊与高在型藏山羊的标记引物,Ｓ及ＭＡＰＤ在某种程度上揭示了类群间遗传相似性;     

甜菜夜蛾GOBP2基因的克隆及序列测定

 比较已报道的 ５种昆虫的 ＧＯＢＰ２基因序列，设计了一对简并引物，以甜菜夜蛾 Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｅｘｉｇｕａ的触角ｃＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ扩增，获得了一条４００ｂｐ左右的特异性条带。将以上片段克隆到Ｔ－ｅａｓｙ载体上，获得重组子ＧＯＢＰ２Ｓｅｘｉ，序列测定和结构分析结果表明，ＧＯＢＰ２Ｓｅｘｉ阅读框全长４２６ｂｐ，编码１４１个氨基酸残基，预测分子量和等电点分别为１６．０７ｋｕ和５．０９。另外，序列中有６个保守的半胱氨酸位点，具有气味结合蛋白的典型特征。同时以基因组 ＤＮＡ为模板进行ＰＣＲ扩增，得到了一条 ２ｋｂ左右的特异性条带，同样克隆到 Ｔ－ｅａｓｙ载体上进行测序，结果表明，在该蛋白的第２２和第２３个氨基酸之间及第８２和第８３个氨基酸之间分别插入了一个１６０ｂｐ和１４０３ｂｐ的内含子。Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交结果表明，ＧＯＢＰ２基因在甜菜夜蛾触角中特异性表达，并且在雌雄蛾触角中表达水平相当。该基因已在ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ中登记，序列号为ＡＪ２９４８０９。     

用RAPD和RFLP定位水稻香味基因（Ⅱ）

用ＲＡＰＤ引物Ｊａｓ１．５从亲本ＣＴ９９９３中扩增出的多态性产物１．５ｋｂ片段，经ＮｃｏＩ酶切后获得的一条０．５ｋｂ片段，将其制备成ＲＦＬＰ探针ｊａｓ５００，选用覆盖整个水稻ＲＦＬＰ图谱的１２５个随机克隆和ｊａｓ５００对ＣＴ９９９３／ＫＤＭＬ１０５的Ｆ２群体进行检测。     

PCR技术在快生型大豆根瘤菌菌株鉴别上的应用

以基因外重复的回文因子（ｒｅｐｅｔｉｔｉｖｅｅｘｔｒａｇｅｎｉｃｐａｌｉｎｄｒｏｍｉｃ，ＲＥＰ）和肠菌基因间重复一致序列（ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｌｒｅｐｅｔｉｔｉｖｅｉｎｔｅｒｇｅｎｉｃｃｏｎｓｅｎｓｕｓ，ＥＲＩＣ）的碱基顺序设计出的引物为引物，用ＰＣＲ（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ）技术分别扩增了８株快生型大豆根瘤菌（Ｓｉｎｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ）的ＤＮＡ，得出了具有菌株特     

土壤棉枯萎病菌选择性培养基——植选二号

土壤棉枯萎病菌选择性培养基──植选二号ＺｈｉｘｕａｎＮｏ．２──ＡＳｅｌｅｃｔｉｖｅＭｅｄｉｕｍｆｏｒＩｓｏｌａｔｉｎｇａｎｄＥｘａｍｉｎｉｎｇＦｕｓａｒｉｕｍｏｘｙｓｐｏｒｕｍｆ．Ｓｐ．ｖａｓｉｎｆｅｃｔｕｍ（Ａｔｋ．）ＳｙｎｄｅｒｅｔＨａｎｓｅｎ...     

