家鸡羽色性状遗传调控机制研究进展

自然界中鸟类呈现出丰富的羽毛颜色,羽色性状在躲避天敌、捕食、求偶及抵御紫外线等方面都具有重要作用。对鸡羽毛颜色性状的研究有助于加强品种区分、识别,在育种工作中建立品种间的显著标识和保障同一品种外观整齐尤为重要。羽毛颜色是禽类表型遗传研究的重要组成部分,它主要由黑色素和类胡萝卜素所决定。目前鸡羽毛颜色性状遗传调控机制的研究大多集中在黑色素相关通路,其中,Wnt、KIT/KITL和EDN3/EDNRB等信号通路对黑素细胞的生长发育、迁移和分化具有重要的调控作用,α-MSH/ASIP-MC1R信号通路负责调控黑色素的合成。已有研究显示,通过全基因组范围内的遗传变异检测技术挖掘与羽色性状相关的基因和变异位点,可以揭示黑羽、麻羽、显性白羽、隐形白羽、常染色体白化、银羽、性连锁不完全白化、深棕色羽、淡紫色羽(灰羽)、非依赖酪氨酸酶的隐性白羽、斑点羽和性连锁横斑羽(芦花羽)等多种羽色性状的遗传调控机制。此外,以图灵模型为理论基础可以解释复杂羽色图案的形成机制。作者通过总结黑色素相关调控通路与图灵模型对家鸡羽毛颜色性状的遗传调控机制,对近年来已经确定基因座的家鸡羽毛颜色性状相关研究展开综述,以期为鸡羽色分子机制研究以及在育种过程中开展鸡羽色性状标记辅助选择提供参考。     

0～20周龄不同羽速太行鸡生长性能和免疫机能的比较研究

为研究0～20周龄不同羽速太行鸡生长性能及免疫机能之间的不同,试验选取健康的1日龄快、慢羽太行鸡母雏各100只,分为快羽组和慢羽组,每组4个重复,每个重复25只鸡,试验期为20周,测定并比较分析两组鸡只的生长性能和主要免疫指标。结果表明:6周龄快羽组平均体重较慢羽组高6.51%(P0.01),平均胫长较慢羽组长2.76%(P0.05);1日龄、14周龄和20周龄时平均体重和平均胫长组间均无显著差异(P0.05);0～6周龄快羽组平均日增重较慢羽组高7.38%(P0.01),快羽组平均日采食量较慢羽组高4.94%(P0.05),快、慢羽组的料重比在各阶段差异均不显著(P0.05);6周龄时快羽组胸腺指数较慢羽组高8.56%(P0.05);8周龄时快羽组血液中IgM水平较慢羽组高20.53%(P0.01),快羽组新城疫抗体水平较慢羽组高9.85%(P0.05)。说明0～6周龄快羽组太行鸡生长速度较快,7～14周龄慢羽组生长速度逐渐加快,15～20周龄时两组之间无显著差异;0～8周龄快羽组主要免疫指标水平更高,免疫机能更强。     

不同饲养模式下滩羊血清代谢组学分析

为探究不同饲养模式下滩羊血清代谢通路及差异代谢物的变化，本试验选取24头9月龄体重为（30.12±3.23）kg、体况相似的去势滩羊，随机分为舍饲组和放牧组，3个月后颈静脉血采血进行非靶向代谢组学分析。结果显示：放牧组和舍饲组中共筛选出234个差异代谢物，其中143个差异代谢物上调，91个差异代谢物下调。通过富集分析得到49个代谢通路，根据富集程度及其与脂质相关性筛选出15个代谢通路，其主要参与机体核苷酸代谢、脂代谢、硒代谢和维生素代谢。综上，放牧饲养模式主要对滩羊的核苷酸代谢、脂代谢和维生素代谢产生影响从而对肉质起到调控作用，而舍饲饲养模式通过硒代谢来调控滩羊肉质。     

