生物信息学研究进展与展望

1　国外生物信息学研究概述随着信息高速公路的快速发展 ,国际生物信息学研究迅速崛起 ,各种专业研究机构和公司如雨后春笋般涌现 ,生物科技公司和制药公司内部的生物信息学研究部门与日俱增 ,几乎因特网所到之处 ,都有各种机构联网、建立数据库 ,开展生物信息学研究。美国、欧     

农业生物信息学研究现状、成就及展望

２０世纪８０年代末，人类基因组计划（HumanGenomeProject，HGP）的启动推动了生物信息学的产生和蓬勃发展。人类基因组计划的直接结果是获得了大量不连续的数据。对这些数据的收集、存储、分析和解释，从中获取有用的生物学信息，导致了生物信息学的产生，生物信息学在农作物基因组分析中的深入应用产生了农业生物信息学。一、生物信息学研究现状及成就１．农业生物信息学基因图谱研究为加快转基因作物育种和生物信息学的农业应用打下了良好基础，对作物进行基因组分析需要生物信息学工具。生物信息学的特殊作用主要体现在以下３个方面…     

生物信息学研究领域概述

1　海量生物信息数据的管理1.1　数据库的开发在庞大的原始数据基础上 ,根据不同的特征将其加工 ,构建出若干高级数据库 ,这不仅给用户带来很多方便 ,更重要的是专业人员注入的知识对用户有很大的启发。二级数据库、专门数据库等的研制开发是生物信息学下一步的重点工作之一。目前著名的二级数据库有 :蛋白质结构分类数据库 (ＳＣｏＰ) ,受体数据库 ,克隆载体数据库等。1.2　数据库接口和检索工具的研制数据库的内容来自万千生物学者的日积月累 ,最终又为生物学所用 ,但不能要求一般生物学工作者具有高深的计算机和网络知识。因此 ,必须开发…     

生物信息学研究进展

随着生物科学和计算机科学的迅猛发展,由此而诞生的生物信息学逐渐发展成为一门独立的学科。本文简单介绍了生物信息学的近几年来的一些主要数据库,应用前景,面临的挑战。     

生物信息学及其在农作物基因工程中的应用

生物信息学是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学、化学等学科相互渗透而高度交叉形成的一门新兴前沿学科。生物信息学必将成为农作物基因工程中获得新基因的重要手段。本文阐述了生物信息学研究所依据的数据库为主的生物信息资源及其在农业领域的部分应用,并为生物信息学在农作物基因工程的前景做了展望。     

生物信息学在药用植物研究中的应用

生物信息学是应用计算机技术将生物化学和分子生物学试验的海量信息转换为数字信息的一门科学,其重点是DNA和蛋白质序列的比对和分析.本文阐述生物信息学的方法学,包括功能基因组、蛋白质组、基因表达谱、生物芯片、靶基因研究等相关技术在药用植物研究上的应用前景.     

生物信息学在基因组学中的应用

随着计算机科学、物理学、数学等与生命科学的相互渗透和交叉,生物信息学愈来愈显示出其重要性,尤其是在抗病基因的研究中。笔者从结构基因组、比较基因组、功能基因组与生物信息学等方面论述了生物信息学在基因组学中的应用。     

基于生物信息学方法挖掘奶山羊miRNAs研究

microRNAs(miRNAs)是长约22nt的内源非编码小分子RNA,在转录后基因调控中发挥重要作用。奶山羊是具有重要经济价值的产乳动物,有关奶山羊miRNAs研究相对匮乏,识别和鉴定新的奶山羊miRNA至关重要。文章以与奶山羊高度同源的绵羊基因组为参考数据库,应用生物信息学方法得到101条新的奶山羊miRNAs序列,并对其进行序列特性分析,为今后基因组信息不全物种的miRNAs挖掘与鉴定提供参考。     

生物信息学及其在检验检疫中的应用

在对生物信息学概述的基础上介绍了其在生物及其产品风险评估、检疫检测技术、预警机制建立、检验检疫资源共享平台建设、物种资源查验、生物鉴定监测、分子可视化自动比对、检疫性生物阳性参比物质研究、检疫性生物流行病学研究中的应用,并展望了生物信息学在检验检疫中的应用前景.     

