鱼类线粒体DNA多态研究和应用进展

自８０年代以来,线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）分析在动物进化遗传学、分子生态学、遗传多样性及其保护学领域得到了广泛应用。国内对鱼类ｍｔＤＮＡ的研究,主要集中于对ｍｔＤＮＡ限制性内切酶酶切图谱的构建和分子大小的估算［１～５,８～１５］。为了提高ｍｔＤＮＡ在...     

鱼类线粒体DNA控制区的分子结构及应用进展

对鱼类线粒体DNA控制区新的研究进展进行阐述.介绍了鱼类线粒体DNA控制区的分子结构、结构的分区情况和各区域的结构特点以及鱼类线粒体DNA控制区多态性及其主要检测方法;综述了最近有关鱼类线粒体DNA控制区在鱼类系统学、地理种群识别、类群的起源、地理分化和扩散等研究中的应用情况.     

动物线粒体DNA研究及在鱼类种群遗传结构研究中的应用

ｍｔＤＮＡ是核外遗传物质,呈母系遗传［Ｂｒｅｓｃｈ１９８４］。由于其结构简单,易于分离,进化较快等特点［Ｂｒｏｗｎ１９７４］,在动植物种群遗传结构分析、物种及品系鉴定方面得到了广泛的应用。线粒体ＤＮＡ酶切技术在国外已被遗传学家用于鱼类种群遗传结构及品...     

线粒体DNA的研究及其应用

线粒体是真核生物细胞内的一种重要而独特的细胞器,为细胞的活动提供能量。线粒体DNA是哺乳动物细胞内唯一存在的核外遗传物质,是核外遗传研究的热点,目前已取得了瞩目的成就,就线粒体DNA的研究及其在动物以及人类中的应用进行综述。     

鱼类线粒体代谢研究概况

鱼类是脊椎动物门中最原始的,同时也是种类最多的一个纲。线粒体中电子传递的作用是使ADP磷酸化成ATP。概述了鱼类线粒体代谢的研究近况,为人们认识和深人研究鱼类线粒体代谢提供基础资料。组织、细胞和亚细胞水平的能量代谢是能量学研究的重要内容之一,而线粒体代谢研究是其重要组成部分。细胞内物质的能量代谢主要发生在线粒体呼吸链上,通过氧化磷酸化作用将其能量转化为能量通货ATP。而鱼类不但种类多,而且原始,是进行脊椎动物线粒体代谢研究的模式动物之一。     

微卫星DNA标记技术及其在鱼类中的应用

微卫星存在于几乎所有真核生物的基因组中,且呈随机均匀分布;在染色体上,除着丝粒及端粒区域外,其它区域均有广泛分布。微卫星能参与遗传物质结构的改变、基因调控及细胞分化等过程,有自身特异结合蛋白,能直接编码蛋白质。通过PCR扩增并使用凝胶电泳分离可产生大量含有微卫星DNA片断。微卫星DNA标记技术可应用于分析鱼类物种遗传多样性、分析群体的遗传结构、建立遗传图谱和基因定位、鱼类种质资源的保护、建立微卫星DNA指纹库、亲子鉴定和血缘关系分析以及种群生态学研究。     

鱼卵线粒体DNA的分离纯化的简便方法

湖北素称鱼米之乡．仅武汉地区鱼类就有800余种．发展渔业生产是国民经济的重要方面之一，我们认为研究鱼的线粒体DNA(mtDNA)可以为发展渔业生产提供重要的有价值的理论依据。而且研究鱼卵mtDNA优点较多，一是材料丰富，二是mtDNA含量较高。     

DNA标记技术在鱼类遗传育种中的应用

1 DNA标记技术概述遗传标记(genetic markers)是分类学、育种学和物种进化研究的主要技术指标之一,是基因型(genetype)的特殊的易于识别的表现形式。当前遗传标记主要有4种类型:①形态标记(morphological markers)即生物的形态特征,如鱼的体色、体长、体高等;②细胞学标记(cyto     