山羊慢性酒糟中毒血液代谢物分析及乙醇中毒通路关键基因mRNA转录水平变化

本试验旨在揭示慢性酒糟中毒对山羊血液代谢物及其显著性代谢通路——乙醇中毒代谢通路的影响，筛选潜在性诊断生物标志物，为该病神经系统紊乱发生机制及早期诊断提供参考资料。试验选取4月龄健康大足黑山羊与波尔山羊的杂交后代15只，随机分为3组，65%白酒糟组、75%白酒糟组、基础日粮对照组。每隔15 d,进行肝肾、钙磷及蛋白质代谢指标检测，结合临床症状判断山羊慢性酒糟中毒建模成功。采集血样，利用超高效液相色谱—四极杆飞行时间质谱联用技术进行差异代谢物分析并筛选差异代谢物代谢富集通路，研究差异代谢通路中关键基因的表达变化。代谢组学结果表明，慢性酒糟中毒引起山羊体内多巴胺(DA)和2-呋喃酰甘氨酸(2-FG)上调，前列腺素I₂(PGI₂)下调；突触小泡周期、多巴胺能突触、乙醇中毒、牛磺酸和亚牛磺酸代谢、组氨酸代谢、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成、三羧酸循环、鞘脂信号通路、cAMP信号通路等代谢通路均差异显著(P<0.05)。其中，乙醇中毒代谢途径变化显著，且影响因子>0.2;乙醇中毒代谢通路中，75%白酒糟组TH、DAT表达量显著降低(P&l...     

基于GC-MS代谢组学技术对叶酸调控鸡原代肝细胞代谢的研究

本试验旨在研究叶酸对鸡原代肝细胞代谢的影响,为探究叶酸调控家禽肝代谢的机制提供参考,也为其在家禽养殖上的合理有效应用提供理论基础和科学依据。选择新生雏鸡分离得到肝细胞,待细胞长至铺满板壁80%左右时更换处理培养基,试验分为对照组和叶酸添加组,每个处理6个重复,处理12h后,收集细胞测定细胞内三酰甘油、游离脂肪酸(NEFA)和胆固醇含量,并采用GC-MS技术进行代谢组检测,建立OPLS-DA模型,筛选两组的差异代谢物,并基于KEGG数据库对差异代谢物进行代谢通路分析。结果表明,与对照组相比,叶酸的添加显著降低了细胞内的三酰甘油和胆固醇含量(P0.05),显著提高了游离脂肪酸的水平(P0.05),除此之外,共鉴定到23个上调和9个下调的代谢物,主要为小分子的糖、酸以及氨基酸等,富集到31条通路上,包括氨基酸类代谢、糖类代谢和脂类代谢等。综上所述,叶酸促进鸡原代肝细胞内的脂类分解,参与调控细胞内的糖、脂以及氨基酸代谢,为今后探究叶酸调控家禽代谢机制提供参考。     

基于气相色谱-质谱技术的鸡胸肉代谢组学研究

为鉴定不同鸡种上市日龄胸肌中小分子代谢物与肌肉风味形成的相关性,研究采用气相色谱-质谱联用技术对上市日龄分别为120 d和42 d的北京油鸡和科宝肉鸡(Cobb500)的胸肌进行代谢组学研究。结果表明,北京油鸡和科宝肉鸡胸肌差异代谢物共46种,差异代谢物种类主要包括氨基酸类(19种)、脂肪酸类(10种)、碳水化合物类(7种)、有机酸类(5种)、核苷酸类(2种)等物质外,还包括尿素、胆固醇和多巴胺等代谢物。其中北京油鸡上调表达的差异代谢物14种,下调表达的差异代谢物32种。代谢通路分析显示氨基酸代谢、脂肪酸代谢、半乳糖代谢、生物碱的生物合成和磷酸转移酶系统等代谢通路在不同鸡种胸肌上市日龄风味形成中起主要调节作用。研究结果可为进一步阐明不同鸡种中胸肉风味物质的调控机制提供科学依据。     

