,斑丹毒丝菌SpaA的分段克隆及表达

为筛选表达量高且免疫原性强的红斑丹毒丝菌表面保护性抗原A(SpaA)的抗原片段,本研究根据该菌SpaA的结构和功能区将其设计为6个子片段和1个全长片段,采用PCR技术从红斑丹毒丝菌HG-1菌株中扩增出SpaA的7个抗原基因片段,利用原核表达系统克隆并表达后采用SDS-PAGE和western blot检测表达及纯化情况...     

番鸭呼肠孤病毒ZJ99株σC蛋白基因的克隆与序列分析

参考已发表的番鸭呼肠孤病毒(mDRV)的S4序列设计了S4对扩增σC蛋白基N的引物，对mDRV ZJ99株的RNA抽提物进行RT—PCR扩增，获得了特异性的扩增片段。将PCR产物克隆测序，序列经同源性比较，发现mDRV ZJ99株σC蛋白基N序列与福建MW9710株对应基N的同源性为99．5％，与法国89026株对应基因的同源性为94．2％，与法国89330株对应基因的同源性为95．0％；相应的氨基酸序列同源性分别为98．9％、94．1％、93．7％。基于σC基因及其推导氨基酸序列的蛋白质结构及物理化学性质预测结果，与国外学者对mDRV σC蛋白的报道相似。     

丹毒丝菌spaA基因免疫保护区的克隆与功能研究

本研究以丹毒丝菌XJ1249基因组DNA为模板,根据GenBank已发表的丹毒丝菌表面保护性抗原A (SpaA)的序列设计引物进行PCR扩增,得到大小约1 029 bp的spaA基因N端免疫保护片段(spaA-N)。将spaA-N连接到载体pGEX-4T-1上构建重组原核表达质粒pGEX-spaA-N,对重组质粒进行序列验证后,在IPTG的诱导下,表达和纯化重组蛋白r-SpaA-N,并研究其对小鼠的免疫保护作用。结果显示:分离纯化的重组蛋白具有免疫原性,并对小鼠具有免疫保护性,能够有效防止丹毒丝菌对小鼠的侵染。研究结果为进一步研究丹毒丝菌致病机理,开发新的猪丹毒诊断试剂盒和亚单位疫苗奠定了基础。     

猪丹毒杆菌SpaA基因的克隆与生物信息学分析

旨在克隆猪丹毒杆菌表面保护性抗原A(surface protein A,SpaA)的编码基因,并预测该蛋白的二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨猪丹毒杆菌SpaA蛋白在免疫保护中所起的作用.首先对猪丹毒杆菌SpaA基因进行PCR扩增、克隆和测序,并进行同源性比较.应用生物信息学方法,对猪丹毒杆菌SpaA蛋白的二级结构和B细胞抗原表位进行预测.结果显示,猪丹毒杆菌SpaA基因全长1 881 bp,编码626个氨基酸,发育进化树结果表明分离的2株猪丹毒杆菌菌株与GenBank中其他菌株在进化树中关系较远,自成一个分支.二级结构的预测结果显示该蛋白主要以无规则卷曲、α螺旋和延伸链为主,只有少数的β转角；推测该蛋白有14个B细胞优势抗原表位区域、8个N-肉豆蔻酰化位点.该研究为进一步分析猪丹毒杆菌免疫机理、表位疫苗设计等奠定理论基础.     

