优化金黄色葡萄球菌基因组DNA的提取方法

为提取金黄色葡萄球菌DNA,比较了酶解法、丙酮-酶解法、玻璃珠机械法等破壁方法,确定玻璃珠破壁法为最优提取方法。该方法无需对样品进行增菌,可直接从乳品中提取金黄色葡萄球菌DNA。     

金黄色葡萄球菌基因组DNA提取方法的比较

为寻求一种较为实用的金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）基因组DNA提取方法,对酶解法、十二烷基硫酸钠（Sodium dodecyl sulfate,SDS）法、FDA法、热裂解法等常见的4种不同提取方法进行了改良和比较.结果表明,4种方法中,SDS法提取的DNA质量最好,检测灵敏度高,当金黄色葡萄球菌的DNA稀释至2.95 pg或更少时,SDS法还能够通过PCR将其检测出来;并且该方法的稳定性好,经济性高,是金黄色葡萄球菌基因组DNA理想的提取方法.     

沙门氏菌和金黄色葡萄球菌3种DNA提取方法的比较

[目的]对沙门氏菌和金黄色葡萄球菌不同的DNA提取方法进行评价。[方法]采取3种不同的方法对沙门氏菌和金黄色葡萄球菌的DNA进行提取,利用全波长紫外/可见光扫描分光光度计比较其浓度和纯度。[结果]方法 3提取的DNA质量最好,浓度和纯度都较高,方法 1提取的DNA质量次之,纯度较高,浓度次之,方法 2提取的DNA浓度一般,但存在碳水化合物或盐类污染。[结论]方法 3是一种适用于沙门氏菌和金黄色葡萄球菌以及其他病原菌的有效提取方法。     

雷公藤叶片基因组DNA不同提取方法比较

[目的]比较雷公藤叶片中基因组DNA的提取方法。[方法]采用常规CTAB法、改良CTAB法、常规SDS法、高盐低pH值法和一步法分别提取雷公藤叶片基因组DNA,利用琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法测定样品OD260与OD280的比值以及RAPD扩增结果,判断所得DNA样品的纯度,并根据OD260值计算不同提取方法的DNA得率。[结果]改良CTAB法提取效果最佳,所提DNA的平均得率为219.3μg/g,OD260/OD280比值在1.869～1.903,用于RAPD-PCR均有较好的扩增结果。[结论]改良CTAB法是雷公藤叶片基因组DNA提取的最佳方法。     

CTAB法在金黄色葡萄球菌DNA提取中的应用

金黄色葡萄球菌Staphylococcus aures（以下简称金葡菌）是革兰氏阳性球状菌,直径0．8～1．0μm,呈葡萄状排列,有些菌株具有荚膜或黏层,广泛分布于空气、土壤、水、食具以及患有化脓性皮肤病人畜的皮肤上。金葡菌是引起食品污染和细菌性食物中毒的一种主要细菌,食品受其污染后,不仅腐败变质,     

滇山茶基因组DNA不同提取方法效果比较

选取3个滇山茶品种(早桃红、柳叶银红及菊瓣)采用4种方法(CTAB法、改良的CTAB法、SDS法及改良的SDS法)进行基因组DNA提取,并对提取效果进行了比较分析.结果表明,CTAB法提取效果最佳,其次为改良的CTAB法,而SDS法不能有效地提取DNA.同时发现,不同品种之间DNA提取效果也存在差异,柳叶银红DNA提取浓度及纯度最高(D260 nm/D280 nm=1.976 2),其次为菊瓣,最差为早桃红.本研究为下一步进行滇山茶分子标记研究与应用奠定了基础.     