拟南芥ATLP-3基因在转基因烟草中的整合和表达

将拟南芥ＡＴＬＰ－３基因从质粒ｐＵＣＴＬ亚克隆到植物表达载体ｐＢＩ１２１中,得到了质粒命名为ｐＢＩＴＬ。被亚克隆到重组质粒ｐＢＩＴＬ的ＡＴＬＰ－３基因通过农杆菌ＬＢＡ４４０４介导法导入烟草（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ ｔｏｂａｃｃｏ Ｌ．ｖａｒ Ｇｅｘｉｎ Ｎｏ．１）。通过卡那霉素抗性筛选,得到１９株再生烟划植株。ＰＣＲ（用根据ＣａＭＶ３５ｓ启动子和ＮＯＳ终止子序列合成的引物）分析表明,ＡＴＬＰ－基因是在     

芥菜遗传多样性的RAPD分析

随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）是一种新的分子标记技术,利用ＲＡＰＤ标记对芥菜（Ｂｒａｓｓｉｃａ ｊｕｎｃｅａ Ｃｏｓｓａ）１６个变种的遗传多样性进行了分析,从６０个１０ｂｐ随机引５物中筛选出２７个有效的,这２７个有效引物共扩增出３３６条ＤＮＡ带,其中２７５条为多态性带,占总数的８１．８５％,平均每个引物扩增出的ＤＮＡ带数为１２．４４,不同引物扩增出各自不同的ＤＮＡ指纹图谱,大部分图谱均有特征或特     

人参单一基因微卫星标记的分析

 【目的】利用人参单一基因（unigene）序列,研究人参转录区SSR的分布特征;开发单一基因微卫星（UGMS）标记,并比较人参UGMS与基因组SSR标记（G-SSR）在分布频率、多态性及通用性等方面的不同,为人参等五加科药用植物的鉴定、遗传图谱的建立等研究奠定基础。【方法】利用NCBI公共数据库的7 649条人参EST序列,筛选出含有SSR的单一基因序列,并分析人参SSR的分布;根据这些序列以及包含SSR的人参基因组序列合成的引物扩增人参不同品种和其它五加科植物。【结果】检测到总长度为2.72 Mb的4 869个单一基因。其中,488个单一基因分布有724个SSR,占人参EST的10.02%,SSR的分布密度为3.75 Kb。一至三核苷酸重复分布频率分别为29.28%、48.06%和19.06%。非编码区和编码区重复序列分别以AT/TA和AAG/CTT为主。在合成的100对UGMS和44对G-SSR引物中,分别有86和44对能够扩增出人参的PCR产物,其多态率分别为42.0%和43.2%。人参UGMS对五加科西洋参、三七和刺五加植物的通用性分别为100%、87.2%和75.6%;G-SSR分别为95.5%、72.7%和40.9%。【结论】人参基因中SSR发生频率较高,并以二核苷酸重复为主。不同基因区域内的SSR分布具有非随机性。UGMS在揭示种内多态性方面不及G-SSR,但具有较高的种间通用性。     

基于高通量测序的北柴胡根转录组SSR位点信息分析

以北柴胡根为试材,采用高通量转录组测序方法,获得uingene序列信息,研究分析SSR分布、基元特征,设计、验证EST-SSR引物的有效性,为开发、丰富EST-SSR分子标记奠定基础。结果表明：从北柴胡根转录组中共筛选到31 176个SSR位点,分布于21 732条unigenes,出现的频率为20.08%,分布密度为3.20个/10 kb,主要重复基元类型以二核苷酸最为丰富,共21 056个,占SSR位点总数的67.54%;其次是单核苷酸和三核苷酸,分别占总SSR的19.05%和12.07%;四核苷酸～六核苷酸重复基元数量均较少。不同核苷酸基序类型共有131种基元,重复基元次数在5～11次的数量最多,占SSR总数的91.7%,且长度基本小于15 bp,其中AT/AT和AC/GT这两种基元在二核苷酸中出现频率最高。2 064条和1 004条含有SSR位点的unigenes分别注释到GO和KEGG通路,获得注释的基因功能主要与基础代谢相关。从22 090对具有潜在多态性的EST-SSR引物中,随机挑选20对引物对3个北柴胡种质DNA进行PCR扩增,扩增成功率最高达85%。北柴胡根转录组S...     