基于LC-MS代谢组学的植物乳杆菌发酵黄芪的代谢产物分析

试验旨在利用色谱-质谱联用（liquid chromatograph-mass spectrometer,LC-MS）代谢组学技术分析植物乳杆菌发酵黄芪的代谢产物,并探索其互作发酵机制。分别采取植物乳杆菌发酵黄芪（FT组）和未发酵黄芪固态粉末（CT组）,经样本前处理、LC-MS分析、生物学信息分析等探寻差异代谢物并分析代谢通路。结果显示,总离子流图峰图重现性良好,发酵黄芪主要代谢物共鉴定出183种代谢成分,正离子和负离子模式样品间关系PCA图均能良好区分。火山图分析表明,FT和CT组间的代谢物变化具有差异性,正离子模式上调的1 416个代谢物富集到83个代谢途径;下调的935个代谢物富集到83个代谢途径;负离子模式上调的1 040个代谢物富集到52个代谢途径,下调的809个代谢物富集到45个代谢途径。发酵黄芪差异代谢产物酸类、脂类、酮类等氨基酸显著增加,烯类等氨基酸显著下调,其中上调代谢物15个,下调代谢物2个,关键代谢产物主要为α-硫酸二乙酯、2-甲基柠檬酸、3-异丙烯基-6-氧代庚酸等,涉及到丙酮酸代谢、丙酸代谢、半乳糖代谢等途径。本研究结果为发酵黄芪的代谢产物、发酵互作机制和临床应用提供理论依据。     

SLC家族成员对黑羽番鸭羽色性状的作用初探

为进一步丰富番鸭羽色性状遗传机制的研究，运用Illumina高通量测序技术对不同性别的黑羽及白羽番鸭皮肤组织进行转录组测序，经GO富集分析和KEGG通路注释对差异表达基因功能进行解析，利用qRT-PCR对部分RNA-Seq数据进行验证。结果显示，公黑羽番鸭皮肤（HFPF.G）vs母黑羽番鸭皮肤（HFPF.M）获得差异基因2 131个，公白羽番鸭皮肤（BFPF.G）vs母白羽番鸭皮肤（BFPF.M）获得差异基因780个，黑羽番鸭皮肤（HFPF）vs白羽番鸭皮肤（BFPF）获得差异基因684个，通过上述三组韦恩分析，以黑、白羽番鸭皮肤对比组（HFPF vs BFPF）504个差异基因为番鸭羽色候选基因，进一步筛选获得番鸭羽色性状相关前10个差异表达，其溶质转运蛋白（Solute carrier,SLC）家族成员SLC7A11和SLC25A4可能对番鸭黑、白羽色性状遗传起重要调控作用。同时发现细胞色素P450对外源物质的代谢作用信号通路、谷胱甘肽代谢信号通路、cAMP信号通路等可能参与番鸭黑白羽色性状遗传的调控过程。研究表明，SLC7A11和SLC25A4可用于黑羽番鸭的羽毛分子辅助选育。     

