蒙古马血液蛋白(酶)遗传多态性及聚类分析

采用垂直平板不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对221匹蒙古马（包括乌珠穆沁马、乌审马、锡尼河马和巴尔虎马）的8种血液蛋白进行多态性检测。计算了各位点的基因型频率、等位基因频率、遗传杂合度，并通过聚类分析探讨了群体间的亲缘关系和遗传距离。结果表明：除α1-B糖蛋白（A1B）位点呈现为单态外，其余7个蛋白（酶）位点均在不同程度上表现出多态。8个蛋白（酶）位点的平均杂合度分别为：乌珠穆沁马0．3296，乌审马0．3056，锡尼河马0．3783和巴尔虎马0．3666。对Nei氏标准遗传距离进行聚类分析，发现巴尔虎马和锡尼河马之间的遗传距离最近，它们与乌珠穆沁马和乌审马的遗传距离相对较远。     

蒙古马不同类群MxA基因部分外显子多态性分析

为了预防和治疗马流感,培育抗流感病毒的品种,也为其他家畜抗病毒基因的研究提供参考资料。试验以地方品种蒙古马为主要研究对象,采用PCR-SSCP技术对蒙古马不同类群MxA蛋白基因部分外显子进行分析研究,寻找其多态性。结果表明:乌珠穆沁马第3外显子存在多态性,乌珠穆沁马MxA基因cDNA序列第429位点由胞嘧啶(C)突变为鸟嘌呤(G),引起了相应氨基酸的变化,使亮氨酸(Leu)变成酪氨酸(Tyr)。     

胎儿期与成年期蒙古马骨骼肌肌纤维类型转化研究

为探索影响蒙古马胎儿期和成年期肌纤维类型差异机理.本研究选取3匹4月龄胎儿(两母一公)与3匹5岁健康成年母马身体4块分布全身、具有代表性的肌肉组织(长臂三头肌、夹肌、背最长肌、臀中肌)作为一个整体.胎儿期蒙古马肌纤维和成年期蒙古马肌纤维因存在差异各做为一组,试验进行3个生物学重复.首先对蒙古马骨骼肌肌肉样品进行免疫组化...     

蒙古马生长激素基因的克隆及部分序列的PCR-SSCP分析

通过PCR-SSCP方法对7个品种285匹马的生长激素基因做了多态性分析,在所检测的5′端侧翼区、第一内含子、第二外显子和第五外显子4个位点中,仅第五外显子检测到多态,该多态位点由A和B两种等位基因控制.GH基因第1 719处1个T→C的突变和1 743处G→A的突变,导致等位基因B变为等位基因A.除纯血马外,A基因在各品种中均为优势等位基因,B基因为纯血马的优势基因.在此多态位点,乌珠穆沁马、乌审马和巴尔虎马处于Hardy-Weinberg平衡状态,纯血马、三河马和锡尼河马则未达到Hardy-Weinberg平衡状态.     

甘肃现代肉羊新品种群遗传结构及遗传变异的生化遗传学研究

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)研究了甘肃现代肉羊新品种群及其两个父本(波德代、陶赛特)与母本(蒙古羊)血红蛋白(Hb)、血液转铁蛋白(Tf)、后转铁蛋白(PTf)、白蛋白(Alb)、脂酶(Es)5个基因座的遗传多态性,运用群体遗传学方法统计分析了9个群体内的遗传变异,并计算了这9个羊群体间的遗传距离.结果表明这9个群体在所检测的5个蛋白(酶)位点上均存在丰富的多态;各群体的平均基因杂合度、群体的多态基因座百分数、有效等位基因数、以及Shannon信息量比较高,群体基因均质度、平均纯合度比较低.9个群体内都有较大变异,群体多样性高.B与BMF1的遗传距离最远,与BMF3遗传距离最近,遗传距离分别为0.129 7、0.044 2.D与DMF1的遗传距离最远,与DMF3遗传距离最近,遗传距离分别为0.083 0、0.043 7,B、D与蒙古羊之间的遗传距离分别为0.123 3、0.137 1,遗传距离较远.     

