我国芸薹属作物基因组学研究取得国际领先地位

<正>在中国农业科学院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所、深圳华大基因研究院主导下,由中国、英国、韩国、加拿大、美国、法国、澳大利亚等国家组成的"白菜基因组测序国际协作组"共同完成了白菜全基因组研究论文,并于8月29日在国际权威学术期刊《自然—遗传学(Nature Genetics)》上发表。这是继黄瓜基因组测序和马铃薯基因组测序项目     

马铃薯基因组序列框架图公布将使育种过程缩短到5年左右

<正>9月23日,由14国科学家组成的"国际马铃薯基因组测序协作组"同时在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地公布了马铃薯基因组序列框架图。     

马铃薯生育抗病关键基因被发现

中国农科院日前在北京宣布．由14个国家29个单位的97名研究人员组成的“马铃薯基因组测序国际协作组”，继2009年完成“马铃薯全基因组序列图”后。经过近两年工作，马铃薯基因组研究又获得重大成果。     

白菜类作物基因组学研究取得突破

在中国农业科学院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所、深圳华大基因研究院主导下,由中国、英国、韩国、加拿大、美国、法国、澳大利亚等国家组成的"白菜基因组测序国际协作组"共同完成了白菜全基因组研究论文,并于8月29日在国际权威学术期刊《自然—遗传学(Nature Genetics)》上发表。这是继黄瓜基因组测序和马铃薯基因组测序项目后,由中国主导,通过国际合作完成的蔬菜领域基因组研究的又一重大成果,标志着我国以白菜类作物为代表的芸薹属作物基因组学研究取得了国际领先地位。     

前沿动态

中国完成白菜全基因组测序白菜类作物包括大白菜、小白菜、菜心和芜菁等形态各异的一大类蔬菜,是我国栽培面积和消费量最大的蔬菜作物。白菜全基因组测序是继黄瓜和马铃薯基因组测序项目后,由中国主导通过国际合作完成的又一重大成果,标志着我国在该领域基因组学研究中取得了国际领先地位。分析结果表明,白菜基因组大小约为485 Mb,包含约42 000个基因;     

科技要闻

<正>中国主导完成马铃薯基因"蓝图"育种时间将减半以中国为首、14国科学家组成的"国际马铃薯基因组测序协作组",宣布马铃薯基因组序列框架图完成。这标志着人类将能够以马铃薯基因组序列为工具,把马铃薯新品种育种的速度从10~12年缩短到5年,并迅速提高其产量、品质和抗病性。     

马铃薯基因组序列框架图公布将使育种过程缩短到5年左右

2009年9月23日,由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”同时在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地公布了马铃薯基因组序列框架图。     

“焦单6号”玉米667米2产突破900千克

以中国为首、14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”，宣布马铃薯基因组序列框架图完成。这标志着人类将能够以马铃薯基因组序列为工具，把马铃薯新品种育种的速度从10～12年缩短到5年，并迅速提高其产量、品质和抗病性。     

农村科技

<正>我国科学家主导完成50个水稻基因组重测序由中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院、中国科学院研究生院和中国科学院植物研究所等单位主导完成的50个水稻基因组重测序及遗传变异数据库构建等研究成果,本月初在国际著名杂志《自然-生物技术》上在线发表。该研究首次对栽培稻和野生稻基因组进行了大     

我国科学家主导完成白菜、甘蓝基因组测序和分析

<正>由我国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目又取得阶段性重大成果,完成了甘蓝基因组测序和分析。该研究近日在线发表在国际权威学术期刊《自然·通讯》。甘蓝基因组测序是白菜、甘蓝和油菜等芸薹属全基因组测序项目的一部分。这是继白菜基因组测序项目后的又一重大成果。据甘蓝项目组技术负责人、中国农科院油料所刘胜毅研究员介绍,甘蓝基因组至少包含45758个蛋白编码基因,与白菜基因组相似,其基因组的大部分能够与十字花科近缘模式植物拟南芥基因组建立共线性关系,进而为基因组进化研究提供了良好的模式材料。通过对这组模式材料的分析,科学家最终揭示出甘蓝和白菜基因组间存在转座子扩增     

作物多倍体基因组不对称进化规律研究获得突破

由我国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目取得了阶段性重大成果,项目组完成了甘蓝基因组测序和分析,并在此基础上与其他近缘种植物基因组比较,发现了作物种间和种内基因组呈现多层次的不对称的进化规律。该研究目前在线发表在国际权威学术期刊《Naturecommunications》。     

中外科学家携手破译油菜多倍体基因组

<正>目前,由30多个研究机构组成的国际油菜测序联盟首次解码了甘蓝型油菜的基因组。这是国际上首次对传统的多倍体作物复杂的基因组进行的完整测序和组装,并完成了其亲本种的系统比较和进化分析。我国科学家是这个联盟的主要力量之一。该突破性研究成果于2014年8月发表在国际顶级期刊《Science》上。甘蓝型油菜是我国的主要油料作物,其     