基于气相色谱-质谱联用技术的急性热应激肉鸡血清物质代谢组学研究

本研究旨在运用气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术分析急性热应激肉鸡血清物质代谢组学变化,鉴定出差异代谢物和差异代谢通路,从代谢组学层次揭示肉鸡急性热应激的营养物质代谢途径变化的发生机制。试验选择20只35日龄爱拔益加(AA)肉鸡,随机均分为2组,每组5个重复,每个重复6只鸡。对照组按常规饲养标准温度饲养,热应激组于(32±1)℃下饲养,均持续12 h。翅下静脉采血2 m L,分离血清,经衍生化处理,运用GC-MS技术获得2组肉鸡血清代谢图谱,对试验收集的数据进行代谢物主成分分析和偏最小二乘法分析,鉴定差异代谢物并进行差异代谢通路富集分析。结果表明:利用GC-MS技术,在肉鸡血清中共检测到144种代谢物,筛选出30种差异代谢物[变量权重值(VIP)1,P0.05]。其中延胡索酸、羟丁酸、丙氨酸等14种代谢物含量上调[差异倍数(FC)1],草酸、苹果酸、二羟基丙酮等16种代谢物含量下调(FC1)。代谢通路富集分析表明机体三羧酸循环、半乳糖代谢、丙酸代谢、脂肪酸生物合成等代谢通路发生显著改变(P0.05或P0.01)。由此可见,肉鸡发生急性热应激时血清代谢物和物质代谢途径发生显著改变。鉴定的30种差异代谢物和7种差异代谢通路可作为标志物用于揭示急性热应激的发病机理。     

基于多组学与网络药理学探究淫羊藿对后备母猪发情的作用

旨在揭示淫羊藿对后备母猪发情的作用及其机理。本试验选择210～220日龄,体重(99.547±1.987)kg,发育成熟且符合配种条件的后备待配二元母猪32头,随机分为对照组和试验组,每组16头母猪,每个重复1头母猪。对照组饲喂基础日粮,试验组在饲喂基础日粮的基础上补充淫羊藿粗提物50 mg·d^-1。试验饲喂28 d。结果表明,试验组母猪发情提前,血清FSH、LH和E₂显著增加(P<0.05)。卵巢转录组结果表明,检测出477个上调差异mRNAs, 754个下调差异mRNAs。GO富集分析发现,差异的mRNA主要富集在运输囊泡、脂肪细胞分化、节律行为、发情周期等过程;KEGG富集分析发现,差异的mRNA主要富集在紧密连接、碳水化合物代谢、刺猬信号通路、GnRH分泌和PI3K-AKT信号通路等信号通路。卵巢代谢组结果表明共有1 616个代谢物上调,1 254个代谢物下调。KEGG富集分析表明,差异代谢物主要富集在α-亚麻酸代谢、ATP转运蛋白、亚油酸代谢、β-丙氨酸代谢、氨基苯甲酸盐降解、生物素代谢等通路。网络药理学分析结果表明淫羊藿作用...     

关中奶山羊睾丸不同发育阶段代谢物的差异分析

【目的】 试验旨在从代谢组学角度探究关中奶山羊睾丸发育代谢机制。【方法】 选择1月龄断奶雄性关中奶山羊和24月龄体成熟的雄性关中奶山羊各6只,采集睾丸组织,使用液相色谱-质谱（LC-MS）技术对睾丸组织进行化学检测,通过多维和单维分析相结合的方式对两组不同代谢物进行化学检测、对比与鉴别,通过富集差异代谢物分析筛选关中奶山羊发育代谢中的潜在关键通路。【结果】 在1和24月龄关中奶山羊睾丸组织中共筛选出334个差异代谢物,其中显著上调137个,显著下调197个。对前36个差异代谢物进行比较鉴定发现,分别为脂质和类脂质分子、有机酸及其衍生物、未分类化合物和苯丙烷和聚酮化合物四大类。经相关性分析发现,在1和24月龄关中奶山羊睾丸发育过程中,脂质和类脂质分子与甘油磷脂呈最大正相关,羧基及其衍生物与甘油磷脂呈最大负相关。对不同的代谢物进行富集分析,筛选出7条潜在的重要代谢通路,分别为肿瘤中的胆碱代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、肿瘤中的中心碳代谢、铁死亡、谷胱甘肽代谢、氨酰-tRNA生物组成以及牛磺酸和亚牛磺酸代谢。【结论】 本试验从代谢组学角度揭示了1和24月龄关中奶山羊睾丸的差异代谢物及代谢机制,为今后哺乳动物睾丸的发育研究奠定了基础。     

