SSPOS:一个用于模拟、预测和优化社会性遗传效应的软件工具

旨在开发一款软件工具来研究畜禽经济性状的社会性遗传效应。利用QT、Fortran、R等语言根据前人研究的社会性遗传效应选择理论和课题组自主研发的优化选择方法,开发社会性遗传效应模拟、预测和优化系统(SSPOS),一款专门综合分析家畜经济性状社会性遗传效应,并且图形化展示结果的软件工具。结果,通过SSPOS软件我们能有效模拟不同情形下社会性遗传效应选择效果,对实际性状数据的社会性遗传效应进行快速预测,并给出目标性状社会性遗传效应最优选择决策。SSPOS能够快速分析家畜经济性状的社会性遗传效应,是研究畜禽社会行为互作的有效工具。     

选育存活率高的家畜具有重大经济意义

许多性状都在选育方案中占有重要地位,但几乎没有人会否认存活率是所有性状中最重要的经济性状。本文论述了应否以及如何将遗传选育应用于提高家畜的存活率。     

利用猪背膘厚和平均日增重的显性效应和印记效应模型进行基因组预测

正显性和印记遗传效应已被证实可以促进某些性状的遗传变异,但是在家畜复杂性状的基因组预测方面通常被忽视。本研究的目的是在丹麦杜洛克猪的背膘厚(BF)和平均日增重(DG)的基因组数据基础上评估加性效应、显性效应和印记遗传效应的变异,并且评估对遗传进展进行的预测。方法     

家畜行为及其遗传学研究进展

家畜生产育种中除对日增重、饲料报酬、瘦肉率等主要生产性状进行选择外,还要求家畜性情温和、无恶癣、母性好、恐惧行为低等良好的行为性状。因此改善提高家畜重要行为性状在生产实践中亦不容忽视。家畜重要行为性状主要指与生产及选择密切相关的母性行为、恐惧行为、攻击行为等,这些性状一般具有数量遗传学的特点,故可通过选择提高以改善其性能。本文在表观及分子水平综述了国内外家畜重要行为性状及其遗传的研究进展,以期对国内家畜行为遗传研究起到推动作用。     

大白猪繁殖性状的遗传参数估计及进展分析

本研究旨在对大白猪繁殖性状进行遗传参数估计,并评估这些性状间的遗传相关和表型相关及遗传趋势和表型趋势,为目标群体的生产管理提供参考依据。利用R软件对影响大白猪繁殖性状的固定效应进行方差分析,利用DMU软件分别采用单/多性状动物模型计算了大白猪繁殖性状的遗传参数,并评估这些性状间的遗传相关和表型相关及遗传趋势和表型趋势。结果显示:不同固定效应对不同繁殖性状的影响不同。大白猪初配日龄的遗传力为0.19,属于中等遗传力性状;其他繁殖性状的遗传力在0.045～0.106,属于低遗传力性状。繁殖性状间的表型相关在0.071～0.978,遗传相关在0.097～0.989。各性状表型趋势和遗传趋势总体呈上升趋势。各固定效应对不同性状的影响不同,应提高各猪场的饲养管理水平。本群体整体遗传趋势和表型趋势呈上升趋势,说明本群体的遗传改良取得了一定效果。     

家畜全基因组关联分析研究进展

全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是一种研究经济性状候选基因的分析方法。近年来,随着家畜全基因组测序的完成,大量的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)被标识,GWAS也越来越多地应用于家畜重要性状的研究领域中,在动物遗传育种中,通过对家畜基因组进行GWAS分析研究,找到控制家畜主要经济性状的重要SNPs,从而挖掘重要经济性状的候选基因。作者详细综述了GWAS的分析方法及其在重要家畜育种中的研究进展。GWAS分析方法包括基因组控制法(genommic control)、分层分析法(stratification analysis)、主成分分析法(principal components analysis,PAC)和混合线性模型分析法(mixed-linear-model association,MLMA),通路分析方法包括非核算法(基因功能富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)和分层贝叶斯优取(hierarchical Bayes prioritization,HBP))和核算法。依据不同的目标性状选择合理的分析方法,提高GWAS分析结果的准确性,为进一步利用GWAS分析各种性状的遗传基础提供合理的借鉴。     