四球茶转录组SSR位点信息分析

对基于高通量测序拼接获得的99 741条四球茶嫩叶Unigenes进行了SSR(simple sequence repeats)位点分析,共揭示了23 732个SSR位点,分布于18 552条Unigenes中,SSR发生频率为23.79%;含有SSR位点的Unigenes的总长度为226 188 bp,SSR位点间的平均距离为1/2.07 kb,重复长度平均长度为9.53 bp。在四球茶转录组SSR中,二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占总SSRs的47.53%和25.92%;在181种重复基元类型中,优势重复基元分别是AG/CT、A/T、ACC/GGT,分别占总SSRs的41.38%、22.10%和6.49%,共占总SSRs的比例达69.97%。     

辣椒EST-SSR标记的开发与应用

通过对数据库中32 295条非冗余的辣椒EST序列进行搜索,发现3 396个SSR分布于3 277条EST序列中,EST-SSR频率为10.52%,平均分布距离为4.46 kb.在辣椒EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复基元占主导地位,分别占总SSR的43.02%和37.84%.优势重复基元为GA/TC、AG/CT和AT,分别占15.99%、11.98%和11.37%.用Primer Premier 5.0软件设计了420对引物,对辣椒抗疫病自交系‘B072’和感疫病自交系‘B088’进行PCR扩增,403对引物有扩增产物,引物有效扩增率为95.96%,其中76对引物有多态性,多态性引物占可扩增引物的18.86%.试验证明,利用辣椒EST序列开发SSR标记是可行的.     

西瓜专化型尖孢镰刀菌的分离鉴定及水稻根系分泌物对其生长的影响

利用尖孢镰刀菌选择性培养基从西瓜枯萎病发病部位分离出病原菌,通过Booth＇s镰刀菌分类鉴定标准和专化型试验,确定该菌株为西瓜专化型尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum f．sp．niveum）。以该菌株为材料,研究水稻根系分泌物对其生长的影响。结果表明,2个水稻品种ELIO和4007的根系分泌物均能显著抑制其孢子萌发和孢子产生。当根系分泌物的加入量为1．5mL时,ELIO和4007对孢子萌发的抑制率分别为37．8％和41．0％;当加入20mL水稻根系分泌物时,ELIO和4007对孢子产生的抑制率达到96．3％和76．4％。水稻根系分泌物对西瓜尖孢镰刀菌孢子产生过程的抑制作用主要发生在孢子萌发阶段和孢子在尖孢镰刀菌瓶状小梗上的生成阶段,而对菌丝营养生长没有影响。西瓜与旱作水稻间作的盆栽试验表明,间作系统中西瓜苗的鲜重和株高分别提高了186．0％和80．5％。单作西瓜枯萎病发病率为66．7％,死亡率为44．4％,而间作处理中西瓜均生长正常。间作条件下,西瓜根际土壤中的尖孢镰刀菌数量显著降低,与单作根际土壤相比减少了91％。表明：水稻根系分泌物能显著抑制西瓜专化型尖孢镰刀菌生长,采用旱作水稻与西瓜间作能有效缓解西瓜枯萎病的发生。     

大蒜转录组简单重复序列标记分析与分子标记开发

为探明大蒜转录组简单重复序列标记(SSR)的特征,开发适合大蒜育种的SSR引物,利用MISA软件对大蒜转录组序列进行SSR位点检测与信息分析,并通过PCR扩增检测引物的有效性和多态性。结果表明:大蒜转录组测序获得444 865条unigenes,共鉴定出141 132个SSR位点,出现频率为31.72%,平均每3.45 kb出现1个SSR位点。单核苷酸和二核苷酸为SSR位点中优势类型,分别占总SSR的68.02%和24.12%;SSR位点共有82种重复基序,以A/T和AT/AT数量较多,占总SSR位点的65.02%和12.37%。利用Primer 3.0共设计出125 616对SSR引物,在随机选取的14对引物中有12对引物能够有效扩增,其中6对引物在35份大蒜资源中表现出多态性,扩增共得到26条多态性条带,每对引物平均产生4.33条条带。UPGMA分析显示,在遗传相似系数0.756 9处,35份大蒜资源可被分成5大类群。综上所述,利用大蒜转录组数据进行SSR分子标记开发能够获得较高频率的SSR位点,且开发的SSR标记可用性强。     

