QTL定位方法及其在番茄品质性状研究中的应用

主要介绍了QTL定位的主要方法,及其在番茄品质性状研究中的应用,并对QTL定位方法的研究进行了展望.     

食用菌QTL定位研究进展

 综述了食用菌数量性状位点（quantitative trait loci,QTL）定位方法和研究现状,指出应在使用稳定性和重复性好的分子标记构建高密度遗传图谱基础上,采用多种分离群体开展食用菌QTL定位研究。     

园艺作物果形遗传研究进展

 果实形状是果品、瓜菜及果菜类蔬菜等园艺作物品质评价、分类以及市场定级的主要考核指标之一,也是商业品质育种的重要依据。对园艺作物果形遗传分析研究中的果形测定方法、遗传分析方法及主要园艺作物果形遗传等进行了综述,并对主要园艺作物果形QTL定位及基因定位和克隆的研究进展作了重点阐述。     

利用高代回交群体定位野生醋栗番茄发芽期耐盐QTL

以野生醋栗番茄（Solanumpim pinellffolium）LA722和栽培番茄（Solanum lycopersicum）9706为材料,结合发芽期大规模盐胁迫筛选方法和AB—QTL技术进行耐盐QTL定位和转育研究,建立了包括280个BC3s。     

番茄渐渗系群体及其利用研究进展

对目前已构建的番茄渐渗系（Introgression Line,IL）群体及相关研究进行了概述,包括利用IL群体对抗生物或非生物胁迫、果实品质、产量等基因或QTL的定位,利用IL群体进行QTL遗传效应及互作分析,基因或QTL精细定位、克隆、聚合、代谢组学分析等。对利用IL群体有关研究及存在的问题进行了展望。     

大白菜叶色相关性状的QTL定位与分析

 应用已构建了AFLP遗传图谱的大白菜DH群体, 采用多模型QTL作图的方法, 通过色差计法、叶色素测定法和人为目测法3种方法7个指标对叶色相关性状进行QTL定位和分析。结果表明, 在7个连锁群上共检测到18个QTL, 其中色差计法检测到9个QTL, 叶色素测定法检测到8个QTL, 人为目测法仅检测到1个QTL。另外, 估算了单个QTL的贡献率和加性效应, 发现各QTL的加性效应各不相等, 各位点的贡献率在5.5%～15.6%之间。     

芥蓝×甘蓝的F2群体抽薹期性状QTLs的RAPD标记

 利用芥蓝C1 12×甘蓝秋缸Ⅵ杂交组合的F2作图群体的RAPD标记连锁图进行了19个农艺学性状的QTL定位研究，在9个连锁群上共定位了28个QTL位点。其中控制抽薹期、开花期、株高(4月27日调查)的QTL各3个；控制伸展度、株高(4月20日调查)、叶柄长QTL各2个；控制茎高、叶数、叶宽(4月27日调查)的QTL各1个；控制叶宽(5月11日调查)的QTL有5个。     

利用高代回交群体定位野生醋栗番茄发芽期耐盐QTL

以野生醋栗番茄( Solanum pimpinellifolium ) LA722和栽培番茄( Solanum lycopersicum ) 9706为材料, 结合发芽期大规模盐胁迫筛选方法和AB-QTL 技术进行耐盐QTL 定位和转育研究, 建立了包括280个BC3 S1单株的高代回交群体, 利用26个CAPS、66个SSR和39个SRAP多态性标记构建了分子遗传图谱并进行了耐盐性QTL定位。利用发芽20、24、28 d的发芽指数分别检测耐盐相关的QTL, 确定发芽24 d时的指数为检测QTL的最优指标, 共检测出11个与耐盐相关的QTL, 8个来自于野生醋栗番茄LA722。研究获得了58个极耐盐株系, 对部分耐盐株系进行QTL qST-8-1 和qST-9-2 的基因型分析, 其中230-1和230-3株系含QTL qST-8-1, 228-4株系含主效QTL qST-9-2, 231-6, 210-7, 226-1, 226-6, 226-7和204-7株系同时含有2个主效QTL, 这些株系的农艺性状接近栽培番茄9706, 可作为耐盐育种种质。     