上海地区屠宰场猪红斑丹毒丝菌的分离鉴定

为了解上海地区猪红斑丹毒丝菌在健康猪群中的带菌状况,本试验选择上海地区标准化屠宰场的上市猪为研究对象,采集鼻拭子、肺脏、扁桃体和下颌淋巴结等样本,进行猪红斑丹毒丝菌的分离,采用VITEK 2 Compact系统和VITEK MS快速鉴定系统进行鉴定,并设计1对16S rRNA基因引物,对分离菌株进行PCR扩增,随机选取16株分离菌进行测序及16S rRNA同源性分析。结果显示,49.07%（105/214）的样本中分离到猪红斑丹毒丝菌,分离菌株同参考菌株及疫苗株之间16S rRNA同源性为99.6%~100.0%。本试验结果表明上海地区猪群中确实存在猪红斑丹毒丝菌的健康带菌状况。     

红斑丹毒丝菌的分离鉴定及疫苗的免疫保护作用

自重庆地区屠宰场猪扁桃体样品分离红斑丹毒丝菌,在测定血清型、Spa基因型和致病性的基础上,研究了弱毒疫苗G_4T_(10)的免疫保护作用。结果显示,从146份样品中分离33株红斑丹毒丝菌,其中27株对小白鼠具有致病性;19株和2株分别在试管凝集试验和琼扩试验中与兔抗G_4T_(10)血清呈阳性反应;12株为SpaA型,21株为SpaB型;在弱毒疫苗G_4T_(10)的免疫保护试验中,被动或主动免疫小白鼠对11株分离细菌的攻击具有保护作用。结果表明,健康猪群红斑丹毒丝菌的带菌率高,弱毒菌苗G_4T_(10)对多数菌株缺乏免疫保护。     

鸡致病性大肠杆菌1型菌毛fimI基因克隆与序列测定

对鸡O2血清型致病性大肠杆菌1型菌毛fimI基因进行了扩增并与国外同源菌株基因序列进行了比较。结果表明：两者核苷酸同源性达98．42％，预测氨基酸顺序同源性达98．92％。fimI基因的预测氨基酸序列中仅第46位氨基酸由ALA变为THR，第76位氨基酸由SER变为ALA，其余核苷酸的变化未影响氨基酸的翻译，推测，这种改变是由分离株的差异所引起的。     

鸡传染性支气管炎病毒分离株核衣壳基因克隆、序列分析和真核表达

根据GenBank公开序列自行设计一对引物，采用RT—PCR扩增出鸡传染性支气管炎病毒（Infectious bronchitis virus，IBV）W和C9001分离株完整的核衣壳（N）基因，并将其克隆至pMD18-T载体进行核苷酸序列测定和分析。结果表明，扩增的2个IBV分离株核衣壳基因片段长度均为1230bp，编码409个氨基酸，彼此间核苷酸和氨基酸同源性分别为88．0％和89．5％，与GenBank中有代表性的参考毒株相应基因核苷酸和氨基酸序列比较显示，w株核苷酸序列与GenBank中的广东分离株（AY646283）同源性最高，为94．1％，氨基酸序列同源性为94．6％；与国内部分毒株核苷酸序列同源性在86．1％～88．0％之间，氨基酸序列同源性在88．0％～90．7％之间；C9001株与国内部分毒株核苷酸序列同源性在86．4％～99．8％之间，氨基酸序列同源性在88．0％～99．8％之间。从核衣壳基因编码的氨基酸序列的系统进化树可见，W株与C9001株处于不同的进化分枝，亲缘关系较远。同时将核衣壳基因构建于真核表达质粒pVAX1中，用脂质体法将重组质粒转染入COS-7细胞中，间接免疫荧光检测出核衣壳蛋白的体外表达。研究结果为进一步研究IBV核衣壳蛋白的结构与功能以及基因工程疫苗的研制奠定了基础。     

禽巴氏杆菌C48-1外膜蛋白H基因克隆及序列分析

根据已发表的外膜蛋白基因核苷酸序列设计一对特异性引物，应用PCR方法扩增出禽巴氏杆菌5：A C48-1株的ompH全长片段，将ompH进行T—A克隆、序列测定和分析。结果表明，ompH全长1597bp，含有一个1056bp的开放性阅读框架（ORF），编码352个氨基酸，前20个氨基酸组成信号肽。与已知的15个血清型及痘苗株CU的ompH的核苷酸及其推导的氨基酸序列比较，核苷酸同源性在51．5％～98．7％之间，氨基酸同源性在39．3％～98，7％之间。氨基酸多序列比较显示，血清型特异性抗原表位位于60～80位和200～220位氨基酸处。     

