稻瘟菌基因组规模分泌蛋白的预测分析

利用信号肽分析软件SignalP v3．0，亚细胞器蛋白定位软件TargetP v1．01，GPI-锚定位点软件big—PI Predictor和跨膜螺旋结构软件THMM-2．0这4个软件分析预测稻瘟菌12595个蛋白序列中有1134个分泌蛋白。编码这些蛋白的可读框（ORF）最小值为78bp，最大值为7849bp，平均1231bp。引导它们的信号肽长度介于15—45个氨基酸之间，平均为21个氨基酸。435个分泌蛋白具有功能描述，主要是与代谢有关的酶类。分析了其中降解细胞壁组分和与致病相关的酶类，提示在稻瘟菌侵染水稻不同阶段产生的关键酶及基因的功能需进一步研究。     

全基因组预测稻瘟菌的分泌蛋白

【目的】分泌蛋白多为病原微生物与植物受体蛋白起作用的激发子和其它致病因子，深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。利用稻瘟菌基因组学研究成果，结合计算机技术和生物信息学的方法，分析其分泌蛋白组学，将有助于全面掌握其致病因子的结构与功能。【方法】利用SignalP对稻瘟菌基因库中所有ORF的N-端信号肽存在与否进行预测，再依次通过Protcomp、TMHMM、big-PI Predictor和TargetP预测程序进行验证，寻找出所有可编码信号肽的基因。【结果】对11 108个稻瘟菌的ORF进行分析，最终预测出共有1 235个ORF可编码分泌蛋白。【结论】经验证此预测方法之可靠性较高，这为深入研究分泌蛋白组学奠定了基础。     

稻瘟菌基因组规模分泌蛋白的预测分析*

 利用信号肽分析软件SignalP v3.0,亚细胞器蛋白定位软件TargetP v1.01,GPI-锚定位点软件big-PI Predictor和跨膜螺旋结构软件THMM-2.0这4个软件分析预测稻瘟菌12595个蛋白序列中有1134个分泌蛋白。编码这些蛋白的可读框(ORF)最小值为78bp,最大值为7849bp,平均1231bp。引导它们的信号肽长度介于15～45个氨基酸之间,平均为21个氨基酸。435个分泌蛋白具有功能描述,主要是与代谢有关的酶类。分析了其中降解细胞壁组分和与致病相关的酶类,提示在稻瘟菌侵染水稻不同阶段产生的关键酶及基因的功能需进一步研究。     

3种作物纹枯病菌可溶性蛋白和酯酶同工酶的比较

为明确水稻、玉米和小麦纹枯病菌之间的生化差异,采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对这3种作物纹枯病菌(Rhizoctoniaspp.)18个菌株的可溶性蛋白和酯酶同工酶进行比较。结果发现,3种纹枯病菌的可溶性蛋白和酯酶同工酶图谱间均存在显著差异,其中可溶性蛋白图谱比酯酶同工酶图谱更具多样性。水稻和玉米纹枯病菌可溶性蛋白谱带有14~19条,而小麦纹枯病菌可溶性蛋白谱带7~9条;水稻和玉米纹枯病菌酯酶同工酶谱带有5~7条,而小麦纹枯病菌仅有3条,表明它们之间的差异是明显的。NTSYS聚类分析结果表明,水稻、玉米和小麦纹枯病菌菌株可溶性蛋白和酯酶同工酶谱带均具有丰富的多样性。     

稻瘟菌胞外蛋白的提取及电泳方法初探

利用蛋白质组学研究方法对稻瘟菌的胞外蛋白进行分析,可以更好地了解该病原菌的生物学特性和致病机制.蛋白质样品制备和双向电泳,都是蛋白质组学研究的基础.采用冷冻干燥,透析结合法与三氯乙酸-脱氧胆酸钠沉淀法(TCA-DOC沉淀法)提取液体培养稻瘟菌得到的胞外蛋白,利用17 cm pH 3.0～10.0与17 cm pH 4.0～7.0两种pH梯度IPG胶条对同一样品进行第一向等电聚焦,12%SDS-PAGE凝胶进行第二向电泳,银染后用PDQuest软件(V7.4)对电泳图谱进行分析.结果表明,在上述两种提取稻瘟菌胞外蛋白的方法中,TCA-DOC沉淀法具有较好的提取效果,应用该实验方法得到的蛋白质分布在pH 4.0～7.0之间的点数达到621个,因此在双向电泳中,采用pH 4.0～7.0的胶条具有较好的分辨率.     

