候选基因法检测家畜数量性状基因位点的研究与应用

对候选基因法的研究过程作了详细介绍，并讨论了其优缺点，指出候选基因法是检测家畜数量性状基因位点的主要方法之一，也是家畜基因组分析最终的必经之路。     

猪数量性状位点定位研究进展

数量性状位点（ＱＴＬ）是在基因组中占据一定染色体区域,控制某一数量性状的一组微效多基因的集合（或基因簇）。目前对猪数量性状的研究已发展为直接将研究目标指向各个数量性状位点,借助各种遗传标记,构建遗传连锁图谱。通过一定的统计分析方法,从而将影响数量性状的多个基因剖分开来,将其定位于特定的染色体区域。本文对猪的生长,胴体,肉质,繁殖及抗病性状的ＱＴＬ的定位现状及应用前景试作综述,同时也涉及到ＱＴＬ的概     

基于最小二乘估计的数量性状基因座的复合区间定位法

数量性状基因座（ＱＴＬ）的复合区间定位法是区间定位法的１种改进方法，它大大提高了ＱＴＬ定位的准确性，但计算上比较复杂和费时．由于其似然比统计量的联合分布未知，故准确的显著性测验临界值必须采用排列测验法或模拟抽样法进行估计，但其复杂费时的计算使得这些经验方法显得不实用．本文给出基于最小二乘估计的复合区间定位法，它保持了复合区间定位的基本性质，但在计算上要比基于最大似然估计的方法简单和快速得多．由于它对性状的分布无需特殊的要求，因而有更广的适用范围．通过消除模型中冗余的标记，可使数值计算速度进一步提高．这样，用经验方法估计显著临界值就变得可行了．另外，消除冗余标记还可提高ＱＴＬ定位的准确性，改进ＱＴＬ效应的估值．文中最后提出了复合区间定位的实用程序     

德系黑白花奶牛数量性状基因定位研究初报

在德系黑白花奶牛中,对产奶量、乳蛋白量、乳脂量和奶中体细胞数数量性状进行基因定位,试验采用祖孙女设计法,试验动物为１６个父系半同胞家系共７５５头种公牛,试验共测定了８对染色 的６４颗微卫星,你代公牛性状的育种值由孙代母在算得到,连锁分析采用加在归间距定位法,临界Ｆ值由置换试验法得到     

分类性状基因定位的多性状似然分析法

简单线性模型统计方法是业已被证明的与GLM法具有相近参数估计准确度和检测效率的一种二歧性状基因定位分析的简化方法。将适于二歧性状的一元线性模型推广到多类别分类性状基因定位分析中,文中提出采用多元线性模型对多类别分类性状进行基因定位分析。该方法首先将分类性状的各个类别转化为不同的二歧性状,并把每个二维数据看作是连续的,然后采用似然分析法,根据多性状联合定位的统计准则判断QTL的位置和估计QTL效应。模拟结果表明：新方法在大样本和中等遗传力条件下,能够以很高的计算效率相当准确地估计分类性状隐含变量给定的QTL位置和效应。     

小麦数量性状基因定位研究进展

小麦的许多重要农艺性状都是数量性状,研究小麦数量性状遗传对小麦育种及其杂种优势具有十分重要的意义.文章综述了近年来小麦QTL定位原理及前提条件,常用的分子标记,QTL定位常用的作图群体,QTL定位的方法,QTL定位的统计软件和阈值,QTL的作图精度及小麦QTL定位的研究进展.讨论了小麦QTL定位存在的问题,展望了该领域的发展前景.     

家蚕F2群体数量性状基因定位的区间作图法

本文简要叙述了家蚕Ｆ２群体数量性状基因定位区间作图法的原理和方法。并通过了计算机模拟验证。     

F2群体动态性状基因定位的极大似然分析

把表型值随着时间(生命时期、年龄、胎次等)或其他可以量化的因素(生理状态、生产水平、代谢率和环境条件等)变化的性状称为动态性状。受动物遗传育种中用来估计动态性状育种值的随机回归测定日模型思想的启发,将关于时间(测定日期)的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,以刻画QTL对动态性状变化过程的作用,从而建立起动态性状基因定位的数学模型。以F2遗传设计群体为例,论述了动态性状基因定位分析的基本原理,推导了QTL效应大小和位置的极大似然法估计过程。选择3次Legendre多项式为子模型,采用MonteCarlo方法模拟F2设计群体,研究抽样群体大小和测定日密度对不同遗传力QTL检测效力的影响。利用正交设计安排因素试验组合,分析模拟试验结果表明:高遗传力的要比低遗传力的QTL在检测时需要较少个体数和测定日抽样;但不论QTL的遗传力多大,300以上的群体大小和5%以上的测定日密度都可以保证足够高的检测效力。     