牛病毒性腹泻病毒HB-DCZ株E0基因的克隆与抗原表位预测

根据GenBank上发表的牛病毒性腹泻病毒(BVDV) Oregon C24V株E0基因的核苷酸序列设计1对特异性引物,应用PCR技术扩增BVDV HB-DCZ株E0基因.将PCR产物克隆到pMD18-T载体,克隆产物进行序列测定与分析.结果显示,HB-DCZ cDNA体外扩增获得特异性条带,约为687 bp.序列测定结果表明,HB-DCZ株E0基因由681个核苷酸组成,编码227个氨基酸.与已公开发表的BVDV其他毒株核苷酸和推导氨基酸序列同源性相似顺序依次为:CCSYD 99％和98.7％、QHZK10 98.4％和97.8％、VEDEVAC 98.2％和97.8％、Oregon C24V80.9％和89.9％、Yak 74.2％和81.1％.HB-DCZ与CCSYD、QHZK10以及VEDEVAC株的遗传距离较近,与国际标准毒株C24V、Yak株的遗传距离较远.运用Kyte-Doolittle方案预测氨基酸的亲水性,采用Karplus-Schulz方案预测蛋白质的柔性区域,按Jameson-Wolf方案预测抗原指数,利用Emini方案预测蛋白质的表面可及性.对预测结果综合分析,推测最有可能的B细胞表位位于N-端6～17、23～29、47～53、59～68、70～81、97～109、114～122、127～134、137～143、165～172、186～198和213～220.     

Characterization of DNA fragment from Chlamydia psittaci avian strain which shows high homology with hypB gene of Chlamydia.

A study was performed to characterize DNA fragment No. 17 of C. psittaci strain P-1041 which encoded 42 KD beta-galactosidase fusion protein with type-specific antigenicity. Sequence determination identified a partial open reading frame that spanned about 1,200b. p. nucleotides. Screening the literatures for the nucleotide and deduced amino acid sequences revealed extensive similarity between the DNA fragment of P-1041 and two chlamydial hypB genes. This DNA showed 91.5% homology with C. psittaci GPIC hypB gene in nucleotide sequence and 96.4% homology in deduced amino acid sequence. The hypB gene of C. trachomatis serovar A and the P-1041 DNA fragment showed 81.2% and 91.3% homology in nucleotide and amino acid sequences, respectively. Dot enzyme-linked immunosorbent assay, for the products of deleted DNA fragments defined the coding region for type-specific antigenic polypeptide. In addition, the P-1041 DNA fragment carried a sequence highly homologous (greater than 49%) with other bacterial and plant genes called chaperonin which responds to various stress in cells. From these results, the P-1041 DNA fragment was found to be a part of hypB gene and to encode the region critical for type-specific antigenicity.     

安徽IBV地方株AH1-99株S2基因的克隆与序列分析

用RT-PCR技术扩增出IBVAH1-99株的S2基因cDNA,并将其克隆到pMD18-T载体中进行序列测定和分析。结果表明,该分离株S2基因全长共1881个核苷酸,编码625个氨基酸;与GenBank中登录的IBVS2基因核苷酸的同源性为72．5％～88．99,氨基酸的同源性为70．3%-88．0％;在895nt-900nt处插入了GCG ACT 6个碱基,在1441nt～1446nt处缺失了ATTACT6个碱基。     