基于UPLC-Q-TOF-MS/MS代谢组学研究土霉素和穿心莲内酯对鸡代谢的影响

本研究旨在建立基于色谱-质谱联用技术的代谢物分析技术平台，利用等剂量中兽药穿心莲内酯和广谱抗生素土霉素对3周龄仔鸡进行干预，分析药物干预对鸡的排泄物代谢变化，通过数据统计分析寻找差异性代谢物，探讨穿心莲内酯和土霉素对鸡肠道菌群代谢的干预机制。采用UPLC-Q-TOF-MS/MS检测各组黄羽鸡排泄物样本，通过MetaboAnalyst平台进行代谢通路的富集与分析，运用QI软件筛选出差异代谢物。结果表明，相较于空白组，土霉素与穿心莲内酯组分别存在12个和10个差异化合物，土霉素组涉及15条代谢通路，其中，2条最相关代谢通路分别为亚油酸代谢和甘油磷脂代谢的通路；穿心莲内酯组涉及17条代谢通路，其中，5条最相关代谢通路分别为甘油磷脂的代谢、鞘磷脂代谢、半胱氨酸和蛋氨酸的代谢、不饱和脂肪酸的生物合成以及甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸的代谢通路。综上，土霉素和穿心莲内酯影响鸡代谢的作用机制十分相似，均可通过改变磷脂代谢、脂肪酸代谢、氨基酸代谢等途径对鸡正常代谢功能产生影响，尤其是土霉素组与对照组的分布规律有明显差异。     

基于GC-MS技术分析感染BmNPV家蚕幼虫脂肪体组织的代谢特征

选择抗脓病家蚕品种白玉N和敏感品种白玉为研究对象,运用GC-MS技术对添食接种高浓度BmNPV前后2个品种5龄幼虫的4种脂肪体组织样品进行代谢组学研究,分析受到BmNPV胁迫后脂肪体组织在代谢组水平发生的变化,筛选差异代谢物,并进一步分析差异代谢通路.结果 显示:抗性品种白玉N和敏感品种白玉的幼虫脂肪体中共检出各类差异代谢物407种,主要包括氨基酸、糖类、核苷酸、醛和酮等小分子物质,其中胱氨酸、正缬氨酸、香芹酮、岩藻糖等24种代谢物特异性地出现在某一个参比样品中.根据差异代谢物进行KEGG代谢通路富集分析,再对每个参比组中差异最显著的10条代谢通路进行功能聚类,获得可能造成不同品种间抗病性迥异的3条代谢通路,即嘌呤代谢、嘧啶代谢以及泛酸和辅酶A的生物合成,这些代谢通路与家蚕的能量代谢和供给、体内DNA和RNA合成以及氮代谢密切相关.     

调教训练不同阶段对伊犁马粪便代谢组学的影响

【目的】研究调教训练不同阶段伊犁马粪便代谢物变化特征,初步筛选受影响伊犁马调教训练的差异代谢物。【方法】于新疆伊犁昭苏马场选取饲养管理一致、未经调教训练的10匹速步型伊犁马,分为两组,一组开展专项训练,另一组为未训练组。采集训练第30、60天的马匹粪便样本,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术进行非靶向代谢组检测,并对检测结果进行分析。【结果】训练第30天组(QY)和未训练第30天组(QB)比较结果中有27个正离子模式代谢物和20个负离子模式代谢物差异显著,2-花生酰基甘油、丙酰左旋肉碱和肌酸等代谢物显著上调,代谢物主要聚集在β-丙氨酸代谢、精氨酸与脯氨酸代谢、戊糖磷酸途径、花生四烯酸代谢、5-羟色胺能突触等代谢途径中。训练第60天组(HY)和未训练第60天组(HB)比较结果中有57个正离子模式代谢物和33个负离子模式代谢物差异显著,棕榈油酸、棕榈酸、甲睾酮和褪黑素等代谢物显著上调,皮质醇和叶酸等代谢物显著下调,代谢物主要聚集在类固醇激素生物合成、库欣综合征、皮质醇的合成和分泌、神经活性配体-受体相互作用、脂肪酸生物合成、不饱和脂肪酸生物合成等代谢途径中。【结论】调教训练不同阶段伊...     