远交群体数量性状基因位点定位的原理

1　引言数量性状基因位点的定位是各种遗传操作的基础 ,如标记辅助选择、基因克隆和转基因动物等。可以预计 ,数量性状基因位点的定位将是今后一段时间内家畜育种工作的重要内容 ,这必将提高家畜育种的效率。利用遗传标记进行数量性状基因位点定位 ,为家畜育种开辟了一条新的途径 ,长期以来由于缺乏合适的遗传标记 ,育种工作者只能利用血型、血蛋白及酶的多态性作为遗传标记进行研究 ,因而进展缓慢。新一代遗传标记微卫星的出现 ,使家畜数量性状基因位点定位的研究再度成为热点。本文将进一步讨论在远交群体中进行数量性状基因位点定位的统…     

家畜行为及其遗传学研究进展

家畜生产育种中除对日增重、饲料报酬、瘦肉率等主要生产性状进行选择外,还要求家畜性情温和、无恶癖、母性好、恐惧行为低等良好的行为性状.因此改善提高家畜重要行为性状在生产实践中亦不容忽视.家畜重要行为性状主要指与生产及选择密切相关的母性行为、恐惧行为、攻击行为等,这些性状一般具有数量遗传学的特点,故可通过选择提高以改善其性能.本文在表观及分子水平综述了国内外家畜重要行为性状及其遗传的研究进展,以期对国内家畜行为遗传研究起到推动作用.     

肉羊遗传参数的估计

家畜数量性状的遗传规律反映了畜禽品种的种质特性,同时,家畜数量性状遗传参数也是确定选种方法、预测选择效果、估计育种值、制定选择指数以及进行间接选种的重要依据。     

家畜全基因组关联分析研究进展

全基因组关联分析（genome-wide association study,GWAS）是一种研究经济性状候选基因的分析方法。近年来,随着家畜全基因组测序的完成,大量的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）被标识,GWAS也越来越多地应用于家畜重要性状的研究领域中,在动物遗传育种中,通过对家畜基因组进行GWAS分析研究,找到控制家畜主要经济性状的重要SNPs,从而挖掘重要经济性状的候选基因。作者详细综述了GWAS的分析方法及其在重要家畜育种中的研究进展。GWAS分析方法包括基因组控制法（genommic control）、分层分析法（stratification analysis）、主成分分析法（principal components analysis,PAC）和混合线性模型分析法（mixed-linear-model association,MLMA）,通路分析方法包括非核算法（基因功能富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）和分层贝叶斯优取（hierarchical Bayes prioritization,HBP））和核算法。依据不同的目标性状选择合理的分析方法,提高GWAS分析结果的准确性,为进一步利用GWAS分析各种性状的遗传基础提供合理的借鉴。     

动物医学临床教学数据库的构建与初步应用

动物医学专业不仅要求学生掌握扎实的理论知识,还需要具有丰富的临床实践经验。为了实现该目标,除了要求授课教师对专业知识融会贯通,更需要拥有大量典型的临床病例资料。以安徽农业大学动物医院和畜禽疾病诊断中心为平台,收集大量宝贵的临床病例资料和最新的临床诊疗技术,构建了动物医学临床教学数据库,使得诊疗动物种类多样化,案例信息全面化、系统化。该数据库的建成和应用,为临床教师提供了丰富的教学素材和资料,亦提升了学生的学习兴趣,促进了动物医学专业的教育教学发展。     

本科生动物生物化学实验课程教学的改革探索

动物生物化学实验课程是动物科学和动物医学专业本科生的一门非常重要的实验课程。分析了动物生物化学实验课程的教学现状和存在的问题,结合本科生的培养目标和培养要求,从教学内容、教学模式、考核方式等方面对动物生物化学实验课程教学改革探索提出针对性意见,以提高实验教学效果和质量,增强学生的科研创新意识和综合素质。     

动物生理学实验课程教学改革研究

动物生理学实验是一门独立开设的、实践性较强的课程,是动物科学和动物医学专业必修的专业基础课。通过动物生理学实验的学习拥有稳固的基础知识和过硬的实践技能是重要目标。为使学生更好地掌握该门课程,适时合理地进行教学改革迫在眉睫。通过简述动物生理学实验传统教学现状、改变现有的教学模式和相应的考核机制,因材施教,分类教学,以期通过教学改革使学生在巩固理论知识的同时掌握实验基本技能,提高实践创新能力及综合素质。     