大花序桉基因组SSR的分布特征及序列分析

【目的】分析大花序桉基因组SSR的分布特征及序列分析,为大规模开发大花序桉分子标记辅助育种的SSR标记提供理论依据。【方法】通过高通量测序获得大花序桉基因组序列信息,经严格过滤、拼接和组装后获得scaffolds,利用MISA网站对Scaffolds进行SSR位点检索及分析,并利用Primer 5.0对具有较大多态性开发潜力（二基元重复次数≥10、三基元重复次数≥7）的SSR标记进行引物设计,随机挑选48对基因组SSR引物进行有效性检测及有效扩增引物筛选。【结果】大花序桉基因组共含有177750个SSR位点,包括171530个SSR独立位点和6220个复合型SSR位点;SSR发生频率为17.86%,分布密度为1/3.13 kb。大花序桉基因组SSR基元类型较丰富,以单核苷酸重复基元类型数量最多,占基因组总SSR数量的69.33%,其次为二、三核苷酸重复基元类型,分别占基因组SSR数量的21.01%和7.58%,四、五、六核苷酸的重复基元类型所占比例均相对较低,三者的比例含量总和为2.08%。SSR基元类型以AG/CT占绝对优势（16812个）,其次为AT/AT（8193个）和AAG/CTT（4404个）。从48对SSR标记引物中筛选出31对引物能有效扩增出清晰、明亮条带且大小与预期相符,其中有14对在6个大花序桉样本中均呈现多态性,多态百分率为29.17%。【结论】大花序桉基因组SSR位点发生频率高,基元类型较丰富,SSR多态性标记开发潜力大。该研究结果为进一步大花序桉SSR引物开发和筛选,以及开展大花序桉及其他桉树遗传多样性分析和遗传图谱构建提供依据。     

西瓜枯萎病菌生理小种1抗性基因连锁标记开发

【目的】开发与栽培西瓜枯萎病菌生理小种1抗性基因Fon-1紧密连锁的分子标记,为开展西瓜抗枯萎病分子辅助育种提供技术支撑。【方法】以栽培西瓜抗枯萎病品种Calhoun Gray为父本,感病品种Black Diamond为母本杂交获得的F2分离群体为供试材料,采用BSA法对Fon-1基因进行区间定位。依据11份栽培西瓜重测序信息,获取位于定位区间内的候选SNP位点。针对候选SNP位点设计CAPS/dCAPS标记,通过F2代分离群体和种质资源验证上述标记与Fon-1基因的连锁关系。【结果】通过BSA法,将Fon-1基因定位于1号染色体15 cM区间内。利用候选SNP位点信息,开发3个CAPS/dCAPS标记7716_fon、7419_fon和4451_fon,F2代分离群体以及164份西瓜育种材料验证显示,上述3个标记与Fon-1基因的连锁距离分别为0.8、1.0和2.8 cM。【结论】利用栽培品种Calhoun Gray的抗性遗传机制,开发的3个CAPS/dCAPS标记可以有效区分栽培西瓜对枯萎病菌生理小种1的抗病、感病性,为栽培西瓜品种枯萎病菌生理小种1抗性基因快速应用于栽培品种枯萎病抗性改良建立有效的技术手段。     

香蕉枯萎病菌4号小种在各培养基上性状比较

通过K2、PPA、MBA和PSA等培养基对香蕉枯萎病菌4号小种的选择性和鉴别作用进行比较,结果表明,K2培养基抑制杂菌的能力强,适宜香蕉枯萎病菌4号小种生长,齿轮状菌落是该小种的鉴别特征.利用K2培养基从土壤中检测出的菌株在香蕉组培苗上进行致病性测定,确认该菌株为香蕉枯萎病菌4号小种.因此,K2培养基可以作为香蕉枯萎病菌4号小种的鉴别培养基,用于土壤、香蕉苗和田间病株中香蕉枯萎病菌4号小种检测.