稻瘟菌粗毒素对水稻幼苗生理生化的影响

为了检验不同稻瘟菌株粗毒素对杂交水稻生理影响的差异,以稻瘟菌XP、MY菌株不同浓度的粗毒素浸根处理水稻冈优725和B优827的幼苗,并对其防御酶POD和可溶性蛋白进行分析比较。结果表明:稻瘟菌2个菌株的不同毒素浓度均对水稻幼苗的POD活性和可溶性蛋白含量有明显影响,POD均表现出先升高后降低的变化规律;高浓度的毒素处理后,2个水稻品种的可溶性蛋白含量随时间的推移明显降低,但是B优827的可溶性蛋白含量明显高于冈优725,其POD变化与冈优725相比较平缓;B优827对稻瘟菌粗毒素的耐受力强于冈优725。     

双孢蘑菇菌丝体酯酶同工酶及可溶性蛋白的电泳分析

对引进的15株双孢蘑菇菌丝体进行了酯酶同工酶和可溶性蛋白的聚丙烯酰胺凝胶电泳分析。结果表明:15株双孢蘑菇菌丝体在酯酶同工酶以及可溶性蛋白质方面都表现出了一定的遗传性差异。进一步通过UPGMA平均连接程序进行聚类分析发现,15株双孢蘑菇在酯酶同工酶上,当相似水平为0 63时聚为一类;在可溶性蛋白方面,当相似水平等于0 94时被聚为一类。结果说明酯酶同工酶和可溶性蛋白电泳图谱对于双孢蘑菇种级水平上的分类具有重要作用,两者中尤以酯酶同工酶酶谱最佳。     

福建稻瘟菌群体遗传多样性RAPD分析

以 OPG、 OPH、 OPK等 3个系列 6 0个引物对福建稻瘟菌进行了 DNA随机扩增多态性 (RAPD)分析 .6 0个引物中有 2 1个扩增出多态性条带 ,表明福建省稻瘟菌群体有丰富的 RAPD多态性 ,可为该菌的遗传分析提供大量的遗传标记 .对 RAPD条带多样性分析发现龙岩江山病圃稻瘟菌群体遗传多样性较简单 ,有明显优势种群 ,可能影响其抗瘟评定的代表性 ,说明多点进行品种抗性鉴定是必要的     

防治稻瘟菌药剂的筛选

对于稻瘟病的防治,在生产上仍然是以化学防治为主,本文通过室内毒力测定方法,筛选对稻瘟病防效较好的药剂。本试验选用六种防治稻瘟菌病害的主要化学药剂:多菌灵、三环唑、苯醚甲环唑、咪鲜胺、嘧菌酯、稻瘟灵做为研究对象。对两株稻瘟菌进行毒力测定。研究的实验结果表明:嘧菌酯对稻瘟菌的抑菌效果最好,其平均EC50值为0.0520μg/ml,稻瘟灵、咪鲜胺、多菌灵、苯醚甲环唑、三环唑的抑菌效果依次降低。嘧菌酯对于水稻的稻瘟病来说防治效果好于其他的五种药剂,可以在生产上广泛推广。     

福建稻瘟菌群体遗传多样性RAPD分析

以ＯＰＧ、ＯＰＨ、ＯＰＫ等３个系列６０个引物对福建稻瘟菌进行了ＤＮＡ随机扩增多态性（ＲＡＰＤ）分析,６０个引物中有２１１个扩增出多态性条带,表明福建省曙菌群体有丰富的ＲＡＰＤ多态性,可为该菌的遗传分析提供大量的遗传标记,对ＲＡＰＤ条带多样性分析发现龙岩江山病圃稻瘟菌群体遗传多样性较简单,有明显优势种群可能影响其抗瘟评定的代表性较说明多点进行品种抗性理必要的。     