竹荚鱼属鱼类线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析

采用PCR产物直接测序法测定了2尾来自中国南海的日本竹煲鱼（Trachurus japonicus）线粒体DNA控制区基因全序列,并结合从GenBank中下载的8种竹笑鱼属相应序列,对竹煲鱼属控制区序列进行了结构分析,识别出终止序列区、中央区和保守序列区3个区域,并找到了2个与DNA复制终止相关的序列TAS和中央保守区的保守序列CSB—F、CSB—E和CSB—D,以及保守序列区的保守序列CSBl、CSB2和CSB3。以鳜（Sinipercachuatsi）作为外群,使用邻接法和最大简约法构建了9种竹荚鱼属的系统发育树。竹笑鱼属鱼类为单系类群,蓝竹煲鱼（rpicturatus）、智利竹笑鱼（zmurphyi）、太平洋竹笑鱼（zsymmetricus）、南非竹荚鱼（rcapensis）和竹荚鱼（rtrachurus）构成一支,地中海竹笑鱼（zmediterraneus）、青背竹笑鱼（zdeclivis）、日本竹荚鱼（rjaponicus）和新西兰竹荚鱼（rnovaezelandiae）为另一支;日本竹笑鱼未单独成一支,而是聚人青背竹笑鱼和新西兰竹笑鱼之间,初步猜测日本竹笑鱼和新西兰竹荚鱼为同种异名。     

鱼类DNA疫苗的研究进展

ＤＮＡ疫苗也称核酸疫苗、基因疫苗 ,是将含有编码保护性抗原蛋白的基因序列和表达所必需调控元件的质粒ＤＮＡ直接导入动物组织 ,使抗原蛋白经过内源性表达并递呈给免疫系统 ,诱发机体产生特异性体液免疫和细胞免疫应答 ,形成对相应病原的免疫保护作用 ,用于免疫的质粒ＤＮＡ称为ＤＮＡ疫苗。它不同于传统的弱毒疫苗、灭活疫苗及亚单位苗 ,是带有特异性抗原基因的真核表达质粒 ,是继病原体疫苗、亚单位疫苗之后的第 3代疫苗[1] 。ＤＮＡ疫苗在人体和哺乳动物研究中已取得一定进展 ,部分疫苗已进入临床试验阶段[2 ] 。而鱼类ＤＮＡ疫苗的研…     

竹筴鱼属鱼类线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析

采用PCR产物直接测序法测定了2尾来自中国南海的日本竹筴鱼(Trachurus japonicus)线粒体DNA控制区基因全序列,并结合从GenBank中下载的8种竹筴鱼属相应序列,对竹筴鱼属控制区序列进行了结构分析,识别出终止序列区、中央区和保守序列区3个区域,并找到了2个与DNA复制终止相关的序列TAS和中央保守区的保守序列CSB-F、CSB-E和CSB-D,以及保守序列区的保守序列CSB1、CSB2和CSB3.以鳜(Siniperca chuatsi)作为外群,使用邻接法和最大简约法构建了9种竹筴鱼属的系统发育树.竹筴鱼属鱼类为单系类群,蓝竹筴鱼(T.picturatus)、智利竹筴鱼(T.murphyi)、太平洋竹筴鱼(T.symmetricus)、南非竹筴鱼(T.capensis)和竹筴鱼(T.trachurus)构成一支,地中海竹筴鱼(T.mediterraneus)、青背竹筴鱼(T.declivis)、日本竹筴鱼(T.japonicus)和新西兰竹筴鱼(T.novaezelandiae)为另一支;日本竹筴鱼未单独成一支,而是聚入青背竹筴鱼和新西兰竹筴鱼之间,初步猜测日本竹筴鱼和新西兰竹筴鱼为同种异名.     