甘肃青海地方绵羊品种(群体)遗传变异研究

用非连续性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对分布在甘肃和青海两省境内的不同绵羊群体的446份血样的8个蛋白位点多态性开展研究,结果表明:Hb、Tf、Es在所有群体中存在多态性,AIb、Pr全部呈单态,AMY在小尾寒羊、甘肃高山细毛羊、滩羊中呈单态,在其它群体中存在多态性,而Ep在甘肃高山细毛羊、滩羊中呈单态,在群体中存在多态性,在LDH中,除青海藏羊LDH中没有出现LDH4外,其余群体都存在LDH的5种同工酶;群体内和群体间的遗传变异:甘肃藏羊和青海藏羊相对较大,青海细毛羊比甘肃高山细毛羊的大,小尾寒羊在两细毛羊品种之间,滩羊最小;遗传距离和聚类图分析结果表明,甘肃高山细毛羊和青海细毛羊遗传关系最近,小尾寒羊与两细毛羊品种遗传距离较近;而甘肃藏羊、青海藏羊与其它绵羊品种(群体)的亲缘关系较远.     

蒙古马突触融合蛋白17(STX17)基因多态性及在不同毛色皮肤组织中的表达分析

为研究突触融合蛋白17(STX17)基因与蒙古马毛色之间的相关性及其作用机制.本研究利用半巢式PCR技术及实时荧光定量PCR技术对蒙古马STX17基因第6内含子的多态性以及不同毛色蒙古马皮肤组织中STX17基因的相对表达量进行了检测.巢式PCR结果显示:STX17基因在青毛蒙古马第6内含子处存在4.6 kb的重复片段,在其它毛色中不存在该重复片段;荧光定量PCR结果显示:STX17基因在蒙古马青毛皮肤组织中表达量最高,在骝毛皮肤组织中的表达量最低.结果证明蒙古马STX17基因与其青毛表型具有典型的相关性.     

中国蒙古马mtDNA D-Loop高变区序列分析

对5匹中国蒙古马mtDNA D-Loop高变区400bp核苷酸序列的变异情况进行分析。结果发现5匹中国蒙古马mtDNA D-Loop高变区的平均核苷酸变异率为3．65％，其核苷酸变异类型包括转换、颠换和缺失3种形式，其中以转换最为常见。核苷酸变异位点较多，且个体之间差异大，说明该5匹中国蒙古马的mtDNA D-Loop高变区多态性丰富。     

中国地方绵羊群体TYRP1基因遗传变异研究

本研究旨在了解酪氨酸酶相关蛋白1（tyrosinase related protein 1,TYRP1）基因在中国地方绵羊群体内的遗传变异,以及TYRP1基因突变与不同毛色表型绵羊群体的相关性。通过直接测序法和PCR-RFLP技术对10个中国地方绵羊群体进行单核苷酸多态性（SNP）检测,利用Beagle、PLINK和POPGENE等软件对突变位点数据进行单倍型构建、连锁不平衡分析和遗传变异研究。突变位点检测结果表明,在绵羊TYRP1基因内识别了13个SNPs,其中位于TYRP1基因外显子上的10个SNPs位点,除个别位点在大尾寒羊、中国美利奴羊和岷县黑裘皮羊中没有发生突变外,其他突变位点在所有绵羊品种中均出现不同程度变异,说明中国地方绵羊群体具有较高的遗传多样性。单倍型分析结果表明,所有样本中共有42个单倍型,优势单倍型0000000000（245/918）、0100000001（91/918）在所有绵羊群体中均存在,除单倍型0101100000（93/918）在中国美利奴羊中没有出现,单倍型0001000001（69/918）在岷县黑裘皮羊、哈萨克羊群体中没有出现外,在其他群体中均存在。连锁分析结果表明,10个SNPs在所有样本中均存在2个连锁模块。群体遗传变异分析表明,中国地方绵羊群体具有较高水平的群体内遗传变异,各绵羊品种间存在明显的遗传分化模式,且各品种遗传关系与其品种传统分类结果基本一致。本研究为进一步研究TYRP1基因对绵羊毛色遗传性状的影响提供了参考依据。     