小麦穗腐镰刀菌的蛋白质和酸性磷酸酯酶凝胶电泳分析及其分类意义

对引致小麦赤霉病穗腐镰刀菌(Fusarium)的10个种或变种及30个不同地理来源的禾谷镰刀菌株的菌体可溶性蛋白质和酸性磷酸酯酶的聚丙烯酰胺凝胶电泳分析结果表明,蛋白质电泳图谱在大多数穗腐镰刀菌种或变种间存在着很大相似性;在禾谷镰刀菌种内,30个不同地理来源菌株间的电泳图型也基本相同,因此很难将这一生化指标用于穗腐镰刀菌的分类。十个穗腐镰刀菌种或变种间的酸性磷酸酯酶同工酶均为二条带,由于带数少,提供的分类信息少、加之彼此间有很大相似性,因此该酶在分类上没有意义。     

新种Roegneria tenuispica的核型和同工酶分析

本文首次报道了新种ＲｏｅｇｎｅｒｉａｔｅｎｕｉｓｐｉｃａＪ．Ｌ．ＹａｎｇｅｔＹ．Ｈ．Ｚｈｏｕ的染色体数目和核型，染色体数目为２８，四倍体，核型为２ｎ＝４ｘ＝２８＝２０ｍ＋６ｓｍ＋２ｓａｔ，２Ａ型，具一对随体染色体。本文还分析了该种和Ｒ。ｐｅｎｄｕｌｉｎａ幼根、幼芽的酯酶同工酶酶谱，同一器官它们表现出较大的差异性，表现在酶带数，酶带迁移率和酶的活性上；同时也具有一定的相似性，酶谱相似性系数幼根为０．２９，幼芽为０．３５。从而从分子水平上证实了按形态特征建立Ｒ。ｔｅｎｕｉｓｐｉｃａ一个新种是合理的，它与Ｒ．ｐｅｎｄｕｌｉｎａ的亲缘关系很近。     

应用蛋白质和DNA片段电泳分析鉴定稻种上的黄色细菌

本研究的目的是建立一种能简便、快速、准确鉴定水稻种子上寄藏的三类黄色细菌的方法。通过对三类菌株的菌体蛋白质和DNA限制性片段的电泳分析结果表明,三类细菌的蛋白质和DNA限制性片段电泳图谱明显不同,而在同一类群内不同菌株间的电泳图型则基本相同,因此能应用蛋白质和DNA限制性片段电泳分析于这些类群细菌的分类鉴定和亲缘关系分析,特别是菌体蛋白质是电泳分析具有简便、快速等优点。     

不同工艺条件对肌肉蛋白质氨基酸的影响

测定在不同工艺条件下加工的肉制品中粗蛋白质和17种氨基酸的含量。结果表明加工温度和加热时间对肌肉蛋白质和氨基酸含量有显著性的影响(P<0.05);在原料肉预处理时,腌液的 pH 值对蛋白质和氨基酸含量无显著性影响(P>0.05);腌液中的硝盐对氨基酸含量有显著性的影响(P<0.05)。     

鸭血浆蛋白(酶)多态性电泳图谱及其与数量性状的关系

本试验采用聚丙烯酰胺凝胶电泳研究了鸭不同品种、不同品系及其商品代等10个组合的血浆淀粉酶（Amylase）、酯酶（Esterase－1）、转铁蛋白（Transferrln）、前白蛋白（Prealbumin）等四项血浆蛋白（酶）的电泳图谱，发现淀粉酶、转铁蛋白、前白蛋白、酯醉（ES－1）强带的电泳图谱在品种间、品系间都没有差异；酯酶（ES－1）弱带型在不同品种间、及品系间具有统计上的差异，其遗传表达行为与性别有关。各品种间、及品系间的Tf相对含量、酯酶强带相对含量及其与鸭的各项肉用性能的关系无特定的趋向可盲。不同品种、不同品系间酯酶弱带图谱的统计上的差异与数量性状有关；ES－la型频数高的品种或品系，其生长速度快、饲料转化率高，ES－1b型频数高的两个不同专门化品系（指父系和母系）杂交后代的杂种优势率最大．ES－1e型频数以麻鸭类型品种为高。     

11个优良侧耳菌株的同工酶及可溶性蛋白综合分析

本试验采用电泳技术对白灵侧耳、阿魏侧耳、刺芹侧耳、鲍鱼侧耳、糙皮侧耳等侧耳属的5个种11个优选菌株的液体菌种,进行了酯酶同工酶、过氧化物酶同工酶、漆酶同工酶及可溶性蛋白图谱分析。结果表明单独利用一种同工酶或可溶性蛋白图谱难以区分供试菌株,如将各图谱进行综合聚类分析则可准确区分。综合聚类分析表明,所选菌株均为不重复菌株,在2．8286≤D≤3．000（最短距离法）和3．0006D≤3．317（最长距离法）水平上均可聚为5大类,即侧耳属5个不同种,这与它们各自的形态学特征相一致。     

