鸡传染性支气管炎病毒中国分离株S1基因的序列分析

采用RT—PCR方法扩增了12株鸡传染性支气管炎病毒中国分离株的全长S1基因，并进行了序列分析。通过与GenBank中登录的其他IBV参考毒株S1基因序列比较，进行了系统进化分析。结果表明，12株分离毒株属于同一个进化群的2个不同进化亚群。其中11株分离株与国内一些分离株亲缘关系最近，属于同一进化亚群，而广西分离株GX04—1则与欧洲毒株4／91亲缘关系较近，属于另一亚群。这些结果说明，中国各地的流行毒株变异较大，实际免疫中要根据流行毒株的特性选择合适的疫苗株来进行。     

中国H3亚型流感病毒生态学与分子进化的研究

病毒生态学与分子进化是一门新兴的学科，研究病毒在各种环境中的关系，可以为今后病毒的研究与防治奠定基础。本研究首次详细对我国14株鸭、鸡等禽流感和马、猪等动物的流感病毒的生态学与分子进化进行了分析研究，初步摸清了这些病毒在我国的流行与进化情况，为今后流感病毒疫苗的应用奠定了理论基础，并为今后的H3或其它亚型流感病毒的研究与防制提供了理论基础。     

环境限制与动物生产（综述）

环境限制与动物生产（综述）刘学洪（云南农业大学牧医系６５０２０１）达尔文最适者生存的自然选择理论，揭示了动物进化基本规律。从遗传学观点看，进化的本质就是每一种类型有多少基因传递给下一代并表达出来，基因频率的改变由个体的繁殖及它们后裔的成活来体现。进化...     

上海市动物源性食品中单增李斯特菌的MLST分析

为了解上海市动物性食品中单增李斯特菌的进化情况和群体遗传学特征，本研究采用MLST法和eBURST软件对33株分离株进行分子分型及进化树分析。结果共分成8个型别，并且33株单增李斯特菌之间遗传相关性不是很大。分为4个进化谱系：ST11和ST196为一个进化谱系，ST9、ST8和ST155为一个进化谱系，ST87和ST277/589为一个进化谱系，所占比例最多的ST121单独一个进化谱系。     

遗传与环境在生物进化中的关系

本文讨论了在生物进化的过程中遗传与环境的关系及遗传物质的范围和生物可塑性的问题。遗传物质的变异是进化的内因，环境对遗传物质的变异起到诱发与筛选的作用，进化后的生物对环境又有反作用。     

不要让瑕疵影响一生

他的父亲只是一名贫穷的油漆工，仅仅靠着微薄的打工收入供他念完高中。这一年，他有幸被美国著名学府——耶鲁大学录取，但是，他却因为缴纳不起大学昂贵的学费，而面临着辍学的危险。于是，他决定利用假期，像父亲一样外出做油漆工，以期挣够学费。他到处揽活，     

“人类纪”新地质时期理论研析之三——“自然选择进化论”还是“生存斗争进化论”

生命的历史是漫长攸久的演替过程表征着植物群落演替进化的周期性特征，即“演替-分化-灭绝-突变-进化”的过程。历经变异多样化、物种形成、适应性族群演替进化、种群散布、转化传递和演替进化。就是通过这一过程，最终导致了现代人类社会的产生。在这一地球历史过程中，生物的进化经历着严峻状态的地球环境，从单细胞生物开始直至高等动物产生，一路历经为生存而艰难挣扎斗争，在斗争中求生存，在生存中力图挣扎前进。为笔者曾提出的“生存斗争进化论”提供了进一步的佐证。     

驼鹿的进化和分类研究进展

驼鹿在距今约27万年的中更新世末期Piss冰期时代出现在欧洲，在距今约1万年的晚Wisconsinian时期出现在阿拉斯加，伴随着大动物区系的灭绝而出现在北美洲南部，并最终生存了下来，进而不断地进化，形成了现有的七个亚种。在近几十年的研究过程中，学术界开始更加关注分布在中国、蒙古和俄罗斯的远东驼鹿，成为研究的新热点。远东驼鹿面临着严重的狩猎威胁，存在着灭绝危险；更重要的是，这一亚种在驼鹿的进化和分类地位问题上，存在着相当大的学术争议。在以前的研究中，对于远东驼鹿的进化与分类地位的研究，主要基于形态学特征、地理分布特征以及古生物学研究来推断的，缺乏最有力的证据。但随着细胞生物学和分子生物学的发展，给驼鹿的进化和分类研究提供了更大的空间。     