不同方法提取葡萄基因组DNA的比较

本试验采用三种不同的方法提取葡萄幼叶基因组DNA,即:改良的CTAB法、高盐法和SDS法。并通过紫外/可见分光光度计检测、琼脂糖凝胶电泳检测、RAPD-PCR扩增对三种方法提取的DNA进行定量、定性分析和综合比较。结果表明,三种不同的方法提取葡萄幼叶DNA均能满足RAPD扩增要求,扩增效果为:CTAB高盐法SDS法。因此,改良的CTAB法是一种适合新疆葡萄基因组DNA提取的最佳方法。     

食品中金黄色葡萄球菌PCR检测方法的建立

目的:建立快速检测食品中金黄色葡萄球菌的PCR方法。方法:优化金黄色葡萄球菌DNA提取方法并设计基因特异性引物,采用PCR方法扩增金黄色葡萄球菌的耐热核酸酶(nuc)编码基因,验证检测的特异性及灵敏度。结论:所检出的金黄色葡萄球菌在497bp处出现特异片段,该方法具有较高的敏感性和特异性,可作为食品中金黄色葡萄球菌快速检测的手段。     

商洛黄芩基因组DNA提取方法效果比较

探讨最佳的提取商洛黄芩基因组DNA的方法,为商洛黄芩在分子生物学领域的研究发展奠定基础。方法:分别采用SDS法、CTAB法、尿素法提取黄芩基因组DNA,测定不同方法所提取DNA的纯度和浓度,进行琼脂糖凝胶电泳检测,并对其结果进行比较。CTAB法和SDS法都能作为提取的商洛黄芩基因组DNA的适宜方法,前者提取浓度大但降解也大,后者纯度较高且降解较少但浓度及提取率较低,都符合PCR扩增模板的要求,尿素法提取的DNA质量差,不能满足分子生物学研究的要求。CTAB法和SDS法适合商洛黄芩基因组DNA的提取,为商洛黄芩在分子生物学领域的研究奠定了基础。     

枳壳基因组DNA提取方法的比较研究

以枳壳(酸橙)叶片为试验材料,采用改良CTAB法、CTAB-硅珠法、SDS法、高盐低pH法和周世良法5种方法提取枳壳基因组DNA,并通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳及SSR-PCR扩增3种检测方法比较DNA的提取效果,以期找到枳壳DNA的最佳提取方法.结果表明,5种方法中SDS法提取的DNA浓度最高(平均为900ng/μl),纯度最好(OD260/OD280平均值为1.90),且以SDS法提取的DNA为模板进行SSR-PCR扩增检测,目的条带清晰、亮度均一、稳定性和重复性好.因此,SDS法是枳壳DNA最佳提取方法,可用于分子检测试验.     

翦股颖属植物基因组DNA提取方法的比较

采用试剂盒法、高盐低pH法、改良高盐低pH法、吸附柱法、SDS法、改良CTAB法,分别对翦股颖属植物品种Penncross、Seaside、PennA-4、粤选1号和新品系粤选10号的基因组DNA进行提取并经DNA电泳检测、蛋白分析仪分析和RAPD分析.结果表明:改良的CTAB法、改良高盐低pH法能够分离出产率高、纯度高、质量好的DNA,而吸附柱法的DNA产率偏低、但纯度较高,3种方法均能扩增出清晰的条带.     

质粒DNA提取方法优选试验

采用酚/氯仿法、异丙醇沉淀法、煮沸法及微波炉法分别提取细菌质粒,琼脂糖凝胶电泳分析,紫外分光光度计测定OD值,对各种方法的优劣进行比较分析。结果表明,以异丙醇沉淀法提取的质粒DNA纯度和产量最高,且重复性好,具有结果稳定的特点;能够满足高水平的分子生物学试验要求,适合大多数实验室使用。     

不同方法提取野生龙眼基因组DNA的效果比较

以广东、海南的3种野生龙眼幼嫩叶片为试验材料,采用常规SDS法、常规CTAB法、改良SDS法和改良2xCTAB法提取龙眼叶片基因组DNA,探索从富含单宁、多酚、多糖和色素等次生代谢物质的野生龙眼叶片中获得高质量DNA的提取方法.结果表明:采用改良的2xCTAB法提取的龙眼叶片基因组DNA纯度最高、质量最佳,可直接用于龙眼RAPD分析和叶绿体DNAtrnL-F基因的PCR扩增分析,且扩增后条带清晰.说明改良的2xCTAB方法获得的DNA纯度和产率较高,提取效果较好.     