固始鸭白细胞介素-18全基因克隆与分子进化分析

根据GenBank发表的鸭IL-18cDNA基因序列设计、合成一对引物,应用RT-PCR技术,无需用非特异性免疫原如PHA等刺激脾淋巴细胞,直接提取脾淋巴细胞总RNA,扩增固始鸭IL-18基因,并克隆、测序。测序结果表明固始鸭IL-18基因全序列为610bp,包含1个完整阅读框,编码1条由200个氨基酸残基组成的多肽。序列分析发现,固始鸭IL-18基因与GenBank中两条鸭IL-18基因(AF336122和DQ490137)核苷酸同源性分别为98.8%、99.8%,与AF336122有5个碱基发生非同义变异,2个碱基为同义变异,氨基酸同源性为97.5%,与DQ490137有一个碱基发生非同义变异,氨基酸同源性为99.5%。固始鸭IL-18前体蛋白第30位谷氨酸处有一个IL-1β转换酶的caspase-1切割位点及在人和其他动物中已证实的IL-1标签序列,推测鸭IL-18成熟蛋白由170个氨基酸组成。固始鸭与人和其他动物的IL-18基因进化分析表明,IL-18基因存在着种的多样性,且亲缘关系越近,同源性越高。     

Antiserum against culture filtrate is cross-protective for various serovars of Erysipelothrix rhusiopathiae

The protective effect of porcine antiserum prepared against culture filtrate (CF) of an attenuated strain of Erysipelothrix rhusiopathiae (serovar 2) in mice to challenge with 20 virulent strains of 18 serovars and one type N was investigated. Passively immunized mice survived after challenge with serovars 1a, 1b, 2, 5, 6, 8 (strain Goda), 11, 12, 15, 16, 21 or type N, but 10-30% mortality occurred in immunized mice challenged with each strain of serovars 4, 7, 8 (strain 911), 9, 18 or 19 and 70% mortality to serovar 10 (strain 2179). All immunized mice died after challenge with serovar 20 (strain 2553). Non-treated control mice died after challenge with all serovars and the type tested.     

Molecular cloning and characterization of cDNA encoding CD11b of cattle

CD18, the common β subunit of β₂-integrins, associates with four distinct chains to give rise to four different β₂-integrins: CD11a/CD18 (LFA-1), CD11b/CD18 (Mac-1), CD11c/CD18 (CR4), and CD11d/CD18. Previously, we and others showed that CD18 of LFA-1 serves as a receptor for Mannheimia haemolytica leukotoxin (Lkt). Level of expression of Mac-1 is higher than that of LFA-1 and other β₂-integrins on polymorphonuclear leukocytes (PMNs), which constitute the leukocyte subset most susceptible to Lkt. Hence, it is likely that CD18 of Mac-1 also mediates Lkt-induced cytolysis. Co-expression of CD11b and CD18 of cattle on Lkt-resistant cells is necessary to irrefutably demonstrate the role of Mac-1 in Lkt-induced cytolysis. This approach is hindered by lack of availability of complete sequence of cattle CD11b. Therefore, in this study, we cloned and sequenced the full length cDNA encoding cattle CD11b. The 3459 bp cDNA of cattle CD11b encodes a polypeptide of 1152 amino acids. The deduced amino acid sequence of CD11b of cattle exhibits 75% identity to that of humans and chimpanzees, 74% identity to that of dogs, and 70% identity to that of mice and rats. Availability of cattle CD11b cDNA should facilitate the elucidation of Lkt-receptor interactions in cattle and other species.     

