牛微卫星DNA的特征天空及其在遗传育种中的应用

本文在对微卫星ＤＮＡ的遗传结构与特性概述的基础上，与目前主要几种遗传标记的特性进行比较，并对微卫星ＤＮＡ多态性分析技术在牛遗传育种中研究与应用进行了搪塞。     

家畜基因组遗传多态标记—微卫星标记研究进展(上)

对家畜核基因组中多态遗传标记—ＤＮＡ微卫星标记的研究进展及其应用进行综述。主要涉及以下两大方面：首先是家畜基因组中分子遗传标记，主要是ＤＮＡ微卫星标记的研究发现及有关该标记的定义、特性等；其次是ＤＮＡ分子标记在家畜基因组分析研究、家畜遗传连锁图制作、基因诊断、家畜品种进化演变和个体系谱确证等方面的应用概况。     

家畜基因组遗传多态标记—微卫星标记研究进展（上）

对家畜基因组中多态遗传标记－ＤＮＡ微卫星标记的研究进展及其应用进行综述，主要涉及以下两大方面：首先是家畜基因组中分子遗传标记，主要是ＤＮＡ微卫星标记的研究发现及有关该标记的定义，特性等；其次是ＤＮＡ分子标记在家畜基因组分析研究，家畜遗传连锁图制作 ，基因诊断，家畜品种进化演变和个体系谱确证等方面的应用概况。     

主要家畜种基因组连锁图现状和展望

对主要家畜种基因组研究中用多态遗传标记，如微卫星标记，ＲＦＬＰ等，制作遗传锁图现状进行了综述，在过去近半个世纪中，家畜基因组遗传连锁图的研究随着遗传记技术，特别是ＤＮＡ微卫星等多态标记的迅速发展，取得了很大进展。     

微卫星标记在畜禽品种资源评估中的应用

就畜禽品种资源的鉴定、划分和保护来说 ,国外科研工作者应用比较多的还是微卫星标记 ,因为它自身的众多优点使畜禽品种资源进一步从分子水平得到了准确的评定。合理地应用微卫星标记对畜禽遗传资源进行系统地研究、保护和利用将更有意义。1　微卫星标记的结构及遗传特点遗传变异主要是由遗传物质ＤＮＡ的差异造成的 ,ＤＮＡ的差异主要是碱基排列顺序的不同 ,因而利用分子遗传标记直接研究ＤＮＡ的变异性具有很大的意义。微卫星ＤＮＡ一般以 1～ 6ｂｐ碱基为核心序列 ,如(ＡＣ)ｎ/ (ＧＴ)ｎ、 (ＣＡＣ)ｎ/ (ＧＴＧ)ｎ等 ,可变重复数的核心序…     

微卫星标记及其在家禽遗传育种中的应用

随着现代养禽业的飞速发展，传统的育种技术已难以满足其要求。分子数量遗传学的产生及应用给家禽遗传育种研究带来了生机，而分子遗传标记的发展则为分子数量遗传学的研究提供了必要的工具。微卫星ＤＮＡ标记，以其优良的特性及简便的操作，受到广大研究者们的青睐，逐渐发展成为基因图谱构建及群体遗传结构分析研究中不可缺少的遗传标记之一，并在基因诊断、物种的演变追踪、数量性状位点（ ＱＴＬ）分析、系谱确证等方面显示出了其巨大的应用价值。本文旨在对微卫星ＤＮＡ标记的研究简史、特性以及它在家禽遗传育种中的主要应用作一简要…     

微卫星DNA指纹技术在动物遗传育种中的应用

1　ＤＮＡ指纹技术的原理及微卫星的特性ＤＮＡ指纹技术是Ｊｅｆｆｅｒｅｙｓ[1] 等人 1985年在人类遗传研究中发展起来的一种遗传标记方法 ,此后在动物、植物、微生物中得到广泛的发展和应用。其主要原理是真核生物基因组中分布着许多具有串联重复序列的区域 ,在细胞有丝分裂或减数分裂过程中由于ＤＮＡ的不均等交换 ,使串联重复数目发生增加或减少 ,从而演化出高度重复区段长度的多态性。目前 ,被用作遗传标记的串联重复序列一种为小卫星序列 ,重复单位长度一般为 11～ 70ｂｐ ,另一种为微卫星序列 ,重复单位长度一般为 2～ 6ｂｐ。用小卫…     