高职农业院校家畜育种学课程教学内容和方法的实践与探讨

家畜育种学是动物科学专业必修的专业基础课。根据养殖企业人才需求及本科和专科学生的特点,实践开展了匹配专科畜牧兽医和本科动物科学专业（4＋0）共享的家畜育种学课程,从重新组织编排教学内容到合理组织教学策略,即突出有用性、适用性和新颖性;采用丰富的教学方法和手段,合理安排理论和实训课程;通过多样的考核方式,综合评定教学效果。以培养学生科学思维为出发点,熟练掌握一线实践技能为落脚点,逐步提高学生的综合实践能力,并获得了良好的教学效果。     

《配合饲料学》课程教学改革与方法

《配合饲料学》是动物科学专业应用性很强的一门课程,教学中应注重学生实践能力的培养,将理论与实践相结合。对《配合饲料学》课程教学模式改革初步探讨,以期通过改变现有的教学模式与内容,提高学生实践创新能力及综合素质。     

GBS育种分析系统在家畜育种学实验教学中的应用

国内外的家畜育种学发展迅速,新理论和新研究成果不断涌现,新方法和新技术在生产中发挥了越来越大的作用,因此,家畜育种学的内容也在不断丰富。河南科技大学动物科技学院在家畜育种学实验教学中普遍存在缺乏综合性实践性的实验以及实验课上学生的动手操作积极性不高的现象。针对以上问题,该研究将GBS育种分析系统在家畜育种学的实验教学中进行应用,具体应用在单性状育种值估计、多性状育种值估计、近交系数计算、选配计划等方面。通过以上实验教学改革以后,提高了学生参加家畜育种学实验课程的积极性,增长了学生的专业技能。     

参与式教学法在《动物生理学》课程教学中的应用

《动物生理学》是动物医学和动物科学专业重要的专业基础课之一。为了提高本科生《动物生理学》课程的教学质量,针对目前教学现状和存在的问题,初步探讨了“参与式”教学法在该课程教学设计中的重要性,并从教学内容、课堂讨论和教学评价模式等方面进行“参与式”教学法改革和探索,以期激发学生学习兴趣,积极参与到课堂教学中来,提高学生自主创新学习的能力。     

以养牛学课程为例探索动物生产学的教学改革

动物生产学属于应用型学科,具有很强的实践性,教学任务是使学生掌握现代畜禽饲养的新技术、新方法,适应行业需求,具备服务企业的基本技能.然而,农业院校现有的教学模式很难实现以上目标,且普遍存在课堂教学不能充分调动学生学习积极性的问题.为培养符合社会需求的高素质畜牧专业人才,课程改革与创新势在必行.以养牛学课程为例,从课堂教...     

动物环境卫生学实验课程教学改革探索

动物环境卫生学实验课是加强学生操作技能的主要环节。通过实验课,可以让学生更好地对养殖场环境做出正确的评价,因此,有必要全面提高实验课的教学质量和效果。论述了动物环境卫生学实验课程建设中的一些主要问题,主要从教学观念、实验内容、教学方法、课程考核评价4个方面进行了分析,提出了动物环境卫生学实验课程改革的对策和建议。     

本科院校动物生产学实践教学模式的创新研究与阶段性评价 ——以河南农业大学牧医工程学院为例

分析了动物生产学实践教学过程中存在的问题,从教学内容与方法创新、构建“3+1”实践教学模式、“双师”型教师培养和实践教学评价体系等方面进行了实践教学内容改革。结果显示：学生的综合素养明显提升,就业适应期缩短;校企合作更加紧密,促进了科研的选题和成果转化;初步建立了实践教学评价体系和企业用人反馈机制;实习基地软硬件建设得到改善;形成了动物生产学实验、实习、实训、毕业设计一整套完善的实践教学新模式。随着信息化技术的发展,农业科学类院校还需要不断完善实践教学工作,包括更新实验设备、虚拟仿真技术的应用、前沿科学技术引入以及现代化养殖场远程教学等。