猪细环病毒1b型ORF3基因克隆及序列分析

为明确福建省猪细环病毒（porcine torque teno sus virus,PTTSuV）1b型（PTTSuV-1b）ORF3基因的遗传进化特征,本研究根据GenBank中登录的PTTSuV-1b基因组特征设计特异性引物,对福建省某猪场患有仔猪断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)的猪血清进行PTTSuV-1b分段扩增,并分别对PCR扩增产物进行胶回收后克隆测序,将测序结果经BLAST分析后进行序列拼接。试验结果表明,所扩增的目的片段编码有完整的PTTSuV-1b ORF3蛋白,全长为600 bp,编码有199个氨基酸。将获得的PTTSuV-1b型福建株与GenBank中PTTSuV-1b型的ORF3基因进行比对分析,其与FJ/China/2010/TTV2/2株核苷酸同源性最高,为99.7%,与西班牙PTTSuV-1b分离株TTV2_G43核苷酸同源性为97.3%,与SC株核苷酸同源性稍低,但也达94.0%;而与猪细环病毒K2型德国家猪分离株472142株核苷酸同源性仅为60.7%,与猪细环病毒1a型西班牙分离株PTTV1_1914株核苷酸同源性仅为46.8%。从遗传进化关系上看,PTTSuV-1b ORF3基因在遗传进化上呈2个大的遗传进化分支（分支Ⅰ和分支Ⅱ）,本研究分离株处于分支Ⅰ。     

猪瘟病毒山东惠民分离株E2基因的克隆及表达

从山东惠民某猪场病料中经RT-PCR扩增了猪瘟病毒（CSFV）E2基因,并将其克隆到pMD18-T载体。经序列测定,E2基因核苷酸序列长度为1 065bp,与GenBank中CSFV石门毒株（SHIMEN）、猪瘟兔化弱毒疫苗株（HCLV）、猪瘟ZJ7分离株E2基因核苷酸序列同源性分别为85.1%,84.2%,98.8%;氨基酸序列同源性分别为91.5%,91.5%,98.6%。将E2基因插入到大肠杆菌原核表达载体pGEX-KG,获得重组质粒pKG-E2,再转化大肠杆菌BL21（DE3）感受态细胞,经IPTG诱导,受体菌能表达大小约为65 000的蛋白。Western blot显示表达的蛋白具有反应原性。     

Cross protection of mice and swine inoculated with culture filtrate of attenuated Erysipelothrix rhusiopathiae and challenge exposed to strains of various serovars

Mice and swine inoculated subcutaneously with culture filtrate vaccine prepared from acriflavine-fast attenuated Erysipelothrix rhusiopathiae strain Koganei 65-0.15 (serovar 2), were challenge exposed to 20 pathogenic strains of E rhusiopathiae of 18 serovars and type N. Vaccinated mice survived after challenge exposure to serovars 1b, 2, 8 (strain Goda), and type N, but mortality occurred in vaccinated mice challenge exposed to other strains: 20% to 30% mortality in mice challenge exposed to serovars 1a, 11, 12, 15, 16, or 21; 40% to 50% mortality in mice challenge exposed to serovars 4, 5, 6, 7, or 8 (strain 911); and 60% to 80% mortality in mice challenge exposed to serovars 9, 10, 18, or 19. All vaccinated mice died after challenge exposure with strain 2553 (serovar 20). Non-vaccinated control mice died after challenge exposure to all strains. Of 2 vaccinated swine challenge exposed to strain 2553, 1 developed a local urticarial lesion at the site of intradermal exposure. Vaccinated swine challenge exposed to serovars 1a, 1b, 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 15, 16, 18, 19, 21, or type N did not have clinical signs of acute erysipelas. Nonvaccinated control swine developed acute generalized erysipelas or localized urticarial lesions at the site of intradermal exposure.     

山羊关节炎-脑炎病毒甘肃株env基因的克隆和序列分析

本试验参考GenBank上发表的CAEV-63株的env基因核苷酸序列设计一对引物，以CAEV甘肃株前病毒DNA为模板，PCR扩增产物约2．9kb，与预期的目的片段大小一致。回收目的基因片段并将其克隆到pMD18-T载体上，经PCR及酶切鉴定阳性的重组质粒测序，结果表明所扩增2893个核苷酸片段含有CAEV囊膜基因的全序列，编码964个氨基酸。核苷酸和氨基酸序列分析显示，CAEV甘肃株env基因与CAEV-63美国株的env基固核苷酸和氨基酸的同源性分别为99．0％和98．1％。