微卫星DNA标记在鱼类遗传育种中的应用

微卫星是近年来常用的一种检测基因组DNA多态性新型的、建立在多聚酶链式反应(PCR基础之上的一种遗传标记技术,因其数量分布广、多态性丰富及检测快速方便等优点而备受青睐,在动物的遗传育种中已得到了广泛的应用。本文就微卫星DNA的研究简史、结构特性、形成的机制、功能及其在鱼类育种中的应用等作一概述。     

鱼类DNA条形码技术的应用进展

<正>基于DNA序列进行物种鉴定的DNA条形码技术自2003年问世以来,经过十几年的快速发展,不仅在各种动植物的物种鉴定方面取得巨大成就,而且在动植物区系、生态和物种保护、生物安全、食品安全等方面得到越来越多的应用,并取得一系列成果。鱼类是最具多样性的脊椎动物,全球预计有多达40000种鱼类[1]。由于在发展过程中具有高度的多样性,传统的鱼类物种鉴定方法存在很多问题。DNA条形码在鱼类物种鉴定中最早获得应     

基于线粒体全基因组结构的鲳属鱼类分子分类研究

为明确鲳属鱼类的线粒体全基因组序列结构、寻找有效的种间鉴别分子标记,并剖析其系统发育信息,从而为鲳属鱼类的分类学、进化遗传学和种质鉴定提供参考依据,测定了鲳属5种鱼类(中国鲳Pampus chinensis、灰鲳P.cinereus、银鲳P.argenteus、珍鲳P.minor、翎鲳P.punctatissimus)的线粒体全基因组序列,并结合NCBI数据库中已有的鲳属鱼类线粒体全基因组序列进行分析。结果显示:1)鲳属线粒体基因组全序列长度在16 551 bp到18 062 bp之间,其基因组结构与大多数硬骨鱼类一致;比较特别的是,银鲳和镰鲳具有两个tRNA^Met结构,珍鲳出现ND1基因重排以及两个重复的D-loop结构。2)银鲳与镰鲳的D-loop区出现重复CSB3结构,灰鲳与翎鲳D-loop区出现重复TAS结构。3)ND2基因条形码及其微型条形码均可将鲳属鱼类区分开,可作为有效的鲳属鉴别分子标记。4)东海区的银鲳与镰鲳应为同一物种,灰鲳可能为翎鲳的同物异名。     

鲤科25种鱼类线粒体COⅡ基因序列差异及其系统进化关系

采用PCR技术获得了23种鲤科鱼类线粒体DNA细胞色素氧化酶（COⅡ）基因部分序列,将所得的COⅡ基因序列与2种取自GenBank的鲤科鱼类同一基因序列采用CLUSTAL X排序后,序列间未见插入和缺失,在实际分析的600 bp序列中,共有变异位点250个。以台湾缨口鳅作为外类群,用PAUP 4.0软件对序列结果进行统计和分支分析,分别用邻接法和最大似然法构建分子系统树。Kimura双因素模型计算25种鲤科鱼类遗传距离范围为0.018 5～0.237 5,其中,遗传距离值最小是与似（0.018 5）,最大是似刺鳊与大鳍（0.237 5）。分子系统树显示鲤科雅罗鱼亚科、亚科、鲤亚科、亚科和亚科均没有各自形成单系群。雅罗鱼亚科被分为北方类群和东亚类群,北方类群是一单系类群,东亚类群与亚科、鲴亚科、鲢亚科形成另一个单系群。丁与贝加尔雅罗鱼、东方欧鳊、湖拟鲤等聚成一单系群,支持将丁保留在雅罗鱼亚科中的传统分类法。     

高原鳅属鱼类线粒体DNA和微卫星标记开发研究进展

高原鳅属Triplophysa鱼类主要分布于亚洲中部的高原地区,对高原环境表现出极强的适应性,是世界上已知分布海拔最高的鱼类.本文通过综述高原鳅属鱼类线粒体DNA、微卫星标记开发的研究现状以及保护遗传学研究进展,为该属鱼类资源的保护提供遗传参考数据.     

利用线粒体DNA序列进行斑海豹鉴定的研究

通过对待鉴定的血液样品中线粒体控制区扩增和序列测定,并与基因库中序列比对分析,成功地对斑海豹进行了种类鉴定。本研究所用方法在野生珍稀动物的种类鉴定中有很好的应用价值。