农业生物信息学网络资源与检索

随着生物信息学的不断发展,网络环境下农业生物信息资源呈指数级增长,如何有效检索利用这些资源成为一个突出的问题。从数据库、在线农业生物学文献、生物信息搜索引擎、专业网站这4个方面对网络环境下农业生物信息资源的检索途径进行了整理汇总及介绍。     

数据挖掘技术及其在生物信息学的应用

数据挖掘是一个崭新的计算机应用领域,而生物信息学是生物学与计算机科学以及应用数学等学科相互交叉而形成的一门新兴学科．综述了数据挖掘技术的内容、过程、方法和模式,介绍了生物信息学的内涵和新的应用技术,同时探索了数据挖掘技术对生物信息挖掘应用的途径．     

昆虫杆状病毒组学研究进展

杆状病毒(baculoviruses)是一类专性感染无脊椎动物的共价闭合双链环状DNA昆虫病毒。由于杆状病毒对环境和人畜无害,其作为生物农药在生物防治方面发挥着重大作用。此外,杆状病毒还可作为一种真核表达载体,广泛用于药物研发、疫苗生产,以及作为基因转移载体用于基因治疗等方面。综述了杆状病毒的基因组学及蛋白质组学研究进展,对阐明病毒的感染机制具有重要意义,并且在此基础上可针对性地对其进行分子改良或开发高效的生物增效剂。     

生物信息学及其在农业科学中的应用

综述了生物信息学的形成与发展及其数据库和功能基因组学研究;同时也概括了生物信息学在模式植物研究、种质资源保存、病虫害防治、作物遗传育种等方面的应用。     

植物蛋白质组学的研究策略

随着拟南芥和水稻基因组测序的完成,对植物基因组学的研究转入到了蛋白质组学的研究。笔者重点介绍了蛋白质组学的概念和关键技术。蛋白质组学的关键技术包括双向电泳技术、高效液相色谱技术、质谱技术、蛋白质组学的相关数据库等。     

猪IFIT1基因的克隆、生物信息学和组织表达分析

采用cDNA末端快速扩增(RACE)方法,对荣昌猪IFIT1基因进行克隆测序,利用生物信息学方法分析其结够和功能,并用Real-ti me PCR方法分析初生个体和1月龄个体11个不同组织(肺、心、肾、舌头、膀胱、卵巢、脾、肝、肌肉、胃和小肠)的表达情况.结果表明:IFIT1基因cDNA序列为1971 bp(GenBank登录号:HQ679904),包含5 UTR48 bp,全部CDS序列1437 bp和3 UTR487 bp,编码478个氨基酸,相对分子质量为55 232.9×103,等电点为6.18.其二级结构以α-螺旋和无归卷曲为主,三级结构具有典型的三角四肽和螺旋转角螺旋重复结构.荧光定量结果显示IFIT1表达量在初生个体和1月龄个体各组织间均存在着显著性差异(p<0.01),初生个体在脾脏中的表达量高于其它各组织(p<0.01),1月龄个体在肌肉中的表达量高于其它组织(p<0.01).     

生物信息学在作物抗性研究中的应用展望

从生物信息学在基因分析和基因鉴定方面,结合生物信息学的应用实例和作物抗性研究的特点,对其在作物抗性研究中的应用进行了综述和展望.     

FOS蛋白的研究进展及生物信息学分析

FOS蛋白作为一类核蛋白转录因子,在调控细胞生长、分裂、增殖、分化乃至程序性死亡等方面具有重要的作用,它的表达影响了许多生命活动和过程,引起了人们的广泛关注,并在学习记忆及射精的标记方面吸引了学者的眼球。对FOS蛋白的作用进行了综述,并对人、大鼠及小鼠FOS蛋白进行了生物信息学分析,旨在为FOS蛋白在生理学方面的研究提供参考依据。