前沿扫描六则

正迄今最大规模的中国人基因组测序完成近日,中国研究人员领导的一个国际研究团队声称,他们完成了迄今最大规模的中国人基因组测序和分析,有助于揭示基因与生育的联系以及了解中国人口基因结构。这项发表在新一期美国《细胞》杂志上的研究显示,深圳华大基因研究院用"无创产前基因检测"技术收集了超过14万名中国孕妇的部分基因组样本。研究人员表示,这项研究的测序对象约占中国总人口的万分     

科学家成功绘制出蚜虫基因组图谱

<正>国际蚜虫基因组联盟已成功地对农业害虫"蚜虫"进行了基因组测序。根据对蚜虫基因信息的解读,研究人员期冀将来能开发出防治蚜虫的有效方法。该研究成果发表于2月23日美国《公共科学图书馆.生物学》杂志的网络版上。     

全球首观斜纹夜蛾全基因组精细图谱

正由我国科学家主导的"斜纹夜蛾基因组测序国际合作项目"最近取得重大进展。来自中国、日本、印度、法国、美国、泰国和比利时等国的科学家,经过5年的合作研究,首次获得斜纹夜蛾的全基因组精细图谱,包括31条染色体和4亿多个碱基对的斜纹夜蛾全基因组精细图谱。研究揭示了化学药物防治斜纹夜蛾效果有限的原因,为农     

GILB的研究和工作进展

“全球马铃薯晚疫病防治倡议组织”GILB(GlobalInitiative on Late Blight),于1996年发起,由国际马铃薯中心(CIP)组织召集.国际马铃薯中心也把晚疫病研究列为其优先项目.介绍了近期GILB的主要研究项目和工作,包括①寄主抗性常规抗病育种、群体测试、基因型-环境(G×E)互作效应、标准化国际田间试验(SIFT)、分子生物学技术的数量抗性性状定位(QTL)等内容.②晚疫病菌研究包括分子标记技术,病菌传播和病害流行研究等为晚疫病研究的主体和中心;③综合防治这部分的工作仍然需要以上所述两方面研究成果的大力支持才能取得更好的实效;④信息交流和人员培训;⑤世界马铃薯晚疫病会议;⑥全球区域性和专题性联络小组的设置.还介绍和讨论了国际马铃薯中心与中国的有关合作成果及国内其他有关成果.     

基于 ddRADseq 的马铃薯品种遗传多样性分析

[目的]收集国内外马铃薯品种(系)资源,研究马铃薯种质群体结构和遗传多样性,开发SNP分子标记,为马铃薯品种鉴定、分子标记辅助选择育种奠定基础.[方法]提取马铃薯嫩芽基因组DNA,利用限制性内切酶MseI和SacI进行双酶切建库,质量检测合格后用Illumina HiSeq平台进行双末端测序,用BWA软件将测序数据与马铃薯参考基因组进行比对,采用GATK软件进行SNP和InDel变异位点检测,利用ANNOVAR软件进行变异注释,并基于上述变异信息对群体结构进行Structure分析、主成分分析(PCA)和遗传多样性分析.[结果]通过简化基因组测序共获得7.50×108条测序reads和2.04×1011个碱基,共检测到39038个变异位点,其中SNP位点36267个,InDel位点2771个;基于上述变异位点的Structure和PCA分析均将研究群体划分为两个亚群,群体系统发生分析表明,G2亚群中的个体聚类在一起,亲缘关系较近,但与其他个体相比G2亚群中的分枝距离中心较远,积累了更多的变异量;群体的平均多态性信息含量PIC=0.3107,期望杂合度He=0.3932,观测杂合度Ho=0.1852,群体自交系数Fis=0.553,表明马铃薯品种(系)间遗传多样性较低;开发了覆盖马铃薯12条染色体且包含120个SNP标记的SNP-Panel,并选取其中的60个标记在46个样品中进行了验证.[结论]研究结果为马铃薯遗传多样性研究、分子标记辅助选择育种、分子身份证开发、遗传图谱构建奠定了一定基础.     

我国完成31个大豆基因组重测序

<正>由香港中文大学、华大基因研究院、农业部、中国科学院等单位合作的"大豆回家"项目研究成果,"31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和进化选择模式"11月14日在国际著名杂志《自然-遗传学》上在线发表。     

辣椒全基因组序列测定完成

<正>近日,由贵州省遵义市农科所牵头,四川农业大学、华南农业大学、深圳华大基因和墨西哥生物多样性基因组学国家重点实验室等13家科研院所,通过对辣椒基因组、转录组、重测序、小RNA、Bisulfite等方面的研究,成功测定了遵义市农业科学研究所选育的栽培品种"遵辣1号"(Zunla-1)和其来自墨西哥的野生种"Chiltepin"的基因组,研究成果以论文形式于2014年3月在国际著名期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)上发表,该论文标志着辣椒基因组序列成功解码,贵州辣     

绵羊基因组的研究新进展

<正>日前,绵羊基因组的研究已进入了国际基因组测序的日程。事实上,由于国际市场绵羊产品需求量少而使得商业化绵羊基因组资源比其它种类的家畜基因组资源开发速度慢,规格也低。Orla Keane博士在爱尔兰农业与食品发展部Teagasc的一个研究与创新杂志《TResearch》上撰文指出,国际绵羊基因组协会的形成宣告了绵羊基因组研究的一个新纪元。国际绵羊基因组协会利用新开发的DNA芯片为来自全世界的74个品