TYRP1和MLANA影响朗德鹅羽色形成的机制研究

研究旨在确定羽色形成的关键候选基因,为筛查鹅羽色的控制基因提供有用信息。利用1月龄和2月龄灰、白羽朗德鹅皮肤样品(n=12),通过定量PCR测定MLANA、TYRP1、MC1R、ASIP和SLC45A2基因的m RNA表达量。从血细胞中提取基因组DNA,通过测序检测MLANA和TYRP1基因上游序列的核酸多态性。结果显示:在1月龄样品中,ASIP基因表达量在灰、白羽间无显著差异,而其他基因的表达量均存在显著差异(P0.05),且白羽低于灰羽。2月龄时,MC1R和SLC45A2基因的表达量在羽色间无显著差异,但白羽中的ASIP基因表达量显著高于灰羽(P0.05)。与1月龄相一致,白羽中MLANA和TYRP1的表达量均显著低于灰羽(P0.05)。此外,MLANA和TYRP1的上游调控序列中并未发现核酸多态性。结果表明:MLANA和TYRP1基因所在的信号通路对鹅灰、白羽形成至关重要,白羽的TYRP1表达缺失可能受αMSH/MC1R分支以外的其他信号通路分支影响。     

鸡皮肤毛囊生长差异基因的生物信息学分析

【目的】 筛选鸡胚胎早期发育期间背部皮肤上皮和间充质中调控毛囊生长的关键基因、生物过程和信号通路,为了解鸡胚胎早期发育期间毛囊生长的分子机制提供参考。【方法】 从GEO数据库中下载基因芯片GSE62882数据集,采用R语言limma包对数据集进行差异分析,分别筛选出胚胎期第7和9天皮肤上皮和间充质差异基因以及皮肤上皮和间充质共同上下调基因,通过STRING在线数据库对差异基因和共同上下调基因进行蛋白互作网络分析,用Cytoscape 3.8.2软件进行可视化,运用R语言中的clusterProfiler程序包对差异基因和共同上下调基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。【结果】 皮肤上皮在胚胎期第7和9天共筛选出626个差异基因,获得189条相互作用关系、10个生物过程和4条信号通路;皮肤间充质在胚胎期第7和9天共筛选出690个差异基因,获得326条相互作用关系、10个生物过程和3条信号通路;皮肤上皮和间充质在胚胎期第7和9天共同上调基因26个,共同下调基因48个,共同上下调基因存在34条相互作用关系,主要富集在Wnt信号通路上。【结论】 本研究从鸡胚胎期第7和9天皮肤上皮和间充质中筛选到共同上调基因26个,共同下调基因48个,这些基因主要富集在Wnt信号通路上,为探究上皮和间充质在毛囊生长发育中的作用机制提供理论参考。     

基于气相色谱-质谱技术的骡鸭肝脏代谢组学研究

为研究不同日龄骡鸭肝脏生长代谢物的变化差异情况,试验通过代谢组学分析70和90日龄公骡鸭肝脏差异代谢物。结果显示：70和90日龄骡鸭肝脏显著差异代谢物共44种,除包括氨基酸类（9种）、脂肪酸类（7种）、有机酸类（4种）、碳水化合物（9种）、维生素（4种）和核苷酸类（6种）等物质外,还有尿囊素、肾上腺素和D-鞘氨醇等显著差异代谢物。与70日龄骡鸭相比,90日龄骡鸭的肝脏差异代谢物表达上调的有6种,表达下调的差异代谢物有38种。代谢通路分析表明嘌呤代谢、癌症中的中枢碳代谢、环腺苷酸信号途径、脂肪细胞脂解的调控、蛋白质的消化与吸收等代谢通路在70和90日龄骡鸭的肝脏代谢中起主要调节作用。研究表明,这些代谢物的变化差异和参与的代谢通路大部分对骡鸭的肝脏生长均起到一定的保护作用,维持肝脏的生长。     