一株大肠杆菌噬菌体的分离鉴定与系统进化分析

本试验从污染噬菌体的大肠杆菌发酵液中分离到一株烈性噬菌体，通过生物学特性和系统进化分析，得出其最佳感染复数为0.01，潜伏期约为20 min，繁殖周期为80 min。测序分析显示与Escherichia phage vB_EcoS_SH2（NC_047828）具有高度同源性（97%)，进化树分析显示属于Drexlerviridae（科），Tunavirus（属）。 [关键词] 噬菌体|分离鉴定|生物学特性|进化分析     

扇穗茅不同居群染色体数目及核型分析

为了探讨扇穗茅(Littledalea racemosa)不同居群的染色体核型特征和进化关系，本研究采用染色体常规压片技术对分布于青藏高原6个自然地理居群的扇穗茅核型特征及进化趋势进行了分析。结果表明：扇穗茅6个居群的染色体数目均为2n=2x=28；染色体有中部着丝粒(m)型和亚中部着丝粒(sm)型，中部着丝粒型占比更高；平均臂比介于1.27~1.44之间，长度比为1.95~2.56，核不对称系数处于55.64%~57.88%之间；核型类型有1B，2A和2B三种；所有居群中，居群83的染色体核型进化程度最高，居群67的进化程度最低；当遗传距离为1时，居群119和120优先聚为一支，亲缘关系最近。本研究首次报道了扇穗茅的染色体核型数目、特征和进化趋势，为今后进一步探明扇穗茅的系统进化关系提供了有力的细胞学佐证。     

云南边境H5N1亚型禽流感病毒聚合酶基因分子结构特征分析

2004～2009年期间在云南边境采集境外禽类样品560份,经RT-PCR及多重RT-PCR检测,检出10份H5N1亚型禽流感病毒阳性样品,对其聚合酶基因进行扩增,克隆至pMD18-T载体中进行测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析。结果显示:云南边境H5N1亚型禽流感病毒可划分为5个进化(亚)分支,分别与标准毒株遗传关系密切,聚合酶基因与血凝素基因的进化分支划分结果存在差异。表明目前聚合酶基因的进化除了自发突变作用影响基因进化,同时聚合酶的进化途径在时间特征和区域特征方面与血凝素基因的进化有一定的关系。2004～2009年期间云南境外H5N1亚型禽流感病毒间具有遗传差异,进化分枝2.3.4毒株已成为当地流行的优势毒株,不同进化分枝或同一进化分枝不同毒株聚合酶基因氨基酸结构和糖基化位点均有改变。     

草食动物与植物之间协同进化研究

草食动物与植物之间存在协同进化关系。在环境的选择压力下,一方面植物为了逃避各类草食动物的采食而形成防御性的形态结构以及生理生态适应机制;另一方面,动物为了尽可能多地获得食物和满足营养需求,通过优化采食以提高其适合度。草食动物与植物之间的协同进化实际上也是自然界适者生存的＂军备竞赛＂,因而对物种进化产生重要影响。本文综述了草食动物与植物之间协同进化关系的研究进展,分析了协同进化的原因,并探讨其生态学意义。     

羊RBP4基因DNA池测序分析

选择黔北麻羊、内蒙古白绒山羊、关中奶山羊3个山羊品种构建品种DNA池。对RBP4基因部分CDS区和3’UTR进行PCR产物扩增，并采用直接测序法进行测序。结果表明：所选山羊品种RBP4基因分CDS区和3’UTR区，无突变位点存在。序列分析表明，山羊与其他物种RBP4基因的同源性很高，其中以牛最高，达到98．8％。系统进化分析表明，羊和牛在同一进化支上。生物信息分析表明：RBP4基因所表达蛋白氨基酸序列中有5个磷酸化位点。因此，山羊RBP4基因在进化过程中是高度保守的。研究结果可为进一步分析山羊RBP4基因功能遗传变异提供借鉴。     

热河生物群脊椎动物的辐射及其环境背景

近年来，热河生物群各门类的研究十分活跃．特别是在鸟类与飞行的起源、早白垩世鸟类、恐龙、哺乳类、昆虫和被子植物的进化研究等方面，已有若干重要成果问世，并引起国内外学术界及公众的广泛关注．热河生物群的研究揭示了早白垩世许多重要生物门类进化辐射的型式和过程，包括被子植物和鸟类演化历史上的第一次显著的辐射，早期哺乳动物的分化，以及白垩纪恐龙类群的早期辐射等。由于相同的环境背景，热河生物群脊椎动物的辐射具有许多共同的特点，如出现了大量树栖生活或者植食性的种类，表明它们的辐射和当时繁茂的植被环境紧密相关．习性和食性的分化还成为热河生物群翼龙、恐龙、鸟类和哺乳类进化辐射的重要标志。     