微卫星标记及其在家畜遗传育种中的应用

本文阐述了微卫星的结构、遗传特性以及微卫星标记在家畜个体亲缘关系鉴定、构建基因图谱、标记辅助选择、评估遗传多样性等四方面的作用。认为微卫星标记是动物遗传育种的一种非常理想的分子遗传标记,但由于已知的微卫星位点较少,加之分析成本较高,微卫星扩增产物在检测过程中常出现各种误判因素等原因而存在应用缺陷,为了更好地利用微卫星,使其成为一种简捷、灵敏、低廉的重要遗传分析方法,必须对其进行更深入地研究。     

微卫星分析中样本量和性别对群体遗传多样性的影响

以边鸡29个微卫星标记的遗传多样性分析数据为例,分析样本量和性别对群体遗传多样性指标的影响。结果表明:当样本量超过30时,平均期望杂合度趋于稳定,样本量与平均期望杂合度无显著相关,与平均多态信息含量和平均等位基因数呈正相关。在微卫星分析中性别对遗传多样性指标无显著影响。在运用微卫星标记进行群体遗传遗传多样性研究时以30～40个样本较为合适。     

兔微卫星标记研究进展

微卫星DNA,亦称简单序列重复,是指以2~6个核苷酸为基本序列串联重复的短片段〔1〕。微卫星标记与其它分子标记技术相比,具有分布广泛、多态信息含量高、呈共显性遗传等优点,因此在品种资源分类及畜禽遗传多样性的评估和保存中,微卫星被作为重要的遗传标记之一〔2〕。我国家兔分子生物学标记的研究起步较晚,最近几年才开始,利用微卫星标记来研究家兔的群体遗传特性是在2003年才开始的,相比较而言,国外则开展的较早,技术比较成熟,研究也相对较深入。1国内研究进展殷宝法、魏万红等,使用8对微卫星引物对高原鼠兔血样中的DNA微卫星位点(Sol33…     

随机扩增微卫星DNA多态标记(RAMPs)及其应用

随机扩增微卫星DNA多态标记是在微卫星DNA基础上衍生出的一种新型分子标记。它综合了微卫星DNA和随机扩增多态DNA（RAPD）两种标记的优点，可用来快速检测动植物群体的遗传变异及分离新的微卫星DNA。本文介绍了随机扩增微卫星DNA多态标记的种类及其应用。     

长江三角洲白山羊群体遗传结构研究

应用结构基因座和微卫星DNA两种遗传标记探讨长江三角洲白山羊群体遗传结构。结果表明,检测的9个结构基因座位上7个存在多态性,座位的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.1767、0.1457和1.2837;7个微卫星位点上共检测到110个等位基因,位点的基因平均杂合度、多态信息含量及有效等位基因数分别为0.8867、0.8774和11.2907。群体内的遗传变异程度相对较高,反映出丰富的遗传多样性,而且微卫星DNA标记揭示的遗传变异高于结构基因座。     

山西省六个地方羊品种微卫星位点多态性研究

利用5个微卫星标记对山西省6个地方羊品种微卫星DNA多态性进行检测,结果为：6个羊品种平均杂合度在0.6711-0.8316之间,平均多态信息含量在0.6152-0.7982之间,平均等位基因数在6.4-9.2之间,平均有效等位基因数在3.81-6.05之间;总群体在5个微卫星位点的平均遗传分化系数是0.1507。根据标准遗传距离,采用UPGMA方法对6个地方羊品种绘制亲缘关系聚类图,聚类图分为两支,黎城大青羊与阳城白山羊先聚在一起,又与吕梁黑山羊聚在一起,再与洪洞奶山羊聚在一起形成一类,本地绵羊与广灵大尾羊聚在一起形成另一类,最后两类聚为一大类。     

微卫星标记技术及其在蚕学研究中的应用前景

微卫星标记 ,又称SSR(simplesequencerepeat)标记 ,是目前运用最广的遗传标记之一。介绍了SSR标记的特征 ,产生多态性的基本原理 ,获得SSR标记的途径以及多态性数据的统计分析方法。解释了SSR标记使用过程中遇到的所谓“影子带”现象。展望了SSR标记技术在家蚕基因组研究中的应用前景。     