猕猴桃分子标记、遗传图谱及QTL定位应用研究进展

猕猴桃属植物共有54个种和21个变种,我国是原产地,种质资源极为丰富。由于猕猴桃属植物具有雌雄异株、丰富的倍性变异及实生苗童期较长等特征,使得传统育种工作周期长、效率低。随着现代生物技术发展,开发了较多分子标记应用于猕猴桃研究领域,利用分子标记也构建了一些猕猴桃遗传图谱并进行了部分重要性状的QTL定位,为后续猕猴桃分子辅助育种奠定了基础。综述了猕猴桃遗传连锁图谱构建的基础,归纳了已发表的猕猴桃遗传连锁图谱和定位到的数量性状遗传位点,梳理出当前QTL定位技术在猕猴桃育种中的研究进展,最后提出了猕猴桃分子标记、遗传图谱构建及QTL定位技术在研究和育种应用中存在的问题和展望,以期为猕猴桃分子辅助育种更好的服务于实践奠定基础。     

番茄灰霉病抗性鉴定技术和抗病QTL的研究现状

综述了番茄灰霉病人工接种抗病性鉴定技术、抗病资源的筛选鉴定、抗病基因的QTL定位,并对未来抗病育种研究进行了展望。     

大白菜耐热性QTL定位与分析

 应用352个标记位点的大白菜AFLP和RAPD图谱，采用复合区间作图的方法对控制大白菜耐热性的数量性状基因位点(QTL)进行定位和遗传效应研究。用苗期热害指数进行耐热性表型鉴定，共检测到5个耐热性Q几位点，分布于3个连锁群上。ht-1、ht-3和ht-5表现为增效加性效应，ht-2和舡4表现为减效加性效应。ht一2对大白菜耐热性的遗传贡献率最大，其次是ht-5。发现了与5个 I8紧密连锁的侧连分子标记，它们与Q几间的距离为0．1 2．4 cM。这为大白菜耐热性分子标记辅助选择提供了理论基础。关键词：中图分类号：     

Quantitative trait loci for photosynthetic pigment concentration in a doubled-haploid population of Pak Choi (Brassica rapa ssp. chinensis var. communis Tsen et Lee)

Summary

Quantitative trait loci (QTL) mapping and marker development are essential steps in any molecular breeding programme. In this study, QTL for photosynthetic pigment concentration were identified using a doubled-haploid (DH) population of 112 lines derived from an F₁ hybrid of Pak Choi, ‘Shulv’, obtained from a cross between Brassica rapa lines SW-13 and SU-124 through microspore culture. QTL mapping was carried out using a modification to the map of ‘Shulv’. Alignment of the linkage groups was carried out with those of reference B. rapa maps, allowing the assignment of these groups as A01 – A10. In total, 11 QTL were associated with photosynthetic pigment concentration and identified on linkage groups A05, A08, and A10. The maximum phenotypic variance for a single QTL was 38.0%. Markers closely linked to these QTL could assist in the development of Pak Choi cultivars with increased yield, due to having improved photosynthetic capabilities.     

十字花科蔬菜根肿病抗性遗传及抗病育种研究进展

综述了十字花科主要蔬菜根肿病抗性遗传规律与抗病育种等方面的研究进展。在抗性遗传规律上,对甘蓝、白菜类根肿病抗性遗传研究较多,且多集中在抗性基因与CR位点连锁的分子标记及根肿病抗性QTL的遗传定位上;甘蓝根肿病的抗性是由多基因控制的数量性状遗传,且已获得20多个甘蓝根肿病抗性QTL;白菜根肿病抗性基因之间是相对保持独立的,且已经发现8个抗根肿病基因。在抗病育种方面,对大白菜研究的比较深入,获得相应的抗根肿病分子标记较多,且选育出了一些抗病材料,并进行了商品化应用;甘蓝根肿病的抗性遗传规律较复杂,获得纯系抗病材料的难度很大,因而育种进程缓慢。针对以上现状,对十字花科根肿病的研究方向及可能性进行了展望。     