马疱疹病毒1型主要毒力基因分析及TK基因缺失载体的构建

为了解新疆马疱疹病毒1型（EHV-1）主要毒力基因遗传进化情况并构建TK基因缺失株，本研究以EHV-1 XJ2015株DNA为模板，对其主要毒力基因TK、gI和gE全长进行克隆、测序及生物信息学分析，并扩增TK基因左右重组臂TKL和TKR，构建质粒pUC-TKLR，将扩增后的增强绿色荧光蛋白（EGFP，含有CMV+polyA）插入pUC-TKLR质粒，构建TK基因缺失打靶质粒。TK、gI和gE基因同源性分析结果显示，XJ2015株与国外EHV-1分离株TK、gI和gE基因同源性均较高，分别为99.8%~100.0%、99.6%~100.0%和99.9%~100.0%；与EHV-3分离株同源性均最低，分别为72.9%、59.4%和62.1%；遗传进化分析显示，3个基因均与国外EHV-1同属于一个遗传进化分支，与EHV-9和EHV-4进化关系较近，但与EHV-3进化关系较远，表明XJ2015毒株与国外EHV-1毒株TK、gI、gE基因核苷酸上差异不明显，没有明显的地域性特征，功能基因保守且进化缓慢，同源基因功能相同或相近；经PCR扩增、酶切、测序及转染鉴定，本试验成功构建了用于TK基因缺失的打靶质粒pUC-TKLR-EGFP。通过对EHV-1主要毒力基因的分析及TK基因缺失打靶载体的构建，为新疆地区马鼻肺炎流行病学调查分析、TK基因缺失株的构建提供理论依据。     

猪线粒体DNA(mtDNA)及其在遗传育种中的应用

线粒体DNA是真核细胞内较为简单的DNA分子，具有极少发生重组、进化、速度快等特点，作为动物进化研究的一类重要标记，为动物的起源、迁移和进化提供了大量的证据。本文介绍了线粒体DNA的基本特征及其多态性，概述了猪线粒体DNA的研究概况和取得的成果。线粒体DNA的独特特性必将在猪遗传育种中发挥其重要的作用。     

2020—2022年玉溪市猪流行性腹泻病毒分子流行病学调查及遗传进化分析

为了解近年玉溪市猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)流行及遗传进化情况，本研究采集了2020—2022年间玉溪市4个养猪场的临床腹泻样品33份，采用RT-qPCR方法调查PEDV的流行情况，再用RT-PCR方法扩增PEDV阳性样品的M基因，分析病毒的遗传进化。流行病学调查结果显示，33份腹泻样品中，RT-qPCR检测PEDV阳性率为39.39%(13/33)。PCR扩增13份阳性cDNA样品M基因，测序结果证实为PEDV M基因片段。基于M基因遗传进化分析结果显示，玉溪市猪群流行的PEDV均属于基因2型，与其他代表毒株基因同源性为97.06%～99.56%,氨基酸同源性为96.48%～99.56%。结果表明，玉溪市PEDV以基因2型为主，提示需要选择更有效的疫苗来控制PEDV的流行。     

白唇鹿的研究现状及保护策略

通过报道白唇鹿在起源进化、生态生物学、组织解剖学、生理生化及社群行为学等方面的研究现状，阐述白唇鹿在进化、分布、繁殖、社群行为、组织解剖等方面已取得的成果，并根据白唇鹿的当前实况，提出相应的保护策略。     

蜜蜂与生态环境

为了解蜜蜂对生态系统的影响，本文通过蜜蜂与被子植物的协同进化关系以及蜜蜂在生态系统中的地位，阐明了蜜蜂在生态系统中的作用，表明了蜜蜂是生态环境理想的修复者。     

差分优化算法及其应用

差分进化算法是一类基于群体的全局优化结果的算法。本文对差分进化算法的三个算子进行研究,并将此算法与旅行商问题结合,针对旅行商问题进行最短路径优化测试与研究。实验结果表明差分进化算法对于最短路径问题有较好的效果。