不同DNA提取方法对4种重要作物DNA提取效率的比较

以大豆、黄瓜、水稻、玉米的幼嫩叶片为材料,采用4种不同的DNA提取方法,比较不同方法的DNA提取效率。结果表明,不同作物采用不同的提取方法,DNA的质量和产率有显著差异。大豆、黄瓜、水稻采用CTAB法,玉米采用SDS法,其DNA提取效率高。     

单增李斯特菌基因组DNA提取方法比较

为了选择一种简单、快速、有效的单增李斯特菌基因组DNA的提取方法,采用溶菌酶-蛋白酶K法、氯仿/异戊醇法、液氮冻融法提取单增李斯特菌基因组DNA,利用PCR扩增结果判断所得DNA样品的质量.结果为,3种不同方法均能扩增出234 bp条带,溶菌酶一蛋白酶K法提取的DNA模板检出限最低,为1.25 x 10,CFU/mL.结论为,溶菌酶-蛋白酶K法提取的DNA模板进行PCR扩增检出限最低,该方法提取的基因组DNA适用于PCR扩增和其他分子生物学研究.     

土壤微生物3种DNA提取方法的比较

以人参地土壤为材料,比较研究SDS高盐加变性剂法、SDS高盐法和试剂盒法等3种土壤微生物基因组DNA提取方法.结果表明,3种方法均可提取人参地土壤微生物基因组DNA,但每种方法所获得的DNA在颜色、提取量及纯度等方面都存在较大差异.普通手工方法(SDS)提取的DNA由于纯度不高等原因很难进行后续的PCR扩增,试剂盒法能够在较短时间内获得用于PCR扩增的较高纯度的DNA,所以该方法是较好的土壤微生物DNA提取方法.     

大肠杆菌质粒DNA提取方法的优选

采用酚/氯仿少量提取法、异丙醇沉淀法、简便快速的煮沸法以及微波炉法提取细菌质粒,然后分别对各种方法所提取的质粒进行琼脂凝胶电泳分析,并用紫外分光光度计测定其OD值,对各种方法的优劣性进行全面分析,结果表明异丙醇提取法所提取的质粒DNA纯度和产量高(其DNA片段荧光较强,具有清晰的亮带,OD260/OD280约为1.77,DNA样品浓度约为195μg/mL),且重复性好,具有结果稳定的特点,达到了分子生物学试验要求,适合大多数试验室使用。     

水稻纹枯菌总 DNA 提取方法的比较

DNA的浓度,尤其是DNA的纯度严重影响后续基因组酶切等结果。为寻找一种高质量的水稻纹枯菌总DNA的提取方法,采用CTAB法、CTAB改良法、SDS法、蜗牛酶法、蛋白酶K法5种方法分别提取水稻纹枯菌总DNA。通过紫外吸光度测定DNA的纯度和浓度、琼脂糖凝胶电泳、PCR扩增、限制性内切酶酶切反应及Southern杂交评价DNA的质量,最终得出蛋白酶K法是获取高质量水稻纹枯菌基因组DNA的最佳方法。     

铁线蕨总DNA提取方法比较分析

以铁线蕨(Adiantum capillus-veneris L.)不同世代植株为材料,对铁线蕨总DNA不同提取方法进行比较,并通过检测体系进行分析.结果表明:结构简单的配子体为材料的DNA的纯度明显高于孢子体,但是产量也明显低于孢子体;对于配子体而言,CTAB法、SDS法、高盐低pH法、尿素提取法、试剂盒法都能提取较为纯净的总DNA,但经过DNA完整性检测体系筛选后,改良CTAB法结果最优;对于含大量次生代谢产物的孢子体植株而言,改良CTAB法得到的总DNA纯度明显高于其它,通过后续的DNA完整性检测得到与配子体相同结论.