微卫星DNA标记遗传多样性在家畜遗传育种上应用的研究进展

作者概述了微卫星DNA标记产生的原理、机制、功能及特征,对其在家畜遗传育种上的应用进行系统分析,为其进一步应用研究奠定基础。     

四个微卫星标记在苏钟猪中的多态性分析

微卫星标记是近年来发展起来的一种检测基因DNA多态性的新型DNA标记,因其数量多、分布广、多态性丰富及检测方便等优点而倍受推崇。本文利用四个微卫星标记分析其在苏钟猪中的遗传多样性。结果表明,四个微卫星座位在苏钟猪中均存在较高的遗传多样性,基因杂合度为0.5962～0.8823;多态信息含量为0.5146～0.8709;有效等位基因数为2.4768～8.4935。以上结果表明,本研究采用的四个微卫星标记可以作为苏钟猪的遗传多样性的标记辅助选择。     

微卫星DNA的分离方法及其在猪遗传育种中的应用

本文综述了微卫星DNA标记的特点、形成机制、作用及分离方法。分析了其在猪构建基因图谱，QTL定位，标记辅助选择(MAS)，揭示群内遗传多样性，研究品种间的分化关系，预测杂种优势等方面的作用，并指出其研究中存在的问题。     

4个肉牛品种微卫星多态性分析

本研究探讨了引进牛种（西门塔尔牛、利木赞牛）和山东地方黄牛（鲁西黄牛、利鲁牛）在20个微卫星位点上的多态性。试验从不同地区的种公牛站采集鲁西黄牛、利鲁牛、利木赞牛和西门塔尔牛的血液或精液样本,分别为56、27、31和30个,共计144个样本,血液样本采用Lab-Aid基因组DNA分离试剂盒提取基因组DNA,精液样本采用高盐法提取基因组DNA。利用20个微卫星标记,采用荧光标记毛细管电泳方法,对4个肉牛品种的DNA多态性进行分析,主要研究了每个群体的遗传变异指标（等位基因数、多态信息含量和杂合度）及群体间的遗传关系（F-统计量和基因流）。结果表明,肉牛基因组DNA条带整齐,无拖尾现象,质量较好,可用于本试验。20个微卫星座位中共检测到211个等位基因,平均等位基因数为10.6个。群体的平均观测杂合度在0.6147~0.7176之间,平均期望杂合度在0.6735~0.7862之间。在所有群体中各位点的多态信息含量在0.4853~0.8714之间,平均为0.7284,但在各个群体内的差异较大。近交系数及基因流分析结果表明,4个肉牛品种近交系数较低,群体间平均近交系数为0.085,每个微卫星位点的基因流均>1。总体来看,所选用的20个微卫星座位多态信息含量高,可作为有效遗传标记用于肉牛品种间遗传多样性分析。     

塔里木马鹿微卫星遗传多样性与产茸量的相关性研究

利用7个微卫星遗传标记,采用PCR扩增,12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、Sanguinetti银染法显色,对新疆塔里木马鹿亚种遗传多样性进行检测,统计各群体的等位基因组成、平均有效等位基因数(E)和平均基因纯合率(Rh),根据等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(h)、多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离,利用分子进化遗传分析软件(MEGA),采用邻结法(NJ)重建系统发生树。根据等位基因频率,利用PHYLIP(3.6)分析软件,采用最大似然法(ML)构建系统发生树,应用自举检验(bootstrap test)估计系统树中节点的自引导值(bootstrap value),并进行了系统发生分析。同时对部分马鹿群体个体基因型与产茸量之间进行了相关分析。结果表明:7个微卫星位点在3个塔里木马鹿中的多态信息含量除BMS2508和Celjp0023没有多态性,以及BM5004为中度多态外,其他4个微卫星均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于3个塔里木马鹿群体遗传多样性和系统发生关系的分析。所有马鹿群体的平均PIC为(0.5196)、h(0.5552)和E(2.45),其基因多态性和遗传多样性相对丰富。塔里木马鹿35团群体与沙雅群体的血缘关系及遗传距离近于阿拉尔群体,3个塔里木马鹿群体的系统发育关系基本符合其地理分布和育成史。微卫星位点BM4208的166bp/185bp基因型和微卫星BM888的208bp/208bp基因型可以对塔里木马鹿35团群体高产茸量进行分子遗传标记。     

牛遗传资源分子遗传多样性的研究进展

作者对牛遗传多样性的主要研究方法（主要包括线粒体DNA、微卫星DNA多态性、单核苷酸多态性、高通量SNP检测方法及全基因组选择方法）及其在牛分子遗传多样性研究方面的应用进行了介绍。