Functional mapping of genotype-environment interactions for soybean growth by a semiparametric approach

Background  

Functional mapping is a powerful approach for mapping quantitative trait loci (QTLs) that control biological processes. Functional mapping incorporates mathematical aspects of growth and development into a general QTL mapping framework and has been recently integrated with composite interval mapping to build up a so-called composite functional mapping model, aimed to separate multiple linked QTLs on the same chromosomal region.     

番茄基因的分子标记与遗传作图——文献综述

介绍了番茄分子图，特别是抗病基因标记作图和构建精密遗传图的新进展，同时概述了分子标记及其作图在基因克隆、ＱＴＬ定位、标记辅助选择，以及在细胞杂交、进化关系和良种纯度检测等方面的应用前景。     

葫芦科作物果实品质性状的分子标记与定位研究进展

近年来,人们对果实品质的要求不断提高,而品质性状基因的表达易受环境因素的影响,在一定程度上制约了品质育种的发展。随着分子标记技术的应用,分子标记辅助选择育种成为提高果实品质的有效途径。根据有关文献结合作者课题组的研究成果,综述了葫芦科作物果实品质性状的分子标记与定位研究进展,并对未来葫芦科果实品质育种的研究方向进行了展望,以期为提高果实品质提供参考。     

AFLP标记在大白菜遗传育种中的应用

AFLP标记是一种新的DNA分子标记技术。对AFLP标记的基本原理、技术流程和关键技术做了简要介绍,从亲缘关系与遗传多样性分析、遗传图谱的构建、特定性状的连锁标记、品种纯度鉴定与QTL分析等方面概述了AFLP标记在大白菜遗传育种中的应用进展,并对其应用前景进行了展望。     

Association analysis of fruit traits in mulberry species (Morus L.)

Improvement of fruit traits is an important objective in current mulberry breeding programs. In this study, 93 mulberry accessions of diverse origin were genotyped using 15 ISSR markers to identify marker–trait associations with fruit traits. Fifteen ISSR primers generated a total of 104 amplification products, of which 94 were polymorphic, revealing 90.38% polymorphism; the mean PIC value was 0.2698. UPGMA cluster analysis showed clear genetic relationships between the 93 mulberry cultivars, and the major clusters were related to known pedigree relationships and their ecotype. The mean r² value for all intra-chromosomal loci pairs was 0.0210. Marker–trait associations were investigated using the unified mixed-model approach, considering both population structure (Q) and kinship (K). In total, 24 marker–trait associations (p < 0.01) were identified using different ISSR markers. The results suggest that association mapping in mulberry is a viable alternative to quantitative trait loci mapping, and detection of associations between markers and mulberry fruit traits will also provide important information for marker-assisted breeding.     

番茄疮痂病抗性遗传研究和基因定位最新进展

 由黄单胞杆菌（Xanthomonas）引起的番茄疮痂病是严重影响番茄生产的一种细菌性病害。近年来，该病害病原菌小种的快速变化，特别是X. gardneri 的扩散，加速了人们对抗性遗传、基因定位和分子标记辅助育种的研究工作。迄今已经定位了3 个抗T3 小种的基因、5 个抗T3 小种的QTL 和3 个抗T4 小种的QTL，并对部分基因或QTL 进行了精细定位，建立了标记辅助选择体系，育成了抗T4 小种的品种。本文将就这些最新的研究进展进行总结，对现存问题进行分析，并对番茄疮痂病抗性遗传研究和育种应用前景进行探讨，以期为抗番茄疮痂病育种提供参考。