高铜诱导肉鸡肝脏差异表达的microRNA分析

为了研究高铜(Cu)对肉鸡肝脏microRNA(miRNA)表达的影响,试验选用1日龄健康白羽肉鸡96羽,随机分为2组,每组48羽,并分别饲喂对照日粮(Cu 11 mg/kg,对照组)和高铜日粮(Cu 330 mg/kg,高铜组),于49日龄采集肝脏,利用高通量测序技术观察高铜日粮对肉鸡肝脏miRNA表达量的影响,利用生物信息学方法对36个miRNA的靶基因进行功能分析和信号通路分析。结果表明:与对照组相比,高铜组肝脏有36个miRNA发生差异表达,其中18个miRNA为上调表达,18个miRNA为下调表达;靶基因主要行使细胞代谢、基因表达等功能,参与RNA转运、DNA复制及MAPK、胰岛素和钙等信号通路。说明高铜可影响肉鸡肝脏miRNA的表达。     

不同精粗比日粮对奶牛血液代谢物变化及代谢通路的影响

试验旨在探究不同精粗比日粮下奶牛血液代谢物及其代谢通路的变化规律。将24头2胎次、健康且产后3周左右的中国荷斯坦奶牛分为2组，每组12头，分别饲喂低精粗比日粮（精粗比为40:60）和高精粗比日粮（精粗比为60:40），于第45天晨饲前尾部采血取样，进行非靶向代谢组学分析。结果表明：40:60组与60:40组共49种差异代谢物，上调代谢物18种，下调代谢物31种，主要富集的代谢通路有丙酮酸代谢、糖降解与糖异生、核黄素代谢、烟酸和烟酰胺代谢、硫胺素代谢等。由此可见，不同精粗比日粮会对奶牛的核苷酸代谢和碳水化合物代谢产生影响，进而影响奶牛机体能量代谢。     

基于LC-MS技术的患乳腺癌猫血清代谢组学分析

本试验旨在研究患乳腺癌猫与健康猫体内差异代谢物的变化情况,并探讨差异代谢物与猫乳腺癌发生之间的关系。本试验选取临床收集的经组织病理学确诊的猫乳腺癌血清样本6例作为试验组（T组）,同时选取年龄相似,品种相同的健康猫血清6例作为对照组（C组）。运用超高效液相色谱质谱联用技术（liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS）对两组猫的血清样本进行检测,采用无监督的主成分分析（principal component analysis,PCA）、正交偏最小二乘法-判别分析（orthogonal projections to latent structures-discriminant analysis,OPLS-DA）及学生t检验（Student's t-test）筛选出差异代谢物,然后再对筛选出的差异代谢物进行层次聚类分析（hierarchical clustering analysis,HCA）,并进行差异代谢物的KEGG注释及差异代谢物的代谢通路分析。结果表明,在两组样本中共定性到159种差异代谢物。与C组相比,在T组中有49种差异代谢物出现下调,110种差异代谢物出现上调。最终共筛选出5种与猫乳腺癌发生发展密切相关的差异代谢产物。与C组相比,T组中麦角硫因（ergothioneine,EGT）和肌酸（creatine）出现下调,吲哚乙酸（indolelactic acid,IAA）、胆碱（choline）和尿酸（uric acid）出现上调。这些差异代谢物表明,在猫乳腺癌的发生过程中,机体变化涉及了甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、组氨酸代谢、色氨酸代谢、嘌呤代谢异常和甘油磷脂代谢等多个代谢途径,为今后深入研究猫乳腺癌的发病机制开辟了一个新的思路。