导入野血牦牛群体的遗传变异和基因分化

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法和火焰光度法对家牦牛和３个含野血牦牛群体ＴＦ,ＨＢ,Ｈｐ,ＫＥ,ＡＭＹ１和ＲＢＣＬＤＨ１６个基因座多态性的研究表明：家牦牛与３个含野血牦牛群体具有同样的多态性特征,但群体的遗传变异随野牦牛血比例的增多而减少。含野血牦牛群体之间的亲缘关系大于家牦牛,再大于野牦牛,但总群体所发生的基因分化程度很小（２７４８％）。     

蒙古马和纯血马免疫相关基因差异表达分析

为了评价蒙古马(Equus mongolian horse)和纯血马(E.thoroughbred)免疫生理机能在适应特殊生存环境和人工选择压力过程中相关基因的表达多样性。本研究对健康成年蒙古马(n=3)和纯血马(n=3)的颈静脉血液进行RNA-Seq和品种间表达谱比较分析。对2岁左右健康蒙古马(n=3)和纯血马(n=3)采集肝脏、脾脏、肺脏和血液样品,利用qRT-PCR方法,分析NF-κB信号通路7个基因在两个品种中的表达情况。利用Western blot方法,分析蒙古马和纯血马肺脏中核因子κB亚基p65 (RELA proto-oncogene NF-kB subunit, NF-κB p65)蛋白和白细胞介素1β (interleukin 1 beta, IL-1β)蛋白的表达情况。结果表明,RNA-Seq共获得19.69～23.95 Gb的高质量数据和1 199个差异表达基因,许多差异表达基因直接参与机体的免疫过程。NF-κB信号通路7个基因在蒙古马和纯血马4个免疫组织中均表达,基因表达的品种间差异存在组织多样性;7个基因在蒙古马肺脏的表达量均高于纯血马,除肿瘤坏死因子(tum...     

四个家鸡群体血液蛋白质多态性分析

本实验采用醋酸纤维薄膜电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳方法测定了新兴黄鸡，矮脚鸡，竹丝鸡，粤黄鸡麻羽系血液蛋白质多态性，观察了以上群体多态性血液蛋白质基因频率的区别，根据基因频率计算出４个群体的平均杂合度，用主分量分析方法对它们之间的区别与联系进行了研究。主要分析表明竹丝鸡与新兴黄鸡的关系相对新兴鸡与矮脚鸡，竹丝鸡与矮脚鸡之间的关系更为疏远：矮脚鸡则与粤黄鸡麻羽系关系密切。     

西农萨能奶山羊群体的遗传变异分析

通过对５７只西农萨能奶山羊９个血液蛋白位点遗传变异分析表明：西农萨能奶山羊在Ｈｂ、Ｔｆ、Ａｃｐ及Ｃａｔ四个血液蛋白位点上具有明显的种群特异性，与原种群瑞士萨能奶山羊的遗传分化系数达１５．５７％，与国内外１１个山羊品种间的遗传关系相对较近。在我国山羊品种中是一个遗传资源极为丰富的代表品种之一，属重点保护及开发利用的对象。     