数量性状的主效和微效基因检测方法研究

植物数量性状遗传由遗传效应较大的主效基因和效应较小的微效微基因控制。在杂交或回交后代群体中检测达到某一序列性状值的株数,通过极大似然检验可以确定控制该性状的遗传模型和各种遗传参数以及各种基因效应的大小。由于不同的遗传模型有着不同的遗传参数和不同的基因表现,需采用不同的迭代运算公式。为使众多迭代公式尽可能统一,该文提出了世代约束和分布约束的概念。     

应用极大似然法分析质量—数量性状的遗传及计算机软件

简述了应用极大似然法分析质量－数量性状遗传５种假设测验的原理和统计方法，编制了根据Ｆ２代分离群体进行遗传分析的计算机软件，并给出了以兼容３８６、Ｑｕｉｃｋ Ｂａｓｉｃ为硬、软件环境的ＱＢａｓｉｃ原程序。     

含有致死基因型的质量性状基因定位的统计方法

假定某一质量性状受单基因控制，且在纯合显性（或纯合隐性）时会致死，造成不符合Mendelian分离比。在F2群体中，根据分子标记和该基因的连锁关系，获得标记与性状的各种表型类别、频率和植株数，通过Fisher最大似然法，推导出估计重组率的方程和标准误公式。Monte Carlo模拟研究表明，最大似然法得到的重组率估计值与真值接近，并验证了重组率估计值标准误公式。     

多个相关数量性状主基因的联合分析方法

 根据多个相关数量性状的主基因+多基因遗传模型，首次提出利用多个相关数量性状进行主基因检测、主基因效应与变异估计的联合分离分析方法。该方法以EM算法实现的极大似然估计方法进行主基因的效应估计，以似然比统计量进行主基因的各种遗传假设检验。大量的计算机模拟研究表明，多性状联合分析不仅可以提高主基因的被发现能力，而且可以增加主基因效应估计值的准确度和精确度。以水稻杂交组合多蘖矮×中花11的F2群体597个植株株高和分蘖数为例演示了分析程序。结果表明该组合的株高和分蘖数受同一主基因控制。该主基因对株高的加性和显性效应分别为-21.3 cm和40.6 cm，表现为超显性；对分蘖数的加性和显性效应则分别为22.7和-25.3，表现为接近完全显性。     

谷物胚乳性状数量基因图的构建方法

 将三倍体胚乳性状的数量遗传模型和二倍体数量性状基因（QTL）图构建方法相结合，导出双侧标记基因型下有关胚乳性状QTL的遗传组成、平均数和遗传方差分量，据之提出以某一区间双侧标记基因型胚乳性状的平均值为依变数，以该区间内任一点假定存在的QTL的加性效应d、显性效应h1和/或h2的系数为自变数，进行有重复观察值的多元线性回归分析，根据多元线性回归的显著性测验该点是否存在QTL，并估计出QTL的遗传效应。给定区间内任一点，皆可以此进行分析，从而可在整条染色体上作图，并以之确定QTL的数目和最可能位置。同时，在检测某一区间时，利用多元线性回归方法将该区间外可能存在的QTL的干扰进行统计控制，以提高QTL检测的精度。文中还讨论了如何将之推广应用于其他类型的DNA不对应资料以及具复杂遗传模型的胚乳性状资料。     

作物数量性状位点(QTL)基因的鉴定分析

分子生物技术的兴起和统计方法的发展为数量性状位点 (QTL)基因的鉴定提供了可能。为推动数量性状位点基因在作物育种中的应用 ,本文简要叙述了用于数量性状位点基因的鉴定与 Q× E分析。列出了Q× E分析的几种数学模型 ,举例介绍了方法的应用     

大豆数量性状定位的研究进展

大豆的许多重要农艺性状和经济性状是受多基因控制的数量性状。针对大豆产量性状、种子品质性状和重要病害的抗性等,综述了近年来大豆数量性状基因座位(quantitativetraitlocus,QTL)定位研究的进展,并讨论了目前大豆QTL定位研究存在的问题及解决途径。     

豌豆数量性状的基因效应分析

本文对２个豌豆组合的Ｐ１，Ｐ２，Ｆ１，Ｆ２，Ｂ１，Ｂ２和Ｆ３七个世代群体的资料用加性－显性模型和加性－显性－上位性模型估算了１２个数量性状的基因效应。结果表明：加性效应是所研究性状的一个重要遗传分量，对不同分析模型表现稳定。显性效应对性状遗传的控制组合间变化较大，对不同分析模型较不稳定。     

德系黑白花奶牛数量性状基因定位研究初报

在德系黑白花奶牛中,对产奶量、乳蛋白量、乳脂量和奶中体细胞数四个数量性状进行基因定位,试验采用祖孙女设计法。试验动物为１６个父系半同胞家系共７５５头种公牛,试验共测定了８对染色体上的６４颗微卫星,父代公牛四个性状的育种值由孙代母牛估算得到。连锁分析采用回归间距定位法,临界Ｆ值由置换试验法得到。