黑猪血清蛋白质及碱性磷酸酶聚丙烯酰胺凝胶电泳分析

用聚丙烯酰胺凝胶圆盘电泳分析了黑猪血清蛋白质和碱性磷酸酶同工酶生化位点多态性的分布。结果：血清蛋白质可分离出１０ ～１２ 条区带,血红蛋白分离出１ ～２ 条区带,结合珠蛋白分离出４ 条区带,铜蓝蛋白分离出１ 条区带,糖蛋白分离出７ ～９ 条区带,脂蛋白分离出４ 条区带,光密度扫描黑猪血清蛋白质相对面积比分别为白蛋白占３１ ．９０ ％ ,α１ 蛋白占１１ ．１６ ％ ,α２ 蛋白占２４ ．４２ ％ ,β蛋白占１１ ．３１ ％ ,γ蛋白占２１ ．１８ ％ 。碱性磷酸酶同工酶分离出２ 条区带,其中 Ａ Ｌ Ｐ１ 占７３ ．６７ ％ , Ａ Ｌ Ｐ２ 占２１ ．７１ ％ 。用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离血清蛋白质和碱性磷酸酶重复性较好,分辨较高,测定蛋白质和碱性磷酸酶的迁移率（ Ｒｍ 值） 和百分含量的变化对分析猪的遗传特征、选育优良品种和诊断诸多疾病有重要意义。     

鱼糜漂洗液中水溶性蛋白质的回收与利用

研究了藻胶对链鱼糜漂行销认中水溶性蛋白质的凝聚作用,探讨了所回收的蛋白质返加到鱼糜中加以利用的可能性。结果表明,用褐藻胶作凝聚剂,蛋白质的回收率超过８０％,而废水的ＣＯＤ下降５０％左右;影响回收效果的主要因素有体系的ｐＨ值,蛋白质的浓度和褐藻胶的投加量等。将回收的蛋白质５％的比例添加于鱼糜中,制出的鱼香肠其凝胶强度基本不变。     

大豆子粒中蛋白质和脂肪积累的研究

本试验研究了大豆在不同密度和施氮量处理下 ,子粒中干物质、蛋白质和脂肪积累的动态变化。结果表明 :不同处理下 ,大豆子粒中干物质积累呈“S”型曲线变化 ;在不同密度处理下 ,蛋白质含量随灌浆期的推移而逐渐增加 ,并呈“W”型曲线变化 ;在不同施氮量处理下 ,蛋白质含量则是随子粒的形成呈不规则消长变化。脂肪含量随着子粒的形成呈“S”型曲线变化。不同密度、施氮量处理下 ,子粒中的干物质、蛋白质和脂肪含量均表现为 :中密度>低密度 >高密度 ;中施氮量 >高施氮量 >低施氮量     

水稻品种抗瘟性诱导机制研究

前胡、白芷的有效诱导成分主要是水溶性物质，加入粘布剂的水提物比未加粘布剂的抗性诱导效果好，所用诱导剂对稻瘟菌菌丝生长和孢子萌发均无明显的抑制作用，对水稻种子萌发及根、芽生长均无影响．前胡、白芷对水稻生长有一定的促进作用．朝六早（Ｓ）和特特勃（Ｒ）稻苗经诱导处理后，稻叶内过氧化物酶活性和多酚氧化酶活性明显增强，抗性诱导效果与两种酶活性的增加有明显的相关性．感病和抗病品种经诱导和接种后过氧化物酶同工酶活性均有所加强．诱导后稻株内脯氨酸含量无明显变化，但接种４８ｈ大量积累，９６ｈ后降至比接种前更低水平．感病品种朝六早在接种前经Ｎａ２ＳｅＯ４和前胡处理后稻叶中有抑菌物质积累，接种后诱导和未诱导的稻叶中均大量积累抑菌物质，但诱导并接种的稻叶比未诱导只接种的稻叶抑菌物质积累更多；在抗病品种上，未接种和接种的稻叶中均有抑菌物质积累。