蒙古马血液蛋白(酶)多态性研究

研究分别对乌珠穆沁马、乌审马、锡尼河马和巴尔虎马4个蒙古马类群共计221匹马的运铁蛋白（Tf）、前白蛋白（Pr）、血清酯酶（Es）、白蛋白（ALb）、碳酸酐酶（CA）、α1-B糖蛋白（A1B）、6-磷酸葡萄糖脱氢酶（PGD）、VD结合蛋白（GC）8个蛋白座位进行检测。群体遗传变异指标计算结果表明,4个类群蒙古马8个蛋白（酶）座位的平均杂合度为：锡尼河马0.3783,巴尔虎马0.3666,乌珠穆沁马0.3296,乌审马0.3056。根据基因频率计算Nei氏遗传距离进行分析。结果表明,巴尔虎马和锡尼河马之间的遗传距离最近,它们与乌珠穆沁马、乌审马的遗传距离相对较远。     

种群遗传变异及基因多样度分析

阐述了种群遗传学和生态遗传学研究的基本单位－种群的定义和意念含义,其一是种系变异含义,其二是生态适应含义,并概述了遗传变异的研究历史。从３个方面及质量性状变异,数量性状变异与基金变异,介绍了种群遗传变异的研究方法,重点介绍了基因变异的测量和亚种群基因多样度的测量,并且依据研究所得的遗传参数对中国苜蓿不同种群遗传结构和多样度进行了例证分析。     

陕西四个黄牛群体遗传变异的Shannon信息量分析

应用群体遗传变异的相对Shannon信息量指标体系，对陕西四个黄牛群体的遗传变异进行研究，结果表明：四个群体的遗传变异主要由杂合体的连续存在所致，平利牛的总遗传变异最大，陕西北部黄牛群体总遗传变异最小。     

鸡传染性支气管炎病毒地方分离株核蛋白基因的遗传变异分析

对2006-2009年从山西各地疑似传染性支气管炎的病例中分离到的7株IBV地方分离株的核蛋白基因片段进行序列测定及分析。结果发现,7株IBV地方分离株核蛋白基因有5株含有一个长1 230 bp的ORF,其余2株含有1 227 bp,编码410/409氨基酸残基组成的多肽,与常用疫苗株H120推导的氨基酸序列比对发现,存在基因突变现象。与GenBank中的34株国内外分离毒株核蛋白基因推导的氨基酸序列进行比较和分析,系统进化关系显示41株IBV毒株分属于4个群,至少有3个群在我国流行,7个分离株分布在第Ⅳ群中,第IV群大多来自我国的北方地区地方分离毒株,第Ⅱ群来自我国南方地区的部分地方分离毒株,从N基因推导氨基酸进化树上分析可见,我国的IBV地方分离毒株主要分布在第Ⅱ和第Ⅳ群中,具有较明显的地理区域性,可见IBV地方分离株在基因进化关系上形成了自己较为独立的进化群。     

蒙古马生长激素基因的克隆与序列分析

参考牛(M57764)、羊(AF002110)、猪(M17704)、人(J03071)和鼠(X12630)等哺乳动物GH基因序列,设计1 对特异引物,用PCR方法首次从蒙古马基因组中扩增出一条长约2 kb的DNA片段。PCR产物经pGEM_Teasy载体转化感受态DH5 α株大肠杆菌,获得重组克隆子。DNA测序表明:蒙古马生长激素基因DNA序列长1 923 bp,含完整的5个外显子和4个内含子,与猪、狗、牛、羊的GH的cDNA序列同源性分别为94．47％、92．63％、90．06％和 90．37％。其cDNA所编码氨基酸与猪、狗、牛、羊同源性分别为97．21％、96．74％、88．84％和88．37％,表明该基因在进化过程中是保守的。     

利用微卫星标记分析溧阳鸡的群体遗传变异

选用30对微卫星引物分析了溧阳鸡的等位基因组成,计算了各座位的基因杂合度和多态性信息含量。结果30个微卫星座位共检出156个等位基因,基因频率分布在0.0088-0.5之间,平均每对引物可检测5.2个等位基因,30个微卫星座位的平均杂合度为0.681,平均多态性含量为0.623,表明溧阳鸡群体遗传变